+

WO1995016792A1 - Methode pour le diagnostic de cancers - Google Patents

Methode pour le diagnostic de cancers Download PDF

Info

Publication number
WO1995016792A1
WO1995016792A1 PCT/IB1994/000414 IB9400414W WO9516792A1 WO 1995016792 A1 WO1995016792 A1 WO 1995016792A1 IB 9400414 W IB9400414 W IB 9400414W WO 9516792 A1 WO9516792 A1 WO 9516792A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
dna
mutations
gene
detection
deletions
Prior art date
Application number
PCT/IB1994/000414
Other languages
English (en)
Inventor
Maurice Stroun
Philippe Anker
Valeri Vasioukhin
Original Assignee
Maurice Stroun
Philippe Anker
Valeri Vasioukhin
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Maurice Stroun, Philippe Anker, Valeri Vasioukhin filed Critical Maurice Stroun
Priority to AU10756/95A priority Critical patent/AU1075695A/en
Priority to US08/663,230 priority patent/US5952170A/en
Priority to GB9612528A priority patent/GB2299166B/en
Publication of WO1995016792A1 publication Critical patent/WO1995016792A1/fr

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/118—Prognosis of disease development
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers

Definitions

  • the present invention relates to a method for diagnosing and / or monitoring the development of various types of cancer after a chemotherapy treatment or after an operation.
  • the aim of this invention therefore consists in providing a method for diagnosing cancers which is on the one hand more precise and more reliable and on the other hand which is easier to perform and does not involve an invasive test on patients.
  • the method for diagnosing and / or monitoring the development of cancers comprises the analysis of deoxyribonucleic acid (DNA) present in the blood plasma. It has now been shown that patients with various cancer diseases have increased levels of DNA in the blood plasma.
  • the diagnostic method according to the invention is therefore based on the detection of gene mutations in this plasma DNA, blood plasma being a human material much more easily accessible than biopsies of tumors for example. Thus, mutations of oncogenes are frequently demonstrated in many types of malignant tumors, and among them mutations in the ras gene are particularly significant.
  • the method can be applied to any gene modification specific to the DNA of cancer cells, such as mutations or deletions of ras, APC, DCC, P53 genes, etc. or any oncogene or antioncogen (tumor suppressing gene) or modifications of microsa ⁇ tellites. It has even been observed that different mutations of the ras genes detected in the DNA of the blood plasma could be absent in the DNA of the peripheral blood cells or in the case of certain leukemic patients of the bone marrow, which tends to confirm the greater reliability of the method according to the invention in comparison with known diagnostic methods.
  • the diagnostic method according to the invention consists in extracting DNA from the blood plasma, in purifying and amplifying this DNA, then in determining the gene mutations or deletions therein, this in principle. compares between the blood plasma of a presumed sick person and that of healthy people.
  • the scope of the present invention extends to any technique for extracting, purifying and amplifying DNA from blood plasma; similarly, any method of determining gene mutations can be used.
  • Example 1 Diagnosis of colon cancer by detection of mutations in the K-ras gene.
  • Blood samples (20-30 ml) from 15 patients with different stages of colorectal adenocarcinoma were taken from heparin, these patients having received no anti-cancer medication during this period. Thirteen of the 15 patients then underwent surgical removal of the tumor; similarly, a total of about 400 ml of blood was also taken from healthy people to isolate DNA from the plasma.
  • the DNA was extracted from tumors and blood cells using standard techniques which are well known.
  • the plasma is first subjected to treatments with phenol, ether and choloroform. After dialysis against SSC (0.15 M sodium chloride, 0.015 M trisodium citrate), the product is passed through a Concanavalin A-Sepharose column in order to remove the polysaccharides, then it is centrifuged in a gradient of CS2SO .
  • the DNA thus extracted and purified (10 to 100 ng) was then subjected to a PCR amplification of the first exon of the K-ras gene in a volume of 100 ⁇ l.
  • the amplimers were 5'-GACTGAATATAAACTTGTGGTAGT-3 'and 5' -CTATTGTTGGATCATATTCGTCC-3 '.
  • the amplifications were carried out in a buffer containing 50 mM of KC1, 10 mM of Tris-MCI at pH 0.3, 200 mM of each nucleotide, 1.8 mM of MgCl2 0, 2 ⁇ M of each precursor and 2.5 units of " AmpliTaq "DNA polymerase. 35 cycles were performed for DNA from tumors and blood cells and 45 cycles for DNA from plasma (94 ° C for 1 min., 59 ° C for 1.5 min., 72 ° C for 1 min., the last cycle being extended by 7 min at 72 ° C).
  • PCR products were placed in equal quantities on "Zeta-probe" membranes (Bio-Rad, Hercules, CA) and hybridized with specific oligonucleotides for mutant or wild-type K-ras.
  • the oligonucleotides were labeled with 32P ddATP (Amersham, GB).
  • the final washing of the membranes was carried out in a solution containing 3M tetramethylamonnium chloride, 50 mM Tris-HCl at pH 8.0 and 0.2 mM EDTA and 0.1 % SDS at 58 ° C for 1 hour.
  • the DNA is subjected to PCR amplification with amplimers complementary to the normal GLY sequences or mutated ALA, VAL, SER, ASP or CYS.
  • the amplifiers specific to the mutations have 3 ′ terminations complementary to the mutations at the specific point.
  • the Taq I polymerase enzyme Perkin-Elmer Cetus, CH, has no 3 'exonuclease activity and is therefore unable to amplify DNA if the mismatch of a single base is located at terminal 3 'to amplify it.
  • Each PCR was carried out in a volume of 40 ⁇ l of a solution containing 50 mM of KC1, 10 mM of Tris-HCl at pH 8.3, 2 mM of each nucleotide, 0.7 mM MgC12, 0.2 mM of each precursor and 1 unit of "AmpliTaq" DNA polymerase. Thirty-five cycles were performed (94 ° C for 1 min., Annealing at 55-62 ° C for 2 min., Extension at 72 ° C for 1 min,). The last cycle was extended by 7 min. at 72 ° C. Each reaction was initiated with the "hot-start" technique.
  • the amplimers used were: 5 '-ACTTGTGGTAGTTGGAGCTGG-3' for wild K-ras (recoration at 55 ° C), 5 '-ACTTGTGGTAGTTGGAGCTGC-3' for the mutant ALA 12 (renaturation at 62 ° C),
  • reaction products were analyzed by electrophoresis in a 0.8% polyacrylamide gel.
  • Example 2 Diagnosis of cancers due to myeloid disorders by detection of mutations in the N-ras gene.
  • MDS myelodysplastic syndrome
  • AML acute myeloblastic leukemia
  • the DNA of the blood cells and of the marrow was isolated by treatment with Proteinase K (Merck, DE) in the presence of SDS, then extraction with phenol, precipitation with ethanol and gradient of CS2SO4.
  • the plasma DNA was extracted as described in Example 1.
  • the DNA (10-100 ng) was amplified in a volume of 100 ⁇ l.
  • the amplimers used (Oncogene Science, NY, USA) were 5'-GACTGAGTACAAACTGGTGG-3 'and
  • the results of the analyzes obtained confirm that the DNA of sick patients had one or more mutations in codon 12 (GLY in CYS or ASP) or codon 13 (GLY in CYS) of the N-ras gene, whereas all of these mutations could not be identified in the DNA of blood cells, or even in that of the bone marrow.
  • the analysis of the DNA of the blood plasma can constitute a method of diagnosis and of monitoring the evolution of a cancerous disease which is more practical, less traumatic ( simple blood sampling from the patient) and sometimes even more reliable than known methods involving the taking of a biopsy.

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

La méthode selon l'invention pour le diagnostic et/ou le suivi de l'évolution de cancers comprend l'analyse de l'acide désoxyribonucléique (ADN) présent dans le plasma sanguin. Cette analyse concerne plus particulièrement toute modification génique propre à l'ADN de cellules cancéreuses, par exemple la détection de mutations ou délétions d'oncogènes, ou bien de mutations ou délétions de gènes suppresseurs de tumeurs ou encore les modifications de microsatellites.

Description

METHODE POUR LE DIAGNOSTIC DE CANCERS
La présente invention concerne une méthode de diagnos¬ tic et/ou de suivi de l'évolution de divers types de can¬ cers après un traitement de chimiothérapie ou après une opération.
On sait que le diagnostic et le suivi de l'évolution des cancers sont effectués, à part l'observation et l'exa¬ men direct de tumeurs, par analyse de biopsies ou, dans le cas de cancers du sang, de la moelle osseuse, ce qui im¬ plique soit une intervention chirurgicale soit un test in- vasif du type biopsie ou aspiration médullaire avec ai¬ guille. Or, en plus du caractère désagréable voire dange¬ reux pour les patients de telles méthodes, il a été constaté qu'elles pouvaient en outre être peu précises. Dans le cas de certaines maladies leucémiques par exemple, l'analyse de l'échantillon de moelle prélevée n'a pas per¬ mis de retrouver toutes les variétés clonales malignes.
Le but de cette invention consiste donc à fournir une méthode de diagnostic de cancers qui soit d'une part plus précise et plus fiable et d'autre part qui soit plus facile à réaliser et n'impliquant pas de test invasif sur les patients.
La méthode de diagnostic et/ou suivi de l'évolution de cancers, objet de l'invention et visant à atteindre le but précité, comprend l'analyse de l'acide désoxyribonucléique (ADN) présent dans le plasma sanguin. Il a en effet maintenant pu être démontré que des pa¬ tients atteints de différentes maladies cancéreuses pré¬ sentaient des taux augmentés d'ADN dans le plasma sanguin. La méthode de diagnostic selon l'invention est donc basée sur la détection de mutations géniques dans cet ADN plas- mique, la plasma sanguin étant un matériau humain beaucoup plus facilement accessible que des biopsies de tumeurs par exemple. Ainsi, des mutations d'oncogènes sont fréquemment mises en évidence dans de nombreux types de tumeurs malignes, et parmi elles les mutations du gène ras sont particulièrement significatives. Toutefois, la méthode peut s'appliquer à n'importe quelle modification génique propre à l'ADN de cellules cancéreuses, telles les muta¬ tions ou délétions de gènes ras, APC, DCC, P53, etc. ou de n'importe quel oncogene ou antioncogène (gène de suppres¬ sion de tumeurs) ou encore les modifications de microsa¬ tellites. On a même observé que différentes mutations des gènes ras détectées dans l'ADN du plasma sanguin pouvaient être absentes dans l'ADN des cellules sanguines périphé¬ riques ou dans le cas de certains patients leucémiques de la moelle osseuse, ce qui tend à confirmer la plus grande fiabilité de la méthode selon l'invention en comparaison avec les méthodes de diagnostic connues.
D'une manière générale, la méthode de diagnostic selon l'invention consiste à extraire l'ADN du plasma sanguin, à purifier et amplifier cet ADN, puis à déterminer les muta¬ tions ou délétions géniques dans celui-ci, ceci en prin¬ cipe de manière comparative entre le plasma sanguin d'une personne présumée malade et celui de personnes en bonne santé. La portée de la présente invention s'étend à toute technique d'extraction, purification et amplification d'ADN du plasma sanguin; de même, n'importe quelle méthode de détermination des mutations géniques peut être utili¬ sée.
La méthode de diagnostic selon l'invention sera main¬ tenant illustrée plus en détails en référence aux deux exemples qui suivent :
Exemple 1 : Diagnostic du cancer du colon par détection de mutations du gène K-ras.
Dans cette première application de la méthode selon l'invention, on a utilisé la détermination de mutations dans le codon 12 des gènes K-ras contenus dans des adéno- carcinomes du colon. Ces mutations apparaissent générale¬ ment lors de la transition du stade adénome I en adénome II, avant la délétion ou la mutation du gène P53, c'est-à- dire relativement tôt dans l'évolution de la tumeur.
Des échantillons de sang (20-30 ml) de 15 patients présentant différents stades d'adénocarcinome colorectal ont été prélevés sur héparine, ces patients n'ayant reçu durant cette période aucun médicament anti-cancéreux. Treize des 15 patients ont ensuite subi une ablation chi¬ rurgicale de la tumeur; de même, on a également prélevé environ 400 ml de sang au total sur des personnes saines afin d'en isoler l'ADN du plasma.
L'ADN a été extrait des tumeurs et des cellules san¬ guines selon des techniques usuelles bien connues.
Quant à l'extraction de l'ADN du plasma sanguin, elle peut être effectuée de la manière suivante : le plasma est d'abord soumis à des traitements par du phénol, de l'éther et du choloroforme. Après dialyse contre la SSC (chlorure de sodium 0,15 M, citrate de trisodium 0,015M), on fait passer le produit à travers une colonne Concanavaline A-Sépharose afin d'éliminer les polysaccharides, puis on le centrifuge dans un gradient de CS2SO .
L'ADN ainsi extrait et purifié (10 à 100ng) a ensuite été soumis à une amplification par PCR du premier exon du gène K-ras dans un volume de lOOμl.
Les amplimers étaient le 5'-GACTGAATATAAACTTGTGGTAGT-3' et le 5 '-CTATTGTTGGATCATATTCGTCC-3 ' .
Les amplifications ont été effectuées dans un tampon contenant 50 mM de KC1, 10 mM de Tris-MCI à pH 0,3, 200mM de chaque nucléotide, 1,8 mM de MgCl2 0, 2μM de chaque précurseur et 2,5 unités de "AmpliTaq" ADN polymérase. 35 cycles ont été réalisés pour l'ADN des tumeurs et des cel¬ lules sanguines et 45 cycles pour l'ADN du plasma (94°C pendant 1 min. , 59°C pendant 1,5 min., 72°C pendant 1 min., le dernier cycle étant prolongé de 7 min. à 72°C) .
En ce qui concerne la détection des mutations , elle peut être effectuée par n'importe quelle méthode connue et appropriée. Dans le présent exemple, elle a été réalisée de deux manières différentes pour chaque échantillon testé.
(a) Hybridisation de produits PCR avec sondes oligonu- cléotiques spécifiques aux mutations (selon Verlaan de Vries et al.. Gène 50, 313-320, 1986):
Les produits PCR ont été disposés en quantités égales sur des membranes "Zeta-probe" (Bio-Rad, Hercules, CA) et hybridisées avec les oligonucleotides spécifiques pour des K-ras mutants ou sauvages. Les oligonucleotides étaient marqués avec 32P ddATP (Amersham, GB) . Afin de séparer les hybrides parfaits des "mismatchs", le lavage final des membranes a été effectué dans une solution contenant du chlorure de tétraméthylamonnium 3M, 50 mM de Tris-HCl à pH 8,0 et 0,2 mM EDTA et 0,1 % SDS à 58°C pendant 1 heure.
(b) Amplification PCR avec amplimers spécifiques de mutations ponctuelles ou amplification PCR pour allèles spécifiques (PASA) (selon Sommer et al. Biotechnique 12, 82-87, 1992):
Dans cette méthode plus sensible, l'ADN est soumis à une amplification PCR avec des amplimers complémentaires aux séquences normales GLY ou mutées ALA, VAL, SER, ASP ou CYS. Les amplimers spécifiques aux mutations ont des ter¬ minaisons 3 ' complémentaires aux mutations au point spéci¬ fiques. L'enzyme Taq I polymérase (Perkin-Elmer Cetus, CH), n'a pas d'activité exonucléasique en 3 ' et est donc incapable d'amplifier l'ADN si le mismatch d'une seule base est situé à la terminaison 3' de l'amplimer.
Chaque PCR a été effectué dans un volume de 40μl d'une solution contenant 50 mM de KC1, 10 mM de Tris-HCl à pH 8,3, 2 mM de chaque nucléotide, 0,7 mM MgC12, 0,2 mM de chaque précurseur et 1 unité de "AmpliTaq" ADN polymérase. Trente-cinq cycles ont été effectués (94°C pendant 1 min., recuit à 55-62°C pendant 2 min., extension à 72°C pendant 1 min,). Le dernier cycle a été étendu de 7 min. à 72°C . Chaque réaction a été amorcée avec la technique "hot- start". Les amplimers utilisés étaient les suivants : 5 ' -ACTTGTGGTAGTTGGAGCTGG-3 ' pour le K-ras sauvage (re- naturation à 55°C), 5 ' -ACTTGTGGTAGTTGGAGCTGC-3 ' pour le mutant ALA 12 (renaturation à 62°C),
5'-ACTTGTGGTAGTTGGAGCTGT-3' pour le mutant VAL 12 (renatu¬ ration à 61 °C), 5'-ACTTGTGGTAGTTGGAGCTA-3' pour le mutant SER 12 (renaturation à 59°C), 5'-ACTTGTGGTAGTTGGAGCTGA-3 ' pour le mutant ASP 12 (renaturation à 60°C), 5'-ACTTGTGGTAGTTGGAGCTT-3' pour le mutant CYS 12 (renatu¬ ration à 59°C) et dans chaque cas l'amplimer "antisense" 5 '-CTATTGTTGGATCATATTCGTCC-3 ' .
Après amplification, les produits de la réaction ont été analysés par électrophorèse dans un gel de polyacryla- mide 0,8 %.
En utilisant la première technique (a) décrite ci- dessus, il s'est avéré qu'il n'était pas possible de mettre en évidence les mêmes mutations dans l'ADN du plas¬ ma que celles détectées dans l'ADN des tumeurs prélevées (GLY en VAL, GYS en ALA); cette technique ne semble pou¬ voir être appliquée ici que si environ 10 % au moins de l'ADN total présente une mutation ponctuelle. Par contre, les mutations précitées ont pu être identifiées dans l'ADN du plasma avec la seconde technique (b) décrite précédem¬ ment; il apparaît que cette technique permet d'identifier les mutations dans un échantillon d'ADN du plasma mélangé avec un excès de 104 à 10*^ d'ADN normal non muté. D'autre part, avec la même technique, il n'a pas été possible de détecter les mêmes mutations sur les échantillons d'ADN de cellules sanguine.
Enfin, tous les échantillons de contrôle provenant de personnes en bonne santé se sont révélés négatifs, c'est- à-dire ne présentant pas de mutations de l'ADN du plasma.
Exemple 2 : Diagnostic de cancers dus à des désordres myéloïdes par détection de mutations du gène N-ras.
On sait qu'une prédominance de mutations N-ras ont été observées dans l'ADN de la moelle osseuse de patients pré¬ sentant un syndrome myelodysplasique (MDS) ou une leucémie myéloblastique aiguë (AML).
On a prélevé 20 à 30 ml de sang sur dix patients at¬ teints de AML ou MDS, ce sang étant recueilli sur héparine et centrifugé sur gradient "Ficoll Hipague" (Pharmacia, SE) . On a également prélevé 400 ml de sang sur des per¬ sonnes saines. L' interphase contenant des cellules mononu¬ cléaires a été recueilli et utilisé pour l'extraction de l'ADN des cellules sanguines. La phase supérieure a été centrifugée à 2500 G pendant 15 minutes, et le surnagent a été utilisé pour l'extraction de l'ADN du plasma. De plus, quelques échantillons de moelle osseuse des mêmes patients ont été prélevés pour analyse de contrôle.
L'ADN des cellules sanguines et de la moelle a été isolé par traitement à la Protéinase K (Merck, DE) en pré¬ sence de SDS, puis extraction au phénol, précipitation à l'éthanol et gradient de CS2SO4. L'ADN du plasma a été ex¬ trait comme décrit dans l'exemple 1.
L'ADN (10-100 ng) a été amplifié dans un volume de 100μl. Les amplimers utilisés (Oncogene Science, NY, USA) étaient 5'-GACTGAGTACAAACTGGTGG-3' et
5' -CTCTATGGTGGGATCATATT-3' pour le premier exon du gène N- ras. Les amplifications ont été effectuées dans un "Thermo-Cycler 480" automatique (Perkin-Elmer Cetus, CH) dans les mêmes conditions que celles de l'Exemple 1. Chaque cycle consistait en une étape de denaturation à 94°C pendant 1 minute, une renaturation (à 51 °C pourN-ras) pendant 1,5 minutes et une extension d'une minute à 72°C avec un troisième segment d'extension de 5 secondes par cycle. Le dernier cycle a été suivi par une extension de 7 minutes à 72°C. Les produits de l'amplification (109 np) ont été analysés par électrophorèse dans du gel polyacry- lamide 0,8%.
Les deux mêmes méthodes de détection des mutations que dans l'Exemple 1 ont été employées. Dans la seconde tech¬ nique (b), on a utilisé comme amplimers pour N-ras 5'-CTGGTGGTGGTTGGAGCAGA-3' pour le mutant ASP 12, 5'-GGTGGTGGTTGGAGCAGGTT-3' pour le mutant CYS 13, et 5'-CTCTATGGTGGGATCATATT-3' comme amplimer "antisense".
Les résultats des analyses obtenus permettent de confirmer que l'ADN des patients malades présentait une ou plusieurs mutations du codon 12 (GLY en CYS ou en ASP) ou du codon 13 (GLY en CYS) du gène N-ras, alors que toutes ces mutations n'ont pas pu être identifiées dans l'ADN des cellules sanguines, ni même dans celui de la moelle os¬ seuse.
Ainsi, il ressort des deux exemples illustratifs ci- dessus que l'analyse de l'ADN du plasma sanguin peut constituer une méthode de diagnostic et du suivi de l'évo¬ lution d'une maladie cancéreuse qui est plus pratique, moins traumatisante (simple prélèvement de sang chez le patient) et parfois même plus fiable que les méthodes connues impliquant le prélèvement d'une biopsie.

Claims

REVENDICATIONS
1. Méthode pour le diagnostic et/ou le suivi de l'évolu¬ tion de cancers comprenant l'analyse de l'acide désoxyri- bonucléique (ADN) présent dans le plasma sanguin.
2. Méthode selon la revendication 1 comprenant l'extrac¬ tion de l'ADN présent dans le plasma sanguin, la purifica¬ tion et l'amplification de l'ADN, et la détection de muta¬ tions géniques dans cet ADN.
3. Méthode selon la revendication 2, dans laquelle on dé¬ tecte les mutations ou délétions d'oncogènes, ou bien les mutations ou délétions de gènes suppresseurs de tumeurs ou encore les modifications géniques propres à l'ADN de cel¬ lules cancéreuses.
4. Méthode selon la revendication 3, dans laquelle la dé¬ tection est appliquée à tout oncogene ou antioncogène ou gène de suppression de tumeurs, par exemple aux gènes APC, ras, DCC ou P53, ou encore aux modifications de microsa¬ tellites.
5. Méthode selon l'une des revendications 2 à 4, dans la¬ quelle l'ADN est amplifié par réaction de la polymérase en chaîne (ci-après "PCR").
6. Méthode selon l'une des revendications 2 à 5, dans la¬ quelle la détection des mutations géniques est effectuée par hybridisation des produits par PCR avec des sondes oligonucléotiques spécifiques aux mutations.
7. Méthode selon l'une des revendications 2 à 5, dans la¬ quelle la détection des mutations géniques est effectuée par amplification par PRC avec des amplimers spécifiques aux mutations ponctuelles.
PCT/IB1994/000414 1993-12-16 1994-12-13 Methode pour le diagnostic de cancers WO1995016792A1 (fr)

Priority Applications (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
AU10756/95A AU1075695A (en) 1993-12-16 1994-12-13 Method for diagnosing cancer
US08/663,230 US5952170A (en) 1993-12-16 1994-12-13 Method for diagnosing cancers
GB9612528A GB2299166B (en) 1993-12-16 1994-12-13 Cancer diagnosis by detection of gene mutations in the DNA fro blood plasma

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CH3761/93-3 1993-12-16
CH03761/93A CH686982A5 (fr) 1993-12-16 1993-12-16 Méthode pour le diagnostic de cancers.

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO1995016792A1 true WO1995016792A1 (fr) 1995-06-22

Family

ID=4262936

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/IB1994/000414 WO1995016792A1 (fr) 1993-12-16 1994-12-13 Methode pour le diagnostic de cancers

Country Status (5)

Country Link
US (1) US5952170A (fr)
AU (1) AU1075695A (fr)
CH (1) CH686982A5 (fr)
GB (1) GB2299166B (fr)
WO (1) WO1995016792A1 (fr)

Cited By (24)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5670325A (en) * 1996-08-14 1997-09-23 Exact Laboratories, Inc. Method for the detection of clonal populations of transformed cells in a genomically heterogeneous cellular sample
US5741650A (en) * 1996-01-30 1998-04-21 Exact Laboratories, Inc. Methods for detecting colon cancer from stool samples
DE19736691A1 (de) * 1997-08-22 1999-02-25 Michael Prof Dr Med Giesing Verfahren zur Charakterisierung und Identifizierung disseminierter und metastasierter Krebszellen
US5928870A (en) * 1997-06-16 1999-07-27 Exact Laboratories, Inc. Methods for the detection of loss of heterozygosity
US5952178A (en) * 1996-08-14 1999-09-14 Exact Laboratories Methods for disease diagnosis from stool samples
US6020137A (en) * 1996-08-14 2000-02-01 Exact Laboratories, Inc. Methods for the detection of loss of heterozygosity
US6100029A (en) * 1996-08-14 2000-08-08 Exact Laboratories, Inc. Methods for the detection of chromosomal aberrations
US6146828A (en) * 1996-08-14 2000-11-14 Exact Laboratories, Inc. Methods for detecting differences in RNA expression levels and uses therefor
US6156504A (en) * 1996-03-15 2000-12-05 The Penn State Research Foundation Detection of extracellular tumor-associated nucleic acid in blood plasma or serum using nucleic acid amplification assays
US6203993B1 (en) 1996-08-14 2001-03-20 Exact Science Corp. Methods for the detection of nucleic acids
US6280947B1 (en) 1999-08-11 2001-08-28 Exact Sciences Corporation Methods for detecting nucleotide insertion or deletion using primer extension
US6291163B1 (en) * 1996-08-28 2001-09-18 The Johns Hopkins University School Of Medicine Method for detecting cell proliferative disorders
US6300077B1 (en) 1996-08-14 2001-10-09 Exact Sciences Corporation Methods for the detection of nucleic acids
WO2000066783A3 (fr) * 1999-05-04 2002-01-03 Ortho Clinical Diagnostics Inc Capture rapide et efficace d'adn dans un prelevement sans recours a un reactif de lyse cellulaire
WO2001042504A3 (fr) * 1999-12-07 2002-08-29 Penn State Res Found Detection d'acide nucleique extracellulaire associe aux tumeurs dans le plasma et le serum sanguins
US6511805B1 (en) 1996-03-15 2003-01-28 The Penn State Research Foundation Methods for detecting papillomavirus DNA in blood plasma and serum
US6919174B1 (en) 1999-12-07 2005-07-19 Exact Sciences Corporation Methods for disease detection
US6964846B1 (en) 1999-04-09 2005-11-15 Exact Sciences Corporation Methods for detecting nucleic acids indicative of cancer
US7252946B2 (en) 2004-01-27 2007-08-07 Zoragen, Inc. Nucleic acid detection
US7262006B1 (en) 2000-05-01 2007-08-28 Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. Rapid and efficient capture of DNA from sample without using cell lysing reagent
US7368233B2 (en) 1999-12-07 2008-05-06 Exact Sciences Corporation Methods of screening for lung neoplasm based on stool samples containing a nucleic acid marker indicative of a neoplasm
WO2009021149A1 (fr) * 2007-08-07 2009-02-12 The Penn State Research Foundation Détection d'acides nucléiques extracellulaires associés à une tumeur dans le plasma ou le sérum sanguin
US9109256B2 (en) 2004-10-27 2015-08-18 Esoterix Genetic Laboratories, Llc Method for monitoring disease progression or recurrence
US9777314B2 (en) 2005-04-21 2017-10-03 Esoterix Genetic Laboratories, Llc Analysis of heterogeneous nucleic acid samples

Families Citing this family (110)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6235470B1 (en) * 1993-11-12 2001-05-22 The Johns Hopkins University School Of Medicine Detection of neoplasia by analysis of saliva
GB9704444D0 (en) 1997-03-04 1997-04-23 Isis Innovation Non-invasive prenatal diagnosis
GB9715034D0 (en) * 1997-07-18 1997-09-24 Zeneca Ltd Assay
EP1792989A1 (fr) 1999-04-12 2007-06-06 Agensys, Inc. Protéine à treize segments transmembranaires exprimée dans le cancer de la prostate
WO2000061746A1 (fr) 1999-04-12 2000-10-19 Agensys, Inc. 13 proteines transmembranaires exprimees dans le cancer de la prostate
WO2001012811A1 (fr) 1999-08-12 2001-02-22 Urogenesys, Inc. Antigene transmembranaire lectine du type c exprime dans le cancer humain de la prostate et ses utilisations
PT1220913E (pt) 1999-10-05 2009-02-16 Agensys Inc Receptor acoplado a proteína g regulado positivamente em cancro da próstata e suas utilizações
US6893818B1 (en) * 1999-10-28 2005-05-17 Agensys, Inc. Gene upregulated in cancers of the prostate
DE50113102D1 (de) * 2000-06-27 2007-11-22 Von Recklinghausen Ges E V Verfahren zur Ermittlung von Daten zur präsymptomatischen oder pränatalen Diagnose von Typ 1 Neurofibromatose
EP1299727B1 (fr) 2000-07-12 2009-04-22 Agensys, Inc. Nouvel antigene tumoral utile dans le diagnostic et le traitement de cancers de la vessie, de l'ovaire, du poumon et du rein
US6863892B2 (en) 2000-08-22 2005-03-08 Agensys, Inc. Nucleic acid and corresponding protein named 158P1D7 useful in the treatment and detection of bladder and other cancers
WO2002018578A2 (fr) 2000-08-28 2002-03-07 Agensys, Inc. Acide nucleique et proteine correspondante denommes 85p1b3 utilises dans le traitement et la detection de cancers
US20020058265A1 (en) * 2000-09-15 2002-05-16 Promega Corporation Detection of microsatellite instability and its use in diagnosis of tumors
US6844152B1 (en) 2000-09-15 2005-01-18 Promega Corporation Detection of microsatellite instability and its use in diagnosis of tumors
US6924358B2 (en) 2001-03-05 2005-08-02 Agensys, Inc. 121P1F1: a tissue specific protein highly expressed in various cancers
US7271240B2 (en) 2001-03-14 2007-09-18 Agensys, Inc. 125P5C8: a tissue specific protein highly expressed in various cancers
US20030191073A1 (en) 2001-11-07 2003-10-09 Challita-Eid Pia M. Nucleic acid and corresponding protein entitled 161P2F10B useful in treatment and detection of cancer
US7736654B2 (en) 2001-04-10 2010-06-15 Agensys, Inc. Nucleic acids and corresponding proteins useful in the detection and treatment of various cancers
KR20020086078A (ko) * 2001-05-11 2002-11-18 김호근 미세부수체 불안정성 측정용 진단 킷트
ES2532757T3 (es) 2001-09-06 2015-03-31 Agensys, Inc. Ácido nucleico y proteína correspondiente denominados STEAP-1 útiles en el tratamiento y la detección de cáncer
US6977162B2 (en) 2002-03-01 2005-12-20 Ravgen, Inc. Rapid analysis of variations in a genome
NZ535044A (en) 2002-03-01 2008-12-24 Ravgen Inc Non-invasive method to determine the genetic sequence of foetal DNA from a sample from a pregnant female thereby detecting any alternation in gene sequence as compared with the wild type sequence
ES2253461T3 (es) * 2002-03-05 2006-06-01 Epigenomics Ag Procedimiento y dispositivo para la determinacion de la especificidad del tejido y del adn que flota libre en tejidos corporales.
AU2003218025A1 (en) * 2002-03-08 2003-09-22 Michael S. Kopreski Analysis of apoptotic bodies in bodily fluids
US7727720B2 (en) 2002-05-08 2010-06-01 Ravgen, Inc. Methods for detection of genetic disorders
US7442506B2 (en) 2002-05-08 2008-10-28 Ravgen, Inc. Methods for detection of genetic disorders
AU2003243151A1 (en) 2002-08-16 2004-03-03 Agensys, Inc. Nucleic acid and corresponding protein entitled 251p5g2 useful in treatment and detection of cancer
CA2515699C (fr) 2003-02-10 2015-01-27 Aya Jakobovits Acide nucleique et proteine correspondante dite 158p1d7, utiles pour le traitement et la detection de cancers de la vessie et autres
CN101090729B (zh) 2003-05-30 2014-07-23 艾更斯司股份有限公司 前列腺干细胞抗原(psca)变体及其序列
US8710012B2 (en) 2003-07-14 2014-04-29 Cls Therapeutics Limited Method for treating oncological diseases
RU2269356C2 (ru) 2003-07-14 2006-02-10 Дмитрий Дмитриевич Генкин Способ лечения онкологических заболеваний
US8388951B2 (en) 2003-07-14 2013-03-05 Cls Therapeutics Limited Method for treating systemic DNA mutation disease
US8431123B2 (en) * 2003-07-14 2013-04-30 Cls Therapeutics Limited Method for treating systemic bacterial, fungal and protozoan infection
US20060183128A1 (en) * 2003-08-12 2006-08-17 Epigenomics Ag Methods and compositions for differentiating tissues for cell types using epigenetic markers
RU2381234C2 (ru) 2004-05-28 2010-02-10 Эдженсис, Инк. Антитела и родственные молекулы, связывающиеся с белками psca
EP1807538A4 (fr) * 2004-10-22 2009-01-14 Promega Corp Procedes et necessaires permettant de detecter une instabilite genomique de cellules germinales
CA2603093A1 (fr) 2005-03-31 2006-10-05 Agensys, Inc. Anticorps et molecules correspondantes qui se fixent aux proteines 161p2f10b
ATE406463T1 (de) 2005-04-06 2008-09-15 Maurice Stroun Methode zur krebsdiagnose mittels nachweis von dna und rna im kreislauf
US8916151B2 (en) * 2005-04-25 2014-12-23 Cls Therapeutics Limited Method for treating a reduction of fertility
US20090005268A1 (en) * 2005-07-18 2009-01-01 Epigenomics Ag Compositions and Methods for Cancer Diagnostics Comprising Pan-Cancer Markers
US9424392B2 (en) 2005-11-26 2016-08-23 Natera, Inc. System and method for cleaning noisy genetic data from target individuals using genetic data from genetically related individuals
US11111544B2 (en) 2005-07-29 2021-09-07 Natera, Inc. System and method for cleaning noisy genetic data and determining chromosome copy number
EP1951906B1 (fr) * 2005-11-10 2010-12-22 Bristol-Myers Squibb Pharma Company Moésine, cavéoline 1 et protéine 1 associée à yes en tant que marqueurs prédictifs de la réponse au dasatinib dans les cancers du sein
PL2095825T3 (pl) * 2006-11-28 2011-12-30 Cls Therapeutics Ltd Sposób leczenia ludzkich chorób związanych ze zwiększoną zawartością kwasu deoksyrybonukleinowego w przestrzeniach pozakomórkowych i tkankach i preparat leczniczy do przeprowadzenia tego sposobu
US20090023138A1 (en) * 2007-07-17 2009-01-22 Zila Biotechnology, Inc. Oral cancer markers and their detection
WO2010028288A2 (fr) 2008-09-05 2010-03-11 Aueon, Inc. Procédés pour la stratification et l’annotation des options de traitement médicamenteux contre le cancer
WO2010048691A1 (fr) * 2008-10-28 2010-05-06 British Columbia Cancer Agency Branch Test de génotypage multiplex permettant la détection de mutations dans le gène k-ras
US20100317534A1 (en) * 2009-06-12 2010-12-16 Board Of Regents, The University Of Texas System Global germ line and tumor microsatellite patterns are cancer biomarkers
US20110177512A1 (en) * 2010-01-19 2011-07-21 Predictive Biosciences, Inc. Method for assuring amplification of an abnormal nucleic acid in a sample
US11326208B2 (en) 2010-05-18 2022-05-10 Natera, Inc. Methods for nested PCR amplification of cell-free DNA
US20190010543A1 (en) 2010-05-18 2019-01-10 Natera, Inc. Methods for simultaneous amplification of target loci
US11332793B2 (en) 2010-05-18 2022-05-17 Natera, Inc. Methods for simultaneous amplification of target loci
US12152275B2 (en) 2010-05-18 2024-11-26 Natera, Inc. Methods for non-invasive prenatal ploidy calling
US11939634B2 (en) 2010-05-18 2024-03-26 Natera, Inc. Methods for simultaneous amplification of target loci
US11332785B2 (en) 2010-05-18 2022-05-17 Natera, Inc. Methods for non-invasive prenatal ploidy calling
US12221653B2 (en) 2010-05-18 2025-02-11 Natera, Inc. Methods for simultaneous amplification of target loci
US11322224B2 (en) 2010-05-18 2022-05-03 Natera, Inc. Methods for non-invasive prenatal ploidy calling
US11339429B2 (en) 2010-05-18 2022-05-24 Natera, Inc. Methods for non-invasive prenatal ploidy calling
CA3207599A1 (fr) 2010-05-18 2011-11-24 Natera, Inc. Procedes de classification de ploidie prenatale non invasive
US11408031B2 (en) 2010-05-18 2022-08-09 Natera, Inc. Methods for non-invasive prenatal paternity testing
US9677118B2 (en) 2014-04-21 2017-06-13 Natera, Inc. Methods for simultaneous amplification of target loci
US10316362B2 (en) 2010-05-18 2019-06-11 Natera, Inc. Methods for simultaneous amplification of target loci
US10167508B2 (en) 2010-08-06 2019-01-01 Ariosa Diagnostics, Inc. Detection of genetic abnormalities
US20130261003A1 (en) 2010-08-06 2013-10-03 Ariosa Diagnostics, In. Ligation-based detection of genetic variants
US11031095B2 (en) 2010-08-06 2021-06-08 Ariosa Diagnostics, Inc. Assay systems for determination of fetal copy number variation
US11203786B2 (en) 2010-08-06 2021-12-21 Ariosa Diagnostics, Inc. Detection of target nucleic acids using hybridization
US10533223B2 (en) 2010-08-06 2020-01-14 Ariosa Diagnostics, Inc. Detection of target nucleic acids using hybridization
US20130040375A1 (en) 2011-08-08 2013-02-14 Tandem Diagnotics, Inc. Assay systems for genetic analysis
US8700338B2 (en) 2011-01-25 2014-04-15 Ariosa Diagnosis, Inc. Risk calculation for evaluation of fetal aneuploidy
US20140342940A1 (en) 2011-01-25 2014-11-20 Ariosa Diagnostics, Inc. Detection of Target Nucleic Acids using Hybridization
US20120034603A1 (en) 2010-08-06 2012-02-09 Tandem Diagnostics, Inc. Ligation-based detection of genetic variants
CA2810931C (fr) 2010-09-24 2018-04-17 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Capture directe, amplification et sequencage d'adn cible a l'aide d'amorces immobilisees
CN114678128A (zh) 2010-11-30 2022-06-28 香港中文大学 与癌症相关的遗传或分子畸变的检测
US8756020B2 (en) 2011-01-25 2014-06-17 Ariosa Diagnostics, Inc. Enhanced risk probabilities using biomolecule estimations
US9994897B2 (en) 2013-03-08 2018-06-12 Ariosa Diagnostics, Inc. Non-invasive fetal sex determination
US11270781B2 (en) 2011-01-25 2022-03-08 Ariosa Diagnostics, Inc. Statistical analysis for non-invasive sex chromosome aneuploidy determination
US10131947B2 (en) 2011-01-25 2018-11-20 Ariosa Diagnostics, Inc. Noninvasive detection of fetal aneuploidy in egg donor pregnancies
JP6153874B2 (ja) 2011-02-09 2017-06-28 ナテラ， インコーポレイテッド 非侵襲的出生前倍数性呼び出しのための方法
US9260753B2 (en) 2011-03-24 2016-02-16 President And Fellows Of Harvard College Single cell nucleic acid detection and analysis
US20140194310A1 (en) 2011-05-24 2014-07-10 Daniel H. Geschwind Genes dysregulated in autism as biomarkers and targets for therapeutic pathways
US8712697B2 (en) 2011-09-07 2014-04-29 Ariosa Diagnostics, Inc. Determination of copy number variations using binomial probability calculations
US10289800B2 (en) 2012-05-21 2019-05-14 Ariosa Diagnostics, Inc. Processes for calculating phased fetal genomic sequences
AU2013292287A1 (en) 2012-07-19 2015-02-19 Ariosa Diagnostics, Inc. Multiplexed sequential ligation-based detection of genetic variants
US20140100126A1 (en) 2012-08-17 2014-04-10 Natera, Inc. Method for Non-Invasive Prenatal Testing Using Parental Mosaicism Data
US20160040229A1 (en) 2013-08-16 2016-02-11 Guardant Health, Inc. Systems and methods to detect rare mutations and copy number variation
US10876152B2 (en) 2012-09-04 2020-12-29 Guardant Health, Inc. Systems and methods to detect rare mutations and copy number variation
JP6275145B2 (ja) 2012-09-04 2018-02-07 ガーダント ヘルス， インコーポレイテッド まれな変異およびコピー数多型を検出するためのシステムおよび方法
US11913065B2 (en) 2012-09-04 2024-02-27 Guardent Health, Inc. Systems and methods to detect rare mutations and copy number variation
US10351899B2 (en) 2013-09-25 2019-07-16 Bio-ID Diagnostics Inc. Methods for detecting nucleic acid fragments
JP6571665B2 (ja) 2013-12-28 2019-09-04 ガーダント ヘルス， インコーポレイテッド 遺伝的バリアントを検出するための方法およびシステム
CA2945962C (fr) 2014-04-21 2023-08-29 Natera, Inc. Detection de mutations et de la ploidie dans des segments chromosomiques
US20180173846A1 (en) 2014-06-05 2018-06-21 Natera, Inc. Systems and Methods for Detection of Aneuploidy
US10617743B2 (en) 2014-06-19 2020-04-14 Cls Therapeutics Limited Method to improve safety and efficacy of anti-cancer therapy
EP3209797B1 (fr) 2014-10-20 2018-12-05 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Procédés de criblage d'un sujet atteint d'un cancer
CN104830981A (zh) * 2015-04-29 2015-08-12 广州和实生物技术有限公司 Kras基因多点突变单管快速检测方法及试剂盒
EP4428863A3 (fr) 2015-05-11 2024-12-11 Natera, Inc. Procédés et compositions pour déterminer la ploïdie
JP6745873B2 (ja) 2015-05-22 2020-08-26 ドミトリエヴィッチ ゲンキン，ドミトリー 神経変性における治療標的としての細胞外ｄｎａ
US11302416B2 (en) 2015-09-02 2022-04-12 Guardant Health Machine learning for somatic single nucleotide variant detection in cell-free tumor nucleic acid sequencing applications
CN108603228B (zh) 2015-12-17 2023-09-01 夸登特健康公司 通过分析无细胞dna确定肿瘤基因拷贝数的方法
US12146195B2 (en) 2016-04-15 2024-11-19 Natera, Inc. Methods for lung cancer detection
US9850523B1 (en) 2016-09-30 2017-12-26 Guardant Health, Inc. Methods for multi-resolution analysis of cell-free nucleic acids
CA3126055A1 (fr) 2016-09-30 2018-04-05 Guardant Health, Inc. Procedes d'analyse multiresolution d'acides nucleiques acellulaires
WO2018067517A1 (fr) 2016-10-04 2018-04-12 Natera, Inc. Procédés pour caractériser une variation de nombre de copies à l'aide d'un séquençage de ligature de proximité
US10011870B2 (en) 2016-12-07 2018-07-03 Natera, Inc. Compositions and methods for identifying nucleic acid molecules
US10907211B1 (en) 2017-02-16 2021-02-02 Quantgene Inc. Methods and compositions for detecting cancer biomarkers in bodily fluids
US12084720B2 (en) 2017-12-14 2024-09-10 Natera, Inc. Assessing graft suitability for transplantation
US11905522B2 (en) 2018-01-16 2024-02-20 Cls Therapeutics Limited Treatment of diseases by liver expression of an enzyme which has a deoxyribonuclease (DNase) activity
AU2019251504A1 (en) 2018-04-14 2020-08-13 Natera, Inc. Methods for cancer detection and monitoring by means of personalized detection of circulating tumor DNA
US12234509B2 (en) 2018-07-03 2025-02-25 Natera, Inc. Methods for detection of donor-derived cell-free DNA
CN113661249A (zh) 2019-01-31 2021-11-16 夸登特健康公司 用于分离无细胞dna的组合物和方法

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4871838A (en) * 1985-07-23 1989-10-03 The Board Of Rijks Universiteit Leiden Probes and methods for detecting activated ras oncogenes
WO1993022456A1 (fr) * 1992-04-27 1993-11-11 Trustees Of Dartmouth College Detection de sequences geniques dans des liquides biologiques

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE69032209T2 (de) * 1990-01-04 1998-12-03 The Johns Hopkins University, Baltimore, Md. In menschlichen kolorektalkarzinomen fehlendes gen
CA2156920A1 (fr) * 1993-02-24 1994-09-01 Stephen N. Thibodeau Instabilite genomique specifique a la tumeur, indicateur de pronostique
US7326778B1 (en) * 1993-05-05 2008-02-05 The John Hopkins University Mutator gene and hereditary non-polyposis colorectal cancer
US5702886A (en) * 1994-10-05 1997-12-30 The Johns Hopkins University Chromosome I8Q loss and prognosis in colorectal cancer

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4871838A (en) * 1985-07-23 1989-10-03 The Board Of Rijks Universiteit Leiden Probes and methods for detecting activated ras oncogenes
WO1993022456A1 (fr) * 1992-04-27 1993-11-11 Trustees Of Dartmouth College Detection de sequences geniques dans des liquides biologiques

Cited By (46)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5741650A (en) * 1996-01-30 1998-04-21 Exact Laboratories, Inc. Methods for detecting colon cancer from stool samples
US6511805B1 (en) 1996-03-15 2003-01-28 The Penn State Research Foundation Methods for detecting papillomavirus DNA in blood plasma and serum
US8361726B2 (en) 1996-03-15 2013-01-29 The Penn State Research Foundation Method of detecting tumor-associated DNA in plasma or serum with a premalignant solid tumor
US7569350B2 (en) 1996-03-15 2009-08-04 The Penn State University Methods for selecting cancer vaccine therapies using extracellular DNA
US7569349B2 (en) 1996-03-15 2009-08-04 The Penn State University Methods for selecting monoclonal antibody therapies using extracellular DNA
USRE41327E1 (en) 1996-03-15 2010-05-11 The Penn State Research Foundation Detection of extracellular tumor-associated nucleic acid in blood plasma or serum using nucleic acid amplification assays
US7410764B2 (en) 1996-03-15 2008-08-12 The Penn State Research Foundation Detection of extracellular tumor-associated nucleic acid in blood plasma or serum using nucleic acid amplification assays
US7387874B2 (en) 1996-03-15 2008-06-17 The Penn State Research Foundation Detection of extracellular tumor-associated nucleic acid in blood plasma or serum using nucleic acid amplification assay
US7790395B2 (en) 1996-03-15 2010-09-07 The Penn State Research Foundation Evaluation of diseases and conditions associated with translocated genes using plasma or serum DNA
US6156504A (en) * 1996-03-15 2000-12-05 The Penn State Research Foundation Detection of extracellular tumor-associated nucleic acid in blood plasma or serum using nucleic acid amplification assays
US8048629B2 (en) 1996-03-15 2011-11-01 The Penn State Research Foundation Detection of extracellular tumor-associated nucleic acid in blood plasma or serum
US7288380B1 (en) 1996-03-15 2007-10-30 The Pennsylvania State University Detection of extracellular translocated tumor-associated nucleic acid in blood plasma or serum using nucleic acid amplification assays
US6521409B1 (en) 1996-03-15 2003-02-18 The Penn State Research Foundation Detection of extracellular tumor-associated nucleic acid in blood plasma or serum using nucleic acid amplification assays
US7935487B2 (en) 1996-03-15 2011-05-03 The Penn State Research Foundation Method of detecting tumor-associated DNA in plasma or serum from humans without cancer
US7935484B2 (en) 1996-03-15 2011-05-03 The Penn State Research Foundation Detection of extracellular tumor-associated nucleic acid in blood plasma or serum using nucleic acid amplification assay
US7208275B2 (en) 1996-03-15 2007-04-24 The Penn State Research Foundation Detection of extracellular tumor-associated nucleic acid in blood plasma or serum using nucleic acid amplification assays
EP0929694A4 (fr) * 1996-03-15 2002-05-02 Penn State Res Found Detection d'acide nucleique extracellulaire lie a des tumeurs dans le plasma ou le serum sanguin a l'aide d'essais d'amplification d'acide nucleique
US7183053B2 (en) 1996-03-15 2007-02-27 The Penn State Research Foundation Methods for detecting papillomavirus DNA in blood plasma and serum
US6939675B2 (en) 1996-03-15 2005-09-06 The Penn State Research Foundation Detection of extracellular tumor-associated nucleic acid in blood plasma or serum using nucleic acid amplification assays
US7282335B2 (en) 1996-03-15 2007-10-16 The Pennsylvania State University Detection of extracellular tumor-associated nucleic acid in blood plasma or serum using nucleic acid amplification assays
US6203993B1 (en) 1996-08-14 2001-03-20 Exact Science Corp. Methods for the detection of nucleic acids
US6300077B1 (en) 1996-08-14 2001-10-09 Exact Sciences Corporation Methods for the detection of nucleic acids
US5952178A (en) * 1996-08-14 1999-09-14 Exact Laboratories Methods for disease diagnosis from stool samples
US6020137A (en) * 1996-08-14 2000-02-01 Exact Laboratories, Inc. Methods for the detection of loss of heterozygosity
US6100029A (en) * 1996-08-14 2000-08-08 Exact Laboratories, Inc. Methods for the detection of chromosomal aberrations
US6146828A (en) * 1996-08-14 2000-11-14 Exact Laboratories, Inc. Methods for detecting differences in RNA expression levels and uses therefor
US5670325A (en) * 1996-08-14 1997-09-23 Exact Laboratories, Inc. Method for the detection of clonal populations of transformed cells in a genomically heterogeneous cellular sample
US6303304B1 (en) 1996-08-14 2001-10-16 Exact Laboratories, Inc. Methods for disease diagnosis from stool samples
US6291163B1 (en) * 1996-08-28 2001-09-18 The Johns Hopkins University School Of Medicine Method for detecting cell proliferative disorders
US6780592B2 (en) 1996-08-28 2004-08-24 Johns Hopkins University School Of Medicine Method for detecting cell proliferative disorders
US6630301B1 (en) 1997-03-14 2003-10-07 The Penn State Research Foundation Detection of extracellular tumor-associated nucleic acid in blood plasma or serum
US5928870A (en) * 1997-06-16 1999-07-27 Exact Laboratories, Inc. Methods for the detection of loss of heterozygosity
DE19736691A1 (de) * 1997-08-22 1999-02-25 Michael Prof Dr Med Giesing Verfahren zur Charakterisierung und Identifizierung disseminierter und metastasierter Krebszellen
WO1999010528A1 (fr) * 1997-08-22 1999-03-04 Michael Giesing Procede permettant de caracteriser des cellules cancereuses disseminees et micrometastasees
US6964846B1 (en) 1999-04-09 2005-11-15 Exact Sciences Corporation Methods for detecting nucleic acids indicative of cancer
WO2000066783A3 (fr) * 1999-05-04 2002-01-03 Ortho Clinical Diagnostics Inc Capture rapide et efficace d'adn dans un prelevement sans recours a un reactif de lyse cellulaire
US7615346B2 (en) 1999-05-04 2009-11-10 Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. Rapid and efficient capture of DNA from sample without using cell lysing reagent
US6280947B1 (en) 1999-08-11 2001-08-28 Exact Sciences Corporation Methods for detecting nucleotide insertion or deletion using primer extension
US7368233B2 (en) 1999-12-07 2008-05-06 Exact Sciences Corporation Methods of screening for lung neoplasm based on stool samples containing a nucleic acid marker indicative of a neoplasm
US6919174B1 (en) 1999-12-07 2005-07-19 Exact Sciences Corporation Methods for disease detection
WO2001042504A3 (fr) * 1999-12-07 2002-08-29 Penn State Res Found Detection d'acide nucleique extracellulaire associe aux tumeurs dans le plasma et le serum sanguins
US7262006B1 (en) 2000-05-01 2007-08-28 Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. Rapid and efficient capture of DNA from sample without using cell lysing reagent
US7252946B2 (en) 2004-01-27 2007-08-07 Zoragen, Inc. Nucleic acid detection
US9109256B2 (en) 2004-10-27 2015-08-18 Esoterix Genetic Laboratories, Llc Method for monitoring disease progression or recurrence
US9777314B2 (en) 2005-04-21 2017-10-03 Esoterix Genetic Laboratories, Llc Analysis of heterogeneous nucleic acid samples
WO2009021149A1 (fr) * 2007-08-07 2009-02-12 The Penn State Research Foundation Détection d'acides nucléiques extracellulaires associés à une tumeur dans le plasma ou le sérum sanguin

Also Published As

Publication number Publication date
GB2299166B (en) 1998-04-15
AU1075695A (en) 1995-07-03
CH686982A5 (fr) 1996-08-15
US5952170A (en) 1999-09-14
GB9612528D0 (en) 1996-08-14
GB2299166A (en) 1996-09-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
WO1995016792A1 (fr) Methode pour le diagnostic de cancers
JP6032616B2 (ja) Ｋｉｆ５ｂ遺伝子とｒｅｔ遺伝子との融合遺伝子、並びに該融合遺伝子を標的としたがん治療の有効性を判定する方法
WO2002083866A2 (fr) Sequences repetees du gene ca125 et leurs utilisations dans des interventions diagnostiques et therapeutiques
Jour et al. GNAS mutations in fibrous dysplasia: a comparative study of standard sequencing and locked nucleic acid PCR sequencing on decalcified and nondecalcified formalin-fixed paraffin-embedded tissues
JP2015522277A (ja) 前立腺癌の診断方法と診断用物質
KR102754525B1 (ko) 대장암 세포에서 표적 단백질에 의해 과발현되는 탈유비퀴틴화 효소의 검출을 위한 다중 중합효소 연쇄 반응용 프라이머 세트
WO1992015602A1 (fr) Diagnostic et therapie du cancer
US7309760B2 (en) Repeat sequences of the CA125 gene and their use for diagnostic and therapeutic interventions
EP3346014B1 (fr) Procédé de détection de lésion buccale précancéreuse
KR101233071B1 (ko) 남성 대상자의 전립선암 또는 췌장암 진단을 위한 분석방법 및 이를 위한 진단용 키트
Pawlowska et al. The Cys326 allele of the 8-oxoguanine DNA N-glycosylase 1 gene as a risk factor in smoking-and drinking-associated larynx cancer
Takeuchi et al. A ubiquitin ligase, skeletrophin, is a negative regulator of melanoma invasion
Mori et al. Microsatellite instability in transforming growth factor-β 1 type II receptor gene in alveolar lining epithelial cells of idiopathic pulmonary fibrosis
US7833757B2 (en) Method for conducting non-invasive early detection of colon cancer and/or of colon cancer precursor cells
CN105238872B (zh) 检测caln1基因表达的产品在胆管癌诊治中的应用
FR2954352A1 (fr) Marqueur de predisposition a un cancer
KR20130011348A (ko) 프로모터 메틸화 검출을 위한 프라이머 및 이를 이용한 암 진단 키트
Baus-Domínguez et al. Detection of NOTCH1 mutations in paraffin samples in patients with potentially malignant lesions
Liang et al. Detection of serum aberrant CDKN2/P16 DNA in colorectal cancer
De Preter Katleen et al. Expression profiling of foetal adrenal neuroblasts: a resource for the study of sympathoadrenal biogenesis and neuroblastoma pathogenesis
JPH09265A (ja) 新規ヒトｓｍａｌｌ ＴＩＭＰ２遺伝子

Legal Events

Date Code Title Description
AK Designated states

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): AM AT AU BB BG BR BY CA CH CN CZ DE DK EE ES FI GB GE HU JP KE KG KP KR KZ LK LT LU LV MD MG MN MW NL NO NZ PL PT RO RU SD SE SI SK TJ TT UA US UZ VN

AL Designated countries for regional patents

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): KE MW SD SZ AT BE CH DE DK ES FR GB GR IE IT LU MC NL PT SE BF BJ CF CG CI CM GA GN ML MR NE SN TD TG

DFPE Request for preliminary examination filed prior to expiration of 19th month from priority date (pct application filed before 20040101)
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application
WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 9612528.1

Country of ref document: GB

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 08663230

Country of ref document: US

REG Reference to national code

Ref country code: DE

Ref legal event code: 8642

122 Ep: pct application non-entry in european phase
NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: CA

点击 这是indexloc提供的php浏览器服务，不要输入任何密码和下载