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ES2337999T3 - Esfeniscinas y peptidos analogos antimicrobianos para la conservacion de los alimentos. - Google Patents

Esfeniscinas y peptidos analogos antimicrobianos para la conservacion de los alimentos. Download PDF

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ES2337999T3
ES2337999T3 ES03761672T ES03761672T ES2337999T3 ES 2337999 T3 ES2337999 T3 ES 2337999T3 ES 03761672 T ES03761672 T ES 03761672T ES 03761672 T ES03761672 T ES 03761672T ES 2337999 T3 ES2337999 T3 ES 2337999T3
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Philippe Bulet
Cecile Thouzeau
Yvon Le Maho
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Abstract

Péptido o un análogo de esfeniscina que presenta una actividad antimicrobiana y que comprende tres enlaces intramoleculares, y que responde a la fórmula (II) siguiente: **(Ver fórmula)** En la que: - Xaa responde a la fórmula siguiente: -Xaa1-Xaa2-(SEQ ID NO.2), en la que Xaa1 representa un grupo -NH2 o un resto peptídico de 1 a 13 aminoácidos, y Xaa2 es Ser-Phe-Gly-Leu; - Xab responde a la fórmula siguiente: -Xab1-Xab2-Xab3-Xab4-Xab5- (SEQ ID NO.3), y Xab3 representa un resto peptídico que responde a la fórmula siguiente: -Xab3.1-Xab3.2-(SEQ ID NO.4), - Xac responde a la fórmula siguiente: -Xac1-Xac2-Xac3-Xac4- (SEQ ID NO.5), en la que Xac2 es His o Arg - Xad con la secuencia siguiente: -Xad1-Xad2-Xad3-xad4-xad5-xad6-Xad7-Xad8-Xad9- (SEQ ID NO.6), en la que Xad2 es Pro o Phe y Xad3 es Pro - Xae responde a la secuencia siguiente: -Xae1-Xae2-Xae3-Xae4-Xae5- (SEQ ID NO.7), en la que Xae2 es Gln o Arg y Xae5 es Gln; - Xaf responde a la secuencia siguiente: -Xaf1-Xaf2-Xaf3-Xaf4- (SEQ ID NO.8) y Xaf2 y/o Xaf3 es Val; y - Ca1, Ca2, Ca3, Ca4, Ca5 y Ca6, son aminoácidos azufrados.

Description

Esfeniscinas y péptidos análogos antimicrobianos para la conservación de los alimentos.
La presente invención se refiere al campo de la conservación de los alimentos y de la lucha contra las infecciones microbianas, bacterianas y/o fúngicas en el ser humano, el animal o las plantas. Está dirigida a péptidos antimicrobianos que poseen una estructura de beta-defensina, en particular las esfeniscinas y sus análogos, así como a las composiciones que las contienen para prevenir y/o tratar las infecciones por agentes patógenos como los microbios, las bacterias y los hongos así como para la conservación de los alimentos.
Se ha publicado en la técnica anterior que el macho de Pingüino Real es capaz, durante su estancia en tierra para asegurar la última parte de la incubación, de guardar el alimento en su estómago durante más de dos semanas (Gauthier-Clerc et al., 2000). Él mismo ayuna y vive de sus reservas corporales.
No existe actualmente una situación similar conocida de almacenamiento de alimento durante varias semanas en un vertebrado superior. El estado de conservación de este alimento es notable, no modificándose su masa ni su valor energético (Gauthier-Clerc et al., 2002). Estas observaciones sobre el estado de conservación del alimento sugieren fuertemente un control de la flora bacteriana presente en el contenido estomacal. Este control de la flora bacteriana permitiría reducir las degradaciones de la alimentación almacenada. Este control podría hacerse a través de la producción de sustancias con actividad antimicrobiana.
En efecto, la bibliografía relata la existencia de sustancias con actividad antimicrobiana en el tracto gastro-intestinal de los Vertebrados. Una gran parte de estas sustancias tienen naturaleza peptídica, principalmente magaininas, brevininas y buforinas en los anfibios (Moore et al., 1991; Minn et al., 1998; Wang et al., 1998), lactoferricinas y defensinas (\alpha, \beta) en los mamíferos, entre ellos el ser humano (Jones & Bevins, 1992; Zhao et al., 1999; O'Neil et al., 2000). En las aves, las defensinas se han encontrado en otras partes del tracto digestivo, principalmente la lengua, el esófago y el intestino (Zhao et al. 2001). Además, numerosos péptidos antimicrobianos están igualmente presentes en el epitelio de superficie (para revisión véase Schröder 1999).
Los inventores han puesto de manifiesto ahora la presencia de péptidos antimicrobianos en el contenido estomacal de los Pingüinos Reales y han mostrado la implicación de estos péptidos con actividad antimicrobiana en el fenómeno de conservación del bolo alimenticio durante el ayuno de incubación en el macho de Pingüino Real. Estos trabajos de investigación han permitido definir nuevos péptidos que se designarán de aquí en adelante "esfeniscinas" según la familia de las Esfeniscidas a la que pertenece el Pingüino Real.
La invención tiene por lo tanto por objeto un péptido o un análogo de esfeniscina que presenta una actividad anti-bacteriana y que comprende tres enlaces intra-moleculares, y que responde a la fórmula (II) siguiente:
1
En la que:
\bullet Xaa responde a la fórmula siguiente: -Xaa1-Xaa2-(SEQ ID NO.2), en la que Xaa1 representa un grupo -NH_{2} o un resto peptídico de 1 a 13 aminoácidos, y Xaa2 es Ser-Phe-Gly-Leu;
\bullet Xab responde a la fórmula siguiente: -Xab1-Xab2-Xab3-Xab4-Xab5- (SEQ ID NO.3), y Xab3 representa un resto peptídico que responde a la fórmula siguiente: -Xab3.1-Xab3.2-(SEQ ID NO.4),
\bullet Xac responde a la fórmula siguiente: -Xac1-Xac2-Xac3-Xac4- (SEQ ID NO.5), en la que Xac2 es His o Arg
\bullet Xad con la secuencia siguiente: -Xad1-Xad2-Xad3-xad4-xad5-xad6-Xad7-Xad8-Xad9- (SEQ ID NO.6), en la que Xad2 es Pro o Phe y Xad3 es Pro;
\bullet Xae responde a la secuencia siguiente: -Xae1-Xae2-Xae3-Xae4-Xae5- (SEQ ID NO.7), en la que Xae2 es Gln o Arg y Xae5 es Gln;
\bullet Xaf responde a la secuencia siguiente: -Xaf1-Xaf2-Xaf3-Xaf4- (SEQ ID NO.8) y Xaf2 y/o Xaf3 es Val; y - Cal, Ca2, Ca3, Ca4, Ca5 y Ca6, son aminoácidos azufrados.
\bullet Xab representa un resto peptídico de 6 aminoácidos Xab responde a la fórmula siguiente: -Xab1-Xab2-Xab3-Xab4-Xab5- (SEQ ID NO.3), en la que estos Xab1, Xab2, Xab4 y Xab5 presentes, idénticos o diferentes, se eligen del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares cargados negativamente, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos hidrófobos o apolares, y Xab3 representa un resto peptídico que responde a la fórmula siguiente: -Xab3.1-Xab3.2-(SEQ ID NO.4), en la que estos Xab3.1 y Xab3.2 presentes, idénticos o diferentes, se eligen del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares cargados negativamente, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos hidrófobos o apolares;
\bullet Xac representa un resto peptídico que comprende 4 aminoácidos Xac responde a la fórmula siguiente: -Xac1-Xac2-Xac3-Xac4- (SEQ ID NO.5), en la que estos Xac1, Xac3 y Xac4 presentes, idénticos o diferentes, se eligen del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares y aminoácidos polares grandes no cargados y Xac_{2} es His o Arg
\bullet Xad representa un resto peptídico que comprende 9 aminoácidos, Xad responde a la secuencia siguiente: -Xad1-Xad2-Xad3-Xad4-Xad5-Xad6-Xad7-Xad8-Xad9- (SEQ ID NO.6), en la que estos Xad1, Xad4, Xad5, Xad6, Xad7, Xad8 y Xad9 presentes, idénticos o diferentes, se eligen del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente; en la que Xad_{2} es Pro o Phe y Xad_{3} es Pro
\bullet Xae representa un resto peptídico que comprende 5 aminoácidos, ventajosamente Xae responde a la secuencia siguiente: -Xae1-Xae2-Xae3-Xae4-Xae5- (SEQ ID NO.7), en la que estos Xae1, Xae3, Xae4 y presentes, idénticos o diferentes, se eligen del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente; en la que Xac2 es Gln o Arg y Xaes es Gln,
\bullet Xaf representa un resto peptídico de 4 aminoácidos, ventajosamente Xaf responde a la secuencia siguiente: -Xaf1-Xaf2-Xaf3-Xaf4- (SEQ ID NO.8), en la que estos Xaf1, y Xaf4 presentes, idénticos o diferentes, se eligen del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente; y Xaf2 y/o Xaf3 es Val
\bullet Ca1, Ca2, Ca3, Ca4, Ca5 y Ca6, idénticos o diferentes, Ca1, Ca2, Ca3, Ca4, Ca5 y Ca6 son aminoácidos azufrados y preferentemente cisteínas.
\bullet Ca1 y -Ca5 están unidos por covalencia. Preferentemente:- Xab1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xab1 es un aminoácido básico y muy preferentemente arginina (Arg).
\bullet Xab2 se elige del grupo que comprende aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos básicos, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xab2 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente leucina (Leu).
\bullet Xab3.2 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados y aminoácidos hidrófobos o apolares y muy preferentemente arginina (Arg).
\bullet Xab4 se elige del grupo que comprende aminoácidos hidrófobos o apolares, y muy preferentemente Xab4 es glicina (Gly).
\bullet rabs se elige del grupo que comprende aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, aminoácidos básicos, aminoácidos polares cargados negativamente, aminoácidos polares pequeños no cargados, preferentemente Xab5 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente fenilalanina (Phe).
\bullet Ca2 y Ca4 están unidos por covalencia.
\bullet Xac1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xac1 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente alanina (Ala).
\bullet Xac2 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xac2 es un aminoácido básico y muy preferentemente arginina (Arg) o histidina (His).
\bullet Xac3 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xac3 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente glicina (Gly).
\bullet Xac4 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares pequeños no cargados, preferentemente Xac4 es un aminoácido básico y muy preferentemente arginina (Arg).
\bullet Ca3 y Ca6 están unidos por covalencia.
\bullet Xad1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xad1 es un aminoácido básico y muy preferentemente arginina (Arg).
\bullet Xad2 se elige del grupo que comprende aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos básicos, preferentemente Xad2 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente fenilalanina (Phe).
\bullet Xad3 se elige del grupo que comprende aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos básicos, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente un aminoácido hidrófobo o apolar, preferentemente Xad3 es prolina o hidroxiprolina y muy preferentemente prolina (Pro).
\bullet Xad4 se elige del grupo que comprende aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos básicos, aminoácidos polares grandes no cargados, aminoácidos polares cargados negativamente, preferentemente Xad4 es un aminoácido polar pequeño no cargado y muy preferentemente serina (Ser).
\bullet Xad5 se elige del grupo que comprende aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos básicos, aminoácidos polares cargados negativamente, preferentemente Xad5 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente isoleucina (Ile).
\bullet Xad6 se elige del grupo que comprende aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos básicos, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente un aminoácido hidrófobo o apolar, preferentemente Xad6 es prolina o hidroxiprolina y muy preferentemente prolina (Pro).
\bullet Xad7 se elige del grupo que comprende aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xad7 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente isoleucina (Ile).
\bullet Xad8 se elige del grupo que comprende aminoácidos hidrófobos o apolares, muy preferentemente Xad8 es glicina (Gly).
\bullet Xad9 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares grandes no cargados, aminoácidos polares pequeños no cargados, preferentemente Xad9 es un aminoácido básico y muy preferentemente arginina (Arg).
\bullet Xae1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, aminoácidos polares pequeños no cargados, preferentemente Xae1 es un aminoácido polar pequeño no cargado y muy preferentemente serina (Ser).
\bullet Xae2 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, aminoácidos polares pequeños no cargados, preferentemente Xae2 es un aminoácido básico y muy preferentemente arginina (Arg).
\bullet Xae3 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos polares cargados negativamente, preferentemente un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente fenilalanina (Phe).
\bullet Xae4 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, aminoácidos polares pequeños no cargados, preferentemente Xae4 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente valina (Val).
\bullet Xae5 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, aminoácidos polares pequeños no cargados, preferentemente Xae5 es un aminoácido polar grande no cargado y muy preferentemente glutamina (Gln).
\bullet Xaf1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, preferentemente Xaf1 es un aminoácido básico y muy preferentemente ariginina (Arg).
\bullet Xaf2 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares pequeños no cargados, preferentemente Xaf2 es un aminoácido básico y muy preferentemente arginina (Arg).
\bullet Xaf3 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xaf3 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente valina (Val).
\bullet Xaf4 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, preferentemente Xaf4 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente triptófano (Trp).
\newpage
Se entiende muy especialmente por:
\bullet aminoácidos básicos, lisina (Lys), arginina (Arg), histidina (His) u homoarginina;
\bullet aminoácidos polares cargados negativamente, ácido aspártico (Asp) o aspartato y ácido glutámico (Glu) o glutamato;
\bullet aminoácidos polares pequeños no cargados, serina (Ser) o treonina (Thr),
\bullet aminoácidos polares grandes no cargados, asparagina (Asn), glutamina (Gln) o metionina (Met),
\bullet aminoácidos hidrófobos o apolares, isoleucina (Ile), leucina (Leu), fenilalanina (Phe), triptófano (Trp), tirosina (Tyr), valina (Val), alanina (Ala), glicina (Gly), prolina (Pro) o hidroxiprolina.
\vskip1.000000\baselineskip
La invención se refiere específicamente a un péptido o un análogo de esfeniscina que presenta una actividad antimicrobiana y que comprende tres enlaces intra-moleculares, y que responde a la fórmula (II) siguiente:
\vskip1.000000\baselineskip
2
\vskip1.000000\baselineskip
en la que:
Xaa es Ser-Phe-Gly-Leu,
Xab es Arg-Leu-Arg-Arg-Gly-Phe,
Xac es Ala-Xac2 -Gly-Arg,
Xad es Arg-Phe-Pro-Ser-Ile-Pro-Ile-Gly-Arg,
Xae es Ser-Arg-Phe-Val-Gln,
Xaf es Arg-Arg-Val-Trp, y
xac2 es His o Arg.
de fórmula (II) siguiente:
\vskip1.000000\baselineskip
A título de ejemplo particular de péptidos de fórmula (II) se puede citar:
\bullet la esfeniscina-1 cuya secuencia primaria es la siguiente:
SFGLCRLRRGFCAHGRCRFPSIPIGRCSRFVQCCRRVW
(SEQ ID NO. 14)
\vskip1.000000\baselineskip
\bullet la esfeniscina-2 cuya secuencia primaria es la siguiente:
SFGLCRLRRGFCARGRCRFPSTPIGRCSRFVQCCRRVW
(SEQ ID NO. 15)
\newpage
Los aminoácidos se representan generalmente por su código de una letra, pero también pueden representarse por su código de tres letras según la nomenclatura siguiente:
\vskip1.000000\baselineskip
3
\vskip1.000000\baselineskip
Los péptidos de la invención pueden presentar a nivel de determinados aminoácidos modificaciones posteriores a la traducción naturales o químicas, por ejemplo, el resto NH-terminal puede presentar por ejemplo una acilación, o el resto C-terminal puede presentar una modificación posterior a la traducción o química, por ejemplo una amidación, una oxidación o una esterificación. La invención también se refiere por lo tanto a derivados de los péptidos de fórmulas (II), como aquellos en los que uno o varios aminoácidos son aminoácidos de conformación D, la invención abarca igualmente los retro-péptidos y los retro-inverso-péptidos, ya que conservan la actividad antimicrobiana.
La invención también tiene por objeto la utilización de dichos péptidos en el campo agroalimentario para proteger los alimentos contra los microbios (bacterias y hongos).
La invención también tiene por objeto la utilización de dichos péptidos en el ser humano, el animal o las plantas para prevenir y/o tratar una infección microbiana, bacteriana y/o fúngica.
La presente invención se refiere por lo tanto a una composición farmacéutica agronómica o agroalimentaria que comprende como agente activo al menos un péptido de la invención tal como se ha definido anteriormente, ventajosamente asociado en dicha composición con uno o varios vehículos, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptables.
Los vehículos, diluyentes y excipientes se eligen en función del tipo de aplicación de la composición a título farmacéutico, agronómico o agroalimentario.
Así, la invención también tiene por objeto la utilización de un péptido de la invención tal como se ha definido anteriormente para la preparación de una composición farmacéutica, agronómica o agroalimentaria antibacteriana, antibacteriana y/o antifúngica.
Las composiciones de la invención son útiles tanto a título preventivo como curativo.
Para la utilización relativa a la conservación de los alimentos, los péptidos de la invención y las composiciones que los contienen pueden presentarse en la forma de polvo o de gránulos. Pueden estar fijados a soportes que contienen los alimentos, o incorporarse directamente en los alimentos principalmente en forma de microorganismos, como las levaduras, que producen dichos péptidos.
La administración de la composición farmacéutica según la invención puede realizarse por uno cualquiera de los modos de administración aceptables para los agentes terapéuticos, agronómicos o agroalimentarios. A título farmacéutico, en el ser humano o el animal, se puede citar la administración sistémica, tópica o incluso central. La administración oral puede hacerse mediante comprimidos, cápsulas duras, cápsulas blandas, incluyendo las formulaciones de liberación diferida o prolongada, píldoras, polvos, gránulos, elixires, tinturas, suspensiones, jarabes y emulsiones. La administración parenteral de compuestos antibacterianos y/o antifúngicos se hace generalmente por inyección intramuscular o intravenosa por perfusión. Las composiciones inyectables pueden prepararse en formas clásicas, bien en suspensión o disolución líquida bien en forma sólida que conviene para una disolución extemporánea en un líquido adecuado, incluyendo las formulaciones de liberación diferida o prolongada como la inclusión de los péptidos en micropartículas biodegradables de formulación lipídica, como los liposomas. Otras preparaciones tópicas habituales comprenden cremas, ungüentos, lociones, geles y los pulverizadores en aerosol.
La utilización de los péptidos a título esencialmente preventivo consiste en incluir dichos péptidos en productos de higiene, apósitos, o incluso lechos para animales.
En función del modo de administración, los compuestos pueden estar en forma sólida, semi-sólida o líquida.
Para las composiciones sólidas, tales como comprimidos, píldoras, polvos o gránulos en estado libre o incluidos en cápsulas, o micropartículas biodegradables de formulación lipídica, como los liposomas, el principio activo puede combinarse con diluyentes, lubricantes, aglutinantes, absorbentes, colorantes, aromatizantes y edulcorantes.
Las composiciones según la invención pueden contener igualmente otras sustancias que presentan un interés terapéutico.
Los péptidos de la invención pueden administrarse en forma de dosis diarias únicas, o la posología diaria total puede administrarse en dos, tres o cuatro dosis por día.
La invención pretende no solamente los péptidos descritos anteriormente sino igualmente la utilización de las secuencias polinucleotídicas que codifican estos péptidos para transformar anfitriones, y principalmente células animales, vegetales o procariotas. Estas secuencias se utilizan según técnicas de ingeniería genética descritas en la bibliografía.
Consecuentemente, la invención tiene igualmente por objeto un polinucleótido que codifica un péptido descrito anteriormente, una molécula de ácido nucleico, ADN o ARN, como un vector, que comprende dicho polinucleótido, y un anfitrión, por ejemplo una célula animal o vegetal o también un procariota que comprende dicha molécula de ácido nucleico, así como las composiciones principalmente farmacéuticas que los contienen.
La invención se interesa también por las aplicaciones agronómicas de los péptidos descritos anteriormente para obtener plantas resistentes a las bacterias y hongos fito-patógenos y reducir así la utilización de plaguicidas químicos tóxicos para el medio ambiente. La aplicación directa sobre la planta de una cantidad eficaz de péptidos antibacterianos y/o antifúngicos o de una composición que los contiene representa una primera forma de emplear la aplicación agronómica. Una segunda forma de emplear esta aplicación está basada en técnicas de transgénesis que consisten en incorporar de forma estable en el ADN de una célula vegetal, una secuencia polinucleotídica que codifica uno o varios péptidos anteriores. Las células vegetales así transformadas permiten regenerar una planta que transmite el carácter de resistencia a las infecciones bacterianas y/o fúngicas a su descendencia. A título de ejemplos de plantas, se pueden citar arroz, maíz, colza, remolacha, trigo, tabaco, tomate, patata, etc.
Otras ventajas y características de la invención aparecerán a partir de los ejemplos siguientes que se refieren a la puesta de manifiesto, aislamiento y caracterización de péptidos antimicrobianos a partir de muestras de contenido estomacal de machos de Pingüinos Reales así como la forma sintética de la esfeniscina-2, su espectro de actividad antimicrobiana y el estudio del efecto del pH sobre su funcionalidad, y en los que se hará referencia a los dibujos y tablas adjuntos en los que
\bullet La figura 1 representa la evolución del pH gástrico y de la temperatura estomacal en dos Pingüinos Reales machos durante la primera semana de su ayuno de incubación. En un caso, el contenido estomacal se conserva (A), en el otro caso, se digiere (B).
\bullet La figura 2 representa la evolución de la motilidad gástrica y de la temperatura estomacal en dos Pingüinos Reales machos durante la primera semana de su ayuno de incubación. En un caso, el contenido estomacal se conserva (A), en el otro caso, se digiere (B).
\bullet La figura 3 representa la evolución de las actividades antimicrobianas en el contenido estomacal de Pingüinos Reales en ayuno, incubando su huevo. Las actividades antimicrobianas se ensayaron depositando fracciones procedentes de una primera purificación por cromatografía de péptidos catiónicos. Se utilizaron tres cepas de microorganismos, representativas de bacterias Gram - (Escherichia coli), Gram + (Micrococcus luteus) y hongos filamentosos (Neurospora crassa). La actividad antimicrobiana corresponde a una disminución o ausencia de crecimiento de los microorganismos para una fracción ensayada. El porcentaje indicado para las actividades antimicrobianas corresponde a la proporción de fracciones que tiene estas actividades. Se constituyeron dos grupos de Pingüinos, según las aves que conservan (histogramas oscuros a la izquierda) o digieren (histogramas más claros a la derecha) su contenido estomacal durante el ayuno. Letras: diferencia durante el ayuno, para un mismo grupo; P < 0,05. Estrella: diferencia para una misma etapa de ayuno, entre los grupos; P < 0,05.
\bullet La figura 4 representa la evolución de las actividades antimicrobianas totales (histogramas llenos) o parciales (histogramas rayados) en el contenido estomacal de Pingüinos Reales en ayuno, incubando su huevo. Las actividades antimicrobianas se ensayaron depositando fracciones procedentes de una primera purificación por cromatografía de péptidos catiónicos. Se utilizaron tres cepas de microorganismos, representativas de bacterias Gram - (Escherichia coli), Gram + (Micrococcus luteus) y hongos filamentosos (Neurospora crassa). Si no hay crecimiento de los microorganismos para una fracción ensayada, se caracteriza la actividad antimicrobiana como total. Si sólo hay un crecimiento ralentizado, se trata de una inhibición parcial. El porcentaje indicado para las actividades antimicrobianas, ya sean totales o parciales, corresponde a la proporción de fracciones que tiene estas actividades. Se constituyeron dos grupos de Pingüinos, según las aves que conservan (histogramas de la izquierda) o digieren (histogramas de la derecha) su contenido estomacal durante el ayuno.
\bullet La figura 5 representa la evolución de las actividades antimicrobianas contra tres tipos de microorganismos, en el contenido estomacal de Pingüinos Reales en ayuno, incubando su huevo (Véase la figura 4 para las leyendas).
\bullet La figura 6 representa la evolución cuantitativa de las esfeniscinas durante el ayuno en el contenido estomacal de Pingüinos Reales en ayuno, incubando su huevo. Se constituyeron dos grupos de Pingüinos, según las aves que conservan (círculos negros y trazos llenos) o digieren (círculos blancos y línea de puntos grandes) su contenido estomacal durante el ayuno. Se representan los valores individuales (A) o promediados \pm ESM (B). En (A) los valores para un individuo que ha conservado su contenido estomacal entre el inicio y la mitad del ayuno (cuadrados negros), y que después lo ha digerido entre la mitad y el fin del ayuno (cuadrados blancos) también se representan (línea de puntos pequeños).
\bullet La figura 7 representa el espectro de masa de las esfeniscinas, en forma nativa (A) o después de la reducción y piridiletilación de los restos cisteína (B).
\bullet La figura 8 representa las \beta-defensinas implicadas en la respuesta inmunitaria epitelial en los Vertebrados. L = lengua; T = tráquea; MB = mucosa bucal; GS = glándulas salivares; P = piel; Mu mucosas pulmonares; y GI = tracto gastro-intestinal; E = Estómago; I = intestino; 0 = esófago; TG = tracto genital. Referencias: (1) Zhao et al. 2001; (2) Harder et al. 1997; (3) Hiratsuka et al. 1998) (4) Mathews et al., 1999; (5) Harder et al. 2001; (6) García et al. 2001a; (7) García et al. 2001b; (8) Bals et al. 2001; (9) Duits et al. 2000; (10) Duits et al. sitio AMSDb; (11) Diamond et al. 1993; (12) Schonwetter et al. 1995; (13) Tarver et al.1998; (14) Bals et al. 1998; (15) Huttner et al.1997; (16) Morrison et al. 1999; (17) Bals et al. 1999; (18) Jia et al. 2000; (19) Yamaguchi et al. 2001; (20) Conejo-García et al. sitio AMSDb; (21) Zhao et al. 1999; (22) Huttner et al. 1998; (23) Zhang et al. 1998.
\bullet La figura 9 ilustra el efecto perjudicial de la esfeniscina-2 de síntesis sobre el crecimiento de Aspergillus fumigatus, un hongo filamentoso patógeno (observación al microscopio electrónico (Philips XL30 LaB6)). (Figura 9A) Crecimiento control: las cabezas aspergilares terminadas por las esporas son bien visibles (x400). (Figura 9B) La incubación con 6 \muM de esfeniscina-2 implica la desaparición de las cabezas aspergilares. El efecto observado de la esfeniscina-2 sobre A. fumigatus no es, consecuentemente, de tipo fungicida directo sobre las esporas, si no que se traduce en una parada del crecimiento por inhibición de la reproducción del hongo ya que no hay formación de cabezas aspergilares, estructuras implicadas en los procesos de reproducción/proliferación de este hongo.
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Ejemplo 1
Evidencia de péptidos antimicrobianos en el contenido estomacal de Pingüinos Reales durante el ayuno de incubación
Como la mayoría de las aves pelágicas, los Pingüinos Reales se alimentan únicamente en el mar. Alternan su estancia en el mar para alimentarse con periodos de ayuno en tierra para reproducirse y mudar. La duración de los viajes alimentarios en el mar tiene sin embargo una duración y una distancia recorrida muy variable, debido a una variabilidad a la vez de la distancia a la que se encuentran sus presas, pero también de la disponibilidad de estas presas en la zona de prospección alimentaria. Esto resulta en que a veces la duración de estos viajes alimentarios puede duplicarse (Bost et al., 1997).
Durante el periodo de reproducción, los dos miembros de la pareja se relevan para asegurar la incubación del huevo único (54 días), asegurando el macho normalmente el último periodo de la incubación. Dada la variabilidad de la duración de los viajes en el mar, existe una incertidumbre sobre el sexo del miembro de la pareja que estará sobre el huevo en el momento de la eclosión. En la mayor parte de los casos, la hembra vuelve a tiempo para la eclosión, pero su retorno puede aplazarse más de nueve días (Gauthier-Clerc et al., 2000), mientras que las reservas endógenas del polluelo recién eclosionado no le aseguran más que dos o tres días de autonomía.
Se comprueba que el macho de Pingüino Real ha puesto a punto una adaptación notable que le permite asegurar la supervivencia del polluelo en caso de retraso de la hembra. Se ha mostrado en efecto que el macho de Pingüino Real es capaz, durante su estancia en tierra para asegurar la última parte de la incubación, de guardar el alimento en su estómago durante más de dos semanas (Gauthier-Clerc et al., 2000). Él mismo ayuna y vive de sus reservas corporales. El estado de conservación de este alimento es notable, no modificándose su masa ni su valor energético (Gauthier-Clerc et al., 2002).
Durante la conservación de este alimento, la temperatura estomacal se mantiene en un valor elevado, de media 38ºC, y el pH gástrico permanece entre 5 y 6 (Figura 1). Por otra parte, la motricidad gástrica se disminuye fuertemente en caso de conservación del alimento en comparación con la que se observa en un ave que digiere su contenido estomacal durante el ayuno de incubación (Figura 2). Mientras que estos diferentes parámetros son favorables para la degradación del alimento por las bacterias presentes en el contenido, el análisis cualitativo y cuantitativo de este alimento ha mostrado que esto no se produce.
Un estudio bacteriológico ha permitido mostrar que existe una proporción muy grande de bacterias viables en el contenido estomacal de Pingüinos que la conservan eficazmente durante el ayuno, pero aparentemente no pueden desarrollarse. Estas bacterias presentan en efecto las características morfológicas de bacterias situadas en condición de estrés medioambiental. Por otra parte, las bacterias cultivables son principalmente bacterias medioambientales tales como Corynebacterium, Moraxella, Staphylococcus, Micrococcus y Streptococcus spp. así como bacterias muy probablemente procedentes de las presas, a saber Clostridium spp. Por el contrario, varias bacterias de tipo Pseudomonas y Vibrio spp. presentes en el medio marino (Mac Cormack & Fraile, 1990) no se han detectado. Asimismo no se ha puesto de manifiesto ninguna bacteria entérica aunque dichas bacterias se hayan observado en el Pingüino Real (Soucek & Mushin, 1970). Los resultados del análisis de la flora bacteriana también están a favor de una protección del alimento almacenado contra la degradación por las bacterias. Un control de la flora bacteriana por sustancias antimicrobianas, producidas por las aves, podría explicar esta conservación.
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La presencia de péptidos antimicrobianos se ha investigado en el contenido estomacal de los Pingüinos Reales durante el ayuno de incubación. Se ha realizado así:
\bullet un seguimiento individual durante el ayuno de los péptidos antimicrobianos presentes en el contenido estomacal. Se realizaron varias tomas para un mismo individuo durante el ayuno,
\bullet una comparación entre dos grupos de aves, según si estas últimas conservaban (grupo "conservación") o digerían (grupo "digestión") su contenido estomacal durante el ayuno (véase el ejemplo 2.1. para el protocolo detallado).
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Se seleccionaron cuatro cepas de microorganismos de ensayo para cribar la presencia de péptidos antimicrobianos en extractos de contenido estomacal: Micrococcus luteus (Gram positiva), Escherichia coli SBS 363 (Gram negativa), Neurospora crassa (hongo filamentoso), y la levadura Candida albicans. Estas cepas se seleccionaron debido a su elevada sensibilidad para los péptidos antimicrobianos (véanse los ejemplos 2.2, 2.3 y 2.4. para el detalle del protocolo). Restringimos nuestra descripción a las actividades dirigidas contra las cepas de bacterias E. coli, M. luteus, y N. crassa.
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Se sacan tres resultados principales:
\bullet Existen moléculas con actividad antimicrobiana en las muestras de contenido estomacal de macho de Pingüinos Reales.
\bullet Estas actividades antimicrobianas se expresan diferentemente en los individuos del grupo "conservación", comparativamente con los individuos del grupo "digestión". Estas diferencias se sitúan a nivel cuantitativo y cualitativo.
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A nivel cuantitativo:
\bullet Las actividades inhibidoras de los microorganismos son más importantes en el grupo "conservación" comparativamente con el grupo "digestión", en el inicio y mitad del ayuno (Figura 3). La distinción entre las actividades inhibidoras totales y parciales muestra que la diferencia entre los dos grupos está asociada a una mayor proporción de actividades inhibidoras totales en el grupo "conservación" comparativamente con el grupo "digestión", esto es a lo largo de todo el ayuno (Figura 4).
\bullet Las actividades inhibidoras (totales y parciales) se mantienen a lo largo de todo el ayuno en el grupo "conservación". Se observa una disminución muy grande en la mitad del ayuno en el grupo "digestión".
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A nivel cualitativo (Figura 5):
\bullet Para los tres tipos de microorganismos ensayados, las actividades inhibidoras son más importantes en el grupo "conservación" comparativamente con el grupo "digestión", esto es a lo largo de todo el ayuno. Estas actividades están dirigidas esencialmente contra la bacteria Gram + ensayada (M. luteus).
\bullet Con una excepción, sólo las muestras de los individuos del grupo "conservación" presentan actividades inhibidoras dirigidas contra la bacteria Gram - ensayada (E. coli).
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En conclusión, estos resultados están muy a favor de la implicación de sustancias con actividad antimicrobiana en el fenómeno de conservación del bolo alimenticio durante el ayuno de incubación en el macho de Pingüino Real.
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Ejemplo 2
Aislamiento y caracterización de péptidos antimicrobianos a partir de muestras de contenido estomacal de machos de Pingüinos Reales 2.1 Aves y toma del contenido estomacal
Todas las muestras de contenido estomacal se tomaron de Pingüinos Reales machos, en su medio natural. La colonia de Pingüinos se encuentra en la Isla de la Posesión (46º25'S - 51º45'E), en el Archipiélago de las Islas Crozet. Las tomas se efectuaron durante el periodo de incubación, mediante una sonda gástrica. Este estudio, realizado en una zona protegida, y en una especie protegida, se realizó con la autorización del Territoire des Terres Australes et Antarctiques Françaises (Decisión nº2000-59 del 16 Octubre 2000) y la autorización del Ministère de l'Aménagement du Territoire et de l'Environnement (autorización 00/240/AUT del 30 Agosto 2000).
a) Aves: Los machos de Pingüino Real se identificaron al inicio del periodo de incubación, justo después de la puesta y el paso del huevo entre la hembra y el macho, con un anillo de plástico puesto temporalmente a nivel del ala.
Las tomas de contenido estomacal se realizaron durante el último periodo de la incubación, asegurada por el macho. Con el fin de realizar un seguimiento individual del contenido estomacal, las tomas se efectuaron, para una misma ave, en tres etapas diferentes del ayuno: el inicio, la mitad del ayuno (aproximadamente 7 días) y el fin del ayuno. Para las tomas del inicio y de la mitad del ayuno, el ave se estudió mientras estaba sobre su huevo. Para la etapa del fin del ayuno, el macho se capturó justo después del relevo por la hembra, fuera de la colonia.
Las tomas se efectuaron en calma, fuera de la colonia. Con el fin de limitar el estrés del ave, ésta se puso en oscuridad mediante un capuchón. Asimismo, el ave se reemplazó provisionalmente por un ave de yeso, previamente calentada. El ave natural se puso en una incubadora el tiempo de la manipulación. Después de la manipulación, las aves se volvieron a poner en el sitio exacto de la captura. Todas las aves estudiadas acabaron la incubación.
Se constituyeron dos grupos de aves, según si las aves conservaban (grupo "conservación", n = 3), o digerían (grupo "digestión", n = 3) su contenido estomacal durante el ayuno de incubación.
b) Toma de las muestras y condicionamiento: Las muestras de contenido estomacal se tomaron por un método no destructivo y no invasivo de intubación y de aspiración. Con el fin de obtener una muestra homogénea se tomó una cantidad superior a la necesaria en varias veces y se homogeneizó inmediatamente en un recipiente mantenido en hielo. El muestreo se realizó solamente después de esta homogeneización. Las muestras se conservaron a -80ºC. Durante la repatriación de las muestras hacia la Francia metropolitana, éstas se mantuvieron congeladas sucesivamente a -80ºC y en nieve carbónica según la técnica de transporte (barco y avión), antes de ponerlas de nuevo a -80ºC hasta su análisis con un estricto respeto de la cadena de frío.
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2.2 Extracción de los péptidos catiónicos hidrófobos y prepurificación
La extracción de los péptidos catiónicos hidrófobos se realizó a partir de las muestras de contenido estomacal congeladas. El contenido estomacal se trituró mediante un ultraturax y una sonda de ultrasonidos, en medio de extracción compuesto por ácido trifluoroacético (TFA, 0,2%) que contiene aprotinina (22,5 \mug/ml concentración final) como inhibidor de proteasa. Las muestras se mantuvieron en frío, en hielo, durante toda la etapa de trituración. La relación volumen de muestra/volumen de medio de extracción se seleccionó 1/10 al final de la trituración. Los péptidos se extrajeron a pH 2,5-3 con agitación durante una noche en cámara fría. Después de centrifugar (10.000 rpm durante 10 min a 6ºC), el sobrenadante se prepurificó por extracción en fase sólida sobre cartuchos de fase inversa Sep-Pak C_{18}. Vac (5 g de fase, Waters^{TM}). El cartucho se solvató con metanol y se equilibró con agua acidificada (0,05% TFA). La elución de los péptidos/polipéptidos y proteínas se realizó con una disolución de 80% de acetonitrilo en agua acidificada. La fracción eluida se liofilizó antes de purificarla por cromatografía líquida de alta resolución (CLHP).
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2.3 Purificación de los péptidos catiónicos a) Etapa 1: Purificación sobre columna semi-preparativa
La fracción 80% Sep-Pak se sometió a una cromatografía sobre soporte de fase inversa sobre una columna semi-preparativa Aquapore RP-300 C_{18} (250 x 7 mm, Brownlee^{TM}), equilibrada con una disolución de acetonitrilo al 2% en agua acidificada. Las fracciones se separaron mediante un gradiente lineal de 2% a 72% de acetonitrilo en agua acidificada en 70 min con un caudal de 1,3 ml/min.
Esta etapa de purificación se realizó bajo temperatura controlada (20-22ºC) sobre un sistema Beckman Gold HPLC equipado con un detector Beckman 168 de fotodiodo. Las moléculas eluidas de la columna se detectaron por su absorbancia a 225 nm.
Las diferentes fracciones se recogieron manualmente, se secaron en vacío (Speed-Vac, Savant) y se reconstituyeron en 150 \mul de agua ultrapura (Millipore^{TM}) previamente filtrada (Millipore^{TM}), antes del análisis de la actividad antimicrobiana.
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b) Etapa 2 Purificación sobre columna analítica
La purificación de las moléculas con actividad antimicrobiana (actividad total dirigida contra las dos cepas de bacterias y la cepa de hongos filamentosos) se realizó a partir de una fracción procedente del contenido estomacal tomado de un ave que pertenece al grupo "conservación" al final del ayuno.
La segunda etapa de purificación se realizó sobre una columna analítica Aquapore OD-300 (220 x 4,6 mm, Brownlee^{TM}). La elución se realizó mediante un gradiente bifásico de acetonitrilo en agua acidificada, de 2 a 23% en 10 min y de 23 a 38% en 45 min con un caudal de 0,8 ml/min. Las diferentes fracciones se recogieron manualmente, se secaron en vacío (Speed-Vac, Savant) y se reconstituyeron en 70 \mul de agua MilliQ (Millipore^{TM}). Con el fin de limitar la utilización del producto activo para los ensayos biológicos, sólo se ensayó la cepa Gram negativa E. coli. Las fracciones inactivas se ensayaron en N. crassa. No se detectó ninguna actividad, lo que sugiere que la actividad dirigida contra el hongo filamentoso N. crassa, registrada durante la etapa de purificación anterior, está asociada a la fracción que presenta la actividad dirigida contra la bacteria Gram negativa E. coli.
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c) Etapa 3: Fase final de purificación sobre columna analítica
La tercera etapa de purificación se realizó sobre la misma columna analítica que en la etapa 2 utilizando como condiciones de elución un gradiente bifásico de acetonitrilo en agua acidificada, de 2 a 20% en 10 min y de 20 a 30% en 50 min con un caudal de 0,8 ml/min. Las fracciones se recogieron, se secaron en vacío, se recogieron en 40 \mul de agua y se analizaron para su actividad antibacteriana contra E. coli.
Estas dos últimas etapas de purificación se realizaron bajo temperatura controlada, sobre un sistema CLHP biocompatible (all PEEK Waters, Modelo Waters 626) conectado a un detector de absorbancia variable (Waters 486). Las moléculas eluidas de la columna se detectaron por su absorbancia a 225 nm, y la actividad antimicrobiana se midió según el procedimiento descrito en el Ejemplo 2.4 siguiente.
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2.4 Detección de las actividades antimicrobianas
La actividad antimicrobiana se midió en cuatro cepas de microorganismos: Micrococcus luteus (Gram positiva; colección del Instituto Pasteur, París), Escherichia coli SBS 363 (Gram negativa; donación de M. Boquet del Centre d'Etudes Nucléaires de Saclay), Neurospora crassa (hongo filamentoso; micoteca de la Société Clause, París) y Candida albicans (levadura; donación del Dr. Koenig, Hospital Civil, Estrasburgo). Estas cuatro cepas se seleccionaron de las colecciones públicas o privadas debido a su sensibilidad reconocida para péptidos antimicrobianos naturales.
Las bacterias a ensayar se pusieron en suspensión en un medio nutritivo apropiado de tipo "Poor Broth", correspondiente a una disolución de bactotriptona a 10 g/l a la que se añadió NaCl 5 g/l preparada en agua ultrapura.
Las esporas del hongo N. crassa a ensayar se pusieron en suspensión en medio de cultivo apropiado de tipo "infusión de Patata - Glucosa". Preferentemente se utilizan 12 g de medio Potato Dextrose Broth (1/2PDB, Difco) para 1 1 de agua desmineralizada. Se añadieron dos antibióticos al medio de cultivo: cefotaxina (concentración final 100 \mug/ml) y tetraciclina (concentración final 10 \mug/ml).
La cepa de levadura C. albicans a ensayar se incubó en un medio de cultivo apropiado de tipo "Sabouraud".
Las actividades antimicrobianas se detectaron por un ensayo de inhibición de crecimiento en medio líquido en placas de microtitulación (Hétru & Bulet, 1997). Se depositan 10 \mul de cada fracción recogida en las placas de microtitulación en presencia de 90 \mul de medio de cultivo que contiene los microorganismos (a una concentración final equivalente a 1 mDO a 600 nm).
Para las bacterias y la levadura, la incubación se realizó a 30ºC durante 12-24 h con agitación. El crecimiento de los microorganismos se midió siguiendo la absorbancia a 600 nm mediante un espectrofotómetro lector de placas de microtitulación.
Para los hongos filamentosos, la incubación se realizó a 37ºC bajo atmósfera húmeda durante 48 horas. El crecimiento fúngico se observó al microscopio fotónico después de 24 h y se cuantificó después de 48 h por medida de la absorbancia a 600 nm mediante un espectrofotómetro lector de placas de microtitulación.
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2.5 Caracterización estructural de la esfeniscinas 2.5.1 Análisis por espectrometría de masa
La pureza y la determinación de la masa molecular de las moléculas bioactivas se realizaron por espectrometría de masa según la técnica denominada de tiempo de vuelo después de ionización por desorción láser asistida por matriz (Técnica MALDI-TOF). El material utilizado es un espectrómetro de masa Brucker BIFLEX- III (Bremen, Alemania) equipado con una óptica de alta resolución SCOUT^{TM} y con un reflectrón. Este instrumento tiene un potencial máximo de aceleración de 20kV y puede utilizarse en modo lineal o en modo reflectrón. La ionización se realiza con un haz a 337 nm emitido por un láser de nitrógeno con una frecuencia de 3Hz. Los espectros de masa se calibraron de forma externa con una mezcla estándar de péptidos de drosophila a saber drosocina, metchnikowina y drosomicina de masa molecular conocida, respectivamente 2.199,5 Da, 3.046,4 Da y 4.890,5 Da (Bullet, 1999).
La muestra a analizar se preparó según la técnica del sandwich (Kussmann et. al., 1997) expuesta como sigue: 0,5\mul de muestra se depositaron sobre una fina capa de cristales de ácido \alpha-ciano-4-hidroxicinámico (4-HCCA, Sigma) obtenidos por una evaporación rápida de una disolución saturada en acetona. Se recubrió todo con 0,5 \mul de matriz 4-HCCA a saturación en una disolución de acetonitrilo 50% en agua. Después de secar en un vacío ligero, la muestra se lavó con 1,5 \mul de TFA 0,1% antes de secarla de nuevo e introducirla en el espectrómetro de masa.
El espectro de masa obtenido para la fracción aislada durante la etapa 3 del ejemplo 2.3 anterior se presenta en la figura 7A. Esta fracción contenía dos moléculas de masa molecular en MH^{+} 4.482,84 y 4.501,67. La etapa siguiente fue verificar la presencia de retos de cisteína en las moléculas antimicrobianas aisladas y opcionalmente modificar estos restos de cisteína para favorecer la identificación de la secuencia durante la secuenciación peptídica por degradación de Edman.
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2.5.2 Verificación de la presencia de restos de cisteína y determinación de su número por reducción y S-piridiletilación a) Etapa 1: Tratamiento químico
La presencia de restos de cisteína se determinó después de reducción y S-piridiletilación. Una fracción alicuota de los péptidos purificados en la etapa 3 del ejemplo 2.3 se sometió a una etapa de reducción química con 4 \mul de ditiotreitol (concentración final 2,2 M) en 40 \mul de tampón Tris/HCl 0,5 M, pH 8,3 que contiene 2 mM de EDTA y 6 M de cloruro de guanidinio. El medio de reacción se puso bajo atmósfera de nitrógeno. Después de 60 min de incubación en oscuridad, se añadieron a la reacción 2 \mul de 4-vinil piridina (agente alquilante). El medio de reacción se puso bajo atmósfera de nitrógeno y se incubó 10 min y a 45ºC en oscuridad. La reacción se paró por acidificación con 50 \mul de TFA 10%.
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b) Etapa 2: Purificación de los péptidos reducidos y alquilados
Los péptidos piridiletilados se purificaron del medio de reacción por cromatografía de fase inversa utilizando una columna narrow bore C_{18} (DeltaPak HPIC_{18}, 2 x 150 mm, Waters^{TM}). La elución se realizó mediante un gradiente lineal de acetonitrilo en agua acidificada de 2 a 60% en 90 min con un caudal de 0,2 ml/min. Esta separación se realizó bajo temperatura controlada, sobre un sistema CLHP biocompatible (all PEEK Waters, Modelo Waters 626) conectado a un detector de absorbancia variable (Waters 486). Las moléculas eluidas de la columna se detectaron por su absorbancia a 225 nm.
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c) Etapa 3: Determinación del número de restos de cisteína por espectrometría de masa
La medida de masa de los péptidos piridiletilados se efectuó por un espectrómetro de masa MALDI-TOF según el protocolo enunciado en el ejemplo 2.5.1. Esta fracción contenía dos moléculas de masa molecular en MH^{+} 5.120,69 y 5.141,54 (Figura 7B). La diferencia de masa molecular medida antes y después de la reducción para las dos moléculas corresponde a la adición de 6 restos de 4-vinil piridina (6 x 106 Da). Esto confirma la presencia de 6 restos de cisteína en la molécula de 4.482.84 (m/z) y en la de 4.501.67 (m/z) y su implicación en la formación de tres puentes disulfuro intramoleculares.
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2.5.3 Determinación de las secuencias primarias de las esfeniscinas a) Etapa 1: Secuenciación por degradación de Edman
La secuenciación automática por degradación de Edman de los péptidos S-piridiletilados se realizó en un secuenciador ABI473A (Applied Biosystems Inc.). Se obtuvieron dos secuencias primarias de 38 aminoácidos, que se diferenciaban sólo en un aminoácido en posición 14 (histidina frente a arginina), con una ambigüedad sobre los aminoácidos en posición 31 y 37. Con el fin de hacer desaparecer esta ambigüedad, los dos péptidos se trataron con quimotripsina.
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b) Etapa 2: Digestión con quimotripsina y análisis de los fragmentos quimotrípsicos por espectrometría de masa
La fracción (4 \mul) que contiene los péptidos S-piridiletilados se puso en disolución en 20 \mul de tampón Tris 100 mM a pH 7,8, que contiene 10 mM de CaCl_{2}, en presencia de quimotripsina en la relación 1/20 (enzima/péptidos, peso/peso). Se analizaron fracciones alicuotas (0,5 \mul) por espectrometría de masa MALDI-TOF después de 30 min y 55 min de incubación a 30ºC. Las muestras se analizaron por espectrometría de masa MALDI-TOF según el protocolo descrito en el ejemplo 1.5.1. Entre los fragmentos quimotrípsicos observados después de 55 min, uno de los fragmentos con la masa molecular medida a 1.261,05 (m/z) ha permitido confirmar y hacer desaparecer las ambigüedades observadas después de la secuenciación por degradación de Edman. Secuencias C-terminales idénticas para los dos péptidos.
El conjunto de las técnicas utilizadas ha permitido obtener así la estructura completa de la esfeniscina-1 y de la esfeniscina-2.
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La secuencia primaria de la esfeniscina-1 es la siguiente:
SFGLCRLRRGFCAHGRCRFPSIPIGRCSRFVQCCRRVW
(SEQ ID NO. 14)
Masa molecular calculada 4.483,38 MH^{+}
Masa molecular medida: 4.482,84 MH^{+}
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La secuencia primaria de la esfeniscina-2 es la siguiente:
SFGLCRLRRGFCARGRCRFPSIPIGRCSRFVQCCRRVW
(SEQ ID NO. 15)
Masa molecular calculada: 4.502,42 MH^{+}
Masa molecular medida: 4.501,67 MH^{+}
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El análisis de los bancos de datos proteicos y nucleotídicos (FASTA Genome, NCBI-TBLASTN) ha permitido mostrar que las esfeniscinas pertenecen a la familia de las \beta-defensinas, péptidos antimicrobianos ampliamente extendidos en el mundo animal. Se realizó una comparación detallada de las secuencias de las esfeniscinas con las secuencias de las \beta-defensinas conocidas encontradas en los epitelios de los vertebrados y en este caso en la gallina (Gallus gallus) y en la pintada (Meleagris gallopavo). Las homologías observadas (Figura 8) muestran claramente que las esfeniscinas, aisladas a partir de un contenido estomacal de Pingüino Real, son producidas y secretadas por el ave y no provienen de la alimentación en sí misma.
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Ejemplo 3
Evolución de las esfeniscinas en el contenido estomacal durante el ayuno de incubación en el Pingüino Real 3.1 Detección de las esfeniscinas en el contenido estomacal por espectrometría de masa MALDI-TOF
Los análisis se realizan para cada muestra de contenido estomacal, sobre las fracciones procedentes de la primera etapa de purificación (véase el Ejemplo 2.3 Etapa 1). El procedimiento de análisis por espectrometría de masa MALDI-TOF es el descrito en el Ejemplo 2.5.1.
Se reagruparon todas las fracciones procedentes de la primera etapa de purificación que proceden de un mismo individuo en una etapa de ayuno dada y que contienen esfeniscina 1 o/y 2. Las esfeniscinas se purificaron por cromatografías sucesivas sobre columnas de fase inversa apropiadas utilizando gradientes de acetonitrilo adaptados según el modelo descrito anteriormente en el Ejemplo 2.3.
Las etapas de purificación se realizaron bajo temperatura controlada, sobre un sistema CLHP biocompatible (all PEEK Waters, Modelo Waters 626) conectado a un detector de absorbancia variable (Waters 486). Las moléculas eluidas de la columna se detectaron por su absorbancia a 225 nm y la presencia de las esfeniscinas 1 y 2 se confirmó por espectrometría de masa MALDI-TOF.
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3.2 Cuantificación y evolución de las esfeniscinas en el contenido estomacal durante el ayuno de incubación en el Pingüino Real a) Etapa 1: Análisis por electroforesis capilar de zona
La primera etapa que permite la cuantificación de las esfeniscinas consistió en realizar una electroforesis capilar de zona sobre un modelo 270 A-HT (Applied Biosystems Inc.). Cuatro nl de cada "pool" de fracciones (12 \mul) que contiene esfeniscina (determinado por espectrometría de masa MALDI-TOF) se inyectaron con asistencia de vacío en un capilar de sílice (72 cm x 50 \mum). El análisis se realizó en tampón citrato 20 mM a pH 2,5. La electroforesis se realizó a 20 kV del ánodo al cátodo durante 20 min a 30ºC. La migración se registró a 200 nm. Para cada muestra, se determinó la superficie del pico correspondiente a las esfeniscinas 1 y 2.
b) Etapa 2: Cuantificación
Con el fin de poder efectuar la cuantificación, el área del pico obtenido por electroforesis capilar se comparó con la de una disolución calibrada de esfeniscinas. Esta disolución corresponde a la muestra analizada por degradación de Edman. La cantidad precisa de esfeniscinas secuenciada se determinó por medida del rendimiento repetitivo y del rendimiento inicial obtenido durante la secuenciación por degradación de Edman.
Las cantidades observadas se refieren a las concentraciones presentes en la muestra inicial del contenido estomacal. Los datos obtenidos muestran claramente una fluctuación importante del contenido de esfeniscinas del contenido estomacal entre los dos grupos tratados: el grupo "conservación " y "digestión" (Figura 6). Por otra parte, en el grupo "conservación", se observa un aumento neto de la tasa de esfeniscinas entre el inicio y el fin del ayuno.
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Ejemplo 4
Forma sintética de la esfeniscina-2, su espectro de actividad antimicrobiana y el estudio del efecto del pH sobre su funcionalidad 4.1. Objeto de estos estudios y resultados principales
En el marco de la presente invención, se realizaron nuevos estudios con el fin de evaluar las propiedades antimicrobianas así como la estructura secundaria (tridimensional, 3D) de los péptidos (esfeniscinas) objeto de dicha invención. Con el objetivo de efectuar estos estudios, se produjo químicamente un péptido de síntesis de composición y estructura idénticos a una de las variantes de los péptidos de la invención que es la esfeniscina-2. Gracias a la esfeniscina-2 sintética, se pudo emprender el estudio:
\bullet del espectro de actividad de la esfeniscina-2 sobre una amplia gama de microorganismos, con cepas patógenas para el ser humano. Se utilizaron cepas de bacterias Gram-positivas y Gram-negativas, de levaduras y de hongos filamentosos.
\bullet de la actividad de la esfeniscina-2 en función del pH del medio. En efecto, en el caso de la conservación del bolo alimenticio en el Pingüino Real se ha mostrado que el pH oscilaba entre 4 y 6 (Thouzeau et al., 2003). Se trataba de ensayar, in vitro, si dicho pH podía tener una incidencia sobre la actividad de la esfeniscina in vivo. Este estudio era esencial en el contexto de la utilización potencial de estas moléculas para la conservación alimentaria o la lucha contra infecciones microbianas en medio gastro-intestinal.
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De estos dos estudios se sacan cinco resultados principales:
\bullet La esfeniscina-2 afecta fuertemente el crecimiento de un número importante de cepas de bacterias Gram-positivas (Tabla 1). Este efecto es principalmente de tipo bactericida (lisis de las células bacterianas);
\bullet La esfeniscina-2 es igualmente activa contra una gran variedad de cepas de bacterias Gram-negativas (Tabla 1). Este efecto, contrariamente al observado contra los gérmenes Gram-positivos, es sobre todo de tipo bacteriostático (parada de la multiplicación bacteriana);
\bullet La esfeniscina-2 posee una actividad antifúngica tanto contra las levaduras como los hongos filamentosos (Tabla 1). Este efecto puede ser fungicida (lisis de las esporas) pero puede afectar igualmente a la fase de reproducción de los hongos por bloqueo de la esporulación como hemos podido observar en el hongo patógeno para el ser humano, Aspergillus fumigatus. Este último efecto se ilustra por la figura 9 adjunta;
\bullet La existencia de modos de acción de la esfeniscina diferentes según las cepas de microorganismos afectadas por este péptido;
\bullet La esfeniscina-2 es siempre funcional en la gama de pH observada en el contenido estomacal de los Pingüinos, es decir de pH 4 a pH 6 (Tabla 2).
En conclusión, la evidencia del amplio espectro de actividad de la esfeniscina-2, que afecta el crecimiento de bacterias y de hongos patógenos de plantas y del ser humano, y el mantenimiento de la funcionalidad de este péptido a los pH observados in vivo en el estómago son argumentos adicionales a favor de la implicación de sustancias con actividad antimicrobiana en el fenómeno de conservación del bolo alimenticio durante el ayuno de incubación en el Pingüino Real. Estas propiedades biológicas están igualmente a favor de la utilización de estas moléculas para la lucha antimicrobiana en un entorno en el que el pH sería moderadamente ácido.
Los subpárrafos siguientes aportan características adicionales que se refieren a la forma sintética de la esfeniscina-2, su espectro de actividad antimicrobiana y el estudio del efecto del pH sobre su funcionalidad.
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4.2. Obtención de la forma sintética de la esfeniscina-2
El estudio de las propiedades de la esfeniscina-2 necesitaba disponer de una cantidad suficiente de péptido, que era difícil de obtener a partir de extracto de contenido estomacal de Pingüino. Una forma sintética de la esfeniscina-2 se obtuvo del laboratorio ALTERGEN (Schiltigheim, Francia). La esfeniscina-2 se produjo por síntesis química según un procedimiento conocido por el experto en la técnica. Después de renaturalizar la molécula en condiciones adaptadas conocidas por el experto en la técnica, se controlaron la pureza de la molécula y su identidad con la molécula nativa utilizando el procedimiento descrito a continuación:
a) Tratamiento del producto bruto de síntesis. El polvo que constituye el producto bruto de síntesis se lavó de restos de ácido trifluoroacético presentes con varios lavados sucesivos mediante una disolución de ACN 50%; lavados entrecortados por una etapa de secado en vacío (Speed-Vac, Savant) seguida de una etapa de liofilización.
b) Verificación de la masa molecular y de la organización de los puentes disulfuro: La identidad del producto sintético así lavado se verificó y comparó con la de la molécula nativa, procedente del contenido estomacal. La masa molecular así como la pureza de la esfeniscina de síntesis se verificaron por espectrometría de masa según la técnica denominada de medida de tiempo de vuelo después de ionización por desorción láser asistida por matriz (Técnica MALDI-TOF, para los detalles de la técnica véase el ejemplo 2.5.1.). La disposición de los puentes disulfuro, característica de la molécula (Cys1-Cys5, Cys2-Cys4, Cys3-Cys6), se verificó por escisión enzimática con tripsina (Boehringer Mannheim, Alemania) seguida de un marcaje másico por MALDI-TOF de los fragmentos procedentes de esta digestión.
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El conjunto de los resultados obtenidos ha mostrado que la esfeniscina de síntesis era totalmente idéntica a la molécula esfeniscina-2 natural tanto a nivel de su estructura primaria como de su disposición de los puentes disulfuro:
Esfeniscina-2 natural (Sphe-2N) y sintética (Sphe-2S):
Masa molecular calculada: 4.502,42 MH^{+}
Masa molecular medida (Sphe-2N): 4.501,67 MH^{+}
Masa molecular medida (Sphe-2S): 4.502,71 MH^{+}
Emparejamiento de las cisteínas: Cys1-Cys5, Cys2-Cys4, Cys3-Cys6
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Debido a esta identidad estricta, la esfeniscina-2 sintética se utilizó para efectuar los estudios de las propiedades biológicas de esta molécula y considerar el estudio de la estructura tridimensional de este péptido.
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4.3. Determinación del espectro de actividad de la esfeniscina-2
Las actividades antimicrobianas expresadas en concentración mínima de inhibición (CMI) de la esfeniscina-2 (concentraciones comprendidas entre 0,2 \muM y 100 \muM) se determinaron contra bacterias, levaduras y hongos utilizando un ensayo de inhibición de crecimiento en medio líquido en placas de microtitulación (para los protocolos detallados véase el ejemplo 2.4. así como Hétru y Bulet 1997).
El efecto bactericida o bacteriostático del péptido se determinó por exposición en placas Petri y recuento de las colonias presentes después de 24 h de incubación.
Las cepas de microorganismos utilizadas son las mismas que determinadas descritas anteriormente en la bibliografía (Lowenberger et al. 1995, 1999) a las que se añadieron las cepas siguientes (donaciones de investigadores): Bacillus cereus ATCC 11778 (Colección del Instituto Pasteur, París), Alcaligenes faecalis, Staphylococcus saprophyticus, S. haemolyticus y Nocardia astéroïdes (Pr. Monteil y Piémont, Instituto de Bacteriología, Universidad de Estrasburgo, Francia), Escherichia coli SBS 363 (Dr. Boquet, Centre d'Etudes Nucléaires, Saclay, Francia), Vibrio metshnikovii y V. anguillarum (Dr. Bachère, IFREMER, Montpellier, Francia), Candida albicans IHEM 8060 (EntoMed, Estrasburgo, Francia) y C. tropicalis (Dr. Koenig, Hospital Civil, Estrasburgo, Francia).
El péptido control MSI-94 es una donación del Dr. M.A. Zasloff (Magainin Scientific Institute, Plymouth Meeting, Filadelfia); y el péptido tanatina es una donación del Dr. Bulet (CNRS, UPR 9022, Estrasburgo).
La tabla 1 siguiente presenta el espectro de actividad de la esfeniscina-2 de síntesis y de dos péptidos control. La concentración mínima de inhibición de crecimiento (CMI) corresponde al intervalo [a] - [b] en el que [a] es la concentración más alta ensayada para la que el microorganismo crece, y [b] la concentración más baja ensayada a partir de la que hay 100% de inhibición de crecimiento del microorganismo (Casteels y Tempst 1994). Los péptidos control son MSI-94 (un péptido de la familia de las mangaininas, procedente de la piel del batracio Xenopus laevis, y que presenta un amplio espectro de actividad antimicrobiana (Maloy y Kari 1995) para ensayar contra las bacterias y las levaduras; y la tanatina (un péptido antifúngico que proviene del insecto Podisus maculiventris; Fehlbaum et al. 1996) para ensayar contra los hongos filamentosos. ND significa que la actividad del péptido no se ha detectado a las concentraciones ensayadas, es decir hasta la concentración máxima de 100 \muM.
TABLA 1 Actividad antimicrobiana de la esfeniscina-2 de síntesis y de péptidos control. Gamas de concentraciones ensayada: esfeniscina-2 = 0,2M – 100 \muM; MSI-94 (control para las bacterias y las levaduras): 0,2 \muM - 10 \muM; Tanatina (control para los hongos): 0,4 \muM – 41,1 \muM)
4
5
6
4.4. Estudio de la funcionalidad de la esfeniscina-2 a diferentes pH
Con el fin de determinar si la acidez moderada del contenido estomacal bien conservada (pH 4-6, Thouzeau et al. 2003) podía modificar la eficacia de la esfeniscina in vivo, se ensayó la actividad de la esfeniscina a pH comprendidos entre 4,2 y 6,1.
Se seleccionaron previamente cepas de microorganismos capaces de crecer a dichos pH: se trata de Pseudomonas aeruginosa y de Escherichia coli 1106 (bacterias Gram-negativas).
Los ensayos de actividad antimicrobiana se realizaron en medio líquido en placas de microtitulación (para los protocolos detallados véase el ejemplo 2.4. así como Hétru y Bulet 1997).
Para cada ensayo, el pH del medio líquido utilizado se ajustó con ácido clorhídrico.
La tabla 2 siguiente presenta el efecto del pH del medio sobre la actividad antimicrobiana de la esfeniscina-2 de síntesis. Se seleccionaron dos cepas de bacterias Gram-negativas (Pseudomonas aeruginosa y Escherichia coli 1106) capaces de crecer en la gama de pH a ensayar. La gama de pH ensayada abarca las variaciones de pH observadas en el contenido estomacal bien conservado del Pingüino Real que incuba (Thouzeau et al. 2003).
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TABLA 2 Efecto del pH sobre la actividad de la esfeniscina-2 de síntesis
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<151> 01-07-02
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<160> 16
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<170> WORD® 2000
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<210> 1
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<211> 15
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<212> PRT
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<213> Esfeniscidas
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<220>
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<221>
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<222> 1
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<223> Xaa representa un grupo -NH_{2} o un resto peptídico de 1 a 16 aminoácidos y preferentemente de 4 aminoácidos,
\hskip1cm
Xaa responde a la fórmula siguiente: -Xaa1-Xaa2- (SEQ ID NO.2)
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<220>
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<221>
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<222> 3
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<223> Xab representa un resto peptídico de 1 a 6 aminoácidos, preferentemente 6 aminoácidos
\hskip1cm
Xab responde a la fórmula siguiente: -Xab1-Xab2-Xab3-Xab4-Xab5- (SEQ ID NO.3)
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<220>
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<221>
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<222> 5
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<223> Xac representa un resto peptídico que comprende de 1 a 4 aminoácidos, preferentemente 4 aminoácidos
\hskip1cm
Xac responde a la fórmula siguiente: Xac1-Xac2-Xac3-Xac4 (SEQ ID NO.5)
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<220>
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<221>
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<222> 7
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<223> Xad representa un resto peptídico que comprende de 1 a 9 aminoácidos, preferentemente 9 aminoácidos, ventajosamente Xad responde a la secuencia siguiente: -Xad1-Xad2-Xad3-Xad4-Xad5-Xad6-Xad7-Xad8-Xad9- (SEQ ID NO.6),
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<220>
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<221>
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<222> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xae representa un resto peptídico que comprende de 1 a 6 aminoácidos, preferentemente 5 aminoácidos, ventajosamente Xae responde a la secuencia siguiente: -Xae1-Xae2-Xae3-Xae4-Xae5- (SEQ ID NO.7)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaf representa un grupo -OH o -CONH_{2} o también un resto peptídico de 1 a 14 aminoácidos, preferentemente 4 aminoácidos, ventajosamente Xaf responde a la secuencia siguiente: -Xaf1-Xaf2-Xaf3-Xaf4- (SEQ ID NO.8)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ca1 representa un aminoácido unido a uno cualquiera de otros Ca2, Ca3, Ca4, Ca5 y Ca6, ventajosamente Ca1 es un aminoácido azufrado de tipo cisteína y preferentemente una cisteína.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ca2 representa un aminoácido unido a uno cualquiera de otros Ca1, Ca3, Ca4, Ca5 y Ca6, ventajosamente Ca2 es un aminoácido azufrado de tipo cisteína, preferentemente una cisteína.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ca3 representa un aminoácido unido a uno cualquiera de otros Ca1, Ca2, Ca4, Ca5 y Ca6, ventajosamente Ca3 es un aminoácido azufrado de tipo cisteína y preferentemente una cisteína.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ca4 representa un aminoácido unido a uno cualquiera de otros Ca1, Ca2, Ca3, Ca5 y Ca6, ventajosamente Ca4 es un aminoácido azufrado de tipo cisteína y preferentemente una cisteína.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ca5 representa un aminoácido unido a uno cualquiera de otros Ca1, Ca2, Ca3, Ca4, y Ca6, ventajosamente Ca5 es un aminoácido azufrado de tipo cisteína y preferentemente una cisteína.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ca6 representa un aminoácido unido a uno cualquiera de otros Ca1, Ca2, Ca3, Ca4 y Ca5, ventajosamente Ca6 es un aminoácido azufrado de tipo cisteína y preferentemente una cisteína.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Xaa Ca1 Xab Ca2 Xac Ca3 Xad Ca4 Xae Ca5 Ca6 Xaf
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa1 representa un grupo -NH_{2} o un resto peptídico de 1 a 13 aminoácidos
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa2 representa un resto peptídico de 3 aminoácidos elegidos entre aminoácidos hidrófobos o apolares;
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Xaa1 Xaa2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xab1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares cargados negativamente, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos hidrófobos o apolares
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xab2 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares cargados negativamente, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos hidrófobos o apolares
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xab3 representa un resto peptídico que responde a la fórmula siguiente -Xab3.1-Xab3.2- (SEQ ID NO.4)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xab4 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares cargados negativamente, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos hidrófobos o apolares
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xab5 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares cargados negativamente, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos hidrófobos o apolares
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Xab1 Xab2 Xab3 Xab4 Xab5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xab3.1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares cargados negativamente, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos hidrófobos o apolares
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xab3.2 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares cargados negativamente, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos hidrófobos o apolares
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Xab3.1 Xab3.2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xac1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares y aminoácidos polares grandes no cargados
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xac2 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares y aminoácidos polares grandes no cargados
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xac3 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares y aminoácidos polares grandes no cargados
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xac4 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares y aminoácidos polares grandes no cargados
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Xac1 Xac2 Xac3 Xac4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xad1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xad2 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xad3 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xad4 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xad5 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xad6 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xad7 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xad8 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xad9 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Xad1 Xad2 Xad3 Xad4 Xad5 Xad6 Xad7 Xad8 Xad9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xae1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xae2 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xae3 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xae4 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xae5 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm 
Xae1 Xae2 Xae3 Xae4 Xae5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaf1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaf2 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaf3 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaf4 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados y aminoácidos polares cargados negativamente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Xaf1 Xaf2 Xaf3 Xaf4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xac1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xac1 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente alanina (Ala).
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xac3 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xac3 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente glicina (Gly).
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Xac1 His Xac3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xac1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xac1 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente alanina (Ala).
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xac3 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xac3 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente glicina (Gly).
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Xac1 Arg Xac3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xad1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xad1 es un aminoácido básico y muy preferentemente arginina (Arg).
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>
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<222> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xad3 se elige del grupo que comprende aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos básicos, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente un aminoácido hidrófobo o apolar, preferentemente Xad3 es prolina o hidroxiprolina y muy preferentemente prolina (Pro).
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Xad1 Pro Xad3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
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<211> 3
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<221>
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<222> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xae1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, aminoácidos polares pequeños no cargados, preferentemente Xae1 es un aminoácido polar pequeño no cargado y muy preferentemente serina (Ser).
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<220>
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<221>
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<222> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xae3 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, aminoácidos polares pequeños no cargados, aminoácidos polares cargados negativamente, preferentemente un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente fenilalanina (Phe).
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
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\hskip1cm
Xae1 Gln Xae3
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaf1 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, preferentemente Xaf1 es un aminoácido básico y muy preferentemente ariginina (Arg).
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaf3 se elige del grupo que comprende aminoácidos básicos, aminoácidos hidrófobos o apolares, aminoácidos polares grandes no cargados, preferentemente Xaf3 es un aminoácido hidrófobo o apolar y muy preferentemente valina (Val).
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Xaf1 Val Xaf3
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 38
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<212> PRT
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<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> DISULFURO
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (5)..(33)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Puente disulfuro entre las cisteínas en posiciones 5 y 33.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> DISULFURO
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (12)..(27)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Puente disulfuro entre las cisteínas en posiciones 12 y 27.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> DISULFURO
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (17)..(34)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Puente disulfuro entre las cisteínas en posiciones 17 y 34.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
9
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Esfeniscidas
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
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<221> DISULFURO
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (5)..(33)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Puente disulfuro entre los restos en posiciones 5 y 33.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> DISULFURO
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<222> (12)..(27)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Puente disulfuro entre los restos en posiciones 12 y 27.
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
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<221> DISULFURO
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<222> (17)..(34)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Puente disulfuro entre los restos en posiciones 17 y 34.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
10

Claims (8)

1. Péptido o un análogo de esfeniscina que presenta una actividad antimicrobiana y que comprende tres enlaces intramoleculares, y que responde a la fórmula (II) siguiente:
11
En la que:
- Xaa responde a la fórmula siguiente: -Xaa1-Xaa2-(SEQ ID NO.2), en la que Xaa1 representa un grupo -NH_{2} o un resto peptídico de 1 a 13 aminoácidos, y Xaa2 es Ser-Phe-Gly-Leu;
- Xab responde a la fórmula siguiente: -Xab1-Xab2-Xab3-Xab4-Xab5- (SEQ ID NO.3), y Xab3 representa un resto peptídico que responde a la fórmula siguiente: -Xab3.1-Xab3.2-(SEQ ID NO.4),
- Xac responde a la fórmula siguiente: -Xac1-Xac2-Xac3-Xac4- (SEQ ID NO.5), en la que Xac2 es His o Arg
- Xad con la secuencia siguiente: -Xad1-Xad2-Xad3-xad4-xad5-xad6-Xad7-Xad8-Xad9- (SEQ ID NO.6), en la que Xad2 es Pro o Phe y Xad3 es Pro
- Xae responde a la secuencia siguiente: -Xae1-Xae2-Xae3-Xae4-Xae5- (SEQ ID NO.7), en la que Xae2 es Gln o Arg y Xae5 es Gln;
- Xaf responde a la secuencia siguiente: -Xaf1-Xaf2-Xaf3-Xaf4- (SEQ ID NO.8) y Xaf2 y/o Xaf3 es Val; y - Ca1, Ca2, Ca3, Ca4, Ca5 y Ca6, son aminoácidos azufrados.
\vskip1.000000\baselineskip
2. Péptido según la reivindicación 1, en el que:
- Xaa es Ser-Phe-Gly-Leu,
- Xab es Arg-Leu-Arg-Arg-Gly-Phe,
- Xac es Ala-Xac2 -Gly-Arg,
- Xad es Arg-Phe-Pro-Ser-Ile-Pro-Ile-Gly-Arg,
- Xae es Ser-Arg-Phe-Val-Gln,
- Xaf es Arg-Arg-Val-Trp, y
- Xac2 es His o Arg.
\vskip1.000000\baselineskip
3. Composición farmacéutica, agroalimentaria o agronómica que comprende como agente activo al menos un péptido según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 2.
4. Composición según la reivindicación 3, caracterizada porque es útil para la conservación de los alimentos.
5. Composición según la reivindicación 4, caracterizada porque es útil para prevenir y/o tratar una infección bacteriana y/o fúngica, en el ser humano, el animal o las plantas.
6. Polinucleótido caracterizado porque codifica un péptido según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 2.
7. Molécula de ácido nucleico, como un vector, que comprende al menos un polinucleótido según la reivindicación 6.
8. Anfitrión, como una célula animal o vegetal o también un procariota, que comprende una molécula de ácido nucleico según la reivindicación 7.
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