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WO2008005559A3 - Stratégie servant à détecter des mutations de faible abondance - Google Patents

Stratégie servant à détecter des mutations de faible abondance Download PDF

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WO2008005559A3 PCT/US2007/015631 US2007015631W WO2008005559A3 WO 2008005559 A3 WO2008005559 A3 WO 2008005559A3 US 2007015631 W US2007015631 W US 2007015631W WO 2008005559 A3 WO2008005559 A3 WO 2008005559A3
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Michael Goggins
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Univ Johns Hopkins
Michael Goggins
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    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
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Abstract

La présente invention concerne, par exemple, un procédé servant à rechercher par criblage des mutations dans un échantillon d'ADN, ledit procédé consistant à (a) diluer et diviser l'échantillon pour obtenir une pluralité de petites quantités d'échantillon qui, en moyenne, contiennent entre environ 2 et 10 équivalents génome de l'ADN ; (b) amplifier par ACP l'ADN dans un nombre suffisant de petites quantités d'échantillon, avec au moins un ensemble d'amorces pour ACP, de façon à générer des amplicons tels que, si des mutations sont présentes à une fréquence d'environ 1-10 % dans un gène donné présent dans l'échantillon, la probabilité qu'il y ait une mutation dans ce gène dans au moins l'un des amplicons soit d'au moins 95 % ; et (c) cribler les amplicons en ce qui concerne la présence de mutations, en utilisant un procédé qui peut détecter des mutations non spécifiées au niveau de sites non spécifiés à l'intérieur d'un amplicon (par exemple par électrophorèse capillaire à gradient de température (TGCE) ou séquençage cyclique de l'ADN).
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