TW202500194A - 用於癌症治療中患者選擇之CEACAM5 mRNA分析 - Google Patents
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Abstract
本揭露關於用於選擇和治療癌症患者之方法和用途,其中該癌症表現CEACAM5。該等方法包括確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(Transcripts Per Kilobase Million,TPM)值,(ii) 將所述值與參考值進行比較,以及 (iii) 如果經確定的值高於參考值,則選擇所述受試者用於癌症治療。用於治療所選擇的受試者的藥劑可為特賽妥單抗-雷星(tusamitamab ravtansine)。這樣的藥劑可以與一或多種額外的藥劑組合使用,以治療該癌症。在某些實施方式中,癌症係非鱗狀非小細胞肺癌(NSQ NSCLC)。
Description
序列表的引用
本申請含有已經以.xml格式電子遞交的序列表並且該序列表藉由引用以其全文特此併入。所述.xml副本創建於2024年3月12日,名為PI022916.WO SANOFI (S327) LISTING.xml。
本揭露關於癌症治療領域。
儘管最近在癌症治療方面取得了進展,但在一線療法後疾病進展時,仍然需要有效的新治療。目前將血管生成抑制劑與全身性細胞毒性劑(如多西他賽(docetaxel))組合的後續全身性選擇的治療方法會帶來嚴重的血液學和其他毒性。多西他賽、培美曲塞(pemetrexed)或吉西他濱(gemcitabine)作為單一細胞毒性劑提供的其他選擇非常有限。因此,靶向細胞毒性療法可以改善安全性、耐受性以及功效。
肺癌係全球癌症相關死亡率的主要原因[1]。在美國,非鱗狀非小細胞肺癌(NSQ-NSCLC)占新診斷肺癌的45.4%,其中47.7%存在遠端轉移[2],相關的5年相對生存率較低,僅為5%至8%[3]。
雖然一些肺癌對靶向多種致癌基因驅動因素的療法[4]或免疫檢查點抑制劑(immune checkpoint inhibitor,ICI)[5]有反應,但對於其肺癌沒有可操作靶點或對ICI無反應的患者,對新型療法仍存在未滿足的需求。
癌胚抗原相關細胞黏附分子(Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule,CEACAM)係參與細胞黏附、細胞訊息傳遞以及促進癌症進展和轉移的細胞表面醣蛋白[6]。因此,它們係新型抗癌藥劑的有希望的標靶。
儘管不同的CEACAM在組織中顯示出特異性表現模式,但它們在結構同源性和胺基酸序列方面表現出相似性[7]。這要求靶向CEACAM的分子必須與單個CEACAM特異性結合,以限制交叉反應性和劑量限制性毒性。
CEACAM5於1965年被首次描述為人類結腸癌組織萃取物中的腫瘤相關抗原(Gold P等人,J Exp Med. [實驗醫學雜誌] 1965;122(3):467-481)。此後,在幾種上皮瘤中觀察到高水平的CEACAM5表現,而在正常成人組織中,其表現僅限於少數組織(Hammarstrom S., Semin Cancer Biol. [癌症生物學研討會] 1999;9(2):67-81;Thompson JA., Tumor Biol. [腫瘤生物學] 1995;16(1):10-16)。
在CEACAM中,在肺癌中,靶向CEACAM5的療法特別令人感興趣。CEACAM5在許多上皮瘤中過表現[8],這促進了腫瘤發生和轉移[9]。CEACAM5在NSCLC中表現水平較高,但在正常肺組織中不表現[7,10]。此外,人類NSCLC組織中CEACAM5表現較高與較差的組織學分級相關[10],並且CEACAM5表現較高與NSCLC患者生存率低相關。[11,12]綜上所述,該等發現表明CEACAM5係抗體藥物接合物(antibody-drug conjugate,ADC)療法的有希望的標靶。
抗體藥物接合物(ADC)已顯示有望改善肺癌患者的預後[13]。特賽妥單抗-雷星(tusamitamab ravtansine,SAR408701)係一種潛在的首創(first-in-class)ADC,其選擇性靶向表現CEACAM5的腫瘤細胞,而不與CEACAM1、CEACAM6或CEACAM8醣蛋白結合[7]。它由經由可切割連接子與強效細胞毒性的美登素生物鹼類(maytansinoid)N2'-脫乙醯基-N-2'(4-甲基-4-巰基-1-側氧基戊基)-美登素(DM4)有效載荷接合的抗CEACAM5人源化單株抗體組成[7]。特賽妥單抗-雷星的抗體成分與CEACAM5胞外結構域結合,隨後ADC內化並且然後DM4釋放到腫瘤細胞中[14]。DM4抑制微管組裝,導致細胞週期停滯和細胞凋亡[14]。DM4及其活性代謝物(S-甲基-DM4)均穿過細胞膜,這意味著特賽妥單抗-雷星的細胞毒性作用既藉由與表現CEACAM5的腫瘤細胞的特異性結合直接作用,又藉由DM4和S-甲基-DM4的局部擴散間接作用(旁觀者效應)[14]。
一項正在進行的研究(TED13751)證明了特賽妥單抗-雷星在針對NSQ NSCLC進行深度預治療的參與者中具有令人鼓舞的初步抗腫瘤活性。
在沒有可用的標準替代療法的晚期實體瘤患者中進行的特賽妥單抗-雷星的首次人體1/2期研究(ClinicalTrials.gov NCT02187848)的劑量遞增階段,主要劑量限制性毒性係可逆性角膜病變,並且最大耐受劑量為每2週100 mg/m
2[15]。
在同一研究的擴展階段,在表現高水平CEACAM5的晚期NSQ-NSCLC患者(定義為至少50%的腫瘤細胞在免疫組織化學(immunohistochemistry,IHC)上具有2+或3+染色強度)中,特賽妥單抗-雷星顯示出20.3%的有希望的客觀反應率和良好的安全性,其中最常見的治療中出現的不良事件係無力、可逆性角膜事件、周圍神經病、呼吸困難和腹瀉,與接受多西他賽的患者報告的那些不良事件相比,血液學毒性較少見[16];此外,在實現部分反應的患者中,47%的治療時間超過1年,這表明對特賽妥單抗-雷星的反應係持久的,並且經常是持續的[17]。
雖然該等臨床試驗數據顯示了前景,但在臨床實踐中,對可能對CEACAM5靶向療法有反應的癌症(例如NSQ-NSCLC)患者進行預篩選的潛在障礙包括用於藉由免疫組織化學測量CEACAM5表現的歸檔腫瘤生檢(biopsy)的可用性。
從上述1/2期研究中,我們探討了生物標誌物與以下方面的關聯性:1) 藉由免疫組織化學測量的腫瘤CEACAM5表現與腫瘤CEACAM5 mRNA水平;以及2) CEACAM5 mRNA是否預測腫瘤客觀反應率。
如實例所示,具有高CEACAM5蛋白表現水平並用特賽妥單抗-雷星治療的患者(特賽妥單抗-雷星反應者)的臨床反應豐富。
在本揭露中,關於用特賽妥單抗-雷星治療的表述「
患者臨床反應豐富」旨在係指投予給定治療後總體緩解率(overall response rate,ORR)增加。ORR被定義為對療法有部分反應或完全反應的患者的比例;其不包括穩定的疾病,並且係藥物殺腫瘤活性的直接測量。
此外,發現腫瘤中CEACAM5蛋白表現水平(藉由免疫組織化學(IHC)染色測量)與CEACAM5腫瘤mRNA水平之間存在相關性。CEACAM5 mRNA表現在具有高與中度CEACAM5蛋白表現的患者中顯著上調。此外,在特賽妥單抗-雷星反應者中,具有高CEACAM5腫瘤mRNA水平和高CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色(即,≥ 50%的腫瘤細胞中≥ 2+強度)的患者的臨床反應豐富。
由於顯示了高CEACAM5蛋白表現的臨床反應豐富,並且顯示了CEACAM5蛋白表現與mRNA CEACAM5表現水平之間的關聯性,因此表明在待用抗CEACAM5抗體藥物接合物(如特賽妥單抗-雷星)治療的患者中,mRNA CEACAM5表現水平係良好的生物標誌物,可預測臨床反應豐富;可替代地,結果表明,可以根據CEACAM5 mRNA水平而不是IHC來選擇患者。
因此,實例部分支持CEACAM5 mRNA水平作為生物標誌物之用途,其用於選擇和治療需要用抗體藥物接合物(ADC)用於癌症治療的患者,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體。
此外,實例部分支持CEACAM5 mRNA水平作為生物標誌物之用途,其用於選擇需要用抗體藥物接合物(ADC,其包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體)進行癌症治療的患者,用於用CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色進行的另外的選擇步驟以及隨後用ADC治療需要癌症治療的患者。
蛋白表現水平並不一定與相應mRNA的表現水平相關係技術者的常識。
本揭露至少部分基於以下觀察結果:CEACAM5基因表現水平(例如CEACAM5基因轉錄水平,例如CEACAM5 mRNA水平,例如CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(Transcripts Per Kilobase Million,TPM)值)的特定值可用作選擇患者用於癌症治療的生物標誌物,該等癌症典型地在其腫瘤細胞上表現CEA細胞黏附分子5(CEACAM5)。
在一些實施方式中,本揭露關於一種用於選擇需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將所述經確定的值與參考值進行比較,以及
(iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則選擇所述受試者用於癌症治療。
在本揭露中,有需要的受試者係患有癌症的受試者。可以使用所述癌症腫瘤的分離樣本。
本文中,術語「
受試者」、「
患者」、「
有需要的受試者」和「
有需要的患者」可以互換使用。
在一些實施方式中,本揭露關於一種用於選擇需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將步驟 (i) 中確定的所述值與CEACAM5基因表現水平的參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中確定的該值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果步驟 (iv) 中經確定的強度高於該參考強度,則選擇所述受試者用於癌症治療。
步驟 (i) 和步驟 (iv) 的腫瘤樣本可為相同樣本或不同樣本。
在一些實施方式中,本揭露關於一種用於選擇並治療需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將所述經確定的值與參考值進行比較,
(iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則選擇所述受試者用於癌症治療,以及
(iv) 向所述選擇的受試者投予有效量的所述ADC。
在一些實施方式中,本揭露關於一種用於選擇並治療需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將步驟 (i) 中經確定的所述值與CEACAM5基因表現水平的參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者進行CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果步驟 (iv) 中經確定的強度高於該參考強度,則選擇所述受試者用於癌症治療,以及
(vii) 向所述選擇的受試者投予有效量的所述ADC。
在一些實施方式中,本揭露關於一種包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC),用於在治療有需要的受試者的癌症中使用,
該使用包括:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將所述經確定的值與參考值進行比較,以及
(iii) 如果所述經確定的值高於該參考值,則向所述受試者投予有效量的所述ADC。
在一些實施方式中,本揭露關於一種包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC),用於在治療有需要的受試者的癌症中使用,
該使用包括:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將步驟 (i) 中經確定的所述值與CEACAM5基因表現水平的參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果所述經確定的強度高於該參考強度,則向所述受試者投予有效量的所述ADC。
在一些實施方式中,本揭露關於從有需要的受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的測量值用於將所述腫瘤表徵為CEACAM5高度表現腫瘤之用途。
在一些實施方式中,本揭露關於從有需要的受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的測量值用於選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試之用途。
在一些實施方式中,本揭露關於從有需要的受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的測量值用於選擇所述受試者用CEACAM5靶向治療劑(例如包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC))治療癌症之用途。
在一些實施方式中,本揭露關於從有需要的受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的測量值用於選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試之用途,所述染色測試用於選擇所述受試者用CEACAM5靶向治療劑(例如包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC))治療癌症。
在一些實施方式中,CEACAM5基因表現水平的值可為CEACAM5基因轉錄本的測量值。
在一些實施方式中,CEACAM5基因轉錄本可為mRNA。
在一些實施方式中,本揭露之方法和用途包括確定腫瘤分離樣本中CEACAM5 mRNA水平值的步驟。
根據其目的之一,本揭露關於一種用於選擇需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(Transcripts Per Kilobase Million,TPM)值,
(ii) 將所述值與參考值進行比較,以及
(iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則選擇所述受試者用於癌症治療。
在一些實施方式中,CEACAM5基因表現水平的值可為CEACAM5基因轉錄本的測量值。
在一些實施方式中,CEACAM5基因轉錄本可為mRNA。
根據其目的之一,本揭露關於一種用於選擇需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值,
(ii) 將步驟 (i) 中經確定的所述值與參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果該經確定的強度高於該參考強度,則選擇所述受試者用於癌症治療。
根據其另一個目的,本揭露關於一種用於選擇並治療需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值,
(ii) 將所述值與參考值進行比較,
(iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則選擇所述受試者用於癌症治療,以及
(iv) 向所述選擇的受試者投予有效量的所述ADC。
由此,癌症可以得到治療。
根據其另一個目的,本揭露關於一種用於選擇並治療需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值,
(ii) 將步驟 (i) 中經確定的所述值與參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果該經確定的強度高於該參考強度,則選擇所述受試者用於癌症治療,以及
(vii) 向所述選擇的受試者投予有效量的所述ADC。
根據其另一個目的,本揭露關於一種包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC),用於在治療有需要的受試者的癌症中使用,
該使用包括 (i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值,(ii) 將所述值與參考值進行比較,以及 (iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則向所述受試者投予有效量的所述ADC。
根據其另一個目的,本揭露關於一種包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC),用於在治療有需要的受試者的癌症中使用,
該使用包括:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值,
(ii) 將步驟 (i) 中經確定的所述值與參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果該經確定的強度高於該參考強度,則向所述受試者投予有效量的所述ADC。
如實例部分所示,使用核糖核酸(RNA)定序評估了包括CEACAM5在內的約15,000個基因的表現。將RNA數據過濾,並定義為對數轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)。據觀察,差異基因表現分析已確定CEACAM5 mRNA係最相關的基因(並且也是唯一顯著的基因,調整的P = 0.00265),其中藉由IHC測量CEACAM5高與中度表現。高與中度CEACAM5表現中CEACAM5 mRNA每百萬轉錄本升高;以及 (C) CEACAM5 mRNA與CEACAM5 IHC H得分相關。因此,CEACAM5基因表現水平(RNA)可用於鑒定和選擇對CEACAM5靶向治療(如包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物)有反應的患者。
在本揭露中,「包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物」、「抗體藥物接合物」和「ADC」可互換使用。
在一些實施方式中,ADC可以以有效量使用。
在一些實施方式中,用途可以在有需要的受試者中體現。
在如本文揭露的用途中,在分離的生物樣本中測量CEACAM5 mRNA的生物標誌物。
在一些實施方式中,抗CEACAM5抗體可以包含具有SEQ ID NO: 1的胺基酸序列的HCDR1、具有SEQ ID NO: 2的胺基酸序列的HCDR2、具有SEQ ID NO: 3的胺基酸序列的HCDR3、具有SEQ ID NO: 4的胺基酸序列的LCDR1、具有胺基酸序列NTR的LCDR2和具有SEQ ID NO: 5的胺基酸序列的LCDR3。
在一些實施方式中,抗CEACAM5抗體可以包含由SEQ ID NO: 6組成的重鏈可變結構域(VH)和由SEQ ID NO: 7組成的輕鏈可變結構域(VL)。
在一些實施方式中,抗CEACAM5抗體可為特賽妥單抗(tusamitamab)。
在一些實施方式中,細胞毒性劑可以選自由以下組成之群組:放射性同位素、蛋白質毒素、小分子毒素及其任何組合。
在一些實施方式中,小分子毒素可以選自抗代謝物、DNA烷化劑、DNA交聯劑、DNA嵌入劑、抗微管劑、拓撲異構酶抑制劑及其任何組合。
在一些實施方式中,抗微管劑可以選自紫杉烷類(taxanes)、長春花生物鹼(vinca alkaloids)、美登素生物鹼類(maytansinoids)、秋水仙鹼(colchicine)、鬼臼毒素(podophyllotoxin)、灰黃黴素(griseofulvin)及其任何組合。
在一些實施方式中,細胞毒性劑可為美登素生物鹼類或美登素生物鹼類類似物。
在一些實施方式中,美登素生物鹼類可以選自N2'-脫乙醯基-N2'-(3-巰基-1-側氧基丙基)-美登素(N2’-deacetyl-N2’-(3-mercapto-1-oxopropyl)-maytansine,DM1)、N2'-脫乙醯基-N2'-(4-甲基-4-巰基-1-側氧基戊基)-美登素(N2’-deacetyl-N2’-(4-methyl-4-mercapto-1-oxopentyl)-maytansine,DM4)及其組合。
在一些實施方式中,抗CEACAM5抗體可以經由可切割或不可切割的連接子與至少一種化療劑共價附接。
在一些實施方式中,連接子可以選自基吡啶基二硫代丁酸N-琥珀醯亞胺酯(N-succinimidyl pyridyldithiobutyrate,SPDB)、4-(吡啶-2-基二硫烷基)-2-磺基-丁酸(4-(pyridin-2-yldisulfanyl)-2-sulfo-butyric acid,磺基-SPDB)和(N-馬來醯亞胺基甲基)環己烷-1-甲酸琥珀醯亞胺酯(succinimidyl(N-maleimidomethyl) cyclohexane-1-carboxylate,SMCC)。
在一些實施方式中,抗CEACAM5抗體可以經由可切割連接子與至少一種化療劑共價附接,該連接子選自吡啶基二硫代丁酸N-琥珀醯亞胺基酯(SPDB)、4-(吡啶-2-基二硫烷基)-2-磺基-丁酸(磺基-SPDB)和(N-馬來醯亞胺基甲基)環己烷-1-甲酸琥珀醯亞胺酯(SMCC)。
在一些實施方式中,CEACAM5抗體可以包含由SEQ ID NO: 8組成的重鏈(VH)和由SEQ ID NO: 9組成的輕鏈(VL)(huMAb2-3),並且其可以經由吡啶基二硫代丁酸N-琥珀醯亞胺基酯(SPDB)與N2'-脫乙醯基-N-2'(4-甲基-4-巰基-1-側氧基戊基)-美登素(DM4)共價連接。
在一些實施方式中,抗體藥物接合物的特徵可在於藥物抗體比(drug-to-antibody ratio,DAR)的範圍為1至10。
在一些實施方式中,抗體藥物接合物可為特賽妥單抗-雷星。
在一些實施方式中,參考值可為CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值。
在一些實施方式中,參考值可以為至少約7至約13。
在一些實施方式中,參考值可以為至少約7,或可以為至少約8、或至少約9、或至少約10、或至少約11、或至少約12、或至少約13。
在一些實施方式中,分位數標準化可以藉由以下方式獲得:(i) 按表現水平對樣本的轉錄本進行排序,(ii) 計算佔據相同排序的基因的平均值,以及 (iii) 用該平均值取代佔據所述相同排序的所有基因的值。
在一些實施方式中,轉錄本的表現水平在轉換為TPM之前可以以每百萬每千鹼基片段數(Fragments Per Kilobase Million,FPKM)來測量。
在一些實施方式中,每百萬每千鹼基片段數(FPKM)可以藉由以下方式獲得:對所述樣本中的總轉錄本進行計數,將獲得的轉錄本計數除以1,000,000,並將獲得的值除以基因的長度,以千鹼基計。
在一些實施方式中,癌症可以選自由以下組成之群組:肝細胞癌、結直腸癌、胃癌、胃食道交界處腺癌(gastroesophageal junction adenocarcinoma,GEJ)、食道癌、肺癌、子宮頸癌、胰臟癌、卵巢癌、甲狀腺癌、膀胱癌、子宮內膜癌、乳癌、肝癌、膽道癌、攝護腺癌、神經內分泌癌和皮膚癌。
在一些實施方式中,癌症可以選自由以下組成之群組:結直腸癌、胃癌、胃食道交界處腺癌(GEJ)、食道癌、肺癌、子宮頸癌、胰臟癌、卵巢癌、甲狀腺癌、膀胱癌、子宮內膜癌、乳癌、肝癌、膽道癌、攝護腺癌、神經內分泌癌和皮膚癌。
在一些實施方式中,癌症可以選自結直腸癌、胃癌、胃食道交界處腺癌(GEJ)、食道癌、胰臟癌和肺癌。
在一些實施方式中,癌症可為胃癌、胃食道交界處(GEJ)腺癌或食道癌。
在一些實施方式中,癌症可為胃癌。
在一些實施方式中,癌症可為結直腸癌。
在一些實施方式中,癌症可為胰臟癌。
在一些實施方式中,癌症可為胃食道交界處腺癌(GEJ)。
在一些實施方式中,癌症可為肺癌。
在一些實施方式中,肺癌可為非鱗狀非小細胞肺癌(non-squamous non-small cell lung cancer,NSQ NSCLC)。
在一些實施方式中,非鱗狀非小細胞肺癌可為晚期或轉移性NSQ NSCLC。
在一些實施方式中,非鱗狀非小細胞肺癌沒有表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)致敏突變或v-raf鼠肉瘤病毒致癌基因同源物B1(BRAF)突變或間變性淋巴瘤激酶/c-ros致癌基因1(ALK/ROS)改變。
在一些實施方式中,抗CEACAM5抗體可為特賽妥單抗。
在一些實施方式中,ADC可為特賽妥單抗-雷星。
在一些實施方式中,ADC的投予劑量可以為相對於所述受試者的體表面積≥ 80 mg/m
2,約每兩週一次,或者ADC的投予劑量可以為相對於所述受試者的體表面積≥ 80 mg/m
2,約每三週一次。
在一些實施方式中,ADC可以以80 mg/m
2至210 mg/m
2、80 mg/m
2至170 mg/m
2的劑量投予,或以80 mg/m
2至150 mg/m
2的劑量投予,或以80 mg/m
2至120 mg/m
2的劑量投予,或以80 mg/m
2至100 mg/m
2的劑量投予。
在一些實施方式中,ADC可以以80、100、120、150、170、180或210 mg/m
2的劑量投予。
在一些實施方式中,如本文所述之方法或用途可以進一步包括向受試者投予有效量的至少一種有效治療癌症的額外的藥劑。
在一些實施方式中,額外的藥劑可以選自由以下組成之群組:免疫檢查點抑制劑(ICI)、基於鉑的化療、培美曲塞、抗VEGFR2、FOLFOX、FOLFIRI、TAS-102、抗EGFR及其任何組合。
在一些實施方式中,ICI可為抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體。
在一些實施方式中,抗PD-1抗體可以選自由以下組成之群組:派姆單抗(pembrolizumab)、納武單抗(nivolumab)、西米普利單抗(cemiplimab)、信迪利單抗(sintilimab)、多塔利單抗(dostarlimab)和替雷利珠單抗(tislelizumab)。
在一些實施方式中,抗PD-L1抗體可以選自由以下組成之群組:阿特珠單抗(atezolizumab)、阿維魯單抗(avelumab)和德瓦魯單抗(durvalumab)。
在一些實施方式中,受試者接受有效量的特賽妥單抗-雷星和派姆單抗。
在一些實施方式中,如本文所述之方法或用途可以進一步包括向受試者投予有效量的基於鉑的化療。
在一些實施方式中,基於鉑的化療可以選自順鉑(cisplatin)和卡鉑(carboplatin)。
在一些實施方式中,如本文所述之方法或用途可以進一步包括向受試者投予有效量的培美曲塞。
序列簡要說明
SEQ ID NO: 1-5顯示了抗CEACAM5抗體(huMAb2-3)的序列CDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1和CDR-L3。
SEQ ID NO: 6顯示了抗CEACAM5抗體(huMAb2-3)的重鏈可變結構域(VH)的序列。
SEQ ID NO: 7顯示了抗CEACAM5抗體(huMAb2-3)的輕鏈可變結構域(VL)的序列。
SEQ ID NO: 8顯示了抗CEACAM5抗體(huMAb2-3)的重鏈序列。
SEQ ID NO: 9顯示了抗CEACAM5抗體(huMAb2-3)的輕鏈序列。
定義
除非本文另外定義,否則結合本揭露使用的科學和技術術語應具有本領域的具有通常知識者通常所理解的含義。例如,Concise Dictionary of Biomedicine and Molecular Biology [生物醫學和分子生物學簡明詞典],Juo, Pei-Show,第2版,2002, CRC Press [CRC出版社];Dictionary of Cell and Molecular Biology [細胞與分子生物學詞典],第3版,1999, Academic Press [學術出版社];和Oxford Dictionary Of Biochemistry And Molecular Biology [生物化學與分子生物學牛津英語詞典],修訂版,2000, Oxford University Press [牛津大學出版社]可以為技術者提供本揭露中使用的許多術語的通用詞典。雖然類似或者等效於本文所述之方法以及材料也可以用於本揭露之實踐或者測試中,但是下文描述了示例性方法以及材料。若存在衝突,則以本說明書(包括定義在內)為準。通常,結合本文所述之細胞和組織培養、分子生物學、病毒學、免疫學、微生物學、遺傳學、分析化學、合成有機化學、醫學和藥物化學以及蛋白質和核酸化學及雜交而使用的命名法及其技術係本領域中所熟知且通常使用的那些命名法及技術。酶促反應及純化技術係根據製造商的說明書、如本領域中通常所實現或如本文中所描述來進行。此外,除非上下文另有要求,否則單數術語將包括複數且複數術語將包括單數。
單位、前綴和符號以其國際單位制(International System Units,Système International des Unités,SI)接受的形式表示。數字範圍包括定義該範圍的數字。除非另有說明,否則胺基酸序列以胺基至羧基方向從左向右書寫。本文提供的標題不是對本揭露之各個方面的限制。因此,藉由參考說明書(以其全文)來更全面地定義下面緊接的定義的術語。
本文提及的所有出版物和其它參考文獻藉由引用以其全文併入。儘管本文引用了許多文件,但這種引用並不構成承認該等文件中的任何一個形成本領域公知常識的一部分。
在整個說明書以及實施方式中,詞語「
具有( have )」和「
包含( comprise )」或變體如「
具有( has/having)」或「
包含( comprises/comprising )」應當被理解為暗指包括所陳述的整體或整體的組,但不是排除任何其他的整體或整體的組。應理解,本文中用語言「
包含」描述方面的任何地方,還提供了以「由……組成」和/或「基本上由……組成」的形式描述的類似方面。
應當注意的是,「
一個/
種(a/an)」實體係指該實體的一個/種或多個/種;例如,「一個/種核苷酸序列」被理解為表示一個/種或多個/種核苷酸序列。因此,術語「一個/種」(a/an)、「一或多個」和「至少一個」在本文中可以互換使用。
此外,「
和 / 或」在本文中使用的情況下應被視為具有或不具有另一個指定特徵或組分的兩個指定特徵或組分中的每一個的特定揭露。因此,如在本文中在如「A和/或B」的片語中使用的術語「和/或」旨在包括「A和B」、「A或B」、「A」(單獨)和「B」(單獨)。同樣,如在如「A、B和/或C」等片語中所用的術語「和/或」意圖涵蓋以下方面中的每一個:A、B和C;A、B或C;A或C;A或B;B或C;A和C;A和B;B和C;A(單獨);B(單獨);以及C(單獨)。
術語「
大約」或「
約」本文用於意指大約、大致、近似或在……左右。當術語「約」結合數值範圍來使用時,它藉由將邊界延伸至高於以及低於所闡述的數值來限定這個範圍。一般而言,術語「約」可將數值限定至以例如10%上下(更高或更低)的變化高於以及低於規定值。在一些實施方式中,該術語表示與指示數值偏差±10%、±5%、±4%、±3%、±2%、±1%、±0.9%、±0.8%、±0.7%、±0.6%、±0.5%、±0.4%、±0.3%、±0.2%、±0.1%、±0.05%或±0.01%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±10%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±5%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±4%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±3%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±2%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±1%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±0.9%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±0.8%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±0.7%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±0.6%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±0.5%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±0.4%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±0.3%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±0.1%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±0.05%。在一些實施方式中,「約」表示與指示數值偏差±0.01%。
「
抗體」可為天然或常規抗體,其中兩條重鏈藉由雙硫鍵彼此連接,並且每條重鏈藉由雙硫鍵與輕鏈連接。有兩種類型的輕鏈,λ(l)和κ(k)。有以下五種主要的重鏈類別(或同種型),其確定抗體分子的功能活性:IgM、IgD、IgG、IgA和IgE。每條鏈含有不同的序列結構域。輕鏈包括兩個結構域或區域:可變結構域(VL)和恆定結構域(CL)。重鏈包括四個結構域:一個可變結構域(VH)和三個恆定結構域(CH1、CH2和CH3,統稱為CH)。輕鏈(VL)和重鏈(VH)二者的可變區決定了對抗原的結合識別和特異性。輕鏈恆定區結構域(CL)和重鏈恆定區結構域(CH)賦予重要的生物學特性,如抗體鏈締合、分泌、經胎盤的流動性、補體結合以及與Fc受體(FcR)的結合。Fv片段係免疫球蛋白Fab片段的N-末端部分,並且由一條輕鏈和一條重鏈的可變部分組成。抗體的特異性在於抗體結合位點和抗原決定簇之間的結構互補性。抗體結合位點由主要來自高變區或互補決定區(CDR)的殘基組成。有時,來自非高變區或框架區(FR)的殘基會影響整體結構域結構,從而影響結合位點。因此,互補決定區或CDR係指共同確定天然免疫球蛋白結合位點的天然Fv區的結合親和力和特異性的胺基酸序列。免疫球蛋白的輕鏈和重鏈各有三個CDR,分別指定為CDR1-L、CDR2-L、CDR3-L和CDR1-H、CDR2-H、CDR3-H。因此,常規抗體抗原結合位點包括六個CDR,其包含來自各個重鏈V區和輕鏈V區的CDR集。
如本文所用,術語「
抗體」旨在係指常規抗體及其片段,以及單結構域抗體及其片段,特別是單結構域抗體的可變重鏈,以及嵌合抗體、人源化抗體、雙特異性抗體或多特異性抗體。本文所考慮的抗體片段係抗原結合片段。
「
框架區」(Framework Region,FR)係指介於CDR之間的胺基酸序列,即單一物種中不同免疫球蛋白之間相對保守的免疫球蛋白輕鏈和重鏈可變區的那些部分。免疫球蛋白的輕鏈和重鏈各有四個FR,分別指定為FR1-L、FR2-L、FR3-L、FR4-L和FR1-H、FR2-H、FR3-H、FR4-H。人類框架區係與天然存在的人類抗體的框架區基本相同(約85%或更高,特別地90%、95%、97%、99%或100%)的框架區。
在本揭露之上下文中,免疫球蛋白輕鏈或重鏈中的CDR/FR定義將基於IMGT定義確定(Lefranc等人,Dev. Comp. Immunol. [發育與比較免疫學],2003, 27(1):55-77; www.imgt.org)。
如本文所用,抗體或免疫球蛋白還包括最近多次描述的「
單結構域抗體」,其係互補決定區係單結構域多肽的一部分的抗體。單結構域抗體之實例包括重鏈抗體、天然無輕鏈抗體、源自常規四鏈抗體的單結構域抗體、工程化單結構域抗體。單結構域抗體可以衍生自任何物種,包括但不限於小鼠、人類、駱駝、美洲駝、山羊、兔、牛。單結構域抗體可為天然存在的單結構域抗體,稱為不含輕鏈的重鏈抗體。特別地,駱駝科物種(例如駱駝、單峰駱駝、美洲駝、羊駝和原駝)產生天然缺乏輕鏈的重鏈抗體。駱駝科重鏈抗體也缺乏CH1結構域。
該等缺乏輕鏈的單結構域抗體的可變重鏈在本領域中被稱為「
VHH」或「
Nanobody
® 」。與常規VH結構域類似,VHH含有四個FR和三個CDR。VHH與常規抗體相比具有以下優勢:它們比IgG分子小約十倍,因此可以藉由體外表現產生正確折疊的功能性VHH,同時實現高產率。此外,VHH非常穩定,並且對蛋白酶的作用具有抗性。VHH的特性和產生已由Harmsen和De Haard HJ(Appl. Microbiol. Biotechnol. [應用微生物學與生物技術] 2007年11月;77(1):13-22)綜述。
如本文所用,術語「
單株抗體」或「
mAb」係指單一胺基酸序列的抗體分子,其針對特定抗原,並且不應被解釋為需要藉由任何特定方法產生抗體。單株抗體可以由B細胞或融合瘤的單一殖株產生,但也可為重組的,即藉由蛋白質工程產生。
術語「
人源化抗體」係指完全或部分非人源並且經修飾以替代某些胺基酸(特別地在VH和VL結構域的框架區中)以避免或最大程度減少人類免疫反應的抗體。人源化抗體的恆定結構域大多數情況下係人類CH和CL結構域。
(常規)抗體的「
片段」包含完整抗體的一部分,特別地完整抗體的抗原結合區或可變區。抗體片段之實例包括Fv、Fab、F(ab')2、Fab'、dsFv、(dsFv)2、scFv、sc(Fv)2、雙抗體、由抗體片段形成的雙特異性和多特異性抗體。常規抗體的片段也可為單結構域抗體,如重鏈抗體或VHH。
術語「
Fab」表示分子量為約50,000且具有抗原結合活性的抗體片段,其中重鏈的N末端側的約一半通過雙硫鍵與整個輕鏈結合在一起。它通常藉由用蛋白酶(如木瓜酶)處理IgG來在片段中獲得。
術語「
F(ab')2」係指分子量為約100,000且具有抗原結合活性的抗體片段,其略大於經由鉸鏈區的雙硫鍵結合的2個相同的Fab片段。它通常藉由用蛋白酶(如胃蛋白酶)處理IgG來在片段中獲得的。
術語「
Fab'」係指分子量為約50,000且具有抗原結合活性的抗體片段,其藉由切割F(ab')2鉸鏈區的雙硫鍵而獲得。
單鏈Fv(「
scFv」)多肽係共價連接的VH::VL異二聚體,其通常由基因融合物(包括由肽編碼連接子連接的VH和VL編碼基因)表現。本揭露之人類scFv片段包括以適當構形保持的CDR,特別是藉由使用基因重組技術進行。二價和多價抗體片段可以藉由單價scFv的締合自發形成,或可以藉由肽連接子偶合單價scFv而產生,如二價sc(Fv)2。「dsFv」係由雙硫鍵穩定的VH::VL異二聚體。「(dsFv)2」表示由肽連接子偶合的兩個dsFv。
術語「
雙特異性抗體」或「
BsAb」表示將兩種抗體的抗原結合位點結合在單個分子中的抗體。因此,BsAb能夠同時結合兩種不同的抗原。基因工程已越來越頻繁地用於設計、修飾和產生具有一組期望的結合特性和效應功能的抗體或抗體衍生物,如例如EP 2 050 764 A1中所述。
術語「
多特異性抗體」表示將兩種或更多種抗體的抗原結合位點結合在單個分子中的抗體。
術語「
雙抗體」係指具有兩個抗原結合位點的小抗體片段,該等片段包含與同一條多肽鏈(VH-VL)中的輕鏈可變結構域(VL)連接的重鏈可變結構域(VH)。藉由使用太短而不會允許同一條鏈的兩個結構域之間配對的連接子迫使結構域與另一條鏈的互補結構域配對並產生兩個抗原結合位點。
「
與參考序列具有至少 85% 同一性」的胺基酸序列係指在其整個長度上與參考胺基酸序列的整個長度具有85%或更多,特別地90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%序列同一性的序列。
藉由在比較視窗上比較兩個最佳比對的序列來確定胺基酸序列之間的「
序列同一性」百分比,其中與參考序列(其不包含添加或缺失)相比,比較視窗中的多核苷酸或多肽序列的部分可以包含添加或缺失(即,間隙(gap))以使兩個序列最佳比對。可以藉由以下方法計算百分比:確定在這兩個序列中出現相同核酸鹼基或胺基酸殘基的位置的數目以產生匹配位置數,將該匹配位置數除以該比較視窗中的位置總數,並將結果乘以100,從而得到序列同一性百分比。用於比較的序列的最佳比對藉由全域成對比對(例如)使用Needleman和Wunsch J. Mol. Biol. [分子生物學雜誌] 48:443 (1970)的演算法進行。序列同一性的百分比可以很容易地確定,例如使用程式Needle,用BLOSUM62矩陣,以及以下參數:間隙-開放= 10,間隙-延伸= 0.5。
「
保守胺基酸取代」係一個胺基酸殘基被具有類似化學特性(例如,電荷、尺寸或疏水性)的側鏈(R基團)的另一個胺基酸殘基取代的胺基酸取代。一般而言,保守胺基酸取代不會實質上改變蛋白質的功能特性。側鏈具有相似化學性質的胺基酸組之實例包括1) 脂肪族側鏈:甘胺酸、丙胺酸、纈胺酸、白胺酸和異白胺酸;2) 脂肪族-羥基側鏈:絲胺酸和蘇胺酸;3) 含醯胺側鏈:天冬醯胺和麩醯胺酸;4) 芳香族側鏈:苯丙胺酸、酪胺酸和色胺酸;5) 鹼性側鏈:離胺酸、精胺酸和組胺酸;6) 酸性側鏈:天冬胺酸和麩胺酸;和7) 含硫側鏈:半胱胺酸和甲硫胺酸。保守的胺基酸取代基團也可以根據胺基酸大小來定義。
在提及多肽(即本揭露之抗體)或核苷酸序列時,「
純化」和「
分離」意指所指示的分子在基本不存在其他相同類型生物大分子的情況下存在。如本文所用,術語「純化」特別地意指存在按重量計至少75%、85%、95%或98%的相同類型的生物大分子。編碼特定多肽的「分離」核酸分子係指基本上沒有其他不編碼目標多肽的核酸分子的核酸分子;然而,分子可以包括一些另外的鹼基或基團,該等鹼基或基團不會有害地影響組成物的基本特性。
如本文所用,術語「
受試者」或「
患者」表示哺乳動物,如嚙齒動物、貓科動物、犬科動物和靈長類動物。特別地,根據本揭露的受試者係人類。
如本文所用,「
投予(
administer或
administering)」係指向受試者遞送本文所述之組成物。可以使用本領域已知的方法將組成物投予於受試者。特別地,組成物可以靜脈內、皮下、肌內、皮內或經由任何黏膜表面例如口服、舌下、經頰、經鼻、直腸、陰道或經由肺途徑投予。在一些實施方式中,靜脈內進行投予。在一些實施方式中,皮下進行投予。
術語「
治療(
treat或
treatment)」或「
療法( therapy )」係指投予根據本揭露的化合物或組成物,目的係治癒、痊癒、緩和、減輕、改變、補救、緩解、改善或影響障礙、病症的症狀,或預防或延遲症狀、併發症的發作,或以統計學上顯著的方式阻止或抑制障礙的進一步發展。更特別地,「
治療(
treating或
treatment)」包括在受試者的癌症病症中獲得有益或期望的結果的任何方法。有益或期望的臨床結果可以包括但不限於緩和或緩解一或多種癌症症狀或病症,縮減或減輕癌症疾病或癌症症狀的程度,穩定(即不惡化)癌症疾病或癌症症狀的狀態,預防癌症疾病或癌症症狀的擴散,延遲或減緩癌症疾病或癌症症狀的進展,緩解或緩和癌症疾病狀態,縮減癌症疾病的復發,以及緩解(無論是部分還是全部,無論是可檢測還是不可檢測)。換言之,如本文所用,「治療」包括任何治癒、緩解或減輕癌症疾病或症狀。症狀或疾病的「減輕」意指降低疾病或症狀的嚴重程度或頻率,或消除疾病或症狀。
如本文所用,術語「
有效量」係指在所考慮的病理過程的治療、預防或管理中提供治療益處的量。治療有效的特定量可以很容易地由普通醫療從業者確定,並且可能因所考慮的病理過程的類型和階段、患者的病史和年齡以及其他治療劑的投予等因素而發生變化。
單位「
mg/m
2 」指示每劑量每m
2受試者體表投予的化合物量(以mg計)。熟悉該項技術者知曉如何根據要治療的受試者的體表確定其所需的化合物量,而該量進而又可以基於身高和體重來計算。
單位「
mg/kg」指示每劑量每kg受試者身體投予的化合物量(以mg計)。熟悉該項技術者知曉如何根據要治療的受試者的體重確定其所需的化合物量。
應理解的是,為清楚起見,在單獨的實施方式之上下文中描述的本揭露之某些特徵也可以在單個實施方式中組合提供。相反,為簡潔起見,在單一實施方式之上下文中描述的本揭露之多個特徵也可單獨提供或以任何合適的子組合提供。
「
生物標誌物」旨在係指與來自具有第二表型(例如,未患疾病)的受試者或一組受試者的生物樣本相比,從具有第一表型(例如患有該疾病,如癌症)的受試者或一組受試者獲得的生物樣本中差異存在、增加或減少的生物分子,例如蛋白質或代謝物。在使用中,生物標誌物從受試者分離。
「
樣本」或「
生物樣本」旨在係指從受試者分離的生物材料。生物樣本可以含有適用於檢測生物標誌物(即,CEACAM5 mRNA)的任何生物材料,並且可以包含來自受試者的細胞材料和/或非細胞材料。樣本可以從任何合適的生物組織或液體(如腎組織、血液、血漿(blood plasma/plasma)、血清(blood serum/serum)、尿液或腦脊液(CSF))中分離。在一些實施方式中,生物樣本係血漿或血清樣本。
「
參考值」或「
閾值」旨在係指指示相關受試者的特定疾病狀態,表型(如癌症)或其缺乏,以及疾病狀態、表型或其缺乏的組合的CEACAM5 mRNA水平。
除非另有定義,否則本文所用的全部技術和科學術語具有與本揭露所屬領域的具有通常知識者通常所理解的相同的意義。儘管與本文所述之方法和材料相似或等效的任何方法和材料也可以用於本揭露之實踐或測試中。本文提及的所有出版物藉由引用併入本文以揭露和描述與所引用的出版物相關的方法和/或材料。
列出了如下所述之來源、成分和組分的清單,使得其組合和混合物也被考慮並且在本文的範圍內。
應當理解在本說明書通篇中給出的每一最大數值限度包括每一較低數值限度,如同這樣的較低數值限度在本文中明確寫出一樣。在本說明書通篇中給出的每一最小數值限度將包括每一較高數值限度,如同這樣的較高數值限度在本文中明確寫出一樣。在本說明書通篇中給出的每一數值範圍將包括落入這樣的較寬數值範圍內的每一較窄數值範圍,如同這樣的較窄數值範圍在本文中全部明確寫出一樣。
所有專案列表(如例如成分列表)都旨在並且應被解釋為馬庫西群組(Markush group)。因此,所有列表都可以被解讀和解釋為「選自由專案列表組成之群組中」的專案「及其組合和混合物」。
本文所引用的可為包括本揭露中使用的各種成分在內的組分的商品名稱。本文的發明人無意受任何特定商品名稱下的材料的限制。在本文的描述中可以替換和使用與以商品名稱提及的材料等效的材料(例如,從不同來源以不同名稱或參考編號的獲得的材料)。
CEACAM mRNA 測量、方法和用途
根據其目的之一,本揭露關於用於選擇需要用靶向CEACAM5的治療劑治療癌症的受試者之方法和用途。靶向CEACAM5的治療劑可為與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體。
本揭露之方法和用途可以包括確定腫瘤樣本中CEACAM5基因表現(基因轉錄本或RNA)的量的步驟。
本揭露之方法和用途可以包括確定腫瘤樣本中CEACAM5基因表現的量(如CEACAM5 mRNA水平)的步驟。
CEACAM5基因表現的量可以表示為相對於腫瘤樣本中總基因表現以及相對於表現的DNA的總長度的量或任何其他已知方法進行表示的量。
在一些實施方式中,本揭露關於一種用於選擇需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將所述經確定的值與參考值進行比較,以及
(iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則選擇所述受試者用於癌症治療。
在一些實施方式中,本揭露關於一種用於選擇需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將步驟 (i) 中經確定的所述值與CEACAM5基因表現水平的參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果步驟 (iv) 中經確定的強度高於該參考強度,則選擇所述受試者用於癌症治療。
步驟 (i) 和步驟 (iv) 的腫瘤樣本可為相同樣本或不同樣本。
在一些實施方式中,本揭露關於一種用於診斷有需要的受試者是否有資格用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將所述經確定的值與參考值進行比較,以及
(iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則選擇所述受試者有資格用於癌症治療。
在一些實施方式中,本揭露關於一種用於診斷有需要的受試者是否有資格用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將步驟 (i) 中經確定的所述值與CEACAM5基因表現水平的參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果步驟 (iv) 中經確定的強度高於該參考強度,則選擇所述受試者用於癌症治療。
在一些實施方式中,本揭露關於一種用於選擇並治療需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將所述經確定的值與參考值進行比較,
(iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則選擇所述受試者用於癌症治療,以及
(iv) 向所述選擇的受試者投予有效量的所述ADC。
在一些實施方式中,本揭露關於一種用於選擇並治療需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將步驟 (i) 中經確定的所述值與CEACAM5基因表現水平的參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果步驟 (iv) 中經確定的強度高於該參考強度,則選擇所述受試者用於癌症治療,以及
(vii) 向所述選擇的受試者投予有效量的所述ADC。
在一些實施方式中,本揭露關於一種包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC),用於在治療有需要的受試者的癌症中使用,
該使用包括:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將所述經確定的值與參考值進行比較,以及
(iii) 如果所述經確定的值高於該參考值,則向所述受試者投予有效量的所述ADC。
在一些實施方式中,本揭露關於一種包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC),用於在治療有需要的受試者的癌症中使用,
該使用包括:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值,
(ii) 將步驟 (i) 中經確定的所述值與CEACAM5基因表現水平的參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果所述經確定的強度高於該參考強度,則向所述受試者投予有效量的所述ADC。
在一些實施方式中,本揭露關於從有需要的受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的測量值用於將所述腫瘤表徵為CEACAM5高度表現腫瘤之用途。
在一些實施方式中,本揭露關於從有需要的受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的測量值用於選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試之用途。
在一些實施方式中,本揭露關於從有需要的受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的測量值用於選擇所述受試者用CEACAM5靶向治療劑(例如包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC))治療癌症之用途。
在一些實施方式中,本揭露關於從有需要的受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的測量值用於選擇所述受試者用CEACAM5靶向治療劑(例如包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC))治療癌症之用途。
在一些實施方式中,CEACAM5基因表現水平的值可為CEACAM5基因轉錄本的測量值。
在一些實施方式中,CEACAM5基因轉錄本可為mRNA。
在一些實施方式中,本揭露之方法和用途包括確定腫瘤分離樣本中CEACAM5 mRNA水平值的步驟。
在一些實施方式中,CEACAM5基因表現量可以表示為log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值。
可以將經確定的值或水平與閾值或參考值進行比較。
與參考值的偏差可以表明表現CEACAM5的腫瘤處於足以使其對靶向CEACAM5的治療產生反應的水平。
在CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色試驗的情況下,可以將經確定的強度或蛋白表現水平與閾值強度或參考強度進行比較。
與參考強度的偏差可以表明表現CEACAM5的腫瘤處於足以使其對靶向表現CEACAM5的癌症的治療產生反應的水平。
本揭露之方法和用途可以用於將有需要的受試者表徵為對靶向CEACAM5的治療(例如與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體)有反應。
本揭露之方法和用途可以用於選擇對靶向CEACAM5的治療(例如與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體)有反應的有需要的受試者。
本揭露之方法和用途可以用於監測有需要的受試者對靶向CEACAM5的治療(例如與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體)的反應。
本揭露之方法和用途可以用於根據有需要的受試者的腫瘤中CEACAM5基因表現水平來選擇靶向CEACAM5的治療,例如與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體。
本揭露之方法和用途可以用於根據有需要的受試者的腫瘤中CEACAM5蛋白表現強度來選擇靶向CEACAM5的治療,例如與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體。
本揭露之方法和用途可以用於將有需要的受試者的腫瘤表徵為對靶向CEACAM5的治療(例如與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體)有反應。
本揭露之方法和用途在分離的生物樣本上進行。分離的樣本可為從腫瘤分離的樣本。在實施如本文揭露的方法和用途之前分離樣本。
本揭露之方法和用途在體外進行。
根據其目的之一,本揭露關於一種用於選擇需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值,
(ii) 將所述值與參考值進行比較,以及
(iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則選擇所述受試者用於癌症治療。
根據其目的之一,本揭露關於一種用於選擇需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值,
(ii) 將步驟 (i) 中經確定的所述值與參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果該經確定的強度高於該參考強度,則選擇所述受試者用於癌症治療。
根據其目的之一,本揭露關於一種用於診斷有需要的受試者是否有資格用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值,
(ii) 將所述值與參考值進行比較,以及
(iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則選擇所述受試者有資格用於癌症治療。
根據其目的之一,本揭露關於一種用於診斷有需要的受試者是否有資格用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值,
(ii) 將步驟 (i) 中經確定的所述值與參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果該經確定的強度高於該參考強度,則選擇所述受試者用於癌症治療。
根據其另一個目的,本揭露關於一種用於選擇並治療需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值,
(ii) 將所述值與參考值進行比較,
(iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則選擇所述受試者用於癌症治療,以及
(iv) 向所述選擇的受試者投予有效量的所述ADC。
根據其另一個目的,本揭露關於一種用於選擇並治療需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值,
(ii) 將步驟 (i) 中經確定的所述值與參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果該經確定的強度高於該參考強度,則選擇所述受試者用於癌症治療,以及
(vii) 向所述選擇的受試者投予有效量的所述ADC。
根據其另一個目的,本揭露關於一種包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC),用於在治療有需要的受試者的癌症中使用,
該使用包括 (i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值,(ii) 將所述值與參考值進行比較,以及 (iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則向所述受試者投予有效量的所述ADC。
根據其另一個目的,本揭露關於一種包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC),用於在治療有需要的受試者的癌症中使用,
該使用包括:
(i) 確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值,
(ii) 將步驟 (i) 中經確定的所述值與參考值進行比較,
(iii) 如果步驟 (i) 中經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇所述受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試,
(iv) 用所述CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從所述受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度,
(v) 將步驟 (iv) 中經確定的所述強度與參考強度進行比較,以及
(vi) 如果該經確定的強度高於該參考強度,則向所述受試者投予有效量的所述ADC。
在一些實施方式中,參考值可以為至少約7至約13。
在一些實施方式中,參考值可以為至少約7,或可以為至少約8、或至少約9、或至少約10、或至少約11、或至少約12、或至少約13。
在一些實施方式中,分位數標準化可以藉由以下方式獲得:(i) 按表現水平對樣本的轉錄本進行排序,(ii) 計算佔據相同排序的基因的平均值,以及 (iii) 用該平均值取代佔據所述相同排序的所有基因的值。
在一些實施方式中,轉錄本的表現水平在轉換為TPM之前可以以每百萬每千鹼基片段數(FPKM)來測量。
在一些實施方式中,每百萬每千鹼基片段數(FPKM)可以藉由以下方式獲得:對所述樣本中的總轉錄本進行計數,將獲得的轉錄本計數除以1,000,000,並將獲得的值除以基因的長度,以千鹼基計。
本文揭露的方法和用途的一個步驟係確定腫瘤樣本中CEACAM5基因相對於其他基因的相對表現。許多方法可用於這樣的確定。
然後將CEACAM5基因轉錄本的相對量與參考值進行比較。與參考值的顯著偏差可以表明表現CEACAM5的腫瘤可能對特異性靶向CEACAM5的治療劑有反應。
基因轉錄本的量可以藉由本領域已知的任何方法測量,如微陣列、大規模即時反轉錄PCR、RNA定序(RNA-Seq)、次世代定序(Next Generation Sequencing,NGS)。
腫瘤樣本的基因表現(RNA-seq)可以藉由本領域已知的任何方法獲得。
RNA-Seq係一種用於確定基因表現水平的定序方法。經確定的源自每個轉錄本的讀數(通常藉由比對)與其表現水平成正比。RNA-Seq可用於為多種癌症類型的腫瘤樣本生成基因表現譜,並確定哪些基因表現水平導致腫瘤發展。RNA-Seq數據可以藉由以下進行協調:將原始RNA讀數與GRCh38參考基因體構建進行比對,並用標準化方案計算基因表現水平。RNA-Seq數據可作為以下比對讀數(BAM)和表現水平提供:原始計數並用TPM、FPKM或FPKM-UQ標準化。
在一些實施方式中,基因表現(RNA-seq)可以如下獲得。
可使用KAPA mRNA HYPERPREPKITILLUMINA®平臺對來自分離腫瘤樣本的基因轉錄本(RNA)進行定序。可如下處理RNA-seq數據:可以使用例如與參考的剪接轉錄本比對(Transcripts Alignment to a Reference)(STAR)比對器來將定序讀數映射到參考基因體GRCh 38 [25]。可以首先藉由CUFFLINK以FPKM(每百萬每千鹼基片段數)測量基因表現[26],並且可以將基因水平的FPKM轉換為TPM(每百萬每千鹼基轉錄本)[27]。可以將TPM值log2轉換並分位數標準化,以用於下游分析,包括差異基因表現(DGE)分析。在一些實施方式中,檢測到的基因子低於10,000的樣本可以被排除在下游分析之外。根據已發表的方法,RNA-seq可能包括微環境細胞群[MCP]計數器分析[28,29]。
在一些實施方式中,可以將CEACAM5基因表現水平的測量值(mRNA或基因轉錄水平的測量值)標準化。
在一些實施方式中,可以將CEACAM5基因表現水平的測量值(mRNA或基因轉錄水平的測量值)log2轉換。
在一些實施方式中,腫瘤樣本中的CEACAM5基因表現水平(mRNA)表示為log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值。
可以通過以下步驟獲得CEACAM5基因表現水平測量值的標準化:
- RNA-seq原始計數值的log2轉換,
- 藉由對樣本中的表現值進行排序並調整其以具有相同的分佈來匹配樣本中的表現值分佈,從而對RNA-seq數據進行分位數標準化,以及
- 藉由按基因長度和定序的總讀數縮放標準化表現值,然後縮放到百萬,以使值更易於判斷,從而將數據表現為每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)。
在一些實施方式中,將腫瘤中測量(或確定)的CEACAM5基因表現水平的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值與參考值進行比較。如果經確定的值高於參考值,則腫瘤可能被定性為對CEACAM5靶向治療有反應。可以選擇其經確定的值高於參考值的有需要的受試者用於CEACAM5靶向治療。
在一些實施方式中,參考值可以為至少約7至約13。
在一些實施方式中,參考值可以為至少約7,或可以為至少約8、或至少約9、或至少約10、或至少約11、或至少約12、或至少約13。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 7。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 7.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 8。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 8.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 9。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 9.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 10。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 10.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 11。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 11.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 12。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 12.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 13。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 13.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 14。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 14.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約= 15。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 7。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 7.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 8。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 8.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 9。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 9.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 10。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 10.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 11。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 11.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 12。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 12.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 13。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 13.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 14。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 14.5。
在一些實施方式中,CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)參考值可以為約≥ 15。
CEACAM5蛋白表現水平(或強度)可以藉由免疫組織化學(IHC)來測量。
可以藉由免疫組織化學(IHC)分析從有需要的患者中分離的腫瘤樣本中CEACAM5蛋白表現的水平和模式,例如,如LaPointe等人(Journal of Clinical Oncology [臨床腫瘤學雜誌],第39卷,第15期增刊, https://doi.org/10.1200/JCO.2021.39.15_suppl.e21030)或Blumenthal等人(
BMC Cancer. [BMC癌症] 2007;7:2. 發表於2007年1月3日. doi:10.1186/1471-2407-7-2)所揭露的。
可以使用CEACAM5質膜染色(全膜或極化膜)的半定量百分比得分(藉由將強度≥ 2+的百分比求和計算)或H得分來評估腫瘤細胞中的CEACAM5反應性。
CEACAM5高度表現者可以定義為腫瘤樣本的≥ 50%的腫瘤細胞群體中CEACAM5蛋白表現強度≥ 2+的患者。
CEACAM5中度表現者可以定義為腫瘤樣本的≥ 1%至< 50%的腫瘤細胞群體中CEACAM5蛋白表現強度≥ 2+的患者。
在一些實施方式中,用CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試測量的CEACAM5蛋白表現水平的參考強度可為≥ 50%的腫瘤細胞群體中強度≥2+。
可以選擇需要用抗體藥物接合物(ADC,其包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體)治療癌症並且≥ 50%的腫瘤細胞群體中CEACAM5表現強度≥ 2+的患者用於所述治療。
可以向需要用抗體藥物接合物(ADC,其包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體)治療癌症並且≥ 50%的腫瘤細胞群體中CEACAM5表現強度≥ 2+的患者投予所述治療。
對於需要用抗體藥物接合物(ADC,其包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體)治療癌症的患者,可以首先確定從所述患者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5基因表現水平。如果從所述患者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的經確定的值高於參考值,則可以選擇該患者用於後續測試,以用CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定CEACAM5蛋白表現水平的強度。
如果經確定的強度高於參考強度,則可以選擇該患者用包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC)用於治療。
如果經確定的強度高於參考強度,則可以將用包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC)的治療投予於該患者。
包含抗 CEACAM5 抗體的抗體藥物接合物
本揭露關於一種包含抗CEACAM5抗體或其片段的抗體藥物接合物(ADC)。
抗體藥物接合物典型地包含抗CEACAM5抗體和至少一種化療劑。抗體藥物接合物(ADC)包含與至少一種化療劑接合的抗CEACAM5抗體。在抗體藥物接合物中,抗CEACAM5抗體可以經由可切割或不可切割的連接子與至少一種化療劑共價附接。
抗 CEACAM5 抗體
根據實施方式,抗體藥物接合物包含抗CEACAM5抗體或其片段。
根據實施方式,抗體藥物接合物包含人源化抗CEACAM5抗體或其片段。
根據實施方式,抗CEACAM5抗體或其片段包含由SEQ ID NO: 1組成的CDR-H1、由SEQ ID NO: 2組成的CDR-H2、由SEQ ID NO: 3組成的CDR-H3、由SEQ ID NO: 4組成的CDR-L1、由胺基酸序列NTR組成的CDR-L2和由SEQ ID NO: 5組成的CDR-L3。
在另外的實施方式中,抗CEACAM5抗體或其片段包含與SEQ ID NO: 6具有至少90%同一性的重鏈可變結構域(VH)以及與SEQ ID NO: 7具有至少90%同一性的輕鏈可變結構域(VL),其中CDR1-H由SEQ ID NO: 1組成,CDR2-H由SEQ ID NO: 2組成,CDR3-H由SEQ ID NO: 3組成,CDR1-L由SEQ ID NO: 4組成,CDR2-L由胺基酸序列NTR組成,並且CDR3-L由SEQ ID NO: 5組成。
在另外的實施方式中,抗CEACAM5抗體或其片段包含與SEQ ID NO: 6具有至少92%、至少95%、至少98%同一性的重鏈可變結構域(VH)以及與SEQ ID NO: 7具有至少92%、至少95%、至少98%同一性的輕鏈可變結構域(VL),其中CDR1-H由SEQ ID NO: 1組成,CDR2-H由SEQ ID NO: 2組成,CDR3-H由SEQ ID NO: 3組成,CDR1-L由SEQ ID NO: 4組成,CDR2-L由胺基酸序列NTR組成,並且CDR3-L由SEQ ID NO: 5組成。
在另外的實施方式中,抗CEACAM5抗體或其片段包含由SEQ ID NO: 6組成的重鏈可變結構域(VH)和由SEQ ID NO: 7組成的輕鏈可變結構域(VL)。
在另外的實施方式中,抗CEACAM5抗體或其片段包含:
- 重鏈可變結構域,其由序列EVQLQESGPGLVKPGGSLSLSCAAS
GFVFSSYDMSWVRQTPERGLEWVAY
ISSGGGITYAPSTVKGRFTVSRDNAKNTLYLQMNSLTSEDTAVYYC
AAHYFGSSGPFAYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO: 6,CDR以粗體顯示)組成,其中FR1-H跨越胺基酸位置1至25,CDR1-H跨越胺基酸位置26至33(SEQ ID NO: 1),FR2-H跨越胺基酸位置34至50,CDR2-H跨越胺基酸位置51至58(SEQ ID NO: 2),FR3-H跨越胺基酸位置59至96,CDR3-H跨越胺基酸位置97至109(SEQ ID NO: 3),並且FR4-H跨越胺基酸位置110至120,以及
- 輕鏈可變結構域,其由序列DIQMTQSPASLSASVGDRVTITCRAS
ENIFSYLAWYQQKPGKSPKLLVY
NTRTLAEGVPSFSGSGSGTDFSLTISSLQPEDFATYYC
QHHYGTPFTFGSGTKLEIK(SEQ ID NO: 7,CDR以粗體顯示)組成,其中FR1-L跨越胺基酸位置1至26,CDR1-L跨越胺基酸位置27至32(SEQ ID NO: 4),FR2-L跨越胺基酸位置33至49,CDR2-L跨越胺基酸位置50至52,FR3-L跨越胺基酸位置53至88,CDR3-L跨越胺基酸位置89至97(SEQ ID NO: 5),並且FR4-L跨越胺基酸位置98至107。
在另外的實施方式中,抗CEACAM5抗體或其片段包含與SEQ ID NO: 8具有至少90%序列同一性的重鏈(HC)以及與SEQ ID NO: 9具有至少90%序列同一性的輕鏈(LC),其中CDR1-H由SEQ ID NO: 1組成,CDR2-H由SEQ ID NO: 2組成,CDR3-H由SEQ ID NO: 3組成,CDR1-L由SEQ ID NO: 4組成,CDR2-L由胺基酸序列NTR組成,並且CDR3-L由SEQ ID NO: 5組成。
在另外的實施方式中,抗CEACAM5抗體或其片段包含與SEQ ID NO: 8具有至少92%、至少95%、至少98%同一性的重鏈(HC)以及與SEQ ID NO: 9具有至少92%、至少95%、至少98%同一性的輕鏈(LC),其中CDR1-H由SEQ ID NO: 1組成,CDR2-H由SEQ ID NO: 2組成,CDR3-H由SEQ ID NO: 3組成,CDR1-L由SEQ ID NO: 4組成,CDR2-L由胺基酸序列NTR組成,並且CDR3-L由SEQ ID NO: 5組成。
在另外的實施方式中,抗CEACAM5抗體或其片段包含由SEQ ID NO: 8組成的重鏈(HC)和由SEQ ID NO: 9組成的輕鏈(LC)。
抗CEACAM5抗體也可為單結構域抗體或其片段。特別地,單結構域抗體片段可以由可變重鏈(VHH)組成,該可變重鏈包含如上所述之抗體的CDR1-H、CDR2-H和CDR3-H。該抗體也可為重鏈抗體,即無輕鏈的抗體,其可能含有或可能不含有CH1結構域。
單結構域抗體或其片段還可以包含駱駝科單結構域抗體的框架區,以及視需要的駱駝科單結構域抗體的恆定結構域。
抗CEACAM5抗體也可為抗體片段,特別地人源化抗體片段,其選自由以下組成之群組:Fv、Fab、F(ab')2、Fab'、dsFv、(dsFv)2、scFv、sc(Fv)2和雙抗體。
抗體也可為由抗體片段形成的雙特異性或多特異性抗體,其中至少一個抗體片段係根據本揭露的抗體片段。多特異性抗體係多價蛋白複合物,如例如EP 2 050 764 A1或US 2005/0003403 A1中所述。
抗CEACAM5抗體及其片段可以藉由本領域熟知的任何技術產生。特別地,所述抗體藉由如下文所述之技術產生。
抗CEACAM5抗體及其片段可以從載體分離(例如,純化)或包含在載體中使用,該載體如膜或脂質囊泡(例如脂質體)。
抗CEACAM5抗體及其片段可以藉由本領域已知的任何技術產生,如但不限於任何化學、生物、遺傳或酶技術(單獨或組合形式)。
知道期望序列的胺基酸序列後,熟悉該項技術者可以很容易地藉由產生多肽的標準技術生產出抗CEACAM5抗體及其片段。例如,其可以使用熟知的固相法(特別地使用可商購肽合成裝置,如由加利福尼亞州福斯特城的應用生物系統公司(Applied Biosystems)製造的裝置)並遵循製造商的說明進行合成。可替代地,抗CEACAM5抗體及其片段可以藉由本領域熟知的重組DNA技術進行合成。例如,在將編碼期望的(多)肽的DNA序列摻入表現載體並將這樣的載體引入合適的真核或原核宿主(該等宿主將表現期望的多肽,之後可以使用熟知的技術從中將其分離)後,該等片段可以作為DNA表現產物獲得。
藉由常規免疫球蛋白純化程序(如例如蛋白A-瓊脂糖、羥基磷灰石層析法、凝膠電泳、透析或親和層析法)來從培養基中適當分離抗CEACAM5抗體及其片段。
基於常規重組DNA和基因轉染技術產生人源化抗體之方法係本領域熟知的(參見例如,Riechmann L.等人,1988;Neuberger MS.等人,1985)。可以使用本領域已知的各種技術將抗體人源化,該等技術包括例如,申請WO 2009/032661中揭露的技術、CDR移植(EP 239,400;PCT公開WO 91/09967;美國專利案號5,225,539;5,530,101;和5,585,089)、鑲飾或重塑(EP 592,106;EP 519,596;Padlan EA (1991);Studnicka GM等人 (1994);Roguska MA.等人 (1994))和鏈替換(美國專利案號5,565,332)。用於製備這樣的抗體的一般重組DNA技術也是已知的(參見歐洲專利申請EP 125023和國際專利申請WO 96/02576)。
抗CEACAM5抗體的Fab可以藉由用蛋白酶(如木瓜酶)處理與CEACAM5特異性反應的抗體來獲得。此外,抗CEACAM5抗體的Fab可以藉由以下方式產生:將編碼抗CEACAM5抗體Fab的兩條鏈的DNA序列插入用於原核表現或真核表現的載體中,並將載體引入原核或真核細胞(視情況而定)中以表現抗CEACAM5抗體的Fab。
抗CEACAM5抗體的F(ab')2可以通過用蛋白酶(胃蛋白酶)處理與CEACAM5特異性反應的抗體來獲得。此外,抗CEACAM5抗體的F(ab')2可以藉由經由硫醚鍵或雙硫鍵結合下文所述之Fab'來產生。
抗CEACAM5抗體的Fab'可以透過用還原劑(如二硫蘇糖醇)處理與CEACAM5特異性反應的F(ab')2來獲得。此外,抗CEACAM5抗體的Fab'可以藉由以下方式產生:將編碼抗體Fab'鏈的DNA序列插入用於原核表現的載體或用於真核表現的載體中,並將載體引入原核或真核細胞(視情況而定)中以進行其表現。
抗CEACAM5抗體的scFv可以藉由以下方式產生:獲取如先前所述之CDR或VH和VL結構域的序列,構建編碼scFv片段的DNA,將DNA插入原核或真核表現載體,然後將表現載體引入原核或真核細胞(視情況而定)中以表現scFv。為了產生人源化scFv片段,可以使用所熟知的稱為CDR移植的技術,該技術涉及選擇根據本揭露的互補決定區(CDR),並將其移植到已知三維結構的人類scFv片段框架上(參見例如,WO 98/45322;WO 87/02671;US 5,859,205;US 5,585,089;US 4,816,567;EP 0173494)。
在實施方式中,抗CEACAM5抗體係特賽妥單抗(CAS [2349294-95-5])。
化療劑
根據本揭露使用的抗體藥物接合物典型地包含至少一種化療劑(本文也稱為細胞毒性劑)。如本文所用的化療劑係指殺死細胞(包括癌細胞)的藥劑。這樣的藥劑有利地阻止癌細胞分裂和生長,並導致腫瘤尺寸縮小。表述「化療劑」在本文中與表述「細胞毒性劑」、「生長抑制劑」或「細胞抑制藥」互換使用。
如本文所用,術語「化療劑」係指抑制或阻止細胞功能和/或引起細胞破壞的物質。術語「化療劑」旨在包括放射性同位素、酶、抗生素和毒素(如細菌、真菌、植物或動物來源的小分子毒素或酶活性毒素,包括其片段和/或變體),以及下文揭露的各種抗腫瘤或抗癌劑。在一些實施方式中,化療劑係抗代謝物。
在另外的實施方式中,化療劑選自由以下組成之群組:放射性同位素、蛋白質毒素、小分子毒素及其組合。
放射性同位素包括適用於治療癌症的放射性同位素。這樣的放射性同位素通常主要發射β-輻射。在另外的實施方式中,放射性同位素選自由以下組成之群組:At
211、Bi
212、Er
169、I
131、I
125、Y
90、In
111、P
32、Re
186、Re
188、Sm
153、Sr
89、Lu的放射性同位素及其組合。在實施方式中,放射性同位素係α-發射體同位素,更特別地Th
227,其發射α-輻射。
在另外的實施方式中,小分子毒素選自抗代謝物、DNA烷化劑、DNA交聯劑、DNA嵌入劑、抗微管劑、拓撲異構酶抑制劑及其組合。
在另外的實施方式中,抗微管劑選自由以下組成之群組:紫杉烷類、長春花生物鹼、美登素生物鹼類、秋水仙鹼、鬼臼毒素、灰黃黴素及其組合。
在一些實施方式中,化療劑可為美登素生物鹼類。
根據實施方式,美登素生物鹼類選自美登醇(maytansinol)、美登醇類似物及其組合。
合適的美登醇類似物之實例包括具有經修飾的芳香族環的那些和在其他位置具有修飾的那些。這樣合適的美登素生物鹼類揭露於美國專利案號4,424,219;4,256,746;4,294,757;4,307,016;4,313,946;4,315,929;4,331,598;4,361,650;4,362,663;4,364,866;4,450,254;4,322,348;4,371,533;6,333,410;5,475,092;5,585,499;和5,846,545。
在另外的實施方式中,本揭露之細胞毒性接合物利用含硫醇的美登素生物鹼類(DM1)(正式稱為
N2’-脫乙醯基-
N2’-(3-巰基-1-側氧基丙基)-美登素)作為細胞毒性劑。DM1由以下結構式 (I) 表示:
(I)。
在另外的實施方式中,本揭露之細胞毒性接合物利用含硫醇的美登素生物鹼類DM4(正式稱為N2’-脫乙醯基-N-2’(4-甲基-4-巰基-1-側氧基戊基)-美登素)作為細胞毒性劑。DM4由以下結構式 (II) 表示:
(II)。
在本揭露之另外的實施方式中,可以使用其他美登素,包括含有硫醇和二硫化物的、在帶有硫原子的碳原子上具有單烷基或二烷基取代美登素生物鹼類。該等美登素生物鹼類包括在C-3、C-14羥甲基、C-15羥基或C-20去甲基處具有醯化胺基酸側鏈(其中醯基基團帶有受阻巰氫基)的美登素生物鹼類,其中帶有硫醇官能基的醯基基團的碳原子具有一個或兩個取代基,所述取代基係CH
3、C
2H
5、直鏈或支鏈烷基或烯基,其具有1至10種試劑和溶液中可能存在的任何聚集體。
該等細胞毒性劑和接合方法之實例在申請WO 2008/010101(該申請藉由引用併入)中進一步給出。
根據本揭露的免疫接合物可以如申請WO 2004/091668(該申請的全部內容藉由引用併入本文)中所述進行製備。
因此,在另外的實施方式中,美登素生物鹼類選自由以下組成之群組:
N2’-脫乙醯基-
N2’-(3-巰基-1-側氧基丙基)-美登素(DM1)或
N2’-脫乙醯基-
N-2’(4-甲基-4-巰基-1-側氧基戊基)-美登素(DM4)及其組合。
在另外的實施方式中,在抗體藥物接合物中,抗CEACAM5抗體經由可切割或不可切割的連接子與至少一種化療劑共價連接。
在另外的實施方式中,連接子選自由以下組成之群組:吡啶基二硫代丁酸N-琥珀醯亞胺基酯(SPDB)、4-(吡啶-2-基二硫烷基)-2-磺基-丁酸(磺基-SPDB)和(N-馬來醯亞胺基甲基)環己烷-1-甲酸琥珀醯亞胺酯(SMCC)。
在另外的實施方式中,連接子與抗CEACAM5抗體的Fc區中的離胺酸或半胱胺酸殘基結合。在另外的實施方式中,連接子與美登素形成雙硫鍵或硫醚鍵。
特別地,抗CEACAM5抗體藥物接合物可以選自由以下組成之群組:
具有式 (III) 之抗CEACAM5-SPDB-DM4抗體藥物接合物:
;
具有式 (IV) 之抗CEACAM5-磺基-SPDB-DM4抗體藥物接合物:
(IV);
和
具有式 (V) 之抗CEACAM5-SMCC-DM1抗體藥物接合物:
(V)。
在上述式 (III)、(IV) 和 (V) 中,「n」對應於每個抗體分子接合的化療劑分子數。它對應於下文定義的「藥物抗體比」(或「DAR」),並且範圍可以從1至10。
在另外的實施方式中,本揭露之抗體藥物接合物包含抗CEACAM5抗體,該抗體包含SEQ ID NO: 8的重鏈(VH)和SEQ ID NO: 9的輕鏈(VL)(特賽妥單抗),其中特賽妥單抗經由吡啶基二硫代丁酸N-琥珀醯亞胺基酯(SPDB)與N2'-脫乙醯基-N-2'(4-甲基-4-巰基-1-側氧基戊基)-美登素(DM4)共價連接。從而獲得抗體藥物接合物特賽妥單抗-雷星(huMAb2-3-SPDB-DM4)。
在實施方式中,本揭露之抗體藥物接合物係特賽妥單抗-雷星(CAS [2254086-60-5])。
如本文所用,「
連接子」意指包含共價鍵或原子鏈的化學部分,其將抗體共價附接至化療劑部分(例如,細胞抑制劑、細胞毒性劑或生長抑制劑)。合適的連接子係本領域熟知的,包括二硫化物基團、硫醚基團、酸不穩定基團、光不穩定基團、肽酶不穩定基團和酯酶不穩定基團。
接合物可以藉由體外方法製備。為了將藥物或前驅藥與抗體(例如化療劑)連接,使用連接基團。合適的連接基團係本領域熟知的,並且包括二硫化物基團、硫醚基團、酸不穩定基團、光不穩定基團、肽酶不穩定基團和酯酶不穩定基團。抗體與本揭露之化療劑(如細胞毒性劑)的接合可以使用多種雙功能蛋白偶合劑進行,該等雙功能蛋白偶合劑包括但不限於吡啶基二硫代丁酸N-琥珀醯亞胺基酯(SPDB)、丁酸 4-[(5-硝基-2-吡啶基)二硫代]-2,5-二側氧基-1-吡咯啶基酯(硝基-SPDB)、4-(吡啶-2-基二硫烷基)-2-磺基-丁酸(磺基-SPDB)、(2-吡啶基二硫代)丙酸N-琥珀醯亞胺基酯(SPDP)、(N-馬來醯亞胺基甲基)環己烷-1-甲酸琥珀醯亞胺酯(SMCC)、亞胺基硫烷(iminothiolane,IT)、亞胺酸酯的雙功能衍生物(如己二亞胺酸二甲酯HCL)、活性酯(如辛二酸二琥珀醯亞胺酯)、醛類(如戊二醛)、雙-疊氮化合物(如雙(對疊氮苯甲醯基)-己二胺)、雙重氮衍生物(如雙-(對重氮苯甲醯基)-乙二胺)、二異氰酸酯(如甲苯2,6-二異氰酸酯)和雙活性氟化合物(如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。例如,蓖麻毒素免疫毒素可以如Vitetta等人 (1987) 所述進行製備。碳標記的1-異硫氰酸基苄基甲基二乙烯三胺五乙酸(MX-DTPA)係一種示例性螯合劑,用於放射性核苷酸與抗體的接合(WO 94/11026)。
連接子可為促進化療劑在細胞中釋放的「可切割連接子」。例如,可以使用酸不穩定連接子、肽酶敏感性連接子、酯酶不穩定連接子、光不穩定連接子或含二硫化物的連接子(參見例如,美國專利案號5,208,020)。連接子也可為「不可切割連接子」(例如SMCC連接子),在一些情況下可能會產生更好的耐受性。
一般而言,接合物可以藉由包括以下步驟的過程獲得:
(i) 使細胞結合劑(例如,根據本揭露的抗體)的視需要緩衝水溶液與連接子和化療劑(如細胞毒性化合物(或藥劑))的溶液接觸;
(ii) 然後視需要將 (i) 中形成的接合物與未反應的細胞結合劑(例如,本揭露之抗體)與未反應的化療劑(如未反應的細胞毒性化合物(或藥劑))分離。
細胞結合劑的水溶液可以用緩衝液緩衝,該等緩衝液係如例如磷酸鉀、乙酸鹽、檸檬酸鹽或N-2-羥乙基哌𠯤-N'-2-乙烷磺酸(Hepes緩衝液)。緩衝液取決於細胞結合劑(例如,本揭露之抗體)的性質。化療劑,如細胞毒性化合物(或藥劑),在有機極性溶劑(例如二甲基亞碸(DMSO)或二甲基乙醯胺(DMA))中之溶液中。
反應溫度通常在20°C至40°C之間。反應時間可以從1小時到24小時不等。細胞結合劑和化療劑(如細胞毒性劑)之間的反應可以藉由粒徑排阻層析法(SEC)用折射和/或UV檢測器監測。如果接合物產率太低,可以延長反應時間。
熟悉該項技術者可以使用多種不同的層析方法來進行步驟 (ii) 的分離:可以例如藉由SEC、吸附層析法(如離子交換層析法,IEC)、疏水作用層析法(HIC)、親和層析法、混合載體層析法(mixed-support chromatography)(如羥基磷灰石層析法)或高效液相層析法(HPLC)將接合物例如從聚集體中純化。也可以使用透析或滲濾純化。
如本文所用,術語「聚集體」意指可以在兩種或更多種細胞結合劑之間形成的締合物,所述細胞結合劑藉由接合修飾或未藉由接合修飾。聚集體可以在許多參數的影響下形成,如溶液中高濃度的細胞結合劑(例如,本揭露之抗體)、溶液的pH、高剪切力、鍵合二聚體的數量及其疏水特性、溫度(參見Wang和Gosh, 2008, J. Membrane Sci. [膜科學雜誌], 318: 311-316,以及其中引用的參考文獻);應當注意的是,其中一些參數的相對影響尚未明確確定。在蛋白質和抗體的情況下,熟悉該項技術者將參考Cromwell等人(2006, AAPS Journal [AAPS雜誌], 8(3): E572-E579)。聚集體中的含量可以用技術者熟知的技術來確定,如SEC(參見Walter等人,1993, Anal. Biochem. [分析生物化學], 212(2): 469-480)。
在步驟 (i) 或 (ii) 之後,含接合物的溶液可以提交到層析法、超濾和/或滲濾的另外的步驟 (iii) 中。
在該等步驟結束時,在水溶液中回收接合物。
在另外的實施方式中,根據本揭露的抗體藥物接合物的特徵在於「藥物抗體比」(或「DAR」)範圍為1至10,或2至5,或3至4。這通常是接合物包括美登素生物鹼類分子的情況。
此DAR值可以隨使用的抗體和藥物(即化療劑,如細胞毒性劑或生長抑制劑)的性質以及用於接合的實驗條件(像化療劑(如生長抑制劑)/抗體的比率、反應時間、溶劑和共溶劑(如果有的話)的性質)而變化。因此,抗體和化療劑(如細胞毒性劑或生長抑制劑)之間的接觸產生包含幾種接合物的混合物,該等接合物彼此不同,其藥物抗體比不同;視需要裸抗體;視需要聚集體。因此,經確定的DAR係平均值。
可用於確定DAR的方法包括分光光度法測量基本純化的接合物溶液在λD和280 nm處的吸光度之比。280 nm係通常用於測量蛋白質濃度(如抗體濃度)的波長。選擇波長λD以允許將藥物與抗體區分開,即,如技術者容易知道的,λD係藥物(即化療劑)具有高吸光度的波長,並且λD距離280 nm足夠遠以避免藥物和抗體的吸光度峰大量重疊。在美登素生物鹼類分子的情況下,λD可以選擇為252 nm。DAR計算方法可源自Antony S. Dimitrov (編輯), LLC, 2009, Therapeutic Antibodies and Protocols [治療性抗體與方案], 第525卷, 445, Springer Science [施普林格科學公司]。
在粒徑排阻層析法(SEC)分析的單體峰上(允許計算「DAR(SEC)」參數)或使用經典分光光度計裝置(允許計算「DAR(UV)」參數)測量接合物在λD(AλD)和280 nm(A280)處的吸光度。吸光度可以如下表示:
AλD = (cD x εDλD) + (cA x εAλD)
A280 = (cD x εD280) + (cA x εA280)
其中:
cD和cA分別是藥物(即化療劑)和抗體溶液中的濃度。
εDλD和εD280分別是藥物在λD和280 nm處的莫耳消光係數。
εAλD和εA280分別是抗體在λD和280 nm處的莫耳消光係數。
用兩個未知數解這兩個方程得出以下方程式:
cD = [(εA280 x AλD) - (εAλD x A280)] / [(εDλD x εA280) - (εAλD x εD280)]
cA = [A280 – (cD x εD280)] / εA280
然後根據藥物濃度與抗體濃度的比率計算平均DAR:DAR = cD / cA。
在一些實施方式中,抗體藥物接合物可以以80 mg/m
2至210 mg/m
2、80 mg/m
2至170 mg/m
2的劑量投予,或以80 mg/m
2至150 mg/m
2的劑量投予,或以80 mg/m
2至120 mg/m
2的劑量投予,或以80 mg/m
2至100 mg/m
2的劑量投予。
在一些實施方式中,抗體藥物接合物可以以80、100、120、150、170、180或210 mg/m
2的劑量水平投予。
在一些實施方式中,劑量方案可以包括經約10分鐘至約48小時、或約1 h至約48 h的時間段,如經1 h至4 h的時間段投予劑量。在一些實施方式中,劑量方案可以包括經約1 h的時間段投予劑量。
在一些實施方式中,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以經約30分鐘至約3小時、約1小時至約2小時、或約1.5小時投予。
ADC 劑量
在一些實施方式中,揭露了一種用於與抗CTLA4抗體和抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體(存在時)組合治療癌症的抗體藥物接合物,其包含抗CEACAM5抗體和化療劑,其中該抗體藥物接合物可以以約60 mg/m
2至約210 mg/m
2、或約80至約170 mg/m
2、或約100至約170 mg/m
2、或約120至約170 mg/m
2、或約135至約170 mg/m
2、或約150至約170 mg/m
2有需要的受試者體表面積的劑量投予。
在一些實施方式中,抗體藥物接合物可以以約60至約210 mg/m
2、或約80至約170 mg/m
2、或約100至約150 mg/m
2的劑量投予。
在多個實施方式中,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約60、70、80、90、100、110、120、130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205或約210 mg/m
2的劑量投予。
在多個實施方式中,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約60、80、100、120、135、150、170、180、190或約210 mg/m
2的劑量投予。
在一些實施方式中,ADC可以以約80 mg/m
2至約170 mg/m
2的劑量投予,或以約80 mg/m
2至約150 mg/m
2的劑量投予,或以約100 mg/m
2至約120 mg/m
2的劑量投予。
在一些實施方式中,ADC可以以約80 mg/m
2或約100 mg/m
2或約120 mg/m
2或約150 mg/m
2或約170 mg/m
2的劑量投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約80 mg/m
2的劑量投予。
在一些實施方式中,ADC可以以約100 mg/m
2的劑量投予。
在一些實施方式中,ADC可以以約120 mg/m
2的劑量投予。
在一些實施方式中,ADC可以以約150 mg/m
2的劑量投予。
在一些實施方式中,ADC可以以約170 mg/m
2的劑量投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約80、100、120、150或約170 mg/m
2的劑量(作為負荷劑量(或第一劑量))投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約80 mg/m
2的劑量(作為負荷劑量)投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約100 mg/m
2的劑量(作為負荷劑量)投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約120 mg/m
2的劑量(作為負荷劑量)投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約150 mg/m
2的劑量(作為負荷劑量)投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約170 mg/m
2的劑量(作為負荷劑量)投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約80、100、120、150或約170 mg/m
2的劑量(作為後續劑量(或第二劑量))投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約80 mg/m
2的劑量(作為後續劑量)投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約100 mg/m
2的劑量(作為後續劑量)投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約120 mg/m
2的劑量(作為後續劑量)投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約150 mg/m
2的劑量(作為後續劑量)投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以以約170 mg/m
2的劑量(作為後續劑量)投予。
後續劑量可在第一個週期之後的週期(後續或另外的週期)的第1天投予。
根據實施方式,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以在第一治療週期(例如,在第1天)以約80、100、120、150或約170 mg/m
2的劑量(作為負荷劑量)投予,然後在另外的週期(例如,在第1天)以約80、100、120、150或約170 mg/m
2的劑量(作為後續劑量)投予。
在某些實施方式中,對於體表面積(BSA)>2.2 m
2的受試者,包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物的劑量可以基於2.2 m
2的BSA計算。
抗體藥物接合物可為特賽妥單抗-雷星(huMAb2-3-SPDB-DM4)。
在某些實施方式中,ADC約每兩週投予一次。在某些實施方式中,ADC約每三週投予一次。在某些實施方式中,ADC約每四週投予一次。在某些實施方式中,ADC約每五週投予一次。在某些實施方式中,ADC約每六週投予一次。
額外的藥劑
在某些實施方式中,方法和用途進一步包括向受試者投予有效量的至少一種有效治療癌症的額外的藥劑。
在某些實施方式中,額外的藥劑選自由以下組成之群組:免疫檢查點抑制劑(ICI)、基於鉑的化療(例如順鉑或卡鉑)、培美曲塞、抗VEGFR2、FOLFOX、FOLFIRI、TAS-102、抗EGFR及其任何組合。
在某些實施方式中,ICI為抗PD-1抗體。
在某些實施方式中,抗PD-1抗體選自由以下組成之群組:派姆單抗、納武單抗、西米普利單抗、信迪利單抗、多塔利單抗和替雷利珠單抗。
在某些實施方式中,抗PD-1抗體係派姆單抗。
在某些實施方式中,ICI係抗PD-L1抗體。
在某些實施方式中,抗PD-L1抗體選自由以下組成之群組:阿特珠單抗、阿維魯單抗、德瓦魯單抗、恩沃利單抗、BMS-936559、CK-301、CS-1001、SHR-1316(HTI-1088)、CBT-502(TQB-2450)及其任何組合。
在某些實施方式中,抗PD-L1抗體選自由以下組成之群組:阿特珠單抗、阿維魯單抗和德瓦魯單抗。
在某些實施方式中,該方法包括向受試者投予有效量的特賽妥單抗-雷星和派姆單抗。
在某些實施方式中,該方法進一步包括向受試者投予有效量的基於鉑的化療。
在某些實施方式中,基於鉑的化療選自順鉑和卡鉑。
在某些實施方式中,該方法進一步包括向受試者投予有效量的培美曲塞。
在某些實施方式中,該方法包括向受試者投予有效量的特賽妥單抗-雷星、派姆單抗和順鉑。
在某些實施方式中,該方法包括向受試者投予有效量的特賽妥單抗-雷星、派姆單抗、順鉑和培美曲塞。
在某些實施方式中,該方法包括向受試者投予有效量的特賽妥單抗-雷星、派姆單抗和卡鉑。
在某些實施方式中,該方法包括向受試者投予有效量的特賽妥單抗-雷星、派姆單抗、卡鉑和培美曲塞。
在一個實施方式中,抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體或其片段係具有干擾PD-1和PD-L1之間相互作用的活性的單株抗體。在一個實施方式中,抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體為IgG。
能夠干擾PD-1(在免疫細胞表面表現)和PD-L1(在癌細胞表面表現)之間的相互作用的抗PD-1抗體和抗PD-L1抗體可用作免疫檢查點抑制劑,從而阻斷保護腫瘤細胞免受免疫系統成分(能夠並準備對抗癌症)影響的途徑。當PD-1和PD-L1相互作用時,它們形成生物化學「屏障」,保護腫瘤細胞免遭免疫系統破壞。因此,阻斷PD-1或PD-L1導致阻斷PD-1和PD-L1之間的相互作用,從而防止或揭開保護腫瘤細胞免遭免疫系統破壞的生物化學「屏障」。
許多抗PD-1抗體已被批准用於臨床治療癌症使用。該等抗PD-1抗體包括派姆單抗(KEYTRUDA®)、納武單抗(OPDIVO®)、西米普利單抗(LIBTAYO®)、信迪利單抗(TYVYT®)、多塔利單抗(JEMPERLI®)和替雷利珠單抗。
同樣,許多抗PD-L1抗體已被批准用於臨床治療癌症使用。該等抗PD-L1抗體包括阿特珠單抗(TECENTRIQ®)、阿維魯單抗(BAVENCIO®)和德瓦魯單抗(IMFINZI®)。
在一個實施方式中,抗PD-1抗體係派姆單抗或信迪利單抗。
在一個實施方式中,抗PD-1抗體係派姆單抗。它係針對人類PD-1的全人類單株IgG1抗體。
在一個實施方式中,抗PD-1抗體或其片段包含派姆單抗的輕鏈和重鏈CDR。
在一個實施方式中,抗PD-1抗體或其片段包含派姆單抗的重鏈可變結構域(VH)和輕鏈可變結構域(VL)。
在一個實施方式中,抗PD-1抗體係信迪利單抗。在一個實施方式中,抗PD-1抗體或其片段包含信迪利單抗的輕鏈和重鏈CDR。在一個實施方式中,抗PD-1抗體或其片段包含信迪利單抗的重鏈可變結構域(VH)和輕鏈可變結構域(VL)。
抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體或其片段也可為單結構域抗體或其片段。特別地,單結構域抗體片段可以由可變重鏈(VHH)組成,該可變重鏈包含如上所述之抗體的CDR1-H、CDR2-H和CDR3-H。該抗體也可為重鏈抗體,即無輕鏈的抗體,其可能含有或可能不含有CH1結構域。
單結構域抗體或其片段還可以包含駱駝科單結構域抗體的框架區,以及視需要的駱駝科單結構域抗體的恆定結構域。
抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體也可為抗體片段,特別地人源化抗體片段,其選自由以下組成之群組:Fv、Fab、F(ab')2、Fab'、dsFv、(dsFv)2、scFv、sc(Fv)2和雙抗體。
抗體也可為由抗體片段形成的雙特異性或多特異性抗體,其中至少一個抗體片段係根據本揭露的抗體片段。抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體及其片段可以藉由本領域熟知的任何技術產生。特別地,所述抗體藉由已經描述的技術產生。
抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體及其片段可以從載體分離(例如,純化)或包含在載體中使用,該載體如膜或脂質囊泡(例如脂質體)。
抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體及其片段可以藉由本領域已知的任何技術產生,如但不限於任何化學、生物、遺傳或酶技術(單獨或以組合形式)。
在一些實施方式中,抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體可以以150 mg至400 mg的劑量投予,或以150 mg至300 mg的劑量投予。
在一個實施方式中,抗VEGFR-2抗體係對VEGFR-2具有拮抗活性的單株抗體或其片段。在一個實施方式中,抗VEGFR-2抗體係IgG。
抗VEGFR-2抗體較佳的是適用於患者。例如,較佳的是將抗小鼠VEGFR-2抗體(如DC-101)用於小鼠,將抗人類VEGFR-2抗體用於人類。
在一個實施方式中,抗VEGFR-2抗體係雷莫蘆單抗(CAS號947687-13-0)。它係一種針對人類VEGFR-2的全人類單株IgG1抗體。
在一個實施方式中,抗VEGFR-2抗體或其片段包含雷莫蘆單抗的輕鏈和重鏈CDR。
在一個實施方式中,抗VEGFR-2抗體或其片段包含雷莫蘆單抗的重鏈可變結構域(VH)和輕鏈可變結構域(VL)。
抗VEGFR-2抗體或其片段也可為單結構域抗體或其片段。特別地,單結構域抗體片段可以由可變重鏈(VHH)組成,該可變重鏈包含如上所述之抗體的CDR1-H、CDR2-H和CDR3-H。該抗體也可為重鏈抗體,即無輕鏈的抗體,其可能含有或可能不含有CH1結構域。
單結構域抗體或其片段還可以包含駱駝科單結構域抗體的框架區,以及視需要的駱駝科單結構域抗體的恆定結構域。
抗VEGFR-2抗體也可為抗體片段,特別地人源化抗體片段,其選自由以下組成之群組:Fv、Fab、F(ab')2、Fab'、dsFv、(dsFv)2、scFv、sc(Fv)2和雙抗體。
抗體也可為由抗體片段形成的雙特異性或多特異性抗體,其中至少一個抗體片段係根據本揭露的抗體片段。抗VEGFR-2抗體及其片段可以藉由本領域熟知的任何技術產生。特別地,所述抗體藉由已經描述的技術產生。
抗VEGFR-2抗體及其片段可以從載體分離(例如,純化)或包含在載體中使用,該載體如膜或脂質囊泡(例如脂質體)。
抗VEGFR-2抗體及其片段可以藉由本領域已知的任何技術產生,如但不限於任何化學、生物、遺傳或酶技術(單獨或以組合形式)。
包含抗CEACAM5抗體的免疫接合物將與西妥昔單抗組合使用,以治療癌症。
西妥昔單抗(CAS號205923-56-4)係一種針對表皮生長因子受體(EGFR)的嵌合單株IgG1抗體。西妥昔單抗本身已用於治療轉移性結直腸癌、轉移性非小細胞肺癌和頭頸癌。
包含抗CEACAM5抗體的免疫接合物將與TAS-102組合使用,以治療癌症。
TAS-102本身是一種已知的批准用於人類使用的化療方案,該化療方案包括組合投予曲氟尿苷(trifluoridine)和替吡嘧啶(tipiracil),並且典型地以4週為週期投予。TAS-102組合了曲氟尿苷和替吡嘧啶,已用於治療結直腸癌。
作為經修飾的去氧尿苷,曲氟尿苷(CAS登記號70-00-8)係一種摻入DNA中的核苷類似物。經修飾的DNA與胸苷酸(thymidiylate)合成酶結合,抑制酶的活性。替吡嘧啶(CAS登記號183204-74-2)係一種胸腺嘧啶類似物,其防止胸苷磷酸化酶降解曲氟尿苷。
包含抗CEACAM5抗體的免疫接合物將與FOLFIRI組合使用,以治療癌症。
FOLFIRI本身是一種已知的批准用於人類使用的化療方案,該化療方案包括組合投予醛葉酸、5-氟-尿嘧啶和伊立替康(irinotecan),並且典型地以長達12個兩週的週期進行投予。FOLFIRI組合多種藥物,每種藥物都具有不同的作用機制,並且有利地具有協同作用,導致癌細胞死亡。
5-氟-尿嘧啶(CAS登記號51-21-8)係一種抗代謝物,其主要抑制胸苷酸合酶並從而阻斷胸苷的合成。5-氟-尿嘧啶已用於治療結腸癌、食道癌、胃癌、胰臟癌、乳癌和子宮頸癌。
醛葉酸,也稱為甲醯四氫葉酸(CAS登記號58-05-9),穩定5-氟-尿嘧啶和胸苷酸合酶之間的複合物,從而增加5-氟-尿嘧啶的細胞毒性。在一個實施方式中,醛葉酸係L-醛葉酸(N-[4-[[[(6S)-2-胺基-5-甲醯基-3,4,5,6,7,8-六氫-4-側氧基-6-喋啶基]甲基]胺基]苯甲醯基]-L-麩胺酸)。在另一個實施方式中,醛葉酸係L-醛葉酸的鈣鹽。醛葉酸還可以包含兩種或更多種立體異構物的混合物。
伊立替康(CAS號97682-44-5)係一種細胞毒素,其係生物鹼喜樹鹼的半合成衍生物且抑制拓撲異構酶I,從而抑制DNA複製和轉錄,並且其已用於治療結腸癌和小細胞癌肺癌。
包含抗CEACAM5抗體的免疫接合物將與FOLFOX組合使用,以治療癌症。
FOLFOX本身是一種已知的批准用於人類使用的化療方案,該化療方案包括組合投予醛葉酸、5-氟-尿嘧啶和奧沙利鉑(oxaliplatin),並且典型地以長達12個兩週的週期進行投予。FOLFOX組合多種藥物,每種藥物都具有不同的作用機制,並且有利地具有協同作用,導致癌細胞死亡。
5-氟-尿嘧啶(CAS登記號51-21-8)係一種抗代謝物,其主要抑制胸苷酸合酶並從而阻斷胸苷的合成。5-氟-尿嘧啶已用於治療結腸癌、食道癌、胃癌、胰臟癌、乳癌和子宮頸癌。
醛葉酸,也稱為甲醯四氫葉酸(CAS登記號58-05-9),穩定5-氟-尿嘧啶和胸苷酸合酶之間的複合物,從而增加5-氟-尿嘧啶的細胞毒性。在一個實施方式中,醛葉酸係L-醛葉酸(N-[4-[[[(6S)-2-胺基-5-甲醯基-3,4,5,6,7,8-六氫-4-側氧基-6-喋啶基]甲基]胺基]苯甲醯基]-L-麩胺酸)。在另一個實施方式中,醛葉酸係L-醛葉酸的鈣鹽。醛葉酸還可以包含兩種或更多種立體異構物的混合物。
奧沙利鉑(CAS號61825-94-3)已知在DNA股中形成交聯,從而阻止DNA複製和轉錄,並且已用於治療結直腸癌。
癌症
在實施方式中,癌症係癌(carcinoma)、肉瘤(sarcoma)或胚細胞瘤(blastoma)。在另外的實施方式中,癌症係癌。
根據實施方式,癌症係表現CEACAM5的癌症。表現CEACAM5的癌症也可稱為CEACAM5陽性癌症。
在一些實施方式中,癌症係CEACAM5陽性癌症。
CEACAM5陽性癌症被定義為在≥ 50%的癌細胞中CEACAM5免疫組織化學[IHC]強度≥ 2+或在≥ 1%且< 50%的腫瘤細胞(或癌細胞)中該強度≥ 2+的癌症。
在某些實施方式中,癌症在腫瘤細胞上具有陰性或低CEACAM5表現。腫瘤細胞上的陰性或低CEACAM5表現定義為如藉由免疫組織化學(IHC)測量的,< 1%的細胞中CEACAM5免疫組織化學[IHC]強度≥ 2+。
在某些實施方式中,癌症在腫瘤細胞上具有中度CEACAM5表現。腫瘤細胞上的中度CEACAM5表現可定義為如藉由免疫組織化學測量的,≥ 1%且< 50%的癌細胞中CEACAM5免疫組織化學[IHC]強度≥ 2+。
在某些實施方式中,癌症在腫瘤細胞上具有高CEACAM5表現。腫瘤細胞上的高CEACAM5表現可定義為如藉由免疫組織化學測量的,≥ 50%的癌細胞中CEACAM5免疫組織化學[IHC]強度≥ 2+強度。
藉由免疫學和化學反應檢測細胞上或組織切片中的抗原的免疫組織化學技術係本領域熟知的。該等技術具有高度敏感性和特異性,並且可以檢測多種抗原。免疫組織化學方法包括以下步驟:抗體與特定抗原的結合;藉由與酶接合的二抗孵育形成抗體-抗原複合物,以及在酶催化的受質和色素原存在下在抗體-抗原結合位點處產生有色沉積物。
CEACAM5腫瘤表現可以藉由使用免疫組織化學(IHC)分析來確定。可以使用抗CEACAM5抗體(如SANOFI的抗體殖株769)進行分析。抗CEACAM5殖株769係一種鼠單株抗體,對CEACAM5標靶具有與特賽妥單抗-雷星相同的特異性。該分析可在Techmate平臺或Dako公司(Dako)/進階公司(Agilent)Autostainer Link 48 IHC或任何其他免疫組織化學平臺上進行。將使用腫瘤細胞中CEACAM5質膜染色(全膜或極化膜)的半定量百分比得分(藉由將強度≥ 2+的百分比求和計算)或H得分來進行CEACAM5反應性的解釋。
根據實施方式,癌症選自肝細胞癌、結直腸癌、胃癌、胃食道交界處腺癌(GEJ)、食道癌、肺癌(例如,非鱗狀非小細胞肺癌)、子宮頸癌、胰臟癌、卵巢癌、甲狀腺癌、膀胱癌、子宮內膜癌、乳癌、肝癌、膽道癌(例如膽管癌)、攝護腺癌、神經內分泌癌和皮膚癌。
癌症可以選自結直腸癌、胃癌、胃食道交界處腺癌(GEJ)、食道癌、胰臟癌和肺癌。
在一些實施方式中,癌症可為結直腸癌。
在一些實施方式中,癌症可為胰臟癌。
在一些實施方式中,癌症可以選自胃癌、胃食道交界處(GEJ)腺癌、食道癌和肺癌。
在一些實施方式中,癌症可為胃癌、胃食道交界處(GEJ)腺癌或食道癌。
根據實施方式,癌症係胃癌或胃食道交界處腺癌(GEJ)。
根據實施方式,癌症係胃癌。
根據實施方式,癌症係肺癌。
肺癌可能是非鱗狀非小細胞肺癌(NSQ NSCLC)。
非小細胞肺癌係一種在肺組織中形成惡性(癌)細胞的疾病。吸菸係該疾病的主要原因。這係一種除了小細胞肺癌以外的上皮性肺癌。非小細胞肺癌有幾種類型。每種類型的非小細胞肺癌都有不同種類的癌細胞。每種類型的癌細胞都以不同的方式生長和擴散。非小細胞肺癌的類型係根據癌症中發現的細胞種類以及細胞在顯微鏡下的外觀來命名的:(1) 鱗狀細胞癌:始於鱗狀細胞的癌症,鱗狀細胞係薄而扁平的細胞,看起來像魚鱗。這也稱為表皮樣癌。(2) 大細胞癌:可能始於幾種類型的大細胞的癌症。(3) 腺癌:始於排列在肺泡上並產生黏液等物質的細胞的癌症。
在一些實施方式中,非鱗狀非小細胞肺癌可為晚期或轉移性NSQ NSCLC。
根據實施方式,受試者係患有惡性腫瘤、特別地患有惡性實體瘤、並且更特別地患有局部晚期或轉移性實體惡性腫瘤的患者。轉移性實體惡性腫瘤可為轉移性癌症,例如轉移性癌。癌症或癌可為如上所示的。
在一些實施方式中,非鱗狀非小細胞肺癌沒有表皮生長因子受體(EGFR)致敏突變或v-raf鼠肉瘤病毒致癌基因同源物B1(BRAF)突變或間變性淋巴瘤激酶/c-ros致癌基因1(ALK/ROS)改變。
醫藥組成物或組合
在一些實施方式中,在如本文揭露的用途和方法中,ADC的投予可以藉由腸胃外途徑進行。合適的腸胃外途徑可為靜脈內輸注。
本揭露還關於一種用於製造用於治療癌症的藥物的ADC,組合包含。
在一些實施方式中,本揭露關於一種醫藥組成物,其包含 (i) 如本文揭露的ADC和藥學上可接受的賦形劑。
本揭露之ADC可以與藥學上可接受的賦形劑和視需要的緩釋基質(如可生物降解的聚合物)組合,以形成治療組成物。
因此,本揭露之另一目的關於一種包含本揭露之ADC和藥學上可接受的載劑或賦形劑的醫藥組成物。根據本揭露的ADC或免疫接合物,其用作藥物。
本揭露還關於根據本揭露的ADC,其用於治療癌症。
「
藥物賦形劑」或「
藥學上可接受的賦形劑」係指當適當地投予於哺乳動物特別是人類時不產生不良反應、過敏反應或其他不想要的反應的分子實體和組成物。藥學上可接受的載劑或賦形劑係指無毒固體、半固體或液體填充劑、稀釋劑、封裝材料或任何類型的調配助劑。
如本文所用,「藥學上可接受的載劑或賦形劑」包括在生理學上相容的任何和所有溶劑、分散介質、包衣、抗細菌劑和抗真菌劑等。合適的載劑、稀釋劑和/或賦形劑之實例包括以下中的一或多種:水、胺基酸、鹽水、磷酸鹽緩衝鹽水、緩衝磷酸鹽、乙酸鹽、檸檬酸鹽、琥珀酸鹽;胺基酸和衍生物,如組胺酸、精胺酸、甘胺酸、脯胺酸、甘胺醯甘胺酸;無機鹽,NaCl、氯化鈣;糖或多元醇,如葡萄糖、甘油、乙醇、蔗糖、海藻糖、甘露醇;界面活性劑,如聚山梨酯80、聚山梨酯20、泊洛沙姆188;等,以及其組合。在許多情況下,較佳的是在組成物中包含等滲劑,如糖、多元醇或氯化鈉,並且調配物還可以含有抗氧化劑,如色胺和穩定劑,如吐溫20。
醫藥組成物的形式、投予途徑、劑量和方案自然取決於受試者的待治療的病症、疾病的嚴重程度、年齡、體重和性別等。
本揭露之醫藥組成物可以調配用於局部、口服、腸胃外、鼻內、靜脈內、肌內、皮下或眼內投予等。在實施方式中,本揭露之醫藥組成物和組合被調配用於靜脈內投予。
特別地,醫藥組成物含有對於能夠注射的調配物而言藥學上可接受的媒介物或賦形劑。該等可以特別是等滲的無菌的鹽溶液(磷酸一鈉或磷酸二鈉、氯化鈉、氯化鉀、氯化鈣或氯化鎂等或這樣的鹽的混合物),或乾燥的,尤其是冷凍乾燥的組成物,其在添加無菌水或生理鹽水後取決情況,允許調配成可注射溶液。
醫藥組成物可以透過藥物組合設備投予。
用於投予的劑量可以根據各種參數進行調整,特別是根據所使用的模式、相關病理或可替代地所期望的治療持續時間進行調整。
為了製備醫藥組成物,可以將有效量的包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物和/或抗CTLA4抗體和/或抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體溶解或分散於藥學上可接受的載劑或水性介質中。
適用於可注射用途的藥物形式包括無菌水溶液或分散體;包括芝蔴油、花生油、或水性丙二醇的調配物;和用於臨時製備無菌可注射溶液或分散體的無菌粉末。在所有情況下,該形式必須是無菌的並且可以利用適當的設備或系統進行注射,以便在不降解的情況下進行遞送。它在製造和儲存條件下必須穩定並且必須抗如細菌和真菌的微生物污染作用而保存。
活性化合物作為游離鹼或藥理學上可接受的鹽的溶液可以在與界面活性劑適當混合的水中製備。分散體也可以在甘油、液態聚乙二醇及其混合物、以及油中製備。在一般的儲存和使用條件下,該等製劑包含一種防腐劑以防止微生物生長。
包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物可以調配成中性或鹽形式的組成物。藥學上可接受的鹽包括與無機酸(如例如鹽酸或磷酸)或有機酸(如乙酸、草酸、酒石酸、苦杏仁酸等)形成的酸加成鹽(與蛋白質的游離胺基基團形成)。與游離羧基基團形成的鹽也可以衍生自無機鹼(如例如氫氧化鈉、氫氧化鉀、氫氧化銨、氫氧化鈣或氫氧化鐵)以及這樣的有機鹼(如異丙胺、三甲胺、甘胺酸、組胺酸、普魯卡因等)。
載劑還可為含有以下的溶劑或分散介質:例如,水、乙醇、多元醇(例如,甘油、丙二醇和液體聚乙二醇等)、其適合的混合物、以及植物油。適當的流動性可以例如藉由使用包衣(如卵磷脂)、在分散體的情況下藉由隨後的所需粒徑、以及藉由使用界面活性劑來維持。對微生物作用的預防可以藉由各種抗細菌劑和抗真菌劑(例如對羥苯甲酸酯、氯丁醇、酚、山梨酸、硫柳汞等)來實現。在許多情況下,較佳的是包括等滲劑,例如糖或氯化鈉。可藉由用於延遲吸收的藥劑(例如,單硬脂酸鋁和明膠)的組成物來實現可注射組成物的延長的吸收。
無菌可注射溶液藉由以下方式來製備:將活性化合物以所需量摻入視需要含有上文所列舉的各種其他成分的適當溶劑中,隨後過濾滅菌。通常,分散液藉由以下方式來製備:將各種經滅菌活性成分摻入無菌媒介物中,該媒介物含有基礎分散介質和來自上文所列舉的那些的其他所需成分。就用於製備無菌可注射溶液的無菌粉末而言,較佳的製備方法係真空乾燥和冷凍乾燥技術,其產生活性成分以及來自其先前無菌過濾溶液的任何另外的期望成分的粉末。
還考慮了用於直接注射的更多或高濃度溶液的製備,其中設想使用DMSO作為溶劑,以導致極快的滲透,以將高濃度的活化劑遞送至小腫瘤區域。
在調配後,溶液將以與劑量調配物相容的方式並且以治療有效的量投予。該等調配物易於以多種劑型投予,如上述可注射溶液的類型,但也可以採用藥物釋放膠囊等。
例如,對於以水溶液形式腸胃外投予,如果需要,應適當緩衝溶液,並且首先用足夠的鹽水或葡萄糖使液體稀釋劑等滲。該等特定的水溶液特別適用於靜脈內、肌內、皮下和腹膜內投予。在這點上,根據本揭露,可以使用的無菌水性介質對於熟悉該項技術者來說將是已知的。例如,可將一個劑量溶於1 ml等滲NaCl溶液中,然後添加到1000 ml皮下注射液中或在建議的輸注部位進行注射(參見,例如,"Remington's Pharmaceutical Sciences [雷明頓醫藥科學]" 第15版,第1035-1038和1570-1580頁)。根據待治療的受試者的狀況,劑量必然會發生一些變化。在任何情況下,負責投予的人員將確定用於個體受試者的適當劑量。
包含抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物調配用於腸胃外投予,如靜脈內或肌內注射,其它藥學上可接受的形式包括,例如,用於口服投予的片劑或其他固體;延時釋放膠囊;以及目前使用的任何其他形式。
在某些實施方式中,考慮使用脂質體和/或奈米顆粒來將多肽引入宿主細胞中。脂質體和/或奈米顆粒的形成和使用係熟悉該項技術者已知的。
奈米膠囊通常可以以穩定且可重複的方式捕獲化合物。為了避免因細胞內聚合物超載引起的副作用,這樣的超微顆粒(尺寸為約0.1 µm)通常使用能夠在體內降解的聚合物來設計。考慮將滿足該等要求的可生物降解的聚氰基丙烯酸烷基酯奈米顆粒、或可生物降解的聚丙交酯或聚丙交酯共乙交酯奈米顆粒用於在本揭露中使用,並且這樣的顆粒可以容易地製備。
脂質體由分散在水性介質中的磷脂形成,並自發形成多層同心雙層囊泡(也稱為多層囊泡(multilamellar vesicles,MLV))。MLV的直徑通常為25 nm至4 µm。MLV的超音波處理導致形成直徑在200至500 Å範圍內的、核心含有水溶液的小單層囊泡(small unilamellar vesicle,SUV)。脂質體的物理特性取決於pH、離子強度和二價陽離子的存在。
投予方法和調配物
本文所述之方法包括向受試者投予治療有效量的抗CEACAM5 ADC。如本文所用,「有效量」或「治療有效量」係導致治療表現CEACAM5的癌症(例如肺癌、胃癌、胃食道交界處癌或食道癌)的治療劑量。如本文所用,「治療」係指引起與表現CEACAM5的癌症(例如肺癌)相關的一或多種症狀的可檢測改善,或引起與導致病症或症狀的潛在病理機制相關的生物學效應(例如,特定生物標誌物水平的降低)。例如,引起與表現CEACAM5的癌症相關的以下任何症狀或病症得到改善的抗CEACAM5 ADC的劑量被視為「治療有效量」:
在另一個實例中,當一定劑量的抗CEACAM5 ADC不導致與表現CEACAM5的癌症(例如,肺癌、胃癌、胃食道交界處癌或食道癌)相關的一或多個參數或症狀的可檢測改善,或者不引起與導致癌症病症或症狀的潛在病理機制相關的生物學效應時,治療無效。
根據該等實施方式中的一些,靜脈內投予抗CEACAM5 ADC。
根據本揭露之方法,向受試者投予的抗CEACAM5 ADC的治療有效量將根據受試者的年齡和體型(例如,體重或體表面積)以及投予途徑和熟悉該項技術者熟知的其他因素而變化。
在某些實施方式中,ADC的劑量根據受試者的體表面積而發生變化。在某些實施方式中,向受試者投予的抗CEACAM5 ADC的劑量為約1 mg/m
2至約500 mg/m
2。在一些實施方式中,向受試者投予的ADC的劑量為約5 mg/m
2至約300 mg/m
2。在多個實施方式中,向受試者投予的ADC的劑量為約5 mg/m
2至約250 mg/m
2。在多個實施方式中,向受試者投予的ADC的劑量為約60 mg/m
2至約190 mg/m
2。在多個實施方式中,基於受試者的體表面積,劑量為約5、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200或210 mg/m
2。在某些實施方式中,ADC的劑量為約100 mg/m
2。在某些實施方式中,ADC的劑量為約150 mg/m
2。在某些實施方式中,ADC的劑量為約170 mg/m
2。在某些實施方式中,ADC的劑量為約190 mg/m
2。
在多個實施方式中,基於受試者的體表面積,ADC的劑量為5、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200或210 mg/m
2。在某些實施方式中,ADC的劑量為100 mg/m
2。在某些實施方式中,ADC的劑量為150 mg/m
2。在某些實施方式中,ADC的劑量為170 mg/m
2。在某些實施方式中,ADC的劑量為190 mg/m
2。
實例
以下實例說明了目前最為人所知的本揭露之實施方式。然而,應當理解,以下僅是對本揭露原理的應用的示例或說明。在不背離本揭露之精神和範圍的情況下,熟悉該項技術者可以設計出許多修改和可替代組成物、方法和系統。因此,雖然上文已特別描述了本揭露,但以下實例提供了與目前被認為是本揭露之最實用和較佳的實施方式相關的進一步細節。
實例 1 :材料與方法 研究設計和患者
此項特賽妥單抗-雷星的1/2期首次人體、開放標籤、劑量遞增和擴展試驗的研究設計細節已在其他地方發表。[15]
倫理聲明
簡而言之,符合劑量遞增和擴展階段條件的患者年齡≥ 18歲,患有局部晚期或轉移性實體瘤,該等腫瘤沒有可用的標準可替代療法,並且美國東部腫瘤協作組體能狀態(ECOG PS)為0或1。
劑量遞增階段的群體富集了(但不限於)患有已知表現CEACAM5的腫瘤類型的患者,並在中心實驗室使用IHC在最新的歸檔組織樣本上對表現進行了回顧性確認。
擴展階段的群體僅限於患有晚期結直腸癌、NSQ-NSCLC、小細胞肺癌和胃腺癌的患者的單獨群組。
在本報告中,我們僅呈現了NSQ-NSCLC患者的結果。基於腫瘤組織的IHC分析,有2個獨立的NSQ-NSCLC擴增階段群體:
CEACAM5高度表現者,定義為≥ 50%的腫瘤細胞群體中CEACAM5表現強度≥ 2+的患者,以及
CEACAM5中度表現者,定義為≥ 1%至< 50%的腫瘤細胞群體中CEACAM5表現強度≥ 2+的患者。
根據實體瘤臨床療效評價標準(Response Evaluation Criteria in Solid Tumors,RECIST)v1.1,所有患者都需要有至少一個可測量的病灶。
關鍵排除標準包括:預期壽命< 12週;已知或有症狀的腦轉移;接受其他癌症治療;曾接受靶向CEACAM5的先前療法;先前曾接受美登素生物鹼類治療;以及骨髓儲備不良或器官功能障礙。
治療
擴展階段期間,所有患者均接受靜脈內(IV)特賽妥單抗-雷星100 mg/m2 Q2W,如本研究劑量遞增階段所確定的[15]。特賽妥單抗-雷星以2.5 mg/min的速度輸注30分鐘,然後以5 mg/min的速度輸注,前提是沒有過敏反應的體徵或症狀。
為了防止過敏反應,患者在接受特賽妥單抗-雷星前1小時預先口服抗組胺藥。
持續治療直至疾病進展、不可接受的毒性或患者願意停止治療。
結果
擴展階段期間的主要結果為根據RECIST v1.1標準評估客觀反應率。
關鍵次要結果評估了安全性,這將在單獨的出版物中報告。
探索性生物標誌物目標(本文報告)包括探索CEACAM5表現特徵與反應之間的潛在聯繫(擴展階段)、研究可能預測特賽妥單抗-雷星活性的潛在生物標誌物(CEACAM5除外)(擴展階段)、以及評估循環CEA水平作為特賽妥單抗-雷星治療的便捷伴隨診斷的潛力(藉由評估循環CEA水平與腫瘤CEACAM5表現之間的相關性以及該生物標誌物與治療反應之間的相關性)。
腫瘤樣本
使用最新的歸檔腫瘤樣本(即在診斷、手術時歸檔的或在患者納入研究但未接受抗癌治療之前採集的腫瘤組織)獲得腫瘤樣本;對於病灶適合生檢的患者,基線時的新鮮生檢係可選的。
藉由免疫組織化學測量 CEACAM5 表現
使用小鼠抗CEACAM5殖株769(其對CEACAM5標靶具有與特賽妥單抗-雷星相同的特異性)在臨床網站本地和/或在實驗室集中藉由IHC分析歸檔腫瘤樣本中CEACAM5表現的水平和模式。
為每位患者提供福馬林固定石蠟包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)組織的至少六張5 µm載玻片以及三張另外的10 µm載玻片(或六張5 µm載玻片)。透過使用0.5 µg/mL的抗CEACAM5殖株769抗體的經驗證的IHC分析來集中分析CEACAM5表現。
使用CEACAM5質膜染色(全膜或極化膜)的半定量百分比得分(藉由將強度≥ 2+的百分比求和計算)或H得分來評估腫瘤細胞中的CEACAM5反應性;還評估了CEACAM5細胞質染色(僅中心)。
組織 RNA/DNA 萃 取
如果提供的是塊,則使用切片機將FFPE腫瘤組織切成10 µm厚,並將3個切片裝在黏性顯微鏡載玻片上。使用無菌手術刀從樣本載玻片上修剪掉多餘的石蠟後,將腫瘤組織宏觀解剖(macrodissected)並收集在單獨的Eppendorf DNA LoBind管中。根據製造商的說明,使用ALLPREP® DNA/RNA FFPE套組(kit)(參考號80234,凱杰公司(QIAGEN))共萃取每個人肺癌FFPE組織樣本中的基因體DNA和總RNA,其中開始是手動處理步驟,然後使用QIACUBE自動核酸純化儀器進行最終的自動提取步驟。將基因體DNA在30 µL ATE緩衝液中洗脫,並將總RNA在20 µL無RNA酶的水中洗脫。
共生成了71個RNA樣本,用於RNA定序分析。
基因表現( RNA-seq )
使用RNA-seq分析具有已知CEACAM5表現水平(藉由IHC測量)的組織樣本。藉由使用KAPA mRNA HYPERPREPKITILLUMINA®平臺來對來自57份FFPE患者生檢的RNA樣本進行定序。如下處理RNA-seq數據:使用與參考的剪接轉錄本比對(Spliced Transcripts Alignment to a Reference,STAR)比對器來將定序讀數映射到參考基因體GRCh 38[25]。最初藉由CUFFLINK以FPKM(每百萬每千鹼基片段數)測量基因表現[26],並將基因水平的FPKM轉換為TPM(每百萬每千鹼基轉錄本)[27]。將TPM值log2轉換並分位數標準化,以用於下游分析,包括差異基因表現(differential gene expression,DGE)分析。檢測到的基因子低於10,000的樣本被排除在下游分析之外。根據已發表的方法,RNA-seq包括微環境細胞群[microenvironment cell populations,MCP]計數器分析[28,29]。
統計分析
所有分析均在生物標誌物群體中進行,生物標誌物群體定義為接受治療且具有至少一項可評估CEACAM5表現測量或至少一項有效RNA評估的患者。
治療前腫瘤樣本中的 CEACAM5 表現
在整個膜上強度≥2+的陽性腫瘤細胞的百分比定義了腫瘤組織中的CEACAM5表現,其使用描述性統計進行分析。
藉由計算曼-惠特尼U檢驗的P值(僅存在2組時)或肯德爾τ(Kendall tau)來評估CEACAM5表現特徵之間的關聯。
還使用Benjamini-Hochberg(BH)多重校正程序計算調整的P值,以控制錯誤發現率。
基線生物標誌物與腫瘤反應之間的關聯
透過雙邊費雪正確性檢定(two-sided Fisher’s exact test)評估CEACAM5表現(中度表現與高度表現)和總反應率(overall response rate,ORR)之間關聯的統計顯著性。
實例 2 :結果 生物標誌物可評估患者
在這項對劑量擴展階段的晚期非鱗狀NSCLC患者群組的探索性生物標誌物分析中,第一位患者於2017年1月2日入組,並且該等分析的數據截止日期為2020年12月。
在888名預先篩選的NSQ-NSCLC患者中,172名(19%)具有高CEACAM5表現,210名(24%)具有中度CEACAM5表現。
92名患者接受治療:64名具有高CEACAM5表現(高度表現者),28名具有中度CEACAM5表現(中度表現者)
總之,中位年齡為62.5歲(範圍為31-91歲;42% ≥ 65歲);51%為男性;72%的ECOG PS ≥ 1;患者先前接受過針對晚期疾病的療法線(其種類中位數為3,範圍為1-10),包括抗微管蛋白劑(61%)和抗PD1/PD-L1藥劑(75%)。
臨床結果顯示,藉由免疫組織化學(IHC)測量的高CEACAM5蛋白表現水平(即藉由CEACAM5 IHC測量,≥ 50%的腫瘤細胞中強度≥ 2+)的患者(反應者)的臨床反應豐富。無反應者係CEACAM5蛋白中度表現者,定義為藉由IHC測量,≥ 1%至< 50%的腫瘤細胞群體中CEACAM5蛋白表現強度≥ 2+。
CEACAM5 表現:腫瘤中的染色和分佈模式
高CEACAM5表現者顯示全膜表現相比於極化膜表現的優勢。相反,中度CEACAM5表現者的全膜表現和極化膜表現相似(
表 1 )。
初步診斷時,主要的組織學類型係腺癌,並且無論CEACAM5表現水平如何,大多數(91.3%)表現CEACAM5的腫瘤處於III期或更高(
表 1)。
表 1. CEACAM5 表現:腫瘤中的染色和分佈模式
| CEACAM5 ≥ 2+ 強度的陽性細胞百分比 | 合併高和中度 CEACAM5 表現者 ( N = 92 ) | 高 CEACAM5 表現者 ( N = 64 ) | 中度 CEACAM5 表現者 ( N = 28 ) |
| 染色模式,平均值 ± SD | |||
| 全膜 | 51.95 ± 37.43 | 6.96 ± 9.02 | |
| 極化的 | 25.08 ± 31.69 a | 6.89 ± 12.04 | |
| 組織學類型, n ( % ) | |||
| 腺癌 | 91(98.9) | 63(98.4) | 28(100) |
| 其他 | 1(1.1) | 1(1.6) | 0 |
| 分期, n ( % ) | |||
| I 期 | 6(6.5) | 5(7.8) | 1(3.6) |
| II 期 | 2(2.2) | 2(3.1) | 0 |
| III 期 | 20(21.7) | 14(21.9) | 6(21.4) |
| IV 期 | 64(69.6) | 43(67.2) | 21(75.0) |
a對於極化膜,N = 63。
CEACAM5,癌胚抗原相關細胞黏附分子5;NSCLC,非小細胞肺癌;SD,標準差。
CEACAM5 表現(藉由 IHC 測量)與基因表現之間的關聯( RNA-seq )
差異基因表現分析已確定CEACAM5 mRNA係最相關的基因(並且也是唯一顯著的基因,調整的P = 0.00265),其中藉由IHC測量CEACAM5高與中度表現。經多次檢測校正後,其他CEACAM家族成員表現或其他基因表現與CEACAM5 IHC無顯著關聯性(
表 2)。
表 2. 高與中度 CEACAM5 表現(藉由 IHC 測量)的 RNA-seq 基因表現倍數變化:排 序 前 10 位的基因,包括排 序 最接近的其他 CEACAM 家族成員。
| 排序 | 基因 | logFC | 下 CL | 上 CL | 平均表現( AveExpr ) | P 值 | 調整的 P 值 |
| 1 | CEACAM5 | 0.46 | 0.28 | 0.63 | 7.1 | 3.2e-06 | 0.05 |
| 2 | TACR1 | -0.96 | -1.4 | -0.51 | 4.2 | 6.8e-05 | 0.38 |
| 3 | HOXB5 | 1 | 0.54 | 1.5 | 5.3 | 7.3e-05 | 0.38 |
| 4 | RIOX2 | -0.15 | -0.22 | -0.071 | 6.5 | 0.00024 | 0.92 |
| 5 | SGCE | -0.22 | -0.33 | -0.1 | 6.4 | 0.00034 | 1 |
| 6 | HOXB6 | 0.82 | 0.38 | 1.3 | 5.2 | 0.00045 | 1 |
| 7 | ENTPD8 | 1.2 | 0.53 | 1.9 | 4.8 | 0.00069 | 1 |
| 8 | MNX1 | 0.99 | 0.44 | 1.5 | 4.6 | 0.00072 | 1 |
| 9 | CYP4Z1 | -0.93 | -1.4 | -0.41 | 4.2 | 0.00076 | 1 |
| 10 | RASL11A | -0.55 | -0.86 | -0.24 | 5.5 | 0.00077 | 1 |
| CEACAM3 | 0.65 | 0.13 | 1.2 | 6.3 | 0.016 | 1 |
CEACAM,癌胚抗原相關細胞黏附分子;CL,信賴界限;logFC,log倍數變化。
CEACAM5 表現、客觀反應率和 CEACAM5 mRNA 水平之間的關聯
在對特賽妥單抗-雷星治療有反應的患者中觀察到CEACAM5 mRNA水平與CEACAM5表現的相關性,該CEACAM5表現藉由免疫組織化學進行測量,記錄為以至少2+強度表現標靶的腫瘤細胞百分比總和。
實例 3 :討論
藉由IHC測量,近20%的預篩選的NSCLC患者具有高CEACAM5表現,即≥ 50%的腫瘤細胞中染色強度≥ 2+。觀察到具有高CEACAM5蛋白表現水平並用特賽妥單抗-雷星治療的患者的臨床反應豐富。
發現CEACAM5表現、cCEA、cCEACAM5與CEACAM5腫瘤mRNA水平之間具有關聯性。
此外,在高與中度CEACAM5蛋白表現的患者中,CEACAM5 mRNA表現顯著上調,但其他基因(包括其他CEACAM家族基因)則沒有(
圖 1和
表 1)。
與中度表現者相比,在CEACAM5高度表現者中觀察到更高水平的CEACAM5 mRNA(P = 0.0027)(
圖 1)。
發現腫瘤細胞中CEACAM5 mRNA水平與腫瘤細胞中CEACAM5 IHC染色之間具有關聯性(
圖 2)。
此外,顯示如藉由IHC測量的,用ADC治療且具有高CEACAM5 mRNA水平和高CEACAM5蛋白表現的患者的臨床反應豐富(
圖 3和
圖 4)。
如
圖 5所示,根據對特賽妥單抗-雷星的臨床反應,說明瞭CEACAM家族成員mRNA表現,與無反應者組相比,反應者組的CEACAM5 mRNA水平的中位數更高。此結果顯示,根據CEACAM5 mRNA水平,用特賽妥單抗-雷星治療的患者的臨床反應豐富。除了CEACAM3具有小趨勢外,其他CEACAM家族成員沒有觀察到這種情況。
臨床研究的劑量遞增和擴展階段的臨床結果顯示,與用ADC治療並且具有中度CEACAM5蛋白表現(無反應者)的患者相比,具有高CEACAM5蛋白表現(反應者)並且用特賽妥單抗-雷星治療的患者的臨床反應豐富。
生物標誌物分析的進一步結果支持mRNA CEACAM5表現水平與CEACAM5蛋白表現水平之間的關聯性。
由於用特賽妥單抗-雷星治療的患者中顯示了CEACAM5蛋白表現水平與臨床反應豐富之間具有關聯性,並且由於顯示了CEACAM5蛋白表現水平與mRNA CEACAM5表現水平之間具有關聯性,因此表明mRNA CEACAM5表現水平係臨床反應豐富的良好生物標誌物,並且用於選擇用抗CEACAM5抗體藥物接合物(如特賽妥單抗-雷星)治療的患者。
此外,CEACAM5 mRNA水平係一種良好的生物標誌物,用於預先選擇需要用包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC)用於癌症治療的患者,用於用CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色進行的另外的選擇步驟以及用ADC治療需要癌症治療的患者。
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無
圖 1:顯示了高與中度CEACAM5表現中CEACAM5 mRNA每百萬轉錄本升高。
圖 2:顯示了CEACAM5 mRNA與CEACAM5 IHC H得分的相關性。
圖 3:顯示了CEACAM5 mRNA水平與CEACAM5表現的相關性,其根據患者對特賽妥單抗-雷星治療的反應,該CEACAM5表現藉由免疫組織化學進行測量,記錄為以至少2+強度表現標靶的腫瘤細胞百分比總和。
圖 4:顯示了在對特賽妥單抗-雷星治療有反應的患者中,CEACAM5 mRNA水平與CEACAM5表現的相關性,該CEACAM5表現藉由免疫組織化學進行測量,記錄為以至少2+強度表現標靶的腫瘤細胞百分比的總和。
圖 5:顯示了根據用特賽妥單抗-雷星治療的患者的臨床反應的CEACAM家族成員表現的箱形圖。
無
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Claims (27)
- 一種用於選擇需要用抗體藥物接合物(antibody-drug conjugate,ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟: (i) 確定從該受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值, (ii) 將經確定的該值與參考值進行比較,以及 (iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則選擇該受試者用於癌症治療。
- 一種包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC),用於在治療有需要的受試者的癌症中使用, 該使用包括: (i) 確定從該受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值, (ii) 將經確定的該值與參考值進行比較,以及 (iii) 如果該經確定的該值高於該參考值,則向該受試者投予有效量的該ADC。
- 一種用於選擇需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟: (i) 確定從該受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值, (ii) 將步驟 (i) 中經確定的該值與CEACAM5基因表現水平的參考值進行比較, (iii) 如果步驟 (i) 中該經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇該受試者用於CEACAM5免疫組織化學(immunohistochemistry,IHC)染色測試, (iv) 用該CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從該受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度, (v) 將步驟 (iv) 中經確定的該強度與參考強度進行比較,以及 (vi) 如果步驟 (iv) 中該經確定的強度高於該參考強度,則選擇該受試者用於癌症治療。
- 一種包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC),用於在治療有需要的受試者的癌症中使用, 該使用包括: (i) 確定從該受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5基因表現水平的值, (ii) 將步驟 (i) 中經確定的該值與CEACAM5基因表現水平的參考值進行比較, (iii) 如果步驟 (i) 中該經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇該受試者進行CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試, (iv) 用該CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從該受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度, (v) 將步驟 (iv) 中經確定的該強度與參考強度進行比較,以及 (vi) 如果該經確定的強度高於該參考強度,則向該受試者投予有效量的該ADC。
- 如請求項1或3所述之方法或如請求項2或4所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該CEACAM5基因表現水平的值係CEACAM5基因轉錄本的測量值。
- 如請求項3所述之方法或所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該CEACAM5基因轉錄本係mRNA。
- 一種用於選擇需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟: (i) 確定從該受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化(quantile-normalized)的每百萬每千鹼基轉錄本(Transcripts Per Kilobase Million,,TPM)值, (ii) 將該值與參考值進行比較,以及 (iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則選擇該受試者用於癌症治療。
- 一種包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC),用於在治療有需要的受試者的癌症中使用, 該使用包括: (i) 確定從該受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值, (ii) 將該值與參考值進行比較,以及 (iii) 如果該經確定的值高於該參考值,則向該受試者投予有效量的該ADC。
- 一種用於選擇需要用抗體藥物接合物(ADC)治療癌症的受試者之方法,該抗體藥物接合物包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體,該方法至少包括以下步驟: (i) 確定從該受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值, (ii) 將步驟 (i) 中經確定的該值與參考值進行比較, (iii) 如果步驟 (i) 中該經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇該受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試, (iv) 用該CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從該受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度, (v) 將步驟 (iv) 中經確定的該強度與參考強度進行比較,以及 (vi) 如果該經確定的強度高於該參考強度,則選擇該受試者用於癌症治療。
- 一種包含與細胞毒性劑接合的抗CEACAM5抗體的抗體藥物接合物(ADC),用於在治療有需要的受試者的癌症中使用, 該使用包括: (i) 確定從該受試者獲得的腫瘤分離樣本中的CEACAM5 mRNA的log2轉換的、分位數標準化的每百萬每千鹼基轉錄本(TPM)值, (ii) 將步驟 (i) 中經確定的該值與參考值進行比較, (iii) 如果步驟 (i) 中該經確定的值高於步驟 (ii) 的該參考值,則選擇該受試者用於CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試, (iv) 用該CEACAM5免疫組織化學(IHC)染色測試確定從該受試者獲得的腫瘤分離樣本中CEACAM5蛋白表現水平的強度, (v) 將步驟 (iv) 中經確定的該強度與參考強度進行比較,以及 (vi) 如果該經確定的強度高於該參考強度,則向該受試者投予有效量的該ADC。
- 如請求項1、3、5至7和9中任一項所述之方法或如請求項2、4至6、8和10中任一項所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該抗CEACAM5抗體包含具有SEQ ID NO: 1的胺基酸序列的HCDR1、具有SEQ ID NO: 2的胺基酸序列的HCDR2、具有SEQ ID NO: 3的胺基酸序列的HCDR3、具有SEQ ID NO: 4的胺基酸序列的LCDR1、具有胺基酸序列NTR的LCDR2和具有SEQ ID NO: 5的胺基酸序列的LCDR3。
- 如請求項1、3、5至7、9和11中任一項所述之方法或如請求項2、4至6、8和10至11中任一項所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該細胞毒性劑係美登素生物鹼類(maytansinoid)或美登素生物鹼類類似物。
- 如請求項7、9和11至12中任一項所述之方法或如請求項8和10至12中任一項所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該參考值為至少約7至約13。
- 如請求項7、9和11至13中任一項所述之方法或如請求項8和10至13中任一項所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該參考值為至少約7,或為至少約8、或至少約9、或至少約10、或至少約11、或至少約12、或至少約13。
- 如請求項7、9和11至14中任一項所述之方法或如請求項8和10至13中任一項所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該分位數標準化藉由以下方式獲得:(i) 按表現水平對該樣本的轉錄本進行排序,(ii) 計算佔據相同排序的基因的平均值,以及 (iii) 用該平均值取代佔據該相同排序的所有基因的值。
- 如請求項7、9和11至15中任一項所述之方法或如請求項8和10至15中任一項所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該等轉錄本的表現水平在轉換為TPM之前以每百萬每千鹼基片段數(Fragments Per Kilobase Million,FPKM)來測量。
- 如請求項16所述之方法或所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該每百萬每千鹼基片段數(FPKM)藉由以下方式獲得:對該樣本中的總轉錄本進行計數,將獲得的轉錄本計數除以1,000,000,並將獲得的值除以該基因的長度,以千鹼基計。
- 如請求項1至17中任一項所述之方法或所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該癌症選自由以下組成之群組:肝細胞癌、結直腸癌、胃癌、胃食道交界處腺癌(gastroesophageal junction adenocarcinoma,GEJ)、食道癌、肺癌、子宮頸癌、胰臟癌、卵巢癌、甲狀腺癌、膀胱癌、子宮內膜癌、乳癌、肝癌、膽道癌、攝護腺癌、神經內分泌癌和皮膚癌。
- 如請求項1至18中任一項所述之方法或所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該ADC係特賽妥單抗-雷星(tusamitamab ravtansine)。
- 如請求項1至19中任一項所述之方法或所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中相對於該受試者的體表面積,該ADC的投予劑量為≥ 80 mg/m 2,特別地劑量為80 mg/m 2至210 mg/m 2、80 mg/m 2至170 mg/m 2,或劑量為80 mg/m 2至150 mg/m 2,或劑量為80 mg/m 2至120 mg/m 2,或劑量為80 mg/m 2至100 mg/m 2,並且特別地劑量為80、100、120、150、170、180或210 mg/m 2,約每兩週一次,或該ADC的投予劑量為相對於該受試者的體表面積≥ 80 mg/m 2,約每三週一次。
- 如請求項2、4至6和8、10至16中任一項所述之方法或所使用的抗體藥物接合物(ADC),其進一步包括向該受試者投予有效量的至少一種有效治療該癌症的額外的藥劑。
- 如請求項21所述之方法或所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該額外的藥劑選自由以下組成之群組:免疫檢查點抑制劑(immune checkpoint inhibitor,ICI)特別地抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體、基於鉑的化療、培美曲塞(pemetrexed)、抗VEGFR2、FOLFOX、FOLFIRI、TAS-102、抗EGFR及其任何組合。
- 如請求項22所述之方法或所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該抗PD-1抗體選自由以下組成之群組:派姆單抗(pembrolizumab)、納武單抗(nivolumab)、西米普利單抗(cemiplimab)、信迪利單抗(sintilimab)、多塔利單抗(dostarlimab)和替雷利珠單抗(tislelizumab),或者其中該抗PD-L1抗體選自由以下組成之群組:阿特珠單抗(atezolizumab)、阿維魯單抗(avelumab)和德瓦魯單抗(durvalumab)。
- 如請求項23所述之方法或所使用的抗體藥物接合物(ADC),其包括向該受試者投予有效量的特賽妥單抗-雷星和派姆單抗。
- 如請求項22所述之方法或所使用的抗體藥物接合物(ADC),其進一步包括向該受試者投予有效量的基於鉑的化療。
- 如請求項25所述之方法或所使用的抗體藥物接合物(ADC),其中該基於鉑的化療選自順鉑(cisplatin)和卡鉑(carboplatin)。
- 如請求項25或26所述之方法或所使用的抗體藥物接合物(ADC),其進一步包括向該受試者投予有效量的培美曲塞。
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