+

DK2365078T3 - Fremgangsmåder under anvendelse af oligonucleotid med dobbelt specificitet og oligonucleotid med dobbelt specificitet - Google Patents

Fremgangsmåder under anvendelse af oligonucleotid med dobbelt specificitet og oligonucleotid med dobbelt specificitet Download PDF

Info

Publication number
DK2365078T3
DK2365078T3 DK11168429.6T DK11168429T DK2365078T3 DK 2365078 T3 DK2365078 T3 DK 2365078T3 DK 11168429 T DK11168429 T DK 11168429T DK 2365078 T3 DK2365078 T3 DK 2365078T3
Authority
DK
Denmark
Prior art keywords
specificity
oligonucleotide
nucleic acid
low
annealing
Prior art date
Application number
DK11168429.6T
Other languages
English (en)
Inventor
Jong-Yoon Chun
Original Assignee
Seegene Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Seegene Inc filed Critical Seegene Inc
Priority claimed from EP06716196A external-priority patent/EP1856257B1/en
Application granted granted Critical
Publication of DK2365078T3 publication Critical patent/DK2365078T3/da

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/04—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/02—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with ribosyl as saccharide radical
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6848—Nucleic acid amplification reactions characterised by the means for preventing contamination or increasing the specificity or sensitivity of an amplification reaction
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6853—Nucleic acid amplification reactions using modified primers or templates
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6858—Allele-specific amplification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2527/00—Reactions demanding special reaction conditions
    • C12Q2527/107—Temperature of melting, i.e. Tm

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Claims (21)

1. Oligonucleotid med dobbelt specificitet og med forøget annealing-specificitet, der er repræsenteret ved følgende almene formel: 5’-Xp-Yq-Zr-3’ hvor Xp repræsenterer et 5’-specificitetsparti med høj Tm, der har en hybridise-ringsnucleotidsekvens, der i det væsentlige er komplementær med et sted på en initial målskabelonnucleinsyre til hybridisering dermed, Yq repræsenterer et separeringsparti omfattende mindst tre på hinanden følgende universelle baser, Zr repræsenterer et 3’-specificitetsparti med lav Tm, der har en hybridise-ringsnucleotidsekvens, der i det væsentlige er komplementær med et sted på den initiale målskabelonnucleinsyre til hybridisering dermed; p, q og r repræsenterer antallet af nucleotider, og p repræsenterer et helt tal på mindst 15, q repræsenterer et helt tal på mindst 3, og r repræsenterer et helt tal på mindst 3; og X, Y og Z er deoxyribonucleotid eller ribonucleotid; Tm af 5’-specificitetspartiet med høj Tm er mindst 20 °C højere end den af 3’-specificitetspartiet med lav Tm, separeringspartiet har den laveste Tm i de tre partier; 5’-specificitetspartiet med høj Tm er længere end 3’-specificitetspartiet med lav Tm; separeringspartiet danner en ikke-baseparring under betingelser, hvor 5’-specificitetspartiet med høj Tm og 3’-specificitetspartiet med lav Tm anneales til den initiale målskabelonnucleinsyre, hvilket gør det muligt, at 5’-specificitetspartiet med høj Tm kan separeres fra 3’-specificitetspartiet med lav Tm med hensyn til annealing-specificitet til den initiale målskabelonnucleinsyre, hvorved annealing-specificiteten af oligonucleotidet til den initiale målskabelonnucleinsyre bestemmes dobbelt af 5’-specificitetspar-tiet med høj Tm og 3’-specificitetspartiet med lav Tm således, at den overordnede annealing-specificitet af oligonucleotidet forøges.
2. Oligonucleotid med dobbelt specificitet ifølge krav 1, hvor den universelle base i separeringspartiet er valgt blandt gruppen bestående af deoxyinosin, ino- sin, 7-deaza-2'-deoxyinosin, 2-aza-2'-deoxyinosin, 2'-OMe-inosin, 2'-F-inosin, deoxy-3-nitropyrrol, 3-nitropyrrol, 2'-OMe-3-nitropyrrol, 2'-F-3-nitropyrrol, 1-(2'-deoxy-beta-D-ribofuranosyl)-3-nitropyrrol, deoxy-5-nitroindol, 5-nitroindol, 2'-OMe-5-nitroindol, 2'-F-5-nitroindol, deoxy-4-nitrobenzimidazol, 4-nitrobenzimida-zol, deoxy-4-aminobenzimidazol, 4-aminobenzimidazol, deoxy-nebularin, 2'-F-nebularin, 2'-F-4-nitrobenzimidazol, PNA-5-introindol, PNA-nebularin, PNA-ino-sin, PNA-4-nitrobenzimidazol, PNA-3-nitropyrrol, morpholino-5-nitroindol, morpholino-nebularin, morpholino-inosin, morpholino-4-nitrobenzimidazol, morpholino-3-nitropyrrol, phosphoramidat-5-nitroindol, phosphoramidat-nebula-rin, phosphoramidat-inosin, phosphoramidat-4-nitrobenzimidazol, phosphorami-dat-3-nitropyrrol, 2'-0-methoxyethyl-inosin, 2'0-methoxyethyl-nebularin, 2'-0-methoxyethyl-5-nitroindol, 2'-0-methoxyethyl-4-nitro-benzimidazol, 2'-0-metho-xyethyl 3-nitropyrrol og kombinationer heraf.
3. Oligonucleotid med dobbelt specificitet ifølge krav 2, hvor den universelle base er deoxyinosin, 1-(2’-deoxy-beta-D-ribofuranosyl)-3-nitropyrrol eller 5-nitroindol.
4. Oligonucleotid med dobbelt specificitet ifølge krav 3, hvor den universelle base er deoxyinosin.
5. Oligonucleotid med dobbelt specificitet ifølge krav 1, hvor p repræsenterer et helt tal på 15 til 40, fortrinsvis 15 til 25.
6. Oligonucleotid med dobbelt specificitet ifølge krav 1, hvor q repræsenterer et helt tal på 3 til 10.
7. Oligonucleotid med dobbelt specificitet ifølge krav 1, hvor r repræsenterer et helt tal på 3 til 15.
8. Oligonucleotid med dobbelt specificitet ifølge krav 1, hvor Tm af 5’-specifici- tetspartiet med høj Tm er i området fra 40 °C til 80 °C.
9. Oligonucleotid med dobbelt specificitet ifølge krav 1, hvor Tm af 3’-specifici-tetspartiet med lav Tm er i området fra 10 °C til 40 °C.
10. Oligonucleotid med dobbelt specificitet ifølge krav 1, hvor Tm af separeringspartiet er i området fra 3 °C til 15 °C.
11. Fremgangsmåde til syntetisering af et nucleinsyremolekyle under anvendelse af et oligonucleotid med dobbelt specificitet ved en skabelonafhængig forlængelsesreaktion, der omfatter trinene: (a) at anneale oligonucleotidet med dobbelt specificitet til et skabelonnucleinsy-remolekyle, hvor oligonucleotidet med dobbelt specificitet er repræsenteret ved følgende almene formel: 5’-Xp-Yq-Zr-3’ hvor Xp repræsenterer et 5’-specificitetsparti med høj Tm, der har en hybridise-ringsnucleotidsekvens, der i det væsentlige er komplementær med et sted på en skabelonnucleinsyre til hybridisering dermed, Yq repræsenterer et separeringsparti omfattende mindst tre på hinanden følgende universelle baser, Zr repræsenterer et 3’-specificitetsparti med lav Tm, der har en hybridiseringsnucleotidse-kvens, der i det væsentlige er komplementær med et sted på skabelonnucleinsy-ren til hybridisering dermed; p, q og r repræsenterer antallet af nucleotider, og p repræsenterer et helt tal på mindst 15, q repræsenterer et helt tal på mindst 3, og r repræsenterer et helt tal på mindst 3; og X, Y og Z er deoxyribonucleotid eller ribonucleotid; Tm af 5’-specificitetspartiet med høj Tm er mindst 20 °C højere end den af 3’-specificitetspartiet med lav Tm, separeringspartiet har den laveste Tm i de tre partier; 5’-specificitetspartiet med høj Tm er længere end 3’-specificitets-partiet med lav Tm; separeringspartiet danner en ikke-baseparring, der ikke tjener som hybridiseringssted og ikke interagerer med skabelonen til baseparring, under betingelser, hvor 5’-specificitetspartiet med høj Tm og 3’-specificitetspartiet med lav Tm anneales til skabelonnucleinsyren, hvilket gør det muligt, at 5’-speci-ficitetspartiet med høj Tm kan separeres fra 3’-specificitetspartiet med lav Tm med hensyn til annealing-specificitet til skabelonnucleinsyren, hvorved annealing-specificiteten af oligonucleotidet bestemmes dobbelt af 5’-specificitetspartiet med høj Tm og 3’-specificitetspartiet med lav Tm således, at den overordnede annealing-specificitet af oligonucleotidet forøges; og (b) at forlænge oligonucleotidet med dobbelt specificitet til syntetisering af nucleinsyremolekylet, der er komplementært med skabelonnucleinsyren.
12. Fremgangsmåde ifølge krav 11, hvor syntesen af nucleinsyremolekylet opnås ved gentagelse af processen med den skabelonafhængige forlængelsesreaktion, hvor trinene med annealing og forlængelse af oligonucleotidet med dobbelt specificitet følges af et denatureringstrin.
13. Fremgangsmåde ifølge krav 11, hvor oligonucleotidet med dobbelt specificitet er en probe, der er immobiliseret på et substrat.
14. Fremgangsmåde ifølge krav 11, hvor annealingen udføres ved en temperatur i området fra 45 °C til 68 °C.
15. Fremgangsmåde ifølge krav 11, hvor p repræsenterer et helt tal på 15 til 40, fortrinsvis 15 til 25.
16. Fremgangsmåde ifølge krav 11, hvor q repræsenterer et helt tal på 3 til 10.
17. Fremgangsmåde ifølge krav 11, hvor r repræsenterer et helt tal på 3 til 15.
18. Fremgangsmåde ifølge krav 11, hvor Tm af 5’-specificitetspartiet med høj Tm er i området fra 40 °C til 80 °C.
19. Fremgangsmåde ifølge krav 11, hvor Tm af 3’-specificitetspartiet med lav Tm er i området fra 10 °C til 40 °C.
20. Fremgangsmåde ifølge krav 11, hvor Tm af separeringspartiet er i området fra 3 °C til 15 °C.
21. Anvendelse af universelle baser til fremstilling af et oligonucleotid med dobbelt specificitet og med forøget annealing-specificitet for at gøre det muligt, at en annealing-specificitet af oligonucleotidet med dobbelt specificitet kan bestemmes dobbelt via en struktur af oligonucleotidet med dobbelt specificitet, hvor fremstillingen omfatter trinene: (a) at vælge en målnucleinsyresekvens; (b) at designe en sekvens af et oligonucleotid med (i) en hybridiseringssekvens, der i det væsentlige er komplementær med målnucleinsyren, og (ii) et separeringsparti omfattende mindst tre på hinanden følgende universelle baser, så at separeringspartiet griber ind i hybridiseringssekvensen til dannelse af tre partier i oligonucleotidet; og (c) at bestemme positionen af separeringspartiet i oligonucleotidet, så at et parti ved 5’-retningen af separeringspartiet kan have en højere Tm end et parti ved 3’-retningen af separeringspartiet, og så at separeringspartiet kan have den laveste Tm i de tre partier, hvorved der tilvejebringes et oligonucleotid med tre distinkte partier med forskellige Tm-værdier fra hinanden, hvor (i) et 5’-specifici-tetsparti med høj Tm af oligonucleotidet har en hybridiseringsnucleotidsekvens, der i det væsentlige er komplementær med målnucleinsyren, (ii) et 3’-specifici-tetsparti med lav Tm af oligonucleotidet har en hybridiseringsnucleotidsekvens, der i det væsentlige er komplementær med målnucleinsyren; og (iii) separeringspartiet af oligonucleotidet mellem 5’-specificitetspartiet med høj Tm og 3’-specifi-citetspartiet med lav Tm omfatter mindst tre på hinanden følgende universelle baser; 5’-specificitetspartiet med høj Tm har en længde på mindst 15 nucleotider, separeringspartiet har en længde på mindst 3 nucleotider, og 3’-specificitetspar-tiet med lav Tm har en længde på mindst 3 nucleotider; Tm af 5’-specificitetspar- tiet med høj Tm er mindst 20 °C højere end den af 3’-specificitetspartiet med lav Tm, separeringspartiet har den laveste Tm i de tre partier; 5’-specificitetspartiet med høj Tm er længere end 3’-specificitetspartiet med lav Tm, hvorved annealing-specificiteten af oligonucleotidet til målnucleinsyren bestemmes dobbelt af både 5’-specificitetspartiet med høj Tm og 3’-specificitetspartiet med lav Tm.
DK11168429.6T 2005-03-05 2006-03-03 Fremgangsmåder under anvendelse af oligonucleotid med dobbelt specificitet og oligonucleotid med dobbelt specificitet DK2365078T3 (da)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR20050018419 2005-03-05
PCT/KR2005/001206 WO2006095941A1 (en) 2005-03-05 2005-04-26 Processes using dual specificity oligonucleotide and dual specificity oligonucleotide
EP06716196A EP1856257B1 (en) 2005-03-05 2006-03-03 Processes using dual specificity oligonucleotide and dual specificity oligonucleotide

Publications (1)

Publication Number Publication Date
DK2365078T3 true DK2365078T3 (da) 2014-02-24

Family

ID=36953514

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK06716196.8T DK1856257T3 (da) 2005-03-05 2006-03-03 Fremgangsmåder under anvendelser af oligonucleotid med dobbelt specificitet og oligonucleotid med dobbelt specificitet
DK11168429.6T DK2365078T3 (da) 2005-03-05 2006-03-03 Fremgangsmåder under anvendelse af oligonucleotid med dobbelt specificitet og oligonucleotid med dobbelt specificitet

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK06716196.8T DK1856257T3 (da) 2005-03-05 2006-03-03 Fremgangsmåder under anvendelser af oligonucleotid med dobbelt specificitet og oligonucleotid med dobbelt specificitet

Country Status (20)

Country Link
US (4) US8092997B2 (da)
EP (1) EP2365078B1 (da)
JP (1) JP4903725B2 (da)
KR (3) KR101440404B1 (da)
CN (1) CN101189336B (da)
AT (1) ATE529534T1 (da)
AU (1) AU2006221202B2 (da)
BR (1) BRPI0609031B1 (da)
CA (1) CA2599647C (da)
DK (2) DK1856257T3 (da)
ES (2) ES2447297T3 (da)
IL (1) IL185683A (da)
MX (1) MX2007010875A (da)
MY (1) MY162156A (da)
NO (2) NO339577B1 (da)
NZ (1) NZ561166A (da)
PL (1) PL2365078T3 (da)
PT (1) PT2365078E (da)
WO (1) WO2006095941A1 (da)
ZA (1) ZA200707514B (da)

Families Citing this family (38)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2006095941A1 (en) 2005-03-05 2006-09-14 Seegene, Inc. Processes using dual specificity oligonucleotide and dual specificity oligonucleotide
JP5197579B2 (ja) * 2006-05-04 2013-05-15 シージーン アイエヌシー 既知の配列に隣接した未知のｄｎａ配列を増幅する方法
ES2725003T3 (es) 2007-03-28 2019-09-18 Signal Diagnostics Sistema y método de análisis de alta resolución de ácidos nucleicos para detectar variaciones de secuencia
WO2010026450A1 (en) * 2008-09-03 2010-03-11 Quantumdx Group Limited Sensing strategies and methods for nucleic acid detection using biosensors
US10669574B2 (en) * 2008-11-18 2020-06-02 XCR Diagnostics, Inc. DNA amplification technology
EP2389585A2 (en) * 2009-01-22 2011-11-30 Li-Cor, Inc. Single molecule proteomics with dynamic probes
WO2011027966A2 (en) * 2009-09-03 2011-03-10 Seegene, Inc. Td probe and its uses
KR101590175B1 (ko) * 2009-09-24 2016-01-29 주식회사 씨젠 반복적 엑소핵산 절단 반응에 의한 타겟 핵산서열의 검출
KR20110050327A (ko) * 2009-11-07 2011-05-13 주식회사 씨젠 Ｔｈｄ 프라이머 타겟 검출
US8940486B2 (en) * 2010-01-12 2015-01-27 Siemens Healthcare Diagnostics Inc. Oligonucleotides and methods for detecting KRAS and PIK3CA mutations
JP2013081448A (ja) * 2011-05-02 2013-05-09 Arkray Inc 遺伝子変異検出用プローブ
BR112013028296B1 (pt) 2011-05-04 2020-03-24 Biocept, Inc. Métodos para detecção de variantes de sequências de ácido nucléico
GB201116131D0 (en) * 2011-09-19 2011-11-02 Epistem Ltd Probe
CN104388426B (zh) * 2012-02-28 2017-08-08 盛司潼 一种Oligo dT引物及构建cDNA文库的方法
RU2015103777A (ru) * 2012-07-17 2016-09-10 Дна Лоджикс, Инк. Кооперативные праймеры, зонды и их применения
US20140038182A1 (en) 2012-07-17 2014-02-06 Dna Logix, Inc. Cooperative primers, probes, and applications thereof
EP3346016B1 (en) 2013-02-07 2019-10-02 Rutgers, the State University of New Jersey Highly selective nucleic acid amplification primers
GB201317355D0 (en) * 2013-10-01 2013-11-13 Epistem Ltd Mutation Analysis
CN103710431B (zh) * 2013-10-30 2017-04-19 常州市第三人民医院 一种检测基因突变的引物及其应用
CN117106868A (zh) * 2013-11-26 2023-11-24 杭州联川基因诊断技术有限公司 一种扩增靶核酸的试剂盒和方法
US10683534B2 (en) 2015-01-27 2020-06-16 BioSpyder Technologies, Inc. Ligation assays in liquid phase
US9856521B2 (en) * 2015-01-27 2018-01-02 BioSpyder Technologies, Inc. Ligation assays in liquid phase
US20170349926A1 (en) * 2014-12-22 2017-12-07 DNAe Group Holdings LTD. Bubble primers
KR101742681B1 (ko) 2015-01-30 2017-06-01 에스디 바이오센서 주식회사 상보적 염기서열 내지는 미스-매치된 염기를 포함하는 상보적인 염기서열과 연결된 pcr 프라이머 및 이를 이용한 핵산 증폭 방법
WO2016137031A1 (ko) * 2015-02-25 2016-09-01 (주)다이오진 덤벨 구조 올리고뉴클레오티드, 이를 포함한 핵산 증폭용 프라이머 및 이를 이용한 핵산 증폭 방법
CN105154437A (zh) * 2015-07-28 2015-12-16 中国检验检疫科学研究院 用于多重pcr检测转基因作物的dpo引物组合及检测方法
CN105274096A (zh) * 2015-09-07 2016-01-27 中国人民解放军第三军医大学第一附属医院 桥式序列区掺入错配碱基的桥式荧光探针及其应用和方法
JP6938641B2 (ja) * 2016-12-29 2021-09-22 シージーン アイエヌシー プライマーダイマー形成を減少させ、増幅効率を増加させる方法
KR101856205B1 (ko) * 2017-11-16 2018-06-20 제노플랜코리아 주식회사 핵산의 대립형질 특이적 프라이머 및 이를 이용한 유전형 판별 방법
KR20190056276A (ko) 2018-05-02 2019-05-24 제노플랜코리아 주식회사 핵산의 대립형질 특이적 프라이머 및 이를 이용한 유전형 판별 방법
EP3807420A1 (en) 2018-06-12 2021-04-21 Keygene N.V. Nucleic acid amplification method
CN108753935A (zh) * 2018-06-15 2018-11-06 上海优甲医疗科技有限公司 一种降低多重聚合酶链式反应中引物二聚体扩增的方法
EP3856931B1 (en) 2018-09-25 2023-10-11 Co-Diagnostics, Inc. Allele-specific design of cooperative primers for improved nucleic acid variant genotyping
CN113557298B (zh) * 2019-03-13 2024-08-27 东洋纺株式会社 核酸的生成和扩增
CN109811080A (zh) * 2019-04-02 2019-05-28 丹娜（天津）生物科技有限公司 一种念珠菌分种检测的dpo引物对、检测方法、试剂盒及其应用
CA3189668A1 (en) 2020-08-31 2022-03-03 Do Hee Kim Computer-implemented method for supplying a nucleic acid dataset for thedesign of oligonucleotides
KR20240124818A (ko) * 2023-02-09 2024-08-19 경희대학교 산학협력단 이중 타겟 핵산 분자 설계 플랫폼
CN117778575A (zh) * 2023-12-25 2024-03-29 深圳海普洛斯医学检验实验室 一种用于检测SNV位点的TaqMan探针及其应用

Family Cites Families (32)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4683195A (en) 1986-01-30 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences
US4683202A (en) 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
US4800159A (en) 1986-02-07 1989-01-24 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences
IL86724A (en) 1987-06-19 1995-01-24 Siska Diagnostics Inc Methods and kits for amplification and testing of nucleic acid sequences
JP2846018B2 (ja) 1988-01-21 1999-01-13 ジェネンテク，インコーポレイテッド 核酸配列の増幅および検出
CA1340807C (en) 1988-02-24 1999-11-02 Lawrence T. Malek Nucleic acid amplification process
US5817797A (en) 1988-06-01 1998-10-06 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Sequencing DNA; a modification of the polymerase chain reaction
US5130238A (en) 1988-06-24 1992-07-14 Cangene Corporation Enhanced nucleic acid amplification process
DE68926504T2 (de) 1988-07-20 1996-09-12 David Segev Verfahren zur amplifizierung und zum nachweis von nukleinsäuresequenzen
WO1990010716A1 (en) 1989-03-10 1990-09-20 Gene-Trak Systems Immobilized oligonucleotide probes and uses therefor
AU635105B2 (en) 1990-01-26 1993-03-11 Abbott Laboratories Improved method of amplifying target nucleic acids applicable to both polymerase and ligase chain reactions
US5756285A (en) 1991-09-27 1998-05-26 Amersham Life Science, Inc. DNA cycle sequencing
US6197556B1 (en) * 1991-12-20 2001-03-06 The University Of Chicago Nucleic acid amplification using modular branched primers
US5432065A (en) 1993-03-30 1995-07-11 United States Biochemical Corporation Cycle sequencing with non-thermostable DNA polymerases
US6077668A (en) 1993-04-15 2000-06-20 University Of Rochester Highly sensitive multimeric nucleic acid probes
US5831065A (en) 1994-04-04 1998-11-03 Lynx Therapeutics, Inc. Kits for DNA sequencing by stepwise ligation and cleavage
US20020055101A1 (en) * 1995-09-11 2002-05-09 Michel G. Bergeron Specific and universal probes and amplification primers to rapidly detect and identify common bacterial pathogens and antibiotic resistance genes from clinical specimens for routine diagnosis in microbiology laboratories
SE506700C2 (sv) 1996-05-31 1998-02-02 Mikael Kubista Sond och förfaranden för analys av nukleinsyra
US5723298A (en) 1996-09-16 1998-03-03 Li-Cor, Inc. Cycle labeling and sequencing with thermostable polymerases
US6309824B1 (en) 1997-01-16 2001-10-30 Hyseq, Inc. Methods for analyzing a target nucleic acid using immobilized heterogeneous mixtures of oligonucleotide probes
US6794499B2 (en) * 1997-09-12 2004-09-21 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
US20030165888A1 (en) * 2001-07-18 2003-09-04 Brown Bob D. Oligonucleotide probes and primers comprising universal bases for diagnostic purposes
US6013449A (en) 1997-11-26 2000-01-11 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Probe-based analysis of heterozygous mutations using two-color labelling
US6140054A (en) 1998-09-30 2000-10-31 University Of Utah Research Foundation Multiplex genotyping using fluorescent hybridization probes
US6350580B1 (en) 2000-10-11 2002-02-26 Stratagene Methods for detection of a target nucleic acid using a probe comprising secondary structure
ATE407224T1 (de) * 2001-12-08 2008-09-15 Seegene Inc Annealing-kontrollprimer und seine verwendungen
WO2003050303A2 (en) 2001-12-12 2003-06-19 Genset S.A. Biallelic markers of d-amino acid oxidase and uses thereof
EP1520040A2 (en) * 2002-06-20 2005-04-06 Nuevolution A/S Microarrays displaying encoded molecules
HUE033651T2 (en) * 2002-10-30 2017-12-28 Nuevolution As A method for producing two-function complexes
EP1597395A2 (en) * 2003-02-21 2005-11-23 Nuevolution A/S Method for producing second-generation library
WO2006095941A1 (en) * 2005-03-05 2006-09-14 Seegene, Inc. Processes using dual specificity oligonucleotide and dual specificity oligonucleotide
FR2933490B1 (fr) 2008-07-02 2010-08-27 Commissariat Energie Atomique Procede de mesure du debit d'un liquide en ecoulement dans un canal fluidique et dispositif de mise en oeuvre

Also Published As

Publication number Publication date
CA2599647A1 (en) 2006-09-14
KR20140056397A (ko) 2014-05-09
KR101440404B1 (ko) 2014-09-17
CA2599647C (en) 2013-07-16
ZA200707514B (en) 2008-12-31
US20130090464A1 (en) 2013-04-11
NO20074394L (no) 2007-12-05
BRPI0609031B1 (pt) 2017-09-26
ES2447297T3 (es) 2014-03-11
US10870675B2 (en) 2020-12-22
WO2006095941A1 (en) 2006-09-14
US8092997B2 (en) 2012-01-10
NO339577B1 (no) 2017-01-09
JP2008531040A (ja) 2008-08-14
MY162156A (en) 2017-05-31
NZ561166A (en) 2011-09-30
AU2006221202B2 (en) 2010-11-11
EP2365078A1 (en) 2011-09-14
JP4903725B2 (ja) 2012-03-28
US20120135473A1 (en) 2012-05-31
IL185683A (en) 2013-04-30
PL2365078T3 (pl) 2014-04-30
NO20161140A1 (no) 2016-07-08
PT2365078E (pt) 2014-02-20
US9884890B2 (en) 2018-02-06
EP2365078B1 (en) 2013-11-20
US8323895B2 (en) 2012-12-04
MX2007010875A (es) 2008-02-20
KR20130018374A (ko) 2013-02-20
BRPI0609031A2 (pt) 2010-11-16
AU2006221202A1 (en) 2006-09-14
US20180141970A1 (en) 2018-05-24
KR101534228B1 (ko) 2015-07-07
ES2375571T3 (es) 2012-03-02
ATE529534T1 (de) 2011-11-15
NO340891B1 (no) 2017-07-10
CN101189336B (zh) 2012-10-24
US20080305478A1 (en) 2008-12-11
KR20130101172A (ko) 2013-09-12
DK1856257T3 (da) 2012-02-27
IL185683A0 (en) 2008-01-06
CN101189336A (zh) 2008-05-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US10870675B2 (en) Process using dual specificity oligonucleotide and dual specificity oligonucleotide
EP1856257B1 (en) Processes using dual specificity oligonucleotide and dual specificity oligonucleotide
KR100649165B1 (ko) 어닐링 조절 프라이머 및 그의 용도
JP2005511096A6 (ja) アニーリング調節プライマーおよびその使用
点击 这是indexloc提供的php浏览器服务，不要输入任何密码和下载