SK131197A3 - Conditional expression system - Google Patents
Conditional expression system Download PDFInfo
- Publication number
- SK131197A3 SK131197A3 SK1311-97A SK131197A SK131197A3 SK 131197 A3 SK131197 A3 SK 131197A3 SK 131197 A SK131197 A SK 131197A SK 131197 A3 SK131197 A3 SK 131197A3
- Authority
- SK
- Slovakia
- Prior art keywords
- molecule
- region
- sequence
- transactivator
- protein
- Prior art date
Links
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 title claims abstract description 71
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 claims abstract description 67
- 238000009739 binding Methods 0.000 claims abstract description 66
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 claims abstract description 65
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims abstract description 65
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract description 42
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 128
- 102100025064 Cellular tumor antigen p53 Human genes 0.000 claims description 66
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 64
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 63
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 41
- 101150054175 cro gene Proteins 0.000 claims description 39
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 36
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 30
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 30
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 29
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 28
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 claims description 25
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 23
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 claims description 23
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 claims description 20
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 claims description 17
- 238000006384 oligomerization reaction Methods 0.000 claims description 15
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 claims description 15
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 claims description 14
- 230000002950 deficient Effects 0.000 claims description 13
- 108020004440 Thymidine kinase Proteins 0.000 claims description 12
- 230000003993 interaction Effects 0.000 claims description 12
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 11
- 101150061166 tetR gene Proteins 0.000 claims description 11
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 claims description 9
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 claims description 9
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 claims description 9
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 claims description 9
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 claims description 8
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 claims description 8
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 7
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 6
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 claims description 6
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 claims description 5
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 claims description 5
- 102000006601 Thymidine Kinase Human genes 0.000 claims description 5
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 5
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 5
- 102000016607 Diphtheria Toxin Human genes 0.000 claims description 4
- 108010053187 Diphtheria Toxin Proteins 0.000 claims description 4
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 4
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 4
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 claims description 3
- AEMBWNDIEFEPTH-UHFFFAOYSA-N n-tert-butyl-n-ethylnitrous amide Chemical compound CCN(N=O)C(C)(C)C AEMBWNDIEFEPTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 102000000311 Cytosine Deaminase Human genes 0.000 claims description 2
- 108010080611 Cytosine Deaminase Proteins 0.000 claims description 2
- 101000979342 Homo sapiens Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit Proteins 0.000 claims description 2
- 108010070875 Human Immunodeficiency Virus tat Gene Products Proteins 0.000 claims description 2
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 claims description 2
- 102100023050 Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit Human genes 0.000 claims description 2
- 241001631646 Papillomaviridae Species 0.000 claims description 2
- 108010039491 Ricin Proteins 0.000 claims description 2
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 claims description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 claims description 2
- 230000003463 hyperproliferative effect Effects 0.000 claims description 2
- 230000003071 parasitic effect Effects 0.000 claims description 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 2
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 2
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 claims 1
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 52
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 51
- 230000023603 positive regulation of transcription initiation, DNA-dependent Effects 0.000 description 38
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 35
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 28
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 28
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 27
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 25
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 20
- 108010035563 Chloramphenicol O-acetyltransferase Proteins 0.000 description 13
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 13
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 12
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 12
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 11
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 description 10
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 10
- 238000000034 method Methods 0.000 description 10
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 10
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 10
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 10
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 10
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 10
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 8
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 8
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 7
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 7
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 7
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 7
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 7
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 7
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 6
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 6
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 6
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 5
- 238000002659 cell therapy Methods 0.000 description 5
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 5
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 5
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 5
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 5
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 5
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 5
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 5
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 5
- 235000002639 sodium chloride Nutrition 0.000 description 5
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 5
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 5
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 4
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 4
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 4
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 4
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 4
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 4
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 4
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 4
- 101710150451 Protein Bel-1 Proteins 0.000 description 4
- 108700026226 TATA Box Proteins 0.000 description 4
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 4
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 4
- 235000005772 leucine Nutrition 0.000 description 4
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 4
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 4
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 4
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 4
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 4
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000002267 Anti-neutrophil cytoplasmic antibody-associated vasculitis Diseases 0.000 description 3
- -1 E6 / E7 Proteins 0.000 description 3
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 3
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 3
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 3
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 3
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 3
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 3
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical compound [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 3
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 3
- 229920006317 cationic polymer Polymers 0.000 description 3
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 3
- 108700004026 gag Genes Proteins 0.000 description 3
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 3
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 3
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 3
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 3
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 3
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 3
- 238000001823 molecular biology technique Methods 0.000 description 3
- 230000029279 positive regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 3
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 3
- 230000007115 recruitment Effects 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 3
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 2
- 241000282465 Canis Species 0.000 description 2
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 2
- 102000001039 Dystrophin Human genes 0.000 description 2
- 108010069091 Dystrophin Proteins 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101000611183 Homo sapiens Tumor necrosis factor Proteins 0.000 description 2
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 2
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 2
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 2
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 2
- UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- 241000713896 Spleen necrosis virus Species 0.000 description 2
- 102100040247 Tumor necrosis factor Human genes 0.000 description 2
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 2
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 238000012761 co-transfection Methods 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 108700004025 env Genes Proteins 0.000 description 2
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 2
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 2
- XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N glycyl-glycyl-glycine Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 2
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 2
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 2
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 2
- NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N insulin Chemical compound N1C(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(NC(=O)CN)C(C)CC)CSSCC(C(NC(CO)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CSSCC(NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2NC=NC=2)NC(=O)C(CO)NC(=O)CNC2=O)C(=O)NCC(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)N3C(CCC3)C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C)C(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O)=O)NC(=O)C(C(C)CC)NC(=O)C(CO)NC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C1CSSCC2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)CC1=CN=CN1 NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940047124 interferons Drugs 0.000 description 2
- 150000002614 leucines Chemical class 0.000 description 2
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 2
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 2
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 2
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000011147 magnesium chloride Nutrition 0.000 description 2
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 2
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- 210000004897 n-terminal region Anatomy 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 2
- 108700004029 pol Genes Proteins 0.000 description 2
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 2
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 210000001995 reticulocyte Anatomy 0.000 description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 2
- ATHGHQPFGPMSJY-UHFFFAOYSA-N spermidine Chemical compound NCCCCNCCCN ATHGHQPFGPMSJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 2
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 2
- 241001529453 unidentified herpesvirus Species 0.000 description 2
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- OPCHFPHZPIURNA-MFERNQICSA-N (2s)-2,5-bis(3-aminopropylamino)-n-[2-(dioctadecylamino)acetyl]pentanamide Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCN(CC(=O)NC(=O)[C@H](CCCNCCCN)NCCCN)CCCCCCCCCCCCCCCCCC OPCHFPHZPIURNA-MFERNQICSA-N 0.000 description 1
- LDGWQMRUWMSZIU-LQDDAWAPSA-M 2,3-bis[(z)-octadec-9-enoxy]propyl-trimethylazanium;chloride Chemical compound [Cl-].CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCCOCC(C[N+](C)(C)C)OCCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC LDGWQMRUWMSZIU-LQDDAWAPSA-M 0.000 description 1
- 102100022464 5'-nucleotidase Human genes 0.000 description 1
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- KIUYPHAMDKDICO-WHFBIAKZSA-N Ala-Asp-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O KIUYPHAMDKDICO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- VWEWCZSUWOEEFM-WDSKDSINSA-N Ala-Gly-Ala-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O VWEWCZSUWOEEFM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- WGDNWOMKBUXFHR-BQBZGAKWSA-N Ala-Gly-Arg Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N WGDNWOMKBUXFHR-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- NMXKFWOEASXOGB-QSFUFRPTSA-N Ala-Ile-His Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 NMXKFWOEASXOGB-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- SDZRIBWEVVRDQI-CIUDSAMLSA-N Ala-Lys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O SDZRIBWEVVRDQI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NLOMBWNGESDVJU-GUBZILKMSA-N Ala-Met-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O NLOMBWNGESDVJU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 108010059886 Apolipoprotein A-I Proteins 0.000 description 1
- 102000005666 Apolipoprotein A-I Human genes 0.000 description 1
- 102000009081 Apolipoprotein A-II Human genes 0.000 description 1
- 108010087614 Apolipoprotein A-II Proteins 0.000 description 1
- 102000007592 Apolipoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010071619 Apolipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000013918 Apolipoproteins E Human genes 0.000 description 1
- 108010025628 Apolipoproteins E Proteins 0.000 description 1
- XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N Arg-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- HJDNZFIYILEIKR-OSUNSFLBSA-N Arg-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O HJDNZFIYILEIKR-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- PAPSMOYMQDWIOR-AVGNSLFASA-N Arg-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O PAPSMOYMQDWIOR-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- VIRHEUMYXXLCBF-WDSKDSINSA-N Asp-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VIRHEUMYXXLCBF-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- CLUMZOKVGUWUFD-CIUDSAMLSA-N Asp-Leu-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O CLUMZOKVGUWUFD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- 241000271566 Aves Species 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 108090000715 Brain-derived neurotrophic factor Proteins 0.000 description 1
- 102000004219 Brain-derived neurotrophic factor Human genes 0.000 description 1
- 101100512078 Caenorhabditis elegans lys-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100505161 Caenorhabditis elegans mel-32 gene Proteins 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 241000701157 Canine mastadenovirus A Species 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 101150044789 Cap gene Proteins 0.000 description 1
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102100038909 Caveolin-2 Human genes 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 102100023321 Ceruloplasmin Human genes 0.000 description 1
- 108010005939 Ciliary Neurotrophic Factor Proteins 0.000 description 1
- 102100031614 Ciliary neurotrophic factor Human genes 0.000 description 1
- 108020004394 Complementary RNA Proteins 0.000 description 1
- 108050006400 Cyclin Proteins 0.000 description 1
- 102000016736 Cyclin Human genes 0.000 description 1
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 1
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 1
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 108050002772 E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2 Proteins 0.000 description 1
- 102000012199 E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2 Human genes 0.000 description 1
- 241000701533 Escherichia virus T4 Species 0.000 description 1
- 102000030914 Fatty Acid-Binding Human genes 0.000 description 1
- 108090000386 Fibroblast Growth Factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100031706 Fibroblast growth factor 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100024785 Fibroblast growth factor 2 Human genes 0.000 description 1
- 108090000379 Fibroblast growth factor 2 Proteins 0.000 description 1
- 108091092584 GDNA Proteins 0.000 description 1
- 102000004038 Glia Maturation Factor Human genes 0.000 description 1
- 108090000495 Glia Maturation Factor Proteins 0.000 description 1
- 102100039289 Glial fibrillary acidic protein Human genes 0.000 description 1
- 101710193519 Glial fibrillary acidic protein Proteins 0.000 description 1
- JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N Glu-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- YWAQATDNEKZFFK-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YWAQATDNEKZFFK-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N Gly-Ser-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- WCORRBXVISTKQL-WHFBIAKZSA-N Gly-Ser-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WCORRBXVISTKQL-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 108010068250 Herpes Simplex Virus Protein Vmw65 Proteins 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- RNMNYMDTESKEAJ-KKUMJFAQSA-N His-Leu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 RNMNYMDTESKEAJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- VIJMRAIWYWRXSR-CIUDSAMLSA-N His-Ser-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 VIJMRAIWYWRXSR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- 101000678236 Homo sapiens 5'-nucleotidase Proteins 0.000 description 1
- 101000740981 Homo sapiens Caveolin-2 Proteins 0.000 description 1
- 101000599951 Homo sapiens Insulin-like growth factor I Proteins 0.000 description 1
- 108091006905 Human Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 102000008100 Human Serum Albumin Human genes 0.000 description 1
- 241000598171 Human adenovirus sp. Species 0.000 description 1
- XQFRJNBWHJMXHO-RRKCRQDMSA-N IDUR Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(I)=C1 XQFRJNBWHJMXHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- 102000004877 Insulin Human genes 0.000 description 1
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 1
- 102100037852 Insulin-like growth factor I Human genes 0.000 description 1
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 1
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 description 1
- 102000015696 Interleukins Human genes 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- APFJUBGRZGMQFF-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN APFJUBGRZGMQFF-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- RZXLZBIUTDQHJQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Lys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RZXLZBIUTDQHJQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 108010074338 Lymphokines Proteins 0.000 description 1
- 102000008072 Lymphokines Human genes 0.000 description 1
- ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- WBSCNDJQPKSPII-KKUMJFAQSA-N Lys-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O WBSCNDJQPKSPII-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- PLDJDCJLRCYPJB-VOAKCMCISA-N Lys-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PLDJDCJLRCYPJB-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- HYSVGEAWTGPMOA-IHRRRGAJSA-N Lys-Pro-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HYSVGEAWTGPMOA-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- QVTDVTONTRSQMF-WDCWCFNPSA-N Lys-Thr-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@H](O)C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN QVTDVTONTRSQMF-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- SBSIKVMCCJUCBZ-GUBZILKMSA-N Met-Asn-Arg Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N SBSIKVMCCJUCBZ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- ADHNYKZHPOEULM-BQBZGAKWSA-N Met-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O ADHNYKZHPOEULM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 241000713869 Moloney murine leukemia virus Species 0.000 description 1
- 241000701168 Murine adenovirus 1 Species 0.000 description 1
- 101001055320 Myxine glutinosa Insulin-like growth factor Proteins 0.000 description 1
- 108010025020 Nerve Growth Factor Proteins 0.000 description 1
- 102000015336 Nerve Growth Factor Human genes 0.000 description 1
- 108090000742 Neurotrophin 3 Proteins 0.000 description 1
- 102000007999 Nuclear Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010089610 Nuclear Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- JXWLMUIXUXLIJR-QWRGUYRKSA-N Phe-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 JXWLMUIXUXLIJR-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- CMHTUJQZQXFNTQ-OEAJRASXSA-N Phe-Leu-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N)O CMHTUJQZQXFNTQ-OEAJRASXSA-N 0.000 description 1
- OAICVXFJPJFONN-NJFSPNSNSA-N Phosphorus-33 Chemical compound [33P] OAICVXFJPJFONN-NJFSPNSNSA-N 0.000 description 1
- 229920002873 Polyethylenimine Polymers 0.000 description 1
- 108010039918 Polylysine Proteins 0.000 description 1
- ULWBBFKQBDNGOY-RWMBFGLXSA-N Pro-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O ULWBBFKQBDNGOY-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710088675 Proline-rich peptide Proteins 0.000 description 1
- 101710149951 Protein Tat Proteins 0.000 description 1
- 102000013009 Pyruvate Kinase Human genes 0.000 description 1
- 108020005115 Pyruvate Kinase Proteins 0.000 description 1
- 239000012083 RIPA buffer Substances 0.000 description 1
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 1
- 241000714474 Rous sarcoma virus Species 0.000 description 1
- 101100379247 Salmo trutta apoa1 gene Proteins 0.000 description 1
- SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CO SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N Ser-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N Ser-Gly-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- SNXUIBACCONSOH-BWBBJGPYSA-N Ser-Thr-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SNXUIBACCONSOH-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100032889 Sortilin Human genes 0.000 description 1
- 102100021993 Sterol O-acyltransferase 1 Human genes 0.000 description 1
- JWQNAFHCXKVZKZ-UVOCVTCTSA-N Thr-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O JWQNAFHCXKVZKZ-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 1
- 102000007238 Transferrin Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010033576 Transferrin Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000009618 Transforming Growth Factors Human genes 0.000 description 1
- 108010009583 Transforming Growth Factors Proteins 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700025716 Tumor Suppressor Genes Proteins 0.000 description 1
- 102000044209 Tumor Suppressor Genes Human genes 0.000 description 1
- 108010040002 Tumor Suppressor Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000001742 Tumor Suppressor Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108700005077 Viral Genes Proteins 0.000 description 1
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 description 1
- 230000001594 aberrant effect Effects 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 238000003916 acid precipitation Methods 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 108010043240 arginyl-leucyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 239000012298 atmosphere Substances 0.000 description 1
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 239000003914 blood derivative Substances 0.000 description 1
- 229910052792 caesium Inorganic materials 0.000 description 1
- TVFDJXOCXUVLDH-UHFFFAOYSA-N caesium atom Chemical compound [Cs] TVFDJXOCXUVLDH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011148 calcium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 229910002092 carbon dioxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001569 carbon dioxide Substances 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 1
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 108091092356 cellular DNA Proteins 0.000 description 1
- 238000011964 cellular and gene therapy Methods 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 238000012412 chemical coupling Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 description 1
- 230000015271 coagulation Effects 0.000 description 1
- 238000005345 coagulation Methods 0.000 description 1
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 1
- 230000001010 compromised effect Effects 0.000 description 1
- 238000009833 condensation Methods 0.000 description 1
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 238000006471 dimerization reaction Methods 0.000 description 1
- BNIILDVGGAEEIG-UHFFFAOYSA-L disodium hydrogen phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].OP([O-])([O-])=O BNIILDVGGAEEIG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000397 disodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019800 disodium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 230000002900 effect on cell Effects 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 description 1
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 108091022862 fatty acid binding Proteins 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 238000001215 fluorescent labelling Methods 0.000 description 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 1
- 101150098622 gag gene Proteins 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 description 1
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 description 1
- 210000005046 glial fibrillary acidic protein Anatomy 0.000 description 1
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010067216 glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 description 1
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 description 1
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 description 1
- 108010040030 histidinoalanine Proteins 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 1
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 239000007972 injectable composition Substances 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 229940125396 insulin Drugs 0.000 description 1
- 229940047122 interleukins Drugs 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 125000000959 isobutyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 238000003670 luciferase enzyme activity assay Methods 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 102000006240 membrane receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020004084 membrane receptors Proteins 0.000 description 1
- 229960004452 methionine Drugs 0.000 description 1
- 108010056582 methionylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 229910000403 monosodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019799 monosodium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000003471 mutagenic agent Substances 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 239000002858 neurotransmitter agent Substances 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 230000009871 nonspecific binding Effects 0.000 description 1
- 210000000633 nuclear envelope Anatomy 0.000 description 1
- 230000030648 nucleus localization Effects 0.000 description 1
- 201000008968 osteosarcoma Diseases 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 1
- 231100000614 poison Toxicity 0.000 description 1
- 239000002574 poison Substances 0.000 description 1
- 231100000572 poisoning Toxicity 0.000 description 1
- 230000000607 poisoning effect Effects 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 229920000656 polylysine Polymers 0.000 description 1
- 239000001103 potassium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011164 potassium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 101150066583 rep gene Proteins 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 108010048818 seryl-histidine Proteins 0.000 description 1
- 210000002460 smooth muscle Anatomy 0.000 description 1
- AJPJDKMHJJGVTQ-UHFFFAOYSA-M sodium dihydrogen phosphate Chemical compound [Na+].OP(O)([O-])=O AJPJDKMHJJGVTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229940063673 spermidine Drugs 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 108700020534 tetracycline resistance-encoding transposon repressor Proteins 0.000 description 1
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 1
- 230000000699 topical effect Effects 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 238000003146 transient transfection Methods 0.000 description 1
- 230000001228 trophic effect Effects 0.000 description 1
- 230000005748 tumor development Effects 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000006648 viral gene expression Effects 0.000 description 1
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 1
- 210000002845 virion Anatomy 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
- C12N15/86—Viral vectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/82—Translation products from oncogenes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/62—DNA sequences coding for fusion proteins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/635—Externally inducible repressor mediated regulation of gene expression, e.g. tetR inducible by tetracyline
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2710/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
- C12N2710/00011—Details
- C12N2710/10011—Adenoviridae
- C12N2710/10311—Mastadenovirus, e.g. human or simian adenoviruses
- C12N2710/10341—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
- C12N2710/10343—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
- C12N2740/00011—Details
- C12N2740/10011—Retroviridae
- C12N2740/13011—Gammaretrovirus, e.g. murine leukeamia virus
- C12N2740/13041—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
- C12N2740/13043—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2830/00—Vector systems having a special element relevant for transcription
- C12N2830/001—Vector systems having a special element relevant for transcription controllable enhancer/promoter combination
- C12N2830/002—Vector systems having a special element relevant for transcription controllable enhancer/promoter combination inducible enhancer/promoter combination, e.g. hypoxia, iron, transcription factor
- C12N2830/003—Vector systems having a special element relevant for transcription controllable enhancer/promoter combination inducible enhancer/promoter combination, e.g. hypoxia, iron, transcription factor tet inducible
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Oncology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Public Health (AREA)
- Virology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
Oblasť technikyTechnical field
Vynález sa týka nového systému na podmienenú expresiu génov. Vynález sa taktiež týka použitia tohto systému v génovej alebo bunkovej terapii na dosiahnutie veľmi selektívnej expresie zainteresovaného génu.The invention relates to a novel system for the conditional expression of genes. The invention also relates to the use of this system in gene or cell therapy to achieve very selective expression of the gene of interest.
Doterajší stav technikyBACKGROUND OF THE INVENTION
Génová a bunková terapia spočíva v korekcii nedostatočnosti alebo anomálie (mutácia, aberantná expresia a podobne) alebo v zaistení expresie terapeutického zainteresovaného proteínu zavedením genetickej informácie do liečeného orgánu alebo do liečenej bunky. Táto genetická informácia môže byť zavedená buď ex vivo do bunky izolovanej z orgánu, pričom táto bunka, ktorá bola takto modifikovaná, sa potom zavedie späť do organizmu (bunková terapia), alebo priamo in vivo do príslušného tkaniva (génová terapia).Gene and cell therapy consist of correcting a deficiency or anomaly (mutation, aberrant expression, and the like) or ensuring expression of a therapeutic protein of interest by introducing genetic information into the organ or cell to be treated. This genetic information can be introduced either ex vivo into a cell isolated from an organ, the cell thus modified being then reintroduced into the body (cell therapy) or directly in vivo into the appropriate tissue (gene therapy).
Pre uskutočnenie prenosu génov existujú rôzne techniky, z ktorých možno predovšetkým uviesť rôzne techniky transfekcie, pri ktorých nachádzajú uplatnenie prírodné alebo syntetické, chemické alebo biochemické vektory, akými sú napríklad komplexy DNA a DEAE-dextránu (Pagano a kol., J.Virol. 1 (1967)891), DNA a jadrových proteínov (Kaneda a kol., Science 243(1989)375), DNA a lipidov (Felgner a kol., PNAS 84 (1987)7413), použitie lipozómov (Fraley a kol., J.Biol.Chem.255(1980)10431), ako i katiónových lipidov a podobne. Iná transfekčná technika spočíva v použití vírusov, ako i vektorov na prenos génov. V tomto ohľade boli testované rôzne vírusy za účelom stanovenia ich schopnosti infikovať určité bunkové populácie. Predovšetkým ide o retrovírusy (RSV, HMS, MMS a podobne), vírus HSV, adeno-pridružené vírusy a adenovírusy.There are various techniques for carrying out gene transfer, including, but not limited to, various transfection techniques in which natural or synthetic, chemical or biochemical vectors, such as DNA and DEAE-dextran complexes are used (Pagano et al., J. Virol. 1). (1967) 891), DNA and nuclear proteins (Kaneda et al., Science 243 (1989) 375), DNA and lipids (Felgner et al., PNAS 84 (1987) 7413), use of liposomes (Fraley et al., J Biol. Chem. 255 (1980) 10431) as well as cationic lipids and the like. Another transfection technique involves the use of viruses as well as gene transfer vectors. In this regard, various viruses have been tested to determine their ability to infect certain cell populations. In particular, retroviruses (RSV, HMS, MMS and the like), HSV, adeno-associated viruses and adenoviruses.
Jednou z hlavných ťažkostí, ktoré sa vyskytujú pri rozvoji génovej a bunkovej terapie, je však selektivita liečenia. V závislosti od danej aplikácie a od prenášaného génu je veľmi dôležité mať možnosť zacieliť niektoré tkanivá alebo len niektoré časti organizmu, a to s cieľom nasmerovania terapeutického účinku len na tieto tkanivá alebo časti organizmu a obmedzenie rozptylu tohto účinku a sekundárnych nežiadúcich účinkov.However, one of the major difficulties encountered in the development of gene and cell therapy is the selectivity of treatment. Depending on the application and the gene to be transmitted, it is very important to be able to target certain tissues or only certain parts of the organism in order to direct the therapeutic effect only to these tissues or parts of the organism and to reduce the spread of this effect and secondary side effects.
Takéto zacielenie terapeutického účinku môže byť uskutočnené za použitia vektorov, ktoré vykazujú potrebnú danú bunkovú špecifickosť, t. j. vektorov, ktoré sú selektívne špecifické len pre zainteresované bunky.Such targeting of a therapeutic effect can be accomplished using vectors that exhibit the desired cell specificity, i. j. vectors that are selectively specific only to the cells of interest.
Iný prístup k riešeniu uvedeného problému spočíva v použití špecifických expresných signálov niektorých bunkových typov. V tomto ohľade boli špecifické promótory, akými kódujúcich pyruvát-kinázu, v literatúre popísané takzvané sú napríklad promótory génov vi11in, GFAP, promótor intestinálnej väzby mastných kyselín, promótor aktínu alfa buniek hladkého svalu alebo promótor génov apo-AI, apo-AII, ľudský albumín a podobne. Tieto promótory však majú niektoré nedostatky, a predovšetkým vykazujú určitý transkripčný šum, ktorý môže byť nepríjemný pri expresii toxických génov. Použitie týchto promótorov je teda obmedzené len na niektoré bunky a nemôžu byť teda použité na akúkoľvek aplikáciu.Another approach to solving this problem is to use specific expression signals of some cell types. In this regard, specific promoters such as those encoding pyruvate kinase have been described in the literature for example by the vi11in, GFAP, intestinal fatty acid binding promoter, smooth muscle actin alpha promoter or the apo-AI, apo-AII, human albumin promoter. and so on. However, these promoters have some drawbacks and, in particular, exhibit some transcriptional noise, which may be unpleasant in the expression of toxic genes. Thus, the use of these promoters is limited to some cells and cannot be used for any application.
Podstata vynálezuSUMMARY OF THE INVENTION
Vynález teraz popisuje nový systém podmienenej expresie génov, ktorý je obzvlášť selektívny a účinný. Výhodným znakom tohto systému podľa vynálezu je jeho schopnosť exprimovať gén nie v závislosti od bunkového typu, ale v závislosti od prítomnosti špecifického bunkového prvku alebo špecifickej fyziologickej situácie. Tento systém sa v skutočnosti týka chimerických bišpecifických molekúl obsahujúcich oblasť, ktorá je schopná selektívne viazať definovanú sekvenciu DNA a detekčnú oblasť, ktorá je schopná špecificky viazať transaktivátor alebo transaktivačný komplex.The invention now describes a novel conditional gene expression system that is particularly selective and effective. A preferred feature of this system of the invention is its ability to express the gene not depending on the cell type but on the presence of a specific cell element or specific physiological situation. In fact, this system relates to chimeric bispecific molecules comprising a region that is capable of selectively binding a defined DNA sequence and a detection region that is capable of specifically binding a transactivator or transactivation complex.
Prvý znak vynálezu spočíva vo vytvorení a expresii chimerických bišpecifických molekúl obsahujúcich oblasť, ktorá je schopná selektívne viazať definovanú sekvenciu DNA a oblasť, ktorá je schopná špecificky viazať transaktivátor alebo transrepresor alebo transaktivačný alebo transrepresorový komplex.A first aspect of the invention is to provide and express chimeric bispecific molecules comprising a region that is capable of selectively binding a defined DNA sequence and a region that is capable of specifically binding a transactivator or transrepressor or a transactivating or transrepressor complex.
Ďalší znak vynálezu spočíva v sekvencii nukleovej kyseliny kódujúcej vyššie definovanú chimerickú molekulu, ako je to v každom expresnom vektore, ktorý obsahuje uvedenú nukleovú sekvenciu.Another feature of the invention resides in a nucleic acid sequence encoding a chimeric molecule as defined above, as in any expression vector comprising said nucleic sequence.
Ďalší znak vynálezu spočíva v systéme podmienenej expresie génov zahrňujúcich i) vyššie definovanú chimerickú molekulu a ii) expresnú kazetu obsahujúcu regulačnú sekvenciu, minimálny promótor (ktorého aktivita závisí od prítomnosti transaktivátora) a uvedený gén.Another feature of the invention consists in a system of conditional expression of genes comprising i) a chimeric molecule as defined above and ii) an expression cassette comprising a regulatory sequence, a minimal promoter (whose activity depends on the presence of a transactivator) and said gene.
Ďalší znak vynálezu spočíva taktiež v expresnom vektore zahrňujúcomAnother feature of the invention also resides in an expression vector comprising
- nukleovú sekvenciu kódujúcu vyššie definovanú chimerickú molekulu aa nucleic acid sequence encoding a chimeric molecule as defined above, and
- uvedenú expresnú kazetu.said expression cassette.
Systém podmienenej expresie podľa vynálezu je obzvlášť vhodný na použitie v génovej alebo bunkovej terapii pre dosiahnutie veľmi selektívnej expresie zainteresovaných génov.The conditional expression system of the invention is particularly suitable for use in gene or cell therapy to achieve very selective expression of the genes of interest.
Jedna zo zložiek systému podľa vynálezu je teda tvorená chimerickými bišpecifickými molekulami obsahujúcimi oblasť, ktorá je schopná selektívne viazať definovanú sekvenciu DNA a oblasť, ktorá je schopná selektívne viazať transaktivátor alebo transaktivačný komplex. Bišpecifickosť molekúl podľa vynálezu spočíva jednak v ich schopnosti viazať definovanú sekvenciu DNA (ktorá je obvykle označovaná ako regulačná alebo operačná sekvencia), a jednak v ich schopnosti špecificky tvoriť transaktivačnú alebo transrepresívnu proteínovú oblasť, ktorá umožňuje indukovať alebo potlačiť expresiu génov.Thus, one component of the system of the invention is composed of chimeric bispecific molecules comprising a region which is capable of selectively binding a defined DNA sequence and a region that is capable of selectively binding a transactivator or transactivation complex. The bispecificity of the molecules of the invention lies in both their ability to bind a defined DNA sequence (commonly referred to as a regulatory or operative sequence) and their ability to specifically form a transactivating or transrepressive protein region that allows to induce or suppress gene expression.
Vynález spočíva vo vytvorení chimériokých bišpecifických molekúl umožňujúcich získanie každého transkripčného faktora, ktorého aktivácia alebo inaktivácia vedie k fyziopatologickej situácii. Chimerické bišpecifické molekuly podľa vynálezu takto umožňujú selektívne získanie špecifických transkripčných transaktivátorov fyziopatologického stavu, fixovanie týchto transkripčných faktorov k promótorom prostredníctvom väzby týchto molekúl k definovaným sekvenciám DNA lokalizovaných v blízkosti týchto promótorov (regulačná alebo operačná sekvencia) a takto aj dosiahnutie podmienenej expresie génov (obr. 1) .The invention resides in the generation of chimeric bispecific molecules enabling one to obtain any transcription factor whose activation or inactivation leads to a physiopathological situation. Thus, the chimeric bispecific molecules of the invention allow selectively obtaining specific transcriptional transactivators of the physiopathological state, fixing these transcription factors to promoters by binding these molecules to defined DNA sequences located near these promoters (regulatory or operative sequence) and thereby achieving conditional gene expression (Fig. 1).
Vynález sa taktiež týka chimerických bišpecifických molekúl umožňujúcich vytvorenie nielen molekuly nesúcej transkripčnú oblasť, ale aj transkripčného transaktivačného komplexu, t. j. komplexu vytvoreného medzi cieľovou molekulou prítomnou v bunke a molekulou nesúcou transaktivačnú oblasť (obr. 2). V tomto prípade je transaktivačný komplex výhodne vytvorený pomocou druhej chimerickej bišpecifickej molekuly obsahujúcej transaktivačnú oblasť a oblasť selektívnej väzby k uvedenej bunkovej molekule. Fixovanie tejto druhej molekuly umožňuje vytvorenie transkripčného transaktivačného binárneho komplexu, pričom tento komplex je takto tvorený detekčným systémom podľa vynálezu. Fixovanie tohto ternárneho komplexu v blízkosti promótorov takto umožňuje regulovanú expresiu génov. Tento typ konštrukcie umožňuje výhodne rozšíriť oblasť použitia systému podľa vynálezu na detekciu ľubovoľnej intracelulárnej molekuly zbavenej transaktivačnej oblasti, a to nech ide už o endogénnu molekulu alebo napríklad o molekulu infekčného pôvodu.The invention also relates to chimeric bispecific molecules enabling the generation not only of a molecule carrying a transcriptional region but also of a transcriptional transactivation complex, i. j. a complex formed between the target molecule present in the cell and the molecule carrying the transactivation region (Fig. 2). In this case, the transactivation complex is preferably formed using a second chimeric bispecific molecule comprising a transactivation region and a selective binding region to said cell molecule. The fixation of the second molecule allows the formation of a transcriptional transactivation binary complex, which complex is thus formed by the detection system of the invention. The fixation of this ternary complex in the vicinity of the promoters thus permits the regulated expression of the genes. This type of construction advantageously extends the field of application of the system according to the invention to detect any intracellular molecule deprived of the transactivation region, whether it be an endogenous molecule or, for example, a molecule of infectious origin.
Systém podľa vynálezu takto vďaka veľmi selektívnemu detekčnému systému (senzor) umožňuje aktivovať výlučne expresiu zainteresovaných génov v prítomnosti cieľových proteínov. Môže ísť o transkripčné faktory vyskytujúce sa v rámci fyziologických alebo fyziopatologických situácií alebo o ľubovoľnú endogénnu molekulu alebo napríklad o molekulu infekčného pôvodu.Thus, the system according to the invention makes it possible to activate exclusively the expression of the genes of interest in the presence of the target proteins due to the highly selective detection system (sensor). These may be transcription factors occurring in physiological or physiopathological situations, or any endogenous molecule or, for example, a molecule of infectious origin.
V rámci vynálezu výraz transaktivátor označuje každý transaktivačný faktor transkripcie alebo každý proteín zahrňujúci transkripčnú transaktivačnú oblasť. Výraz transaktivačný komplex označuje komplex vytvorený medzi molekulou prítomnou v bunke a bispecifickou molekulou podľa vynálezu obsahujúcou transaktivačnú oblasť a oblasť špecifickej väzby k uvedenej molekule.Within the scope of the invention, the term transactivator refers to any transactivation factor of transcription or any protein comprising a transcriptional transactivation region. The term transactivation complex refers to a complex formed between a molecule present in a cell and a bispecific molecule of the invention comprising a transactivation region and a specific binding region to said molecule.
Expresný systém podľa vynálezu môže byť použitý na získanie ľubovoľného transaktivačného proteínu alebo proteínu nesúceho transaktivačnú oblasť, a predovšetkým ľubovoľného proteínu vírusového, parazitného alebo mykobakteriálneho pôvodu, ako i bunkového pôvodu, majúceho transkripčnú transaktivačnú účinnosť.The expression system of the invention may be used to obtain any transactivating protein or protein carrying a transactivating region, and in particular any protein of viral, parasitic or mycobacterial origin, as well as of cellular origin, having transcriptional transactivating activity.
Z transkripčných faktorov vírusového pôvodu možno uviesť predovšetkým proteín Tat vírusu HIV, proteíny E6/E7 vírusu papilomu alebo tiež proteín EBNA vírusu Epsteina a Barrovej. Tieto proteíny majú transkripčnú transaktivačnú oblasť a sú prítomné výlučne v bunkách infikovaných týmito vírusmi, t. j. za špecifických fyziopatologických podmienok. Systém podmienenej expresie podľa vynálezu výhodne umožňuje detekciu takej fyziologickej situácie (výskyt uvedených špecifických transaktivátorov vírusovej infekcie) a indukciu selektívnej expresie daného génu alebo daných génov.Transcription factors of viral origin include, but are not limited to, the HIV Tat protein, the E6 / E7 papilloma virus proteins, or the Epstein-Barr virus EBNA protein. These proteins have a transcriptional transactivation region and are present exclusively in cells infected with these viruses, i. j. under specific physiopathological conditions. The conditional expression system of the invention preferably allows for the detection of such a physiological situation (occurrence of said specific transactivators of viral infection) and induction of selective expression of the gene or genes.
Z bunkových proteínov možno výhodne uviesť mutovaný alebo divoký proteín p53. Tento proteín p53 je tvorený 393 aminokyselinami. Vo svojej divokej forme je tento proteín supresorom nádorov schopným negatívne regulovať rast a delenie buniek. Táto účinnosť je spojená s prítomnosťou transkripčnej transaktivačnej oblasti v štruktúre proteínu p53, lokalizovanej v N-terminálnej oblasti proteínu (asi zvyšky 1 až 100). V niektorých situáciách je divoký proteín p53 rovnako schopný indukovať apoptózu (Yonish-Rouach a kol., Náture, 352, 345-347, 1991). Tieto vlastnosti sa prejavujú v stresových situáciách, kedy je ohrozená integrita bunkovej DNA a proteín p53 je takto pokladaný za strážcu genómu. Prítomnosť mutovaných proteínov p53 v asi 40 % ľudských nádoroch všetkých typov posilňuje túto hypotézu a podčiarkuje pravdepodobne kľúčovú úlohu, ktorú zohráva mutácia tohto génu pri rozvoji nádorov (o tom viď: Montenarh, Oncogene, 7, 1673-1680, 1992, Oren, FASEB J., 6, 3169-3176, 1992, Zambetti a Levine, FASEB J., 7, 855-865, 1993). V rámci vynálezu je možné selektívne regrutovať transaktivačnú oblasť proteínu p53 a takto indukovať regulovanú expresiu génu alebo génov výlučne v bunkách obsahujúcich tento proteín. Podľa vynálezu je obzvlášť zaujímavé špecificky regrutovať mutované formy proteínu p53, ktoré sa, ako už bolo vyššie uvedené, vyskytujú vo fyziopatologických situáciách bunkovej proliferácie (rakovinového typu). Takéto zacielenie môže byt výhodne uskutočnené pomocou oblasti špecifickej väzby k mutovaným formám proteínu p53. Avšak existuje tu špecifickosť spojená s akumuláciou mutovaných foriem, ktoré majú polčas života výrazne dlhší oproti divokej forme.Of the cellular proteins, mutated or wild-type p53 protein may be mentioned. This p53 protein consists of 393 amino acids. In its wild form, this protein is a tumor suppressor capable of negatively regulating cell growth and division. This activity is associated with the presence of a transcriptional transactivation region in the structure of the p53 protein, located in the N-terminal region of the protein (about residues 1-100). In some situations, the wild-type p53 protein is also capable of inducing apoptosis (Yonish-Rouach et al., Nature, 352, 345-347, 1991). These properties manifest themselves in stressful situations where the integrity of cellular DNA is compromised and the p53 protein is thus considered to be a genome guardian. The presence of mutated p53 proteins in about 40% of human tumors of all types reinforces this hypothesis and underlines probably the key role that mutation of this gene plays in tumor development (see: Montenarh, Oncogene, 7, 1673-1680, 1992, Oren, FASEB J 6, 3169-3176, 1992, Zambetti and Levine, FASEB J., 7, 855-865, 1993). Within the scope of the invention, it is possible to selectively recruit the transactivating region of the p53 protein and thereby induce regulated expression of the gene or genes exclusively in cells containing the protein. According to the invention, it is of particular interest to specifically recruit mutated forms of the p53 protein which, as mentioned above, occur in physiopathological situations of cell proliferation (cancer type). Such targeting can advantageously be accomplished using a specific binding region to mutated forms of the p53 protein. However, there is a specificity associated with the accumulation of mutated forms having a half-life significantly longer than that of the wild-type.
Systém podľa vynálezu môže byť taktiež použitý na indukovanie selektívnej expresie génu alebo génov detekciou každej cieľovej molekuly prítomnej v bunke. Detekovaným proteínom je výhodne proteín vyskytujúci sa v bunke pri abnormálnych situáciách (infekcia, hyperproliferácia a podobne). Môže predovšetkým ísť o vírusové proteíny, akými sú napríklad štruktúrové alebo funkčné proteíny vírusu, predovšetkým vírusu HIV, hepatitídy, herpes a podobne. Môže ísť taktiež o špecifické proteíny bunkového hyperproliferačného stavu, akými sú predovšetkým proteíny myc, fos, jun, cykliny a podobne.The system of the invention can also be used to induce selective expression of a gene or genes by detecting each target molecule present in the cell. Preferably, the protein detected is a protein occurring in the cell in abnormal situations (infection, hyperproliferation, and the like). In particular, they may be viral proteins, such as structural or functional proteins of the virus, in particular HIV, hepatitis, herpes and the like. They may also be specific proteins of the cell hyperproliferative state, such as, in particular, myc, fos, jun, cyclins and the like.
Jedna z vlastností chimerických molekúl podľa vynálezu spočíva teda v ich schopnosti viazať sa na špecifické oblasti DNA (regulačné alebo operačné oblasti). Táto väzba umožňuje priviesť transaktivačnú oblasť do blízkosti promótora a týmto spôsobom aktivovať expresiu génu vloženého pod kontrolu uvedeného promótora.Thus, one of the properties of the chimeric molecules of the invention lies in their ability to bind to specific DNA regions (regulatory or operational regions). This binding makes it possible to bring the transactivation region close to the promoter and in this way activate the expression of the gene inserted under the control of said promoter.
Oblasť schopná selektívne viazať definovanú sekvenciu DNA prítomná v molekulách podľa vynálezu je v podstate proteínového pôvodu. Výhodnejšie je táto oblasť odvodená od prokaryotického alebo eukaryotického proteínu schopného interakcie so sekvenciami DNA. Početné genetické a štrukturálne štúdie dnes už umožňujú presne definovať v proteínoch vstupujúcich do interakcie so sekvenciami dvojvláknovej DNA oblasti, ktoré sú zodpovedné za tieto interakcie.A region capable of selectively binding a defined DNA sequence present in the molecules of the invention is essentially of protein origin. More preferably, this region is derived from a prokaryotic or eukaryotic protein capable of interacting with DNA sequences. Numerous genetic and structural studies now make it possible to precisely define in the proteins interacting with the double-stranded DNA sequences that are responsible for these interactions.
Z prokaryotických proteínov vstupujúcich do interakcie so sekvenciami dvojvláknovej DNA možno uviesť predovšetkým bakteriálne represory a výhodnejšie tetracyklínový represor odvodený z E.coli a represor Cro odvodený od bakteriofága Lambda.Among the prokaryotic proteins interacting with the double-stranded DNA sequences, mention may be made in particular of bacterial repressors and more preferably the tetracycline repressor derived from E. coli and the repressor Cro derived from bacteriophage Lambda.
Uvedený tetracyklínový represor (tetR) od E.coli je proteínom s asi 210 aminokyselinami. V E.coli tento tetracyklínový supresor tetR negatívne reguluje transkripciu génov mediujúcich rezistenciu k tomuto antibiotiku v operóne tet. Za neprítomnosti tetracyklínu sa represor tetR fixuje k DNA na úrovni špecifickej sekvencie (ktorá je označovaná ako operačná sekvencia alebo Tetop) a potláča transkripciu rezistentného génu. Naopak, v prítomnosti tetracyklínu sa represor tetR už nefixuje k operátoru tetop umožňujúc tak konštitučnú transkripciu uvedeného génu (Hillen. W a Wissman A. (1989) v Protein-Nucleic Acid Interaction. Topics in Molecular and Structural Biology, ed., Saenger W. a Heinemann U. (Macmillan, Londýn), sv.10, str. 143-162). Sekvencia tetracyklínového supresora tetR už bola publikovaná (je uvedená predovšetkým v patentovom dokumente WO94/04682). Sekvencia dvojvláknovej DNA, ktorá je špecifická pre väzbu tetracyklínového supresora tetR k DNA (Tetop) je tvorená nasledujúcim motívom:Said E.coli tetracycline repressor (tetR) is a protein of about 210 amino acids. In E. coli, this tetR tetracycline suppressor negatively regulates the transcription of genes mediating resistance to this antibiotic in the tet operon. In the absence of tetracycline, the tetR repressor is fixed to DNA at the level of a specific sequence (referred to as an operative sequence or Tetop) and suppresses the transcription of a resistant gene. Conversely, in the presence of tetracycline, the tetR repressor is no longer fixed to the tetop operator, thus allowing the constitutive transcription of the gene (Hillen. W and Wissman A. (1989) in Protein-Nucleic Acid Interaction. Topics in Molecular and Structural Biology, ed., Saenger W. and Heinemann U. (Macmillan, London), vol.10, pp 143-162). The sequence of the tetR tetracycline suppressor has already been published (particularly disclosed in WO94 / 04682). A double stranded DNA sequence that is specific for the binding of the tetR tetracycline suppressor to DNA (Tetop) is formed by the following motif:
TCTCTATCACTGATAGGGA (SEQ ID n° 1).TCTCTATCACTGATAGGGA (SEQ ID NO: 1).
Tento motív sa môže opakovať niekoľkokrát s cieľom zvýšenia afinity a účinnosti systému. Regulačná sekvencia môže takto obsahovať 10 uvedených motívov, pričom výhodne obsahuje dva motívy (Tetop2) alebo sedem motívov (Tetop7) (viď obr. 3).This motif can be repeated several times to increase the affinity and efficiency of the system. The regulatory sequence may thus comprise 10 of said motifs, preferably comprising two motifs (Tetop2) or seven motifs (Tetop7) (see Fig. 3).
Proteín Cro bol definovaný pôvodne ako regulátor expresie represora CI (Eisen H. a kol. (1970)PNAS 66, str. 855). Klonovanie génu cro umožnilo identifikáciu proteínu so 66 aminokyselinami (SEQ ID n° 21, Roberts T. a kol. (1977), Náture 270, str. 274). Cro vykonáva svoju fyziologickú úlohu tým, že sa prednostne fixuje na operátor 0R3 odvodeného od bakteriofága Lambda.The Cro protein was originally defined as a regulator of CI repressor expression (Eisen H. et al. (1970) PNAS 66, page 855). Cloning of the cro gene allowed the identification of a protein of 66 amino acids (SEQ ID NO: 21, Roberts T. et al. (1977), Nature 270, p. 274). Cro performs its physiological role that is preferably fixed on the operator 0r 3 derived from bacteriophage lambda.
Sekvencia dvojvláknovej DNA špecifická pre väzbu Cro k DNA (oblasť označovaná ako 0R3) je tvorená nasledujúcimi bázami:The double stranded DNA sequence specific for Cro binding to DNA (the region designated OR 3 ) is made up of the following bases:
TATCACCGCAAGGGATA (SEQ ID n° 2).TATCACCGCAAGGGATA (SEQ ID NO: 2).
Táto oblasť môže byť opakovaná niekoľkokrát s cieľom dosiahnutia zvýšenej afinity a účinnosti systému (viď obr. 4).This region can be repeated several times to achieve increased affinity and efficiency of the system (see Fig. 4).
Z eukaryotických proteínov vstupujúcich do interakcie so sekvenciami dvojvláknovej DNA sa na konštrukciu molekúl podľa vynálezu výhodne používajú proteíny alebo oblasti odvodené od proteínov STAT, p53 alebo NFkB (Inoue a kol., PNAS 89(1992) 4333). Pokiaľ ide o proteín p53, je jeho väzbová oblasť k DNA lokalizovaná v centrálnej oblasti proteínu, presnejšie v oblasti medzi aminokyselinami 102 až 292 (Pavletich a kol., Genes and Dev. 7 (1993)2556).Of the eukaryotic proteins interacting with the double-stranded DNA sequences, proteins or regions derived from STAT, p53 or NFκB proteins are preferably used to construct the molecules of the invention (Inoue et al., PNAS 89 (1992) 4333). With respect to the p53 protein, its DNA binding region is located in the central region of the protein, more precisely in the region between amino acids 102-292 (Pavletich et al., Genes and Dev. 7 (1993) 2556).
Ako už bolo vyššie uvedené, oblasť je schopná selektívne viazať definovanú sekvenciu DNA prítomnú v molekulách podľa vynálezu výhodne odvodenú od prokaryotického alebo eukaryotického proteínu schopného vstúpiť do interakcie s oblasťou dvojvláknovej DNA. Oblasť použitá na konštrukciu molekúl podľa vynálezu môže byť tvorená celým proteínom alebo jeho častou obsahujúcou oblasť interakcie s DNA. Táto oblasť bola identifikovaná v prípade rôznych proteínov, a predovšetkým v prípade TetR (viď napríklad Berens a kol., J.Biol.Chem267 (1992) 1945). Táto oblasť môže byť rovnako tvorená derivátom tohto proteínu alebo jeho fragmentom, ktorý si zachoval schopnosť väzby k DNA. Takými derivátmi sú predovšetkým proteíny s modifikáciou jednej alebo niekoľkých aminokyselín, napríklad s cieľom umožnenia ich fúzie s ostatnými oblasťami molekúl podľa vynálezu, ktoré môžu byť pripravené klasickými technikami molekulárnej biológie. Tak napríklad takéto deriváty proteínov TetR a Cro boli už popísané v literatúre, pričom tieto deriváty majú presné lokálne mutácie alebo/a delécie (Hecht a kol., J. Bact.175(1993) , str. 1206, Atlschmied a kol., EMBO J 7 (1988) 4011, Baumister a kol., Proteins 14 (1992)168, Hansen a kol., J.Biol.Chem.262 (1987) 14030). Schopnosť týchto derivátov viazať sa k definovanej sekvencií DNA môže byť potom testovaná inkubáciou pripraveného derivátu s regulačnou sekvenciou a detekciou vytvorených komplexov. Okrem toho uvedenými derivátmi môžu byť taktiež proteíny majúce zlepšenú schopnosť väzby k DNA (špecifickosť, afinita a podobne).As mentioned above, the region is capable of selectively binding a defined DNA sequence present in the molecules of the invention preferably derived from a prokaryotic or eukaryotic protein capable of interacting with the double-stranded DNA region. The region used to construct the molecules of the invention may consist of all or part of a protein comprising a DNA interaction region. This region has been identified for various proteins, and in particular for TetR (see, for example, Berens et al., J.Biol.Chem267 (1992) 1945). This region may also consist of a derivative of the protein or a fragment thereof that retains the ability to bind to DNA. Such derivatives are, in particular, proteins with a modification of one or more amino acids, for example in order to allow their fusion with other regions of the molecules of the invention which can be prepared by conventional molecular biology techniques. For example, such TetR and Cro protein derivatives have already been described in the literature and have precise local mutations and / or deletions (Hecht et al., J. Bact.175 (1993), p. 1206, Atlschmied et al., EMBO J 7 (1988) 4011, Baumister et al., Proteins 14 (1992) 168, Hansen et al., J.Biol.Chem. 26 (1987) 14030). The ability of these derivatives to bind to a defined DNA sequence can then be tested by incubating the prepared derivative with a regulatory sequence and detecting the formed complexes. In addition, said derivatives may also be proteins having improved DNA binding ability (specificity, affinity, and the like).
Podľa výhodnej formy uskutočnenia je oblasť schopná selektívne viazať definovanú sekvenciu DNA prítomnú v molekulách podľa vynálezu odvodenú od prokaryotického proteínu. Tento typ konštrukcie je obzvlášť výhodný vzhľadom na to, že tieto proteíny neľudského pôvodu rozpoznávajú dvojvláknové DNA s aspoň 14 nukleotidmi. Pravdepodobnosť nájdenia rovnakej sekvencie v ľudskom genóme je takmer nulová a získaný expresný systém je takto ešte selektívnejší.According to a preferred embodiment, the region is capable of selectively binding a defined DNA sequence present in the molecules of the invention derived from a prokaryotic protein. This type of construction is particularly advantageous since these proteins of non-human origin recognize double-stranded DNA of at least 14 nucleotides. The probability of finding the same sequence in the human genome is almost nil and the expression system obtained is thus even more selective.
V rámci inej výhodnej formy uskutočnenia je oblasť schopná selektívne viazať definovanú sekvenciu DNA, prítomnú v molekulách, podľa vynálezu odvodenú od proteínov TetR alebo Cro. Je obzvlášť výhodné použiť proteíny TetR alebo Cro (SEQ ID n° 21) v kompletnom stave.In another preferred embodiment, the region is capable of selectively binding a defined DNA sequence present in the molecules of the invention derived from the TetR or Cro proteins. It is particularly preferred to use the TetR or Cro proteins (SEQ ID NO: 21) in the complete state.
Oblasť schopná špecificky viazať transkripčný transaktivátor alebo transkripčný transaktivačný komplex, prítomná v molekulách, podľa vynálezu môže byť oblasťou rôzneho typu. Predovšetkým môže ísť o oligomerizačnú oblasť v prípade, kedy transaktivátor alebo transaktivačný komplex, ktorý má byť zacielený, takú oblasť taktiež obsahuje. Môže ísť taktiež o každú syntetickú alebo prírodnú oblasť, o ktorej je známe, že vstupuje do interakcie s uvedeným transaktivátorom alebo transaktivačným komplexom. Môže tiež ísť o protilátku alebo o fragment, alebo derivát protilátky nasmerovaný proti uvedenému transaktivátoru, alebo transaktivačnému komplexu.A region capable of specifically binding a transcriptional transactivator or a transcriptional transactivating complex present in the molecules of the invention may be of various types. In particular, it may be an oligomerization region where the transactivator or transactivation complex to be targeted also contains such an region. It may also be any synthetic or natural region known to interact with said transactivator or transactivation complex. It may also be an antibody or a fragment or derivative of an antibody directed against said transactivator or transactivating complex.
Z oligomeračných oblastí použiteľných v rámci vynálezu možno predovšetkým menovať leucínové zipsy, napríklad oblasti SH2 alebo oblasti SH3. Leucínové zipsy sú alfa-amfipatickými helixami, ktoré obsahujú 4 alebo 5 leucínov každých 7 aminokyselín. Táto periodicita umožňuje lokalizáciu leucínov takmer v rovnakej polohe na alfa helixe. Dimerácia je podmienená hydrofóbnymi interakciami medzi bočnými reťazcami leucínov dvoch priľahlých zipsových oblastí (Vogt a kol., Trend In Bioch.Science 14 (1989). O oblastiach SH2 je známe, že vstupujú do interakcie s fosforylovanými špecifickými peptidovými oblasťami v tyrozíne. Oblasti SH3 môžu byť použité na vytvorenie oligoméru s každým transaktivátorom alebo transaktivačným komplexom, ktorý obsahuje odpovedajúci peptid bohatý na prolín (Pawson a kol., Current Biology 3) (1993) 434). Taktiež môžu byť použité oblasti proteínov, o ktorých je známe, že indukujú oligomeráciu, akými sú predovšetkým C-terminálna oblasť proteínu p53. Použitie tejto oblasti umožňuje regrutovať selektívnym spôsobom proteíny p53 prítomné v bunke. V rámci vynálezu sa výhodne používa oblasť p53 obsiahnutá medzi aminokyselinami 320-393 (SEQ ID n° 3) 302-360 alebo 302-390.Among the oligomerization regions useful in the present invention, mention may be made in particular of leucine zippers, for example SH2 or SH3 regions. Leucine zippers are alpha-amphipathic helices that contain 4 or 5 leucines every 7 amino acids. This periodicity allows the localization of leucines at almost the same position on the alpha helix. The dimerization is due to hydrophobic interactions between the leucine side chains of two adjacent zipper regions (Vogt et al., Trend In Bioch.Science 14 (1989). SH2 regions are known to interact with phosphorylated specific peptide regions in tyrosine. be used to form an oligomer with each transactivator or transactivation complex containing the corresponding proline-rich peptide (Pawson et al., Current Biology 3) (1993) 434). Protein regions known to induce oligomerization, such as, in particular, the C-terminal region of the p53 protein, may also be used. The use of this region makes it possible to selectively recruit p53 proteins present in the cell. Preferably, the p53 region comprised between amino acids 320-393 (SEQ ID NO: 3) 302-360 or 302-390 is used in the present invention.
Zo syntetických alebo prírodných oblastí, o ktorých je známe, že vstupujú do interakcie s molekulou obsahujúcou cieľový transaktivačný prvok, možno napríklad uviesť oblasť proteínu MDM2 vstupujúcou do interakcie s proteínom p53. Tento typ konštrukcie takto umožňuje regrutovať ako transaktivátor divoký alebo mutovaný proteín p53.Synthetic or natural regions known to interact with a molecule containing a target transactivating element include, for example, a region of the MDM2 protein interacting with the p53 protein. This type of construction thus makes it possible to recruit wild-type or mutated p53 protein as a transactivator.
Výhodnou oblasťou špecifickej väzby k transkripčnému transaktivátoru podľa vynálezu je protilátka alebo fragment alebo derivát protilátky. Fragmenty alebo deriváty protilátky sú napríklad fragmenty Fab alebo F(ab)'2, oblasti VH alebo VL protilátky s jednoduchým reťazcom (ScFv) obsahujúcim oblasť VH spojenú s oblasťou VL ramenom. Tento typ oblasti je obzvlášť výhodný vzhľadom na to, že môže byť nasmerovaný proti celej molekule.A preferred region of specific binding to a transcriptional transactivator of the invention is an antibody or antibody fragment or derivative. For example, antibody fragments or derivatives are Fab or F (ab) '2 fragments, a VH or VL region of a single chain antibody (ScFv) comprising a VH region linked to a VL arm region. This type of region is particularly advantageous in that it can be directed against the entire molecule.
Protilátky tvorené molekulami skupiny imunoglobulínov sú tvorené rôznymi reťazcami (2 ťažké (H) a 2 ľahké (L)), pričom tieto reťazce sú tvorené rôznymi oblasťami (variabilná oblasť (V), pripojovacia oblasť (J) a podobne). Oblasť väzby k transaktivátoru alebo k transaktivačnému komplexu prítomná v molekulách podľa vynálezu je výhodne tvorená fragmentom alebo derivátom protilátky obsahujúcim aspoň väzbové miesto zodpovedné za väzbu k antigénu. Tento fragment môže byť buď variabilnou oblasťou ľahkého reťazca (V ) alebo ťažkého reťazca (V ) , prípadne vo forme fragmentu fab alebo F(ab')2 alebo výhodne vo forme protilátky s jednoduchým reťazcom (jednoreťazcová protilátka) (ScFv). Jednoreťazcové protilátky použité na konštrukciu molekúl podľa vynálezu sú tvorené peptidom zodpovedajúcim väzbovému miestu variabilnej oblasti ľahkého reťazca protilátky a pripojeným peptidovým ramenom k peptidu zodpovedajúcemu väzbovému miestu variabilnej oblasti ťažkého reťazca protilátky. Konštrukcia sekvencii nukleových kyselín kódujúcich také modifikované protilátky podľa vynálezu bola napríklad popísaná v patentovom dokumente US 4,946,778 alebo v patentových prihláškach W094/02610 a WO94/29446. Táto konštrukcia je ilustrovaná v ďalej zaradených príkladoch.Antibodies formed by molecules of the immunoglobulin family are made up of different chains (2 heavy (H) and 2 light (L)), these chains being made up of different regions (variable region (V), linker region (J) and the like). The region of binding to a transactivator or transactivating complex present in the molecules of the invention is preferably comprised of an antibody fragment or derivative comprising at least the binding site responsible for antigen binding. This fragment may be either a light chain (V) or heavy chain (V) variable region, optionally in the form of a fab or F (ab ') 2 fragment, or preferably in the form of a single chain antibody (single chain antibody) (ScFv). The single chain antibodies used to construct the molecules of the invention are composed of a peptide corresponding to the antibody light chain variable region binding site and an attached peptide arm to the peptide corresponding to the antibody heavy chain variable region binding site. The construction of nucleic acid sequences encoding such modified antibodies of the invention has been described, for example, in US Patent 4,946,778 or in WO94 / 02610 and WO94 / 29446. This construction is illustrated in the examples below.
Výhodná konštrukcia podľa vynálezu zahrňuje oblasť väzby k proteínu p53. Výhodne ide o derivát protilátky nasmerovaný proti proteínu p53. Výhodnou formou tejto oblasti je jednoreťazcová protilátka nasmerovaná proti p53. Ako ilustračný príklad je možné uviesť použitie ScFv so sekvenciou SEQ ID n° 4, ktorého konštrukcia je.popísaná v príkladoch uskutočnenia.A preferred construct of the invention comprises a p53 binding region. Preferably, it is an antibody derivative directed against the p53 protein. A preferred form of this region is a single chain antibody directed against p53. By way of illustration, the use of a ScFv having the sequence of SEQ ID NO: 4, the construction of which is described in the Examples.
Oblasť väzby k DNA a oblasť väzby k transaktivátoru sú vzájomne spojené prostredníctvom ramena. Toto rameno je všeobecne tvorené peptidom zaisťujúcim celému komplexu dostatočnú flexibilitu, nevyhnutnú k tomu, aby obe uvedené oblasti molekúl podľa vynálezu mohli byt funkčné autonómnym spôsobom. Tento peptid je všeobecne tvorený nezaťaženými aminokyselinami, ktoré neinterferujú s aktivitou molekúl podľa vynálezu a ktorými sú napríklad glycín, serín, tryptofán, lyzín alebo prolín. Toto rameno obsahuje všeobecne 5 až 30 aminokyselín, výhodne 5 až 20 aminokyselín. Príklady peptidových ramien použiteľných na konštrukciu molekúl podľa vynálezu sú napríklad:The DNA binding region and the transactivator binding region are connected to each other via an arm. This arm is generally made up of a peptide providing the entire complex with the flexibility necessary for both regions of the molecules of the invention to be functional in an autonomous manner. The peptide is generally composed of unloaded amino acids that do not interfere with the activity of the molecules of the invention and are, for example, glycine, serine, tryptophan, lysine or proline. This arm generally comprises 5 to 30 amino acids, preferably 5 to 20 amino acids. Examples of peptide arms useful for the construction of the molecules of the invention are, for example:
-GGGGSGGGGSGGGGS (SEQ ID n° 5),-GGGGSGGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 5),
-PKPSTPPGSS (SEQ ID n° 6), ktorého kódujúca sekvencia je CCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCA (SEQ ID n° 6) ,-PKPSTPPGSS (SEQ ID n ° 6), whose coding sequence is CCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCA (SEQ ID n ° 6),
Výhodnými príkladmi molekúl podľa vynálezu sú predovšetkým nasledujúce molekuly:In particular, the following molecules are preferred examples of the molecules of the invention:
a) ScFv-tag-Hinge-TET alebo Cro (obr. 5A) .a) ScFv-tag-Hinge-TET or Cro (Fig. 5A).
Tento typ molekuly zahrňuje:This type of molecule includes:
- oblast väzby k transaktivátoru tvorenú jednoreťazcovou protilátkou,- a single chain antibody binding region of the transactivator,
- peptidovú sekvenciu tag rozpoznávanú monoklonálnou protilátkou umožňujúcou imunologickú detekciu molekuly. Touto sekvenciou môže byť napríklad epitóp VSV sekvencie MNRLGK (SEQ ID n°- a peptide tag sequence recognized by a monoclonal antibody allowing immunological detection of the molecule. This sequence may be, for example, an epitope of the VSV sequence of MNRLGK (SEQ ID n °
7) , ktorej kódujúcou sekvenciou je ATGAACCGGCTGGGCAAG (SEQ ID n° 7), alebo epitóp myc so sekvenciou EQKLISEEDLN (SEQ ID n°7), whose coding sequence is ATGAACCGGCTGGGCAAG (SEQ ID n ° 7), or myc epitope with sequence EQKLISEEDLN (SEQ ID n °
8) , ktorého kódujúcou sekvenciou je8), the coding sequence of which is
GAACAAAAACTCATCTCAGAAGAGGATCTGAAT (SEQ ID n° 8) a ktorý je rozpoznateľný protilátkou 9E10.GAACAAAAACTCATCTCAGAAGAGGATCTGAAT (SEQ ID NO: 8) and which is recognizable by 9E10.
- peptidové rameno so sekvenciou SEQ ID n° 6 (Hinge) aa peptide arm having the sequence of SEQ ID No. 6 (Hinge), and
- oblasť väzby k DNA tvorenú proteínom TET alebo Cro.a DNA binding region formed by the TET or Cro protein.
ScFv je výhodne nasmerovaný proti proteínu p53.The ScFv is preferably directed against the p53 protein.
b) ŠcFv-Hinge-TET1 alebo Cro (obr. 5B)b) ŠcFv-Hinge-TET 1 or Cro (Fig. 5B)
Tento typ molekuly obsahuje rovnaké prvky ako molekula a) s výnimkou spočívajúcou v tom, že je tu neprítomná sekvencia tag.This type of molecule contains the same elements as molecule a) except that the tag sequence is absent.
c) ScFv-TET alebo Cro (obr. 5V).c) ScFv-TET or Cro (Fig. 5V).
Tento zjednodušený typ molekuly obsahuje len oblasť väzby k transaktivátoru tvorenú jednoreťazcovou protilátkou a oblasť väzby k DNA tvorenú proteínom TET alebo Cro. Táto molekula neobsahuje ani rameno ani sekvenciu tag. V tejto konštrukcii je oblasť väzby k transaktivátoru lokalizovaná v N-terminálnej časti molekuly a oblasť väzby k DNA sa nachádza v C-terminálnej časti molekuly.This simplified type of molecule contains only a single chain antibody transactivator binding region and a DNA binding region consisting of a TET or Cro protein. This molecule contains neither arm nor tag sequence. In this construction, the transactivator-binding region is located in the N-terminal part of the molecule and the DNA-binding region is located in the C-terminal part of the molecule.
d) TET alebo Cro-ScFv (obr. 5D)d) TET or Cro-ScFv (Fig. 5D)
Tento typ molekuly je podobný vyššie uvedenému typu c). Jediný rozdiel spočíva v podstate v usporiadaní oblastí: oblasť väzby k transaktivátoru je teraz lokalizovaná v C-terminálnej časti molekuly a oblasť väzby k DNA sa nachádza v N-terminálnej oblasti molekuly.This type of molecule is similar to the above type c). The only difference lies essentially in the arrangement of the regions: the transactivator-binding region is now located in the C-terminal part of the molecule and the DNA-binding region is located in the N-terminal region of the molecule.
e) TET alebo Cro-Hinge-ScFv (obr. 5E)e) TET or Cro-Hinge-ScFv (Fig. 5E)
Tento typ molekuly obsahuje rovnaké prvky ako vyššie uvedený typ b) molekuly. Rozdiel spočíva v podstate v usporiadaní oblastí: oblasť väzby k transaktivátoru je teraz lokalizovaná v C-terminálnej časti molekuly, zatiaľ čo oblasť väzby k DNA sa v tomto prípade nachádza v N-terminálnej časti molekuly.This type of molecule contains the same elements as the above type b) molecule. The difference lies essentially in the arrangement of the regions: the transactivator-binding region is now located in the C-terminal part of the molecule, while the DNA-binding region in this case is located in the N-terminal part of the molecule.
f) 01igom-tag-Hinge-TET alebo Cro (obr. 5A)f) 01igom-tag-Hinge-TET or Cro (Figure 5A)
Tento typ molekuly je podobný vyššie uvedenému typu a) s výnimkou spočívajúcou v tom, že oblasť väzby k transaktivátoru je nahradená oblasťou oligomerácie s proteínom p53 so sekvenciou SEQ ID n° 3. Táto molekula umožňuje regrutovať mutované proteíny p53 vyskytujúce sa v nádorových bunkách.This type of molecule is similar to the above type a) except that the transactivator-binding region is replaced by the p53 oligomerization region of SEQ ID NO: 3. This molecule makes it possible to recruit mutated p53 proteins occurring in tumor cells.
g) Oligom-Hinge-TET alebo Cro (obr. 5B)g) Oligo-Hinge-TET or Cro (Fig. 5B)
Tento typ molekuly je podobný vyššie uvedenému typu b) s výnimkou spočívajúcou v tom, že oblasť väzby k transaktivátoru je v tomto prípade nahradená oblasťou oligomerácie s proteínom p53 so sekvenciou SEQ ID n° 3.This type of molecule is similar to the aforementioned type b) except that the transactivator-binding region in this case is replaced by an oligomerization region with the p53 protein of SEQ ID n ° 3.
h)01igom-TET alebo Cro (obr. 5C)h) 01igom-TET or Cro (Figure 5C)
Tento typ molekuly je podobný vyššie uvedenému typu c) s výnimkou spočívajúcou v tom, že oblasť väzby k transaktivátoru je v tomto prípade nahradená oblasťou oligomerácie s proteínom p53 so sekvenciou SEQ ID n° 3.This type of molecule is similar to the above type c) except that the transactivator-binding region in this case is replaced by an oligomerization region with the p53 protein of SEQ ID NO: 3.
i) TET alebo Cro-Oligom (obr. 5D)i) TET or Cro-Olig (Fig. 5D)
Tento typ molekuly je podobný vyššie uvedenému typu d) s výnimkou spočívajúcou v tom, že oblasť väzby k transaktivátoru je tu nahradená oblasťou oligomerácie s proteínom p53 so sekvenciou SEQ ID n° 3.This type of molecule is similar to the aforementioned type d) except that the transactivator-binding region is replaced here by the oligomerization region of the p53 protein of SEQ ID NO: 3.
j) TET alebo Cro-Hinge-Oligom (obr. 5E)j) TET or Cro-Hinge-Oligo (Fig. 5E)
Tento typ molekuly je podobný vyššie uvedenému typu e) s výnimkou spočívajúcou v tom, že oblasť väzby k transaktivátoru je tu nahradená oblasťou oligomeráciou s proteínom p53 so sekvenciou SEQ ID n° 3.This type of molecule is similar to the aforementioned type e) except that the transactivator-binding region is replaced here by oligomerization with the p53 protein of SEQ ID NO: 3.
Inak môže byť v každej z týchto molekúl peptidové rameno ľahko nahradené sekvenciou (G4S)3 (SEQ ID n° 5).Alternatively, in each of these molecules, the peptide arm can be readily replaced by (G4S) 3 (SEQ ID NO 5).
Ďalším predmetom vynálezu je sekvencia nukleovej kyseliny kódujúca vyššie definovanú chimerickú molekulu. Výhodne ide o sekvenciu DNA, predovšetkým cDNA. Môže taktiež ísť o RNA. Tieto sekvencie podľa vynálezu sa všeobecne konštruujú zostavením sekvencií v klonovacom vektore kódujúcich rôzne oblasti technikami molekulárnej biológie. Uvedené sekvencie nukleových kyselín podľa vynálezu môžu byť prípadne modifikované chemickou, enzymatickou alebo genetickou cestou za účelom generovania stabilizovaných oblastí alebo/a multifunkčných oblastí alebo/a oblastí s redukovanou dĺžkou alebo/a s cieľom priaznivého ovplyvnenia ich lokalizácie v tom či onom intracelulárnom úseku. Sekvencie nukleových kyselín podľa vynálezu môžu takto obsahovať sekvencie kódujúce peptidy jadrovej lokalizácie (NLS). Predovšetkým je možné uskutočniť fúziu sekvencií podľa vynálezu so sekvenciou kódujúcou NLS vírusu SV40, ktorý má nasledujúcu peptidovú sekvenciu:Another object of the invention is a nucleic acid sequence encoding a chimeric molecule as defined above. It is preferably a DNA sequence, in particular a cDNA. It may also be RNA. These sequences of the invention are generally constructed by assembling sequences in a cloning vector encoding different regions by molecular biology techniques. Said nucleic acid sequences according to the invention may optionally be modified by chemical, enzymatic or genetic means to generate stabilized regions and / or multifunctional regions and / or regions of reduced length and / or in order to favorably influence their localization in one or another intracellular region. The nucleic acid sequences of the invention may thus comprise sequences encoding nuclear localization peptides (NLS). In particular, it is possible to fuse the sequences of the invention with the sequence encoding the NLS of SV40 virus having the following peptide sequence:
PKKKRKV (SEQ ID n° 9) (Kalderon a kol., Celí 39(1984)499).PKKKRKV (SEQ ID NO: 9) (Kalderon et al., Cell 39 (1984) 499).
Nukleové sekvencie podľa vynálezu tvoria výhodne časť expresného vektora, ktorý môže mať plazmidový alebo vírusový charakter.The nucleic sequences of the invention preferably form part of an expression vector, which may be plasmid or viral in nature.
Ďalším predmetom vynálezu je fúzny proteín obsahujúci transkripčnú transaktivátorovú oblasť a oblasť špecifickej väzby k danej molekule, ktorej oblasti sú prípadne spojené s peptidovým ramenom, ako i ľubovoľnou sekvenciou nukleovej kyseliny kódujúcou takúto fúziu. Transaktivačná oblasť môže pochádzať z ľubovoľného transkripčného transaktivačného proteínu, akým je napríklad p53, VP16, EBNA, E6/E7, Tat a podobne.A further object of the invention is a fusion protein comprising a transcriptional transactivator region and a specific binding region to a given molecule, the regions of which are optionally linked to a peptide arm, as well as any nucleic acid sequence encoding such a fusion. The transactivating region may be derived from any transcriptional transactivating protein, such as p53, VP16, EBNA, E6 / E7, Tat and the like.
Ďalším predmetom vynálezu je systém podmienenej expresie génov zahrňujúci:Another object of the invention is a conditional gene expression system comprising:
- vyššie definovanú chimerickú molekulu aa chimeric molecule as defined above, and
- expresnú kazetu obsahujúcu regulačnú sekvenciu, minimálny transkripčný promótor a uvedený gén.an expression cassette comprising a regulatory sequence, a minimum transcriptional promoter, and said gene.
Uvedená expresná kazeta obsahuje prvky nevyhnutné pre aktiváciu expresie génu transaktivátorom alebo transaktivačným komplexom regrutovaným bišpecifickou molekulou. Regulačná sekvencia je takto väzbovou sekvenciou zodpovednou za väzbu k DNA exprimovanej chimerickej molekuly. V prípade, že oblasť väzby k DNA chimerickej molekuly je reprezentovaná celkom alebo časťou tetracyklínového supresora TetR, potom regulačná sekvencia obsahuje sekvenciu SEQ ID n° 1 alebo jej derivát, opakovanú prípadne niekoľkokrát. Výhodne ide o sekvenciu op2 (obsahujúca 7 motívov Tetop, ktoré sa opakujú tak, ako je to popísané napríklad Weinmannom a kol., v The Plánt Journal 5(1994)559). Rovnako tak, keď je oblasť väzby k DNA chimerickej molekuly reprezentovaná celkom alebo časťou Cro, obsahuje regulačná sekvencia sekvenciu SEQ ID n° 2 alebo jej derivát, ktoré sú prípadne niekoľkokrát opakované. Výhodne ide o sekvenciu 0R3. Deriváty sekvencií SEQ ID n° 1 a n° 2 môžu byť tvorené každou sekvenciou získanou modifikáciou genetického charakteru (mutácia, delécia, adícia, repetícia a podobne), ktorá zachováva schopnosť derivátu špecificky viazať proteín. Takéto deriváty boli popísané v literatúre (Baumeister a kol. (už vyššie citovaný), Tovar a kol., Mol.Gen.Genet.215(1988)76, WO94/04672).Said expression cassette contains elements necessary for activating gene expression by a transactivator or transactivation complex recruited by a bispecific molecule. The regulatory sequence is thus the binding sequence responsible for binding to the DNA of the expressed chimeric molecule. Where the DNA binding region of the chimeric molecule is represented in whole or in part by the tetetrotycline suppressor TetR, then the regulatory sequence comprises the sequence of SEQ ID NO: 1 or a derivative thereof, optionally repeated several times. Preferably, it is an op2 sequence (comprising 7 Tetop motifs that are repeated as described, for example, by Weinmann et al., In The Plant Journal 5 (1994) 559). Likewise, when the DNA binding region of the chimeric molecule is represented in whole or in part by Cro, the regulatory sequence comprises the sequence of SEQ ID NO: 2 or a derivative thereof, which is optionally repeated several times. Preferably it is an OR3 sequence. Derivatives of SEQ ID N ° 1 and N ° 2 may be made up of any sequence obtained by modification of a genetic nature (mutation, deletion, addition, repeat, and the like) that retains the ability of a derivative to specifically bind a protein. Such derivatives have been described in the literature (Baumeister et al. (Cited above), Tovar et al., Mol.Gen.Genet.215 (1988) 76, WO94 / 04672).
Pokiaľ ide o minimálny transkripčný promótor, ide o promótor, ktorého aktivita závisí od prítomnosti transaktivátora. Vzhľadom na to je promótor v neprítomnosti chimerickej molekuly neaktívny a nedochádza k expresii génu alebo dochádza len k veľmi obmedzenej expresii tohto génu. Naopak, v prítomnosti chimerickej molekuly umožňuje regrutovaný transaktivátor alebo transaktivačný komplex indukovať aktivitu minimálneho promótora a taktiež i expresiu zainteresovaného génu.As regards the minimal transcriptional promoter, it is a promoter whose activity depends on the presence of the transactivator. Accordingly, the promoter is inactive in the absence of the chimeric molecule and there is no or only very limited expression of the gene. Conversely, in the presence of a chimeric molecule, a recombinant transactivator or transactivation complex allows inducing minimal promoter activity as well as expression of the gene of interest.
Uvedený minimálny promótor je všeobecne tvorený boxom TATA alebo INR. Tieto prvky sú v skutočnosti minimálne potrebnými prvkami na expresiu génu v prítomnosti transaktivátora. Tento minimálny promótor môže byť pripravený z každého promótora genetickou modifikáciou. Ako príklad výhodného promótorového kandidáta možno uviesť promótor génu tymidín-kinázy. Zaujímavé výsledky boli dosiahnuté s minimálnym promótorom odvodeným od promótora TK tvoreného nukleotidmi -37 až +19. Uvedený minimálny promótor môže byť taktiež odvodený od ľudského CMV. Predovšetkým môže byť tvorený fragmentárni obsiahnutými medzi nukleotidmi -53 až +75 alebo -31 až +75 vírusu CMV. Avšak môže byť použitý každý konvenčný promótor, akým je napríklad promótor génov kódujúcich enzýmy chloramfenikolacetyl-transferázu, betagalaktozidázu alebo tiež luciferázu.Said minimum promoter is generally comprised of a TATA or INR box. These elements are, in fact, the minimum necessary elements for gene expression in the presence of a transactivator. This minimal promoter can be prepared from each promoter by genetic modification. An example of a preferred promoter candidate is the thymidine kinase gene promoter. Interesting results were obtained with a minimal promoter derived from the TK promoter consisting of nucleotides -37 to +19. Said minimal promoter may also be derived from human CMV. In particular, it may be comprised of fragmentary between nucleotides -53 to +75 or -31 to +75 of CMV. However, any conventional promoter, such as the promoter of genes encoding chloramphenicol acetyl transferase, betagalactosidase, or even luciferase, can be used.
Expresná kazeta je výhodne tvorená nasledujúcimi prvkami:The expression cassette is preferably comprised of the following elements:
- regulačná sekvencia: sekvencia zahrňujúca sekvenciu SEQ ID n° 1 alebo n° 2 alebo jej derivát, ktoré sú prípadne niekoľkokrát opakované,- regulatory sequence: a sequence comprising the sequence of SEQ ID n ° 1 or n ° 2 or a derivative thereof, optionally repeated several times,
- minimálny promótor: promótor odvodený od promótora génu tymidín-kinázy (TK),- minimal promoter: a promoter derived from the thymidine kinase (TK) gene promoter,
- zainteresovaná kódujúca sekvencia.- the coding sequence of interest.
Ešte výhodnejšie je minimálny promótor tvorený oblasťou -37 až +19 promótora génu tymidín-kinázy.Even more preferably, the minimal promoter is comprised of the -37 to +19 regions of the thymidine kinase gene promoter.
Výhodne je expresná kazeta zvolená z množiny zahrňujúcej štruktúrne kazety Tetop2.TK-Gen, Tetop7.TK-Gen a 0R3.TK-Gen.Preferably, the expression cassette is selected from the group consisting of the structural cassettes Tetop2.TK-Gen, Tetop7.TK-Gen and OR3.TK-Gen.
Ďalším znakom vynálezu je expresný vektor obsahujúci sekvenciu nukleových kyselín kódujúcu chimerickú molekulu a vyššie definovanú vynálezu môžu byť chimerickú molekulu expresnú kazetu. Do vektorov podľa sekvencie nukleových kyselín kódujúce a expresná kazeta vložené v rovnakej orientácii alebo v opačných orientáciách. Inak uvedený vektor môže mať plazmidovú alebo vírusovú povahu.Another feature of the invention is an expression vector comprising a nucleic acid sequence encoding a chimeric molecule, and the above-defined invention may be a chimeric molecule expression cassette. In vectors according to the nucleic acid sequence encoding and expression cassette inserted in the same orientation or in opposite orientations. Alternatively, said vector may be plasmid or viral in nature.
Z vírusových vektorov možno uviesť výhodnejšie adenovírusy, retrovírusy, herpesvírusy alebo tiež adeno-pridružené vírusy. Vírusy podľa vynálezu sú detektívnymi vírusmi, t. zn. vírusy, ktoré nie sú schopné replikovať sa autonómnym spôsobom v cieľovej bunke. Všeobecne je teda genóm defektných vírusov použitých v rámci vynálezu zbavený aspoň sekvencii nevyhnutných na replikáciu uvedeného vírusu v infikovanej bunke. Tieto oblasti môžu byť buď eliminované (celkom alebo čiastočne), alebo urobené nefunkčnými, alebo nahradené inými sekvenciami, predovšetkým sekvenciami podľa vynálezu. Avšak výhodne si defektný vírus zachováva tie sekvencie svojho genómu, ktoré sú nevyhnutné na inkapsidáciu vírusových častíc.Among the viral vectors, adenoviruses, retroviruses, herpesviruses or adeno-associated viruses may be mentioned. The viruses according to the invention are detective viruses, i. no. viruses that are unable to replicate autonomously in the target cell. In general, therefore, the genome of the defective viruses used in the invention is devoid of at least the sequences necessary for the replication of said virus in the infected cell. These regions may either be eliminated (in whole or in part) or rendered inoperative or replaced by other sequences, in particular those of the invention. Preferably, however, the defective virus retains those genome sequences that are necessary for encapsulating the viral particles.
Pokiaľ ide o adenovírusy, boli už charakterizované rôzne sérotypy, ktorých štruktúra a vlastnosti sa čiastočne líšia. Z týchto sérotypov je výhodné použiť v rámci vynálezu ľudské adenovírusy typu 2 alebo 5 (Ad 2 alebo Ad 5) alebo adenovírusy zvieracieho pôvodu (viď prihláška WO94/26914). Z adenovírusov zvieracieho pôvodu použiteľných v rámci vynálezu možno uviesť adenovírusy psieho, bovínneho, murínneho (príklad: Mavl, Beard a kol., Virology 75(1990)81), ovčieho, prasačieho, vtáčieho alebo tiež opičieho (príklad: SAV) pôvodu. Výhodne je adenovírusom zvieracieho pôvodu psí adenovírus, predovšetkým adenovírus CAV2 (kmeň Manhattan alebo A26/61 (ATCC VR-800), napríklad). Výhodne sa v rámci vynálezu použijú adenovírusy ľudského alebo psieho pôvodu alebo zmiešaného pôvodu.With regard to adenoviruses, different serotypes have been characterized, whose structure and properties vary somewhat. Of these serotypes, it is preferred to use human adenoviruses of type 2 or 5 (Ad 2 or Ad 5) or adenoviruses of animal origin (see WO94 / 26914). Adenoviruses of animal origin useful in the present invention include canine, bovine, murine adenoviruses (example: Mavl, Beard et al., Virology 75 (1990) 81), sheep, porcine, avian or also monkey (example: SAV) origin. Preferably, the animal-derived adenovirus is a canine adenovirus, in particular a CAV2 adenovirus (Manhattan strain or A26 / 61 (ATCC VR-800), for example). Preferably, adenoviruses of human or canine or mixed origin are used in the present invention.
Výhodne genóm rekombinantných adenovirusov podľa vynálezu obsahuje aspoň sekvencie ITR a inkapsidačnú oblasť adenovirusu a sekvenciu nukleových kyselín kódujúcu chimerickú molekulu, ako i vyššie definovanú expresnú kazetu. Výhodne v genóme adenovirusov je podľa vynálezu nefunkčná aspoň oblasť El. Uvažovaný vírusový gén môže byť urobený nefunkčným ľubovoľnou o sebe známou technikou, predovšetkým celkovou supresiou, substitúciou (napríklad sekvenciami podľa vynálezu), čiastočnou deléciou alebo adíciou jednej alebo niekoľkých báz v uvažovanom géne alebo v uvažovaných génoch. Takéto modifikácie môžu byť dosiahnuté in vitro (na izolovanej DNA) alebo in situ, napríklad za použitia techník génového inžinierstva alebo tiež pôsobením mutagénnych činidiel. Rovnako ostatné oblasti môžu byť modifikované, predovšetkým Oblasť E3 (WO95/02697), oblasť E2 (WO94/28938), oblasť E4 (WO94/28152, WO94/12649, WO95/02697) a oblasť L5 (W095/02697).Preferably, the genome of the recombinant adenoviruses of the invention comprises at least the ITR sequences and the adenovirus encapsidation region and the nucleic acid sequence encoding the chimeric molecule as well as the expression cassette as defined above. Preferably, at least the E1 region is non-functional in the genome of adenoviruses according to the invention. The viral gene contemplated may be rendered inoperative by any technique known per se, in particular by total suppression, substitution (e.g., sequences of the invention), partial deletion or addition of one or more bases in the gene or genes under consideration. Such modifications may be achieved in vitro (on isolated DNA) or in situ, for example using genetic engineering techniques or also by treatment with mutagenic agents. Likewise, other regions may be modified, in particular Area E3 (WO95 / 02697), Area E2 (WO94 / 28938), Area E4 (WO94 / 28152, WO94 / 12649, WO95 / 02697), and Area L5 (WO95 / 02697).
V rámci výhodnej formy uskutočnenia adenovírus obsahuje podľa vynálezu deléciu v oblastiach El a E4. V rámci inej výhodnej formy uskutočnenia tento adenovírus obsahuje deléciu v oblasti El, v ktorej úrovni sú vložené oblasť E4 a sekvencie podľa vynálezu (viď FR 9413355).In a preferred embodiment, the adenovirus according to the invention comprises a deletion in the E1 and E4 regions. In another preferred embodiment, the adenovirus comprises a deletion in the E1 region at which the E4 region and the sequences of the invention are inserted (see FR 9413355).
Defektné rekombinantné adenovírusy podľa vynálezu môžu byť pripravené ľubovoľnou o sebe známou technikou (Lavrero a kol., Gene 101(1991)195, EP185573, Graham, EMBO J.The defective recombinant adenoviruses of the invention may be prepared by any technique known in the art (Lavrero et al., Gene 101 (1991) 195, EP185573, Graham, EMBO J.
3(1984)2917. Tieto adenovírusy môžu byť predovšetkým pripravené homologickou rekombináciou medzi adenovírusom a plazmidom nesúcim okrem iného sekvencie DNA podľa vynálezu (sekvencie kódujúce chimerickú molekulu + expresnú kazetu). Uvedená homologická rekombinácia sa uskutočňuje po ko-transfekcii uvedených adenovirusov a plazmidu do príslušného bunkového kmeňa. Použiteľný bunkový kmeň musí (výhodne 1) byť transformovateľný uvedenými prvkami a 2) musí obsahovať sekvencie schopné komplementovat časť genómu defektného adenovirusu, výhodne v integrovanej forme s cieľom zamedzenia rekombinantných rizík. Ako príklad takého bunkového kmeňa možno uviesť ľudský embryo19 nálny renálny kmeň 293 (Graham a kol., J.Gen.Virol.36 (1977)59), ktorý obsahuje predovšetkým v integrovanej forme vo svojom genóme ľavú časť genómu adenovírusu Äd5 (12 %) alebo kmene schopné komplementovať funkcie El a E4, ktoré boli opísané predovšetkým v prihláškach W094/26914 a WO95/02697.3 (1984) 2917th In particular, these adenoviruses can be prepared by homologous recombination between an adenovirus and a plasmid carrying, inter alia, the DNA sequences of the invention (sequences encoding the chimeric molecule + expression cassette). Said homologous recombination is performed after co-transfection of said adenoviruses and plasmid into the respective cell strain. The usable cell strain must (preferably 1) be transformable with said elements and 2) it must contain sequences capable of complementing a portion of the genome of the defective adenovirus, preferably in integrated form, in order to avoid recombinant risks. An example of such a cell strain is the human embryonic renal strain 293 (Graham et al., J. Gen. Virol. 36 (1977) 59), which contains, in its integrated form, the left-hand part of the genome of the adenovirus 5d5 (12%). or strains capable of complementing E1 and E4 functions, which have been described in particular in WO94 / 26914 and WO95 / 02697.
Následne sa multiplikované a izolované adenovírusy purifikujú klasickými technikami molekulárnej biológie, ktoré sú ilustrované v ďalej zaradených príkladoch uskutočnenia.Subsequently, the multiplied and isolated adenoviruses are purified by conventional molecular biology techniques as illustrated in the Examples below.
Pokiaľ ide o adeno-pridružené vírusy (AkV), ide o vírusy s DNA majúcou relatívne redukovanú veľkosť a integrujúce sa do genómu buniek, ktoré infikujú stabilným a miestne špecifickým spôsobom. Tieto vírusy sú schopné infikovať široké spektrum buniek, bez toho, aby indukovali akýkoľvek účinok ovplyvňujúci rast, morfológiu alebo delenie buniek. Inak sa nezdá, že by tieto vírusy boli implikované do ľudských patológií. Genóm adeno-pridružených vírusov už bol klonovaný, sekvenovaný a charakterizovaný. Zahŕňa asi 4700 báz a obsahuje na každom konci oblasť obrátenej repetície (ITR) s asi 145 bázami, slúžiacu ako začiatok replikácie vírusu. Zbytok genómu je rozdelený do dvoch hlavných oblastí nesúcich inkapsidačné funkcie: ľavá časť genómu, ktorá obsahuje gén rep implikovaný pri vírusovej replikácii a expresiu vírusových génov, a pravá časť genómu, ktorá obsahuje gén cap kódujúci proteíny kapsidu vírusu.As regards adeno-associated viruses (AkV), they are viruses with DNA having a relatively reduced size and integrating into the genome of cells that infect in a stable and site-specific manner. These viruses are capable of infecting a broad spectrum of cells without inducing any effect on cell growth, morphology or division. Otherwise, these viruses do not appear to be implicated in human pathologies. The genome of adeno-associated viruses has already been cloned, sequenced and characterized. It comprises about 4700 bases and contains, at each end, an inverted repeat region (ITR) of about 145 bases, serving as the origin of virus replication. The remainder of the genome is divided into two major regions carrying the encapsidation functions: the left part of the genome that contains the rep gene implicated in viral replication and viral gene expression, and the right part of the genome that contains the cap gene encoding the capsid proteins of the virus.
Použitie vektorov adeno-pridružených vírusov (AAV) pre prenos génov in vitro a in vivo už bol opísaný v literatúre (viď predovšetkým W091/18088, WO93/09239, US 4,797,368, USThe use of adeno-associated virus (AAV) vectors for gene transfer in vitro and in vivo has already been described in the literature (see especially WO91 / 18088, WO93 / 09239, US 4,797,368, US
5,139,941, EP 488 528). V týchto prihláškach sú opísané rôzne konštrukcie odvodené od adeno-pridružených vírusov AAV, v ktorých sú gény rep alebo/a cap eliminované deléciami a nahradené zainteresovaným génom, ako i ich použitie na prenos in vitro (na bunkách v bunkovom kmeni) alebo in vivo (priamo do organizmu) zainteresovaného génu. Defektné rekombinantné adeno-pridružené adenovírusy ko-transfekciou do bunkového vírusom ľudského pôvodu (napríklad adenovírusom) plazmidom obsahujúcim nukleové sekvencie podľa vynálezu (sekvencie5,139,941, EP 488,528). These applications describe various constructs derived from adeno-associated AAVs in which the rep and / or cap genes are eliminated by deletions and replaced with the gene of interest, as well as their use for transfer in vitro (on cells in a cell strain) or in vivo ( directly into the organism) of the gene of interest. Defective recombinant adeno-associated adenoviruses by co-transfection into a cellular virus of human origin (e.g., adenovirus) with a plasmid containing the nucleic sequences of the invention (sequences
AAV môžu byť pripravené kmeňa infikovaného pomocným kódujúce chimerickú molekulu + expresnú kazetu) ohraničené dvoma oblasťami obrátenej repetície (ITR) odvodenými od adeno-pridružených vírusov a plazmidu nesúceho inkapsidačné gény (gény rep a cap) odvodené z adeno-pridružených vírusov AAV. Produkované rekombinantné AAV sa potom purifikujú klasickými technikami.AAVs can be prepared strains infected with the helper encoding chimeric molecule + expression cassette) flanked by two inverted repeat regions (ITRs) derived from adeno-associated viruses and a plasmid carrying the encapsidation genes (rep and cap genes) derived from adeno-associated AAV viruses. The recombinant AAVs produced are then purified by conventional techniques.
Pokiaľ ide o herpesvírusy a retrovírusy, bola konštrukcia rekombinantných vektorov v širokej miere opísaná v literatúre. 0 tom viď predovšetkým: Breakfield a kol., New Biologist 3 (1991) 203, EP 453242, EP 178220, Bernstein a kol. Genet.Eng.7 (1985) 235, McCormick, BioTechnology 3 (1985)689 a podobne.With regard to herpesviruses and retroviruses, the construction of recombinant vectors has been extensively described in the literature. In particular, see: Breakfield et al., New Biologist 3 (1991) 203, EP 453242, EP 178220, Bernstein et al. Genet.Eng.7 (1985) 235, McCormick, BioTechnology 3 (1985) 689 and the like.
Retrovírusy sú integratívnymi vírusmi, ktoré selektívne infikujú bunky v štádiu ich delenia. Tieto vírusy takto tvoria žiadané vektory pri rakovinových aplikáciách. Genóm retrovírusov v podstate obsahuje dve sekvencie LTR, inkapsidačnú sekvenciu a tri kódujúce oblasti (gag, pol a env). V rekombinantných vektoroch odvodených od retrovírusov sú gény gag, pol a env všeobecne eliminované deléciou, a to celkom alebo čiastočne a nahradené zainteresovanou heterologickou sekvenciou nukleovej kyseliny. Tieto vektory môžu byt získané z rôznych typov retrovírusov, akými sú predovšetkým MoMuLV (vírus murínna Maloneyova leukémia, tiež označovaná ako MoMLV), MSV (vírus murínneho Maloneyovho sarkómu), HaSV (vírus Harveyovho sarkómu), SNV (vírus slezinnej nekrózy), RSV (vírus Rousovho sarkómu) alebo tiež Friendov vírus.Retroviruses are integrative viruses that selectively infect cells at the stage of their division. These viruses thus form the desired vectors in cancer applications. The retrovirus genome essentially comprises two LTR sequences, an encapsidation sequence and three coding regions (gag, pol and env). In recombinant vectors derived from retroviruses, the gag, pol and env genes are generally eliminated by deletion, in whole or in part, and replaced by the heterologous nucleic acid sequence of interest. These vectors can be obtained from various types of retroviruses, such as in particular MoMuLV (Murine Maloney Leukemia Virus, also referred to as MoMLV), MSV (Murine Maloney Sarcoma Virus), HaSV (Harvey Sarcoma Virus), SNV (Spleen Necrosis Virus), RSV. Rous sarcoma virus) or Friend virus.
S cieľom konštrukcie rekombinantných retrovírusov podľa vynálezu sa všeobecne zostrojí plazmid obsahujúci predovšetkým sekvenciu LTR, inkapsidačnú sekvenciu a sekvenciu podľa vynálezu (sekvencia kódujúca chimerickú molekulu + expresnú kazetu), ktorý sa potom použije na transfekciu takzvaného inkapsidačného bunkového kmeňa, schopného priniesť do polohy trans retrovírusové funkcie, ktoré sú v plazmide deficitné. Všeobecne sú inkapsidačné kmene teda schopné exprimovať gény gag, pol a env. Také inkapsidačné kmene boli opísané v rámci doterajšieho stavu techniky a sú nimi predovšetkým kmene PA317 (US 4,861,-719), PsiCRIP (W090/02806) a GP+envAm-12 (W089/07150). Ináč môžu rekombinantné retrovírusy zahrňovať modifikácie potlačenie uskutočnené s cieľom ako i rozložených časť génu gag (Bender na úrovni sekvencií LTR transkripčnej aktivity, inkapsidačných sekvenciách zahrňujúcich a kol., J.Virol.61(1987)1639). Produkované rekombinantné retrovírusy sa potom purifikujú klasickými technikami.In order to construct the recombinant retroviruses according to the invention, a plasmid containing, in particular, an LTR sequence, an encapsidation sequence and a sequence according to the invention (a sequence encoding a chimeric molecule + expression cassette) is generally constructed, which is then used to transfect a so-called encapsidating cell strain capable of delivering trans retroviral functions that are plasmid deficient. In general, the encapsidation strains are therefore capable of expressing the gag, pol and env genes. Such encapsidation strains have been described in the prior art and are in particular strains PA317 (US 4,861, -719), PsiCRIP (WO90 / 02806) and GP + envAm-12 (WO89 / 07150). Alternatively, recombinant retroviruses may include modifications of the suppressions made to target as well as the digested portions of the gag gene (Bender at the LTR transcriptional activity sequence level, including encapsidation sequences including et al., J. Virol. 61 (1987) 1639). The recombinant retroviruses produced are then purified by conventional techniques.
Príklad konštrukcie defektného rekombinantného vírusu podľa vynálezu (retrovírus) je opísaný na obr. 8. Z tohto obrázku je zrejmá druhá výhoda konštrukcií podľa vynálezu, ktorá spočíva v absencii expresie zainteresovaného génu v inkapsidačných kmeňoch. Vzhladom na to, že v týchto kmeňoch nie je prítomný transaktivátor alebo transaktivačný komplex regrutovaný systémom podľa vynálezu, je promótor neaktívny a nedochádza tak k expresii génu v produkčnej bunke (obr. 8A). K tomu dochádza len v prípade, kedy vírus účinne infikoval cieľovú bunku, t. j. bunku, v ktorej je prítomný transaktivátor alebo transaktivačný komplex regrutovaný systémom podľa vynálezu, a kedy dochádza k účinnej expresii génu (obr. 8B). To je obzvlášť výhodné na konštrukciu vírusu obsahujúceho gény, ktorých expresia by bola pre bunky toxická (gény Grb3-3, IL-2, difterický toxín a podobne).An example of the construction of a defective recombinant virus of the invention (retrovirus) is described in FIG. From this figure, a second advantage of the constructs of the invention is that the absence of expression of the gene of interest in the encapsidation strains is apparent. Since there is no transactivator or transactivation complex recruited by the system of the invention in these strains, the promoter is inactive and thus does not express the gene in the production cell (Fig. 8A). This occurs only when the virus has effectively infected the target cell, i. j. a cell in which a transactivator or transactivation complex is present recruited by the system of the invention, and where the gene is efficiently expressed (FIG. 8B). This is particularly advantageous for the construction of a virus containing genes whose expression would be toxic to cells (Grb3-3, IL-2, diphtheria toxin and the like).
V rámci realizácie vynálezu je obzvlášť výhodné použiť defektný rekombinantný adenovírus alebo retrovírus. Tieto vektory majú v skutočnosti vlastnosti, ktoré sú mimoriadne zaujímavé pre prenos génov do nádorových buniek.In the practice of the invention, it is particularly advantageous to use a defective recombinant adenovirus or retrovirus. In fact, these vectors have properties that are of particular interest for gene transfer into tumor cells.
V rámci vynálezu môžu byť taktiež použité rôzne typy nevírusových vektorov. Systém podmienenej expresie podľa vynálezu môže byť v skutočnosti zabudovaný do nevirusového činidla schopného podporovať prenos a expresiu nukleových kyselín do eukaryotických buniek. Chemické alebo biochemické vektory predstavujú zaujímavú alternatívu prírodných vírusov, a to predovšetkým vzhladom na ľahkú manipuláciu, na zvýšenú bezpečnosť a vzhľadom na to, že tu neexistuje teoretická medza týkajúca sa veľkosti DNA, ktorá má byť transfektovaná.Various types of non-viral vectors can also be used in the invention. The conditional expression system of the invention may in fact be incorporated into a non-viral agent capable of promoting the transfer and expression of nucleic acids into eukaryotic cells. Chemical or biochemical vectors are an interesting alternative to natural viruses, especially in view of ease of handling, increased safety and the lack of a theoretical limit on the size of the DNA to be transfected.
Tieto syntetické vektory majú dve základné funkcie, a síce zhutňovať transfektovanú nukleovú kyselinu a podporovať jej bunkovú fixáciu, ako i jej priechod cez plazmovú membránu a prípadne cez obe jadrové membrány. Aby sa zabránilo polyaniónovému charakteru nukleových kyselín, majú nevírusové vektory vo všetkých prípadoch polykatiónové náboje.These synthetic vectors have two basic functions, namely to compact the transfected nucleic acid and promote its cellular fixation, as well as its passage through the plasma membrane and possibly through both nuclear membranes. In order to avoid the polyanionic nature of the nucleic acids, non-viral vectors in all cases have polycationic charges.
Z vyvinutých syntetických vektorov sú najvýhodnejšie katiónové polyméry typu polylyzínu, (LKLK)n, (LKKL)n, polyetylénimín a DEAE-dextrán alebo tiež katiónové a lipofektantné lipidy. Tieto vektory majú schopnosť zhutnit DNA a podporovať jej spojenie s bunkovou membránou. Z týchto posledne uvedených možno uviesť lipopolyamíny (lipofektamín, transfektám a podobne) a rôzne katiónové alebo neutrálne lipidy (DOTMA, DOGS, DOPE a podobne). V nedávnej dobe bol vyvinutý systém cielenej transfekcie, mediovanej receptorom, ktorý využíva princíp kondenzácie DNA vďaka katiónovému polyméru riadiac fixovanie komplexu k membráne v dôsledku chemickej kopulácie medzi katiónovým polymérom a ligandom membránového receptora prítomného na povrchu bunkového typu, ktorý má byť transformovaný. Bolo už opísané nasmerovanie receptora transferínu, inzulínu alebo receptora azialoglykoproteínov hepatocytov.Among the synthetic vectors developed, the most preferred are cationic polymers of the polylysine type, (LKLK) n, (LKKL) n, polyethyleneimine and DEAE-dextran, or else cationic and lipofectant lipids. These vectors have the ability to compact DNA and promote its association with the cell membrane. Among the latter, lipopolyamines (lipofectamine, transfectam and the like) and various cationic or neutral lipids (DOTMA, DOGS, DOPE and the like) can be mentioned. Recently, a receptor-mediated targeted transfection system has been developed that utilizes the principle of DNA condensation due to a cationic polymer controlling the fixation of the complex to the membrane due to chemical coupling between the cationic polymer and the membrane receptor ligand present on the cell type surface to be transformed. Alignment of the transferrin receptor, insulin or hepatocyte azialoglycoprotein receptor has already been described.
Predmetom vynálezu je tiež akákoľvek farmaceutická kompozícia, ktorá obsahuje vyššie uvedený vektor. Tieto kompozície môžu byť formulované s ohľadom na topické, perorálne, parenterálne, intranasálne, intravenózne, intramuskulárne, subkutánne, intraokulárne a podobné podania. Výhodne kompozícia podľa vynálezu obsahuje farmaceutický prijateľné nosiče na injekovateľné formulácie. Môže ísť predovšetkým o roztoky solí (dihydrogénfosforečnan sodný, hydrogénfosforečnan sodný, chlorid sodný, chlorid draselný, chlorid vápenatý alebo chlorid horečnatý a podobne, alebo zmesi takýchto solí) v sterilnom a izotonickom stave alebo v suchej kompozícii, predovšetkým lyofilizované kompozície, ktoré po pridaní sterilizovanej vody alebo fyziologického roztoku umožňujú rekonštitúciu injikovateľných tekutín. Pokiaľ ide o retrovírusy, môže byť výhodné priamo použiť inkapsidačné bunky alebo bunky infikované ex vivo a reimplantované in vivo, prípadne vo forme neoorgánu.The present invention also provides any pharmaceutical composition comprising the above vector. These compositions may be formulated with respect to topical, oral, parenteral, intranasal, intravenous, intramuscular, subcutaneous, intraocular and the like administration. Preferably, the composition of the invention comprises pharmaceutically acceptable carriers for injectable formulations. These may be, in particular, solutions of salts (sodium dihydrogen phosphate, sodium hydrogen phosphate, sodium chloride, potassium chloride, calcium chloride or magnesium chloride and the like, or mixtures of such salts) in a sterile and isotonic state or in a dry composition, in particular lyophilized compositions which water or saline allows for reconstitution of injectable fluids. For retroviruses, it may be advantageous to directly use the encapsidation cells or cells infected ex vivo and reimplanted in vivo, optionally in the form of a neo-organ.
Dávky vektora použité na injekciu môžu byť prispôsobené v závislosti od rôznych parametrov, predovšetkým v závislosti od použitého spôsobu podania, od liečenej patológie alebo tiež od požadovanej doby liečenia. Všeobecne sú rekombinantné vírusy podľa vynálezu formulované a podávané vo forme dávok pohybujúcich sa medzi 104 a 1014 pfu/ml. V prípade adeno-pridružených vírusov (AAV) a adenovírusov môžu byť taktiež použité dávky pohybujúce sa medzi 106 a 101Q pfu/ml. Výraz pfu (plaque forming unit) odpovedá infekčnej potencii suspenzie viriónov a je stanovená infekciou príslušného bunkového kmeňa a vyhodnotením (obvykle po 48 hodinách) počtu infikovaných bunkových plakov. Techniky stanovenia titra pfu vírusového roztoku sú v širokej miere dokumentované v literatúre.The dosages of the vector used for injection may be adjusted depending on various parameters, in particular depending on the route of administration used, the pathology to be treated or also the desired duration of treatment. In general, the recombinant viruses of the invention are formulated and administered in the form of doses ranging between 10 4 and 10 14 pfu / ml. For adeno-associated viruses (AAV) and adenoviruses, doses ranging from 10 6 to 10 10 pfu / ml may also be used. The term pfu (plaque forming unit) corresponds to the infectious potency of the virion suspension and is determined by infection of the respective cell strain and evaluation (usually after 48 hours) of the number of infected cell plaques. Techniques for determining the pfu titre of a viral solution are extensively documented in the literature.
Expresný systém podľa vynálezu a zodpovedajúce vektory sú obzvlášť vhodné na reguláciu expresie zainteresovaných génov v rámci bunkových a génových terapií. Tieto vektory môžu byť tiež použité na reguláciu expresie akejkoľvek zainteresovanej kódujúcej sekvencie, predovšetkým sekvencie kódujúcej terapeutický produkt, ktorým môže byť peptid, polypeptid, proteín ribonukleová kyselina a podobne. Génom je sekvencia DNA (cDNA, gDNA, syntetická, ľudská, zvieracia, rastlinná a podobná DNA) kódujúci proteínové produkty, akými sú napríklad enzýmy, krvné deriváty, hormóny, lymfokíny: interleukíny, interferóny, TNF a podobne (FR 9203120), rastové faktory, neurotransmitery syntetické enzýmy, trofické GMF, aFGF, bFGF, NT3, NT5 a ApoAIV, ApoE a podobne alebo ich prekurzory alebo faktory: BDNF, CNTF, NGF, IGF, podobne, apolipoproteíny: ApoAI, (FR 93 05125), dystrofín alebo minidystrofín (FR 9111947), nádorovo-supresorové gény: p53, Rb, RaplA, DCC, k-rev a podobne (FR 93 04745), gény kódujúce faktory implikované v koagulácii: faktory VII, VIII, IX a podobne alebo tiež celok alebo časť prírodného alebo umelého imunoglobulínu (Fab, ScFv a podobne), RNA-ligand (WO91/19813) a podobne.The expression system of the invention and the corresponding vectors are particularly suitable for regulating expression of the genes of interest in cellular and gene therapies. These vectors may also be used to regulate the expression of any of the coding sequences of interest, particularly the sequence encoding the therapeutic product, which may be a peptide, a polypeptide, a ribonucleic acid protein, and the like. The gene is a DNA sequence (cDNA, gDNA, synthetic, human, animal, plant and the like DNA) encoding protein products such as enzymes, blood derivatives, hormones, lymphokines: interleukins, interferons, TNF and the like (FR 9203120), growth factors , neurotransmitters synthetic enzymes, trophic GMF, aFGF, bFGF, NT3, NT5 and ApoAIV, ApoE and the like or precursors or factors thereof: BDNF, CNTF, NGF, IGF, like, apolipoproteins: ApoAI, (FR 93 05125), dystrophin or dystrophin (FR 9111947), tumor suppressor genes: p53, Rb, RaplA, DCC, k-rev and the like (FR 93 04745), genes encoding factors implicated in coagulation: factors VII, VIII, IX and the like, or all or part of natural or artificial immunoglobulin (Fab, ScFv and the like), RNA-ligand (WO91 / 19813) and the like.
Zainteresovaným génom môže byť tiež antimediátorová sekvencia, ktorej expresia v cieľovej bunke umožňuje regulovať expresiu génov alebo transkripciu bunkových mRNA. Takéto sekvencie môžu byť napríklad prepísané do cieľovej bunky ako komplementárna RNA bunkových mRNA a môžu takto blokovať ich transláciu na proteín technikou opísanou v patentovom dokumente EP 140 308.The gene of interest may also be an antisense sequence whose expression in a target cell allows the expression of genes or the transcription of cellular mRNAs to be regulated. Such sequences may, for example, be transcribed into the target cell as complementary RNA of cellular mRNAs and may thus block their translation into a protein by the technique described in EP 140 308.
Vynález je obzvlášť vhodný na expresiu sekvencií kódujúcich toxické faktory. Predovšetkým môže ísť o bunkové jedy (difterický toxín, toxín pseudomonas, ricín A a podobne) a o produkty indukujúce senzibilitu na vnútorné činidlo (sebevražedné gény: tymidín-kináza, cytozín-deamináza a podobne) alebo tiež o vražedné gény schopné indukovať bunkovú smrť (Grb3—3 (PCT/FR94/00542), ScFv anti-ras (WO94/29446) a podobne) . Systém podľa vynálezu v skutočnosti umožňuje produkovať predovšetkým vírusové vektory obsahujúce tieto sekvencie, a to bez rizika otravy produkčnej bunky a potom indukovať expresiu týchto toxických molekúl, a to selektívne v cieľových bunkách majúcich požadovaný transaktivátor alebo transaktivačný komplex. Tento typ konštrukcie je teda obzvlášť vhodný na protinádorové terapeutické stratégie, ich cieľom je napríklad selektívne zničiť napadnuté bunky. Tento systém je taktiež obzvlášť zaujímavý pre expresiu cytokínov, interferónov, TNF, TGF, ktorých neregulovaná produkcia by mohla mať výrazné vedľajšie účinky.The invention is particularly suitable for the expression of sequences encoding toxic factors. In particular, they may be cellular poisons (diphtheria toxin, pseudomonas toxin, ricin A and the like) and products inducing sensitivity to the intrinsic agent (suicide genes: thymidine kinase, cytosine deaminase and the like) or murine genes capable of inducing cell death (Grb3). 3 (PCT / FR94 / 00542), ScFv anti-ras (WO94 / 29446) and the like). In fact, the system according to the invention makes it possible, in particular, to produce viral vectors containing these sequences without the risk of production cell poisoning and then to induce the expression of these toxic molecules selectively in target cells having the desired transactivator or transactivation complex. Thus, this type of construction is particularly suited to anti-tumor therapeutic strategies, for example, to selectively destroy invaded cells. This system is also of particular interest for the expression of cytokines, interferons, TNF, TGF, whose unregulated production could have significant side effects.
Prehľad obrázkov na výkresochBRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS
V nasledujúcich častiach opisu bude vynález detailnejšie opísaný pomocou príkladov jeho konkrétneho uskutočnenia, pričom tieto príklady majú len ilustračný charakter a nijako neobmedzujú rozsah vynálezu, ktorý je jednoznačne definovaný definíciou patentových nárokov.In the following parts of the description, the invention will be described in more detail by way of examples of a specific embodiment thereof, these examples being illustrative only and not in any way limiting the scope of the invention, which is clearly defined by the definition of the claims.
Na pripojených výkresoch:In the attached drawings:
obr. 1 znázorňuje zobrazenie systému podmienenej expresie podľa vynálezu umožňujúci selektívne regrutovanie transaktivátora pomocou oligomeračnej oblasti (A) aleboFig. 1 depicts an illustration of a conditional expression system according to the invention allowing selectively recruiting a transactivator using the oligomerization region (A) or
ScFv (B), obr. 2 znázorňuje zobrazenie systému podmienenej expresie podľa vynálezu umožňujúci selektívne regrutovanie transaktivačného komplexu, obr. 3 znázorňuje expresnú kazetu podľa vynálezu zahrňujúcu regulačnú sekvenciu Tetop7, minimálny promótor (box TATA) a gén (CAT), obr. 4 znázorňuje zobrazenie expresnej kazety podľa vynálezu zahrňujúcej regulačnú sekvenciu 0R3, minimálny promótor (box TATA) a gén (CAT), obr. 5 znázorňuje bišpecifické chimérické molekuly podľa vynálezu, obr. 6 znázorňuje sekvencie DNA kódujúce bišpecifické chimérické molekuly podľa vynálezu, obr. 7 znázorňuje chimérické kontrolné konštrukcie, obr. 8 znázorňuje štruktúru a funkciu vírusového vektora (retrovírus) podľa vynálezu, obr. 9 znázorňuje štúdiu interakcie medzi hybridnými molekulami podľa vynálezu a regulačnou sekvenciou, obr. 10 znázorňuje štúdiu interakcie medzi hybridnými molekulami podľa vynálezu a rôznymi formami proteínu p53, obr. 11 znázorňuje preukázanie aktivácie kazety Tet-Luc v bunkách SAOS-2, obr. 12 znázorňuje preukázanie aktivácie kazety Tet-Luc v bunkách H358.ScFv (B), FIG. 2 shows an illustration of a conditional expression system according to the invention allowing selective recruiting of the transactivation complex; FIG. Figure 3 shows an expression cassette according to the invention comprising a Tetop7 regulatory sequence, a minimal promoter (TATA box) and a gene (CAT); Fig. 4 shows an illustration of an expression cassette according to the invention comprising the OR3 regulatory sequence, the minimal promoter (TATA box) and the gene (CAT); Figure 5 shows the bispecific chimeric molecules of the invention; Figure 6 shows DNA sequences encoding the bispecific chimeric molecules of the invention; 7 shows chimeric control structures; FIG. Figure 8 shows the structure and function of a viral vector (retrovirus) according to the invention; Fig. 9 shows an interaction study between the hybrid molecules of the invention and the regulatory sequence; Fig. 10 shows an interaction study between hybrid molecules of the invention and different forms of the p53 protein; 11 shows demonstration of Tet-Luc cassette activation in SAOS-2 cells; FIG. 12 shows demonstration of Tet-Luc cassette activation in H358 cells.
Všeobecné techniky molekulárnej biológieGeneral techniques of molecular biology
Klasické metódy molekulárnej biológie, medzi ktoré patrí predovšetkým centrifugácia plazmidovej DNA v systéme chlorid cézny-etídiumbromid, štiepenie reštrikčnými enzýmami, elektroforéza na géli, transformácia do E.coli, precipitácia nukleových kyselín a podobne, sú opísané v literatúre (Maniatis a kol., 1989).Classical molecular biology methods, including, in particular, centrifugation of plasmid DNA in cesium chloride-ethidium bromide, restriction enzyme digestion, gel electrophoresis, transformation into E. coli, nucleic acid precipitation and the like, are described in the literature (Maniatis et al., 1989) ).
Enzýmy boli poskytnuté firmou New-England Biolabs (Beverly, MA). S cieľom ligácie sú fragmenty DNA separované podľa ich veľkosti na 0,8 až 1,5 % agarózovom géli, purifikovaná metódou GeneClean (BI0101, LaJolla CA) a inkubované cez noc pri teplote 14 °C v pufri Tris-HCl, pH 7,4,50 mM, MgCl^ 10 mM, DTT 10 mM, ATP 2 mM, v prítomnosti DNA-ligázy fágu T4.Enzymes were provided by New-England Biolabs (Beverly, MA). For ligation, DNA fragments are separated according to their size on a 0.8-1.5% agarose gel, purified by GeneClean (BI0101, LaJolla CA) and incubated overnight at 14 ° C in Tris-HCl buffer, pH 7.4 , 50 mM, MgCl 4 10 mM, DTT 10 mM, ATP 2 mM, in the presence of phage T4 DNA ligase.
Amplifikácia reakcií PCR (Polymerase Chain Reaction) bola taktiež uskutočnená podľa Maniatis-a a kol. (1989) pri dodržaní nasledujúcich podmienok:Polymerase Chain Reaction (PCR) amplification was also performed according to Maniatis et al. (1989) under the following conditions:
- koncentrácia MgCl^ upravená na 8mM,- MgCl2 concentration adjusted to 8mM,
- denaturačná teplota 95 °C, hybridizačná teplota 55 °C, elongačná teplota 72 °C. Tento cyklus bol opakovaný 25krát v zariadení PE9600 Thermalcycler (Perkin Elmer, Norwalk CO) .- denaturation temperature 95 ° C, hybridization temperature 55 ° C, elongation temperature 72 ° C. This cycle was repeated 25 times in a PE9600 Thermalcycler (Perkin Elmer, Norwalk CO).
Oligonukleotidy sa syntetizujú za použitia chémie fosforamiditov chránených v polohe beta kyanoetylovou skupinou (Sinha a kol., 1984, Giles 1985) a automatického syntetizéru DNA Applied Biosystem model 394 (Applied Biosystem, Foster City CA) pri dodržaní odporúčania výrobcu.Oligonucleotides are synthesized using the cyanoethyl-protected phosphoramidite chemistry (Sinha et al., 1984, Giles 1985) and an Applied Biosystem model 394 automatic DNA synthesizer (Applied Biosystem, Foster City CA) following the manufacturer's recommendations.
Sekvenovanie bolo uskutočnené na dvojvláknových matriciach metódou terminácie reťazcov za použitia fluorescenčných značkovacích činidiel. Tu bola použitá sekvenovacia súprava Taq Sye Primer Kit dostupná u firmy Applied Biosystem (Applied Biosystem, Foster City CA) pri dodržaní pokynov výrobcu.Sequencing was performed on double-stranded matrices by the chain termination method using fluorescent labeling reagents. The Taq Sye Primer Kit available from Applied Biosystem (Applied Biosystem, Foster City CA) was used herein following the manufacturer's instructions.
Príklady uskutočnenia vynálezuDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
Príklad 1Example 1
Konštrukcia expresnej kazety zahrňujúcej regulačnú sekvenciu, minimálny transkripčný promótor a génConstruction of an expression cassette comprising a regulatory sequence, a minimum transcriptional promoter, and a gene
1.1. Konštrukcia plazmidu pTETop7/CAT1.1. Construction of plasmid pTETop7 / CAT
Plazmid pTETop7/CAT obsahuje nasledujúce prvky (obr. 3):Plasmid pTETop7 / CAT contains the following elements (Fig. 3):
- regulačnú sekvenciu tvorenú sekvenciou interakcie s tetracyklínovým supresorom tetR pozostávajúci zo siedmich opakovaných motívov Tetop (SEQ ID n° 1),- a regulatory sequence consisting of an interaction sequence with the tetR tetracycline suppressor consisting of seven repeated Tetop motifs (SEQ ID n ° 1),
- minimálny promótor odvodený od promótora génu tymidín-kinázy (oblasť -37 až +19 nesúca box TATA),- minimal promoter derived from the thymidine kinase gene promoter (region -37 to +19 carrying the TATA box),
- sekvenciu kódujúcu chloramfenikolacetyl-transferázu (CAT) pod kontrolou uvedeného minimálneho promótora.a sequence encoding chloramphenicol acetyl transferase (CAT) under the control of said minimal promoter.
Tento plazmid bol konštruovaný klonovaním fragmentu Smal-BglII plazmidu pUHD10-7 (WO94/29442) do plazmidu pKK232-8 (Pharmacia), ktorý bol predbežne štiepený reštrikčnými enzýmami Smal a BamHI.This plasmid was constructed by cloning the SmaI-BglII fragment of plasmid pUHD10-7 (WO94 / 29442) into plasmid pKK232-8 (Pharmacia), which had been pre-digested with the restriction enzymes SmaI and BamHI.
1.2. Konštrukcia plazmidu pOR3/CAT1.2. Construction of plasmid pOR 3 / CAT
Plazmid pOR^/CAT obsahuje nasledujúce prvky (obr. 4):Plasmid pOR ^ / CAT contains the following elements (Fig. 4):
- regulačnú sekvenciu tvorenú sekvenciou OR^ interakcie s represorom Cro (SEQ ID n° 2),- a regulatory sequence formed by the sequence of the OR ^ interaction with the Cro repressor (SEQ ID n ° 2),
- minimálny promótor odvodený od promótora génu tymidín-kinázy (oblasť -37 až 19 nesúceí box TATA) ,- minimal promoter derived from the thymidine kinase gene promoter (region -37 to 19 carrying the TATA box),
- sekvenciu kódujúcu chloramfenikolacetyl-transferázu (CAT) pod kontrolou uvedeného minimálneho promótora.a sequence encoding chloramphenicol acetyl transferase (CAT) under the control of said minimal promoter.
Tento plazmid bol konštruovaný nasledujúcim spôsobom: sekvencia 0R3 interakcie s represorom Cro bola syntetizovaná umelo. S tým cieľom boli syntetizované dva nasledujúce oligonukleotidy:This plasmid was constructed as follows: the sequence 0R 3 interacting with the repressor Cro was synthesized artificially. To this end, the following two oligonucleotides were synthesized:
Oligo 5533 (SEQ ID n° 22): 5'-GATCCTATCACCGCAAGGGATAA-3'Oligo 5533 (SEQ ID NO: 22): 5'-GATCCTATCACCGCAAGGGATAA-3 '
Oligo 5534 (SEQ ID n° 23): 3'-GATAGTGGCGTTCCCTATTTCGA-5'.Oligo 5534 (SEQ ID NO: 23): 3'-GATAGTGGCGTTCCCTATTTCGA-5 '.
Oba tieto oligonukleotidy boli potom hybridizované za účelom rekonštituovania dvojvláknovej sekvencie 0R3 ohraničenej sekvenciami umožňujúcimi jej klonovanie orientované nasledujúcim spôsobom:Both of these oligonucleotides were then hybridized in order to reconstitute the double stranded OR 3 sequence flanked by sequences allowing its cloning, oriented as follows:
CATCCTATCACCGCAAGGGATAACATCCTATCACCGCAAGGGATAA
GATAGTGGCGTTCCCTATTTCGA.GATAGTGGCGTTCCCTATTTCGA.
1.31.3
Konštrukcia expresnej kazety toxických génovConstruction of the toxic cassette expression cassette
Expresné kazety opísaných plazmidov sekvenciou kódujúcou toxických génov sa získajú z vyššie (1.1 a 1.2) nahradením sekvencie CAT toxický produkt, výhodne gén Grb3-3 (PCT/FR94/00542) , gén tymidín-kinázy, gén kódujúci difterický toxín alebo pseudomonas a podobne.The expression cassettes of the described plasmids with the sequence encoding the toxic genes are obtained from above (1.1 and 1.2) by replacing the CAT sequence with a toxic product, preferably the Grb3-3 gene (PCT / FR94 / 00542), the thymidine kinase gene, the diphtheria toxin coding gene or pseudomonas.
Príklad 2Example 2
Konštrukcia špecifických jednovláknových protilátok pre p53Construction of p53-specific single-stranded antibodies
Táto jednovláknová protilátka sa konštruuje podľa nasledujúceho protokolu:This single-stranded antibody is constructed according to the following protocol:
cDNA kódujúca oblasti VH a VL boli získané z hybridómu pAb421 produkujúceho protilátku anti-p53. S týmto cieľom boli extrahované a podrobené za použitia náhodných subjektov. Použitie tohtoThe cDNAs encoding the VH and VL regions were obtained from the anti-p53 antibody producing hybridoma pAb421. To this end, they were extracted and subjected to random subjects. Use this
Avšak v prípade, totálnych cDNA, totálne RNA uvedeného hybridómu inverznej transkripčnej reakcii hexamérov vo funkcii primárových typu primérového subjektu umožňuje vyvarovať sa použitia špecifických primérových subjektov imunoglobulínov. Získané klony cDNA majú dostatočnú dĺžku na klonovanie oblastí V.However, in the case of total cDNAs, the total RNA of said hybridoma inverse transcription reaction of hexamers in the function of the primary type of the primer subject makes it possible to avoid the use of specific primer subjects of immunoglobulins. The cDNA clones obtained were of sufficient length to clone the V regions.
že predstavujú malú frakciu z prítomných potom musí byť uskutočnená predbežná amplifikačná reakcia s cieľom produkovania množstva DNA dostatočného na klonovanie. S tým cieľom sa cDNA kódujúca oblasti VH a VL amplifikuje oddelene. Použitými primárovými subjektami sú oligonukleotidy hybridizujúce na úrovni opačných koncov variabilných oblastí každého reťazca (H a L). Amplifikačným produktom využívajúcim špecifické primérové subjekty ťažkých reťazcov je fragment obsahujúci asi 340 bázových párov. Amplifikačný produkt používajúci špecifické primérové subjekty ľahkých reťazcov je tvorený fragmentom obsahujúcim asi 325 bázových párov.If they represent a small fraction of those present then a preliminary amplification reaction must be performed to produce an amount of DNA sufficient for cloning. To this end, cDNAs encoding the VH and VL regions are amplified separately. The primary subjects used are oligonucleotides hybridizing at the opposite ends of the variable regions of each chain (H and L). An amplification product utilizing specific primer entities of the heavy chains is a fragment containing about 340 base pairs. An amplification product using specific primer light chain entities consists of a fragment containing about 325 base pairs.
Po purifikácii sa cDNA kódujúca oblasť VH a VL protilátkami usporiada do jediného reťazca pomocou nukleotidového ramena (L). Toto nukleotidové rameno je konštruované takým spôsobom, že jeden z koncov sa viaže na koniec 3' cDNA kódujúci oblasť VH a druhý koniec sa viaže na koniec 5' cDNA kódujúci oblasť VL. Sekvencia ramena kóduje peptid SEQ ID n° 5. Zostavená sekvencia s asi 700 bázovými pármi obsahuje vo forme fragmentu Ncol-NotI reťazec VH-L-VL, ktorého sekvencia je reprezentovaná sekvenciou SEQ ID n° 4 (aminokyseliny 9 až 241). Táto sekvencia taktiež zahŕňa na konci C sekvenciu tag odvodenú od myc (zbytky 256 až 266).After purification, the cDNA coding region of the VH and VL antibodies is assembled into a single strand using a nucleotide arm (L). This nucleotide arm is constructed in such a way that one end binds to the end of the 3 'cDNA encoding the VH region and the other end binds to the end of the 5' cDNA encoding the VL region. The arm sequence encodes the peptide of SEQ ID NO: 5. The assembled sequence of about 700 base pairs contains, in the form of an NcoI-NotI fragment, the VH-L-VL chain, the sequence of which is represented by SEQ ID NO: 4 (amino acids 9 to 241). This sequence also includes a myc-derived tag at the end of the C sequence (residues 256-266).
Príklad 3Example 3
Konštrukcia sekvencií nukleových kyselín kódujúcich bišpecifické chimerické molekuly obsahujúce oblasť väzby k transaktivátoru tvorenú jednovláknovou protilátkou (ScFv)Construction of Nucleic Acid Sequences Encoding Bispecific Chimeric Molecules Containing a Single-Fiber Antibody (ScFv) Transactivator Binding Region
3.1. Konštrukcia plazmidu obsahujúceho sekvenciu ScFv-myc3.1. Construction of a plasmid containing the ScFv-myc sequence
Hinge-TetR alebo Cro (obr. 5A a obr. 6)Hinge-TetR or Cro (Fig. 5A and Fig. 6)
Najskôr bol fragment Ncol-NotI obsahujúci cDNA kódujúci ScFv anti-p53 klonovaný do plazmidu typu pUC19. Potom sa za tento fragment vloží sekvencia kódujúca epitop VSV (SEQ ID n° 7) alebo myc (SEQ ID n° 8).First, the NcoI-NotI fragment containing the cDNA encoding the ScFv anti-p53 was cloned into a pUC19 type plasmid. Then, a sequence encoding a VSV epitope (SEQ ID No. 7) or myc (SEQ ID No. 8) is inserted after this fragment.
Sekvencie kódujúce proteíny TetR a Cro sa potom získajú nasledujúcim spôsobom:The TetR and Cro coding sequences are then obtained as follows:
-sekvencia kódujúca TetR bola získaná amplifikáciou z materinského plazmidu nesúceho sekvenciu TetR za použitia nasledujúcich oligonukleotidov:-TetR coding sequence was obtained by amplification from a parent plasmid carrying the TetR sequence using the following oligonucleotides:
Oligo 5474 (SEQ ID n° 10):Oligo 5474 (SEQ ID NO. 10):
GGCTCTAGACCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCAACGCGGGCTCTAGACCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCAACGCG
TGGATCCATGTCCAGATTAGATAAAAGTAAAGTGGATCCATGTCCAGATTAGATAAAAGTAAAG
Oligo 5475 (SEQ ID n° 11):Oligo 5475 (SEQ ID NO. 11):
CGTACGGAATTCGGGCCCTTACTCGAGGGACCCACTTTCACATTTCGTACGGAATTCGGGCCCTTACTCGAGGGACCCACTTTCACATTT
AAGTTGAAGTTG
Tieto oligoméry taktiež prinášajú sekvenciu kódujúcu peptidové rameno Hinge spájajúce obe funkčné oblasti molekúl.These oligomers also provide a sequence encoding the Hinge peptide arm linking the two functional regions of the molecules.
Amplifikovaný fragment teda obsahuje sekvenciu kódujúcu peptidové rameno a oblasť väzby s DNA tetT. Tento fragment sa klonuje do miest Xbal-EcoRI získaného plazmidu s cieľom generovania plazmidu obsahujúceho sekvenciu kódujúcu molekulu ScFv-myc-Hinge-TetR (obr. 6).Thus, the amplified fragment contains the sequence encoding the peptide arm and the tetT DNA binding region. This fragment was cloned into the XbaI-EcoRI sites of the obtained plasmid to generate a plasmid containing the sequence encoding the ScFv-myc-Hinge-TetR molecule (Fig. 6).
- sekvencia kódujúca Cro bola získaná amplifikáciou na DNA-matrici bakteriofága Lambda za použitia nasledujúcich oligonukleotidov:- the Cro coding sequence was obtained by amplification on the DNA matrix of the bacteriophage Lambda using the following oligonucleotides:
Oligo 5531 (SEQ ID n° 12):Oligo 5531 (SEQ ID NO. 12):
GGCTCTAGACCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCAACGCGGGCTCTAGACCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCAACGCG
TGGATCCATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGTGGATCCATGGAACAACGCATAACCCTGAAAG
Oligo 5532 (SEQ ID n° 13):Oligo 5532 (SEQ ID NO. 13):
CGTACGGAATTCGGGCCCTTACTCGAGTGCTGTTGTTTTTTTGTTCGTACGGAATTCGGGCCCTTACTCGAGTGCTGTTGTTTTTTTGTT
ACTCGGACTCGG
Tieto oligonukleotidy prinášajú taktiež sekvenciu kódujúcu peptidové rameno Hinge spájajúce obe funkčné oblasti molekuly.These oligonucleotides also provide a sequence encoding the Hinge peptide arm linking both functional regions of the molecule.
Amplifikovaný fragment teda obsahuje sekvenciu kódujúcu peptidové rameno a oblasť väzby s DNA Cro. Tento fragment bol klonovaný do miest Xbal-EcoRI vyššie uvedeného získaného plazmidu s cieľom generovania plazmidu obsahujúceho sekvenciu kódujúcu molekulu ScFv-myc-Hinge-Cro (obr. 6).Thus, the amplified fragment comprises a sequence encoding a peptide arm and a Cro DNA binding region. This fragment was cloned into the XbaI-EcoRI sites of the above-obtained plasmid to generate a plasmid containing a sequence encoding a ScFv-myc-Hinge-Cro molecule (Fig. 6).
3.2. Konštrukcia plazmidu obsahujúceho sekvenciu ScFvHinge-TetR alebo Cro (obr. 5B)2.3 Construction of a plasmid containing the sequence ScFvHinge-TetR or Cro (Fig. 5B)
Tento príklad opisuje konštrukciu plazmidov nesúcich sekvenciu kódujúcu bišpecifickú chimerickú molekulu podľa vynálezu zbavenú sekvencie tag.This example describes the construction of plasmids bearing a sequence encoding a bispecific chimeric molecule of the invention devoid of tag sequence.
Tieto plazmidy boli získané z plazmidov opísaných v 3.1. štiepením enzýmov NotI a Xbal. Toto štiepenie umožňuje vyštiepiť fragment nesúci oblasť kódujúcu tag myc.These plasmids were obtained from the plasmids described in 3.1. digestion of NotI and XbaI. This cleavage makes it possible to cleave the fragment carrying the myc tag coding region.
3.3. Konštrukcia plazmidu zahrňujúceho sekvenciu ScFv3.3 Construction of a plasmid comprising the ScFv sequence
TetR alebo Cro (obr. 5C)TetR or Cro (Fig. 5C)
Tento príklad opisuje konštrukciu plazmidov nesúcich sekvenciu kódujúcu bišpecifickú chimerickú molekulu podľa vynálezu nemajúcu rameno a sekvenciu tag.This example describes the construction of plasmids carrying a sequence encoding a bispecific chimeric molecule of the invention lacking an arm and a tag sequence.
Tieto plazmidy boli získané z plazmidov opísaných v 3.1. štiepením enzýmami Nôti a BamHl. Toto štiepenie umožňuje vyštiepiť fragment nesúci oblasť kódujúcu tag myc a peptidové rameno Hinge.These plasmids were obtained from the plasmids described in 3.1. by digestion with the enzymes Nôti and BamH1. This cleavage makes it possible to cleave the fragment carrying the region encoding the myc tag and the Hinge peptide arm.
Príklad 4Example 4
Konštrukcia sekvencií nukleových kyselín kódujúcich bišpecifické chimerické molekuly obsahujúce oblasť väzby na transaktivátor tvorenú oligomeračnou oblasťouConstruction of Nucleic Acid Sequences Coding for Bispecific Chimeric Molecules Containing a Transactivator Binding Region Comprised by an Oligomeric Region
4.1. Klonovanie oligomeračnej oblasti proteínu p53 (fragment 320-393) cDNA kódujúca oligomeračnú oblasť proteínu p53 (SEQ ID n° 3) bola získaná amplifikáciou reakciou PCR na plazmide nesúcom cDNA divokého ľudského p53 za použitia nasledujúcich oligonukleotidov:4.1. Cloning of the p53 oligomerization region (fragment 320-393) The cDNA encoding the p53 oligomerization region (SEQ ID NO: 3) was obtained by amplification by PCR reaction on a plasmid carrying wild-type human p53 cDNA using the following oligonucleotides:
Oligo 5535 (SEQ ID n° 14):Oligo 5535 (SEQ ID NO 14):
CAGGCCATGGCATGAAGAAACCACTGGATGGAGAA (podčiarknutá časť predstavuje miesto Ncol)CAGGCCATGGCATGAAGAAACCACTGGATGGAGAA (underlined is Ncol)
Oligo 5536 (SEQ ID n° 15):Oligo 5536 (SEQ ID NO 15):
CGTCGGATCCTCTAGATGCGGCCGCGTCTGAGTCAGGCCCTTC (podčiarknutá časť: miesto BamHl, dvakrát podčiarknutá časť: miesto Xbal, tučné napísaná časť: Nôti).CGTCGGATCCTCTAGATGCGGCCGCGTCTGAGTCAGGCCCTTC (underlined part: BamH1 site, twice underlined: Xbal site, bold part: Nots).
4.2. Plazmidy p53 320/393-myc-Hinge-TetR alebo Cro (obr. 5A) boli získané klonovaním vyššie uvedeného amplifikovaného fragmentu vo forme fragmentu2.4 Plasmids p53 320/393-myc-Hinge-TetR or Cro (Fig. 5A) were obtained by cloning the above amplified fragment as a fragment
Ncol-NotI do miest zodpovedajúcich plazmidom opísaných v príklade 3.1. nahradením za oblasť kódujúcu ScFv.Ncol-NotI to the sites corresponding to the plasmids described in Example 3.1. replacing it with the ScFv coding region.
4.3. Plazmidy p53 320/393-Hinge-TetR alebo Cro (obr. 5B) boli získané klonovaním amplifikovaného fragmentu z 4.1. vo forme fragmentu Ncol-Xbal do miest zodpovedajúcich plazmidom opísaným v 3.1. nahradením za oblasť kódujúcu ScFv a tag.3.4 Plasmids p53 320/393-Hinge-TetR or Cro (Fig. 5B) were obtained by cloning the amplified fragment of 4.1. in the form of the NcoI-XbaI fragment to the sites corresponding to the plasmids described in 3.1. replacing it with the ScFv coding region and tag.
4.4. Plazmidy p53 320/393-TetR alebo Cro (obr. 5C) boli získané klonovaním fragmentu amplifikovaného v 4.1. vo forme fragmentu Ncol-BamHI do miest zodpovedajúcich plazmidom opísaným v príklade 3.1. nahradením za oblasť kódujúcu ScFv, tag a Hinge.4.4 Plasmids p53 320/393-TetR or Cro (Fig. 5C) were obtained by cloning the fragment amplified in 4.1. in the form of the NcoI-BamHI fragment to the sites corresponding to the plasmids described in Example 3.1. replacing it with the ScFv, tag, and Hinge coding region.
4.5. Plazmidy tetR alebo Cro- p53 320/393 (obr. 5D) alebo tetR alebo Cro-Hinge-p53 320/393 (obr. 5E) boli získané klonovaním fragmentov amplifikovaných reakciou PCR na plazmide nesúcom cDNA divokého ľudského p53 za použitia oligo 5537/5539 alebo 5538/5539 štiepených Xhol/EcoRI do plazmidov opísaných v 3.1., predbežne štiepených enzýmami Xhol/EcoRI.4.5 Plasmids tetR or Cro-p53 320/393 (Figure 5D) or tetR or Cro-Hinge-p53 320/393 (Figure 5E) were obtained by cloning fragments amplified by PCR on a plasmid carrying wild-type human p53 cDNA using oligo 5537/5539 or 5538/5539 digested with XhoI / EcoRI into the plasmids described in 3.1, pre-digested with XhoI / EcoRI.
Oligo 5537 (SEQ ID n° 16):Oligo 5537 (SEQ ID NO 16):
CAGGCTCGAGAAGAAACCACTGGATGGAGAACAGGCTCGAGAAGAAACCACTGGATGGAGAA
Oligo 5538 (SEQ ID n° 17):Oligo 5538 (SEQ ID NO 17):
CAGGCTCGAGCCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCAAAGACAGGCTCGAGCCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCAAAGA
AACCACTGGATGGAGAAAACCACTGGATGGAGAA
Oligo 5539 (SEQ ID n° 18):Oligo 5539 (SEQ ID NO 18):
GGTCGAATTCGGGCCCTCAGTCTGAGTCAGGCCCTTCGGTCGAATTCGGGCCCTCAGTCTGAGTCAGGCCCTTC
Príklad 5Example 5
Konštrukcia kontrolného plazmidu nesúceho sekvenciu kódujúcu chimérickú molekulu zahrňujúcu oblasť väzby na DNA (TetR alebo Cro) a transaktivátorovú oblasť proteínu p53 (oblasť 1-73)Construction of a control plasmid carrying a sequence encoding a chimeric molecule comprising a DNA binding region (TetR or Cro) and a p53 transactivator region (1-73 region)
Plazmidy p53 1/73-TetR alebo Cro s alebo bez tag (myc alebo VSV) a Hinge (obr. 7A, 7B a 7C) boli získané klonovaním fragmentov amplifikovaných reakciou PCR z plazmidu nesúceho cDNA divokého ľudského p53 za použitia oligo 3661/5662 a potom štiepených enzýmami Ncol/NotI, Ncol/Xbal, Ncol/BamHI do plazmidov opísaných v 3.1., predbežne štiepených enzýmami Ncol/NotI, Ncol/Xbal alebo Ncol/BamHI.Plasmids p53 1/73-TetR or Cro with or without tag (myc or VSV) and Hinge (Figs. 7A, 7B and 7C) were obtained by cloning fragments amplified by PCR from a plasmid carrying wild-type human p53 cDNA using oligo 3661/5662 and then digested with NcoI / NotI, NcoI / XbaI, NcoI / BamHI into the plasmids described in 3.1., pre-digested with NcoI / NotI, NcoI / XbaI or NcoI / BamHI.
Oligo 5661 (SEQ ID n° 19):Oligo 5661 (SEQ ID NO 19):
CAGGCCATGGAGGAGCCGCAGTCAGATCCCAGGCCATGGAGGAGCCGCAGTCAGATCC
Oligo 5662 (SEQ ID n° 20):Oligo 5662 (SEQ ID NO. 20):
CGTCGGATCCTCTAGAŤGCGGCCGCCACGGGGGGAGCAGCCTCCGTCGGATCCTCTAGAŤGCGGCCGCCACGGGGGGAGCAGCCTC
TGGTGG
Príklad 6Example 6
Konštrukcia expresných plazmidov rôznych hybridných molekúl podľa vynálezuConstruction of Expression Plasmids of Various Hybrid Molecules of the Invention
Plazmidy použité na expresiu hybridných molekúl boli získané klonovaním fragmentov obsahujúcich cDNA kódujúcu tieto molekuly do miest Ncol/EcoRI eukaryotického expresného vektora pcDNA3 (invitrogén). Takto boli uskutočnené rôzne nasledujúce konštrukcie:The plasmids used to express the hybrid molecules were obtained by cloning fragments containing the cDNA encoding these molecules into the NcoI / EcoRI sites of the eukaryotic expression vector pcDNA3 (invitrogen). In this way, the following constructions were made:
-ScFv 421: SEQ ID n° 4,-ScFv 421: SEQ ID NO: 4,
-TET19: hybridný proteín obsahujúci reťazec ScFv421-VSV-HingeTetR opísaný na obr. 6 podľa príkladu 3.1.,-TET19: a hybrid protein comprising the ScFv421-VSV-HingeTetR chain described in FIG. 6 according to example 3.1.,
-ΤΕΤ02: hybridný proteín obsahujúci reťazec p53(320/393)-VSVHinge-TetR opísaný na obr. 5A podľa príkladu 4.3.,-ΤΕΤ02: hybrid protein containing the p53 (320/393) -VSVHinge-TetR chain described in FIG. 5A according to Example 4.3.,
-TET03: hybridný proteín obsahujúci reťazec p53(320/393)-Hinge TetR opísaný na obr. 5B podľa príkladu 4.4.,-TET03: hybrid protein containing the p53 (320/393) -Hinge TetR chain described in FIG. 5B according to Example 4.4.,
-TET04: hybridný proteín obsahujúci reťazec p53(320/393)-TetR opísaný na obr. 5C podľa príkladu 4.4.,-TET04: a hybrid protein comprising the p53 (320/393) -TetR chain described in FIG. 5C according to Example 4.4.,
-TET07: hybridný proteín obsahujúci reťazec p.53 (1/73 )-VSVHinge-TetR opísaný na obr. 7A podľa príkladu 5.-TET07: a hybrid protein comprising the p.53 (1/73) -VSVHinge-TetR chain described in FIG. 7A according to Example 5.
Príklad 7Example 7
Rozpoznanie dvoj vláknových sekvencii DNA hybridnými molekulami podľa vynálezuRecognition of double stranded DNA sequences by hybrid molecules of the invention
7.1. Produkcia hybridných molekúl7.1. Production of hybrid molecules
Rôzne molekuly použité v tomto experimente boli získané translácíou in vitro v lyzáte retikulocytov molekúl opísaných v príklade 6 za použitia súpravy TNT Coupled Reticulocyte lysate Systems (Promega) a podľa experimentálneho protokolu opísaného dodávateľom pre celkový reakčný objem 50 mikrolitrov.The various molecules used in this experiment were obtained by in vitro translation in a reticulocyte lysate of the molecules described in Example 6 using the TNT Coupled Reticulocyte Lysate Systems (Promega) kit and following the experimental protocol described by the supplier for a total reaction volume of 50 microliters.
7.2. Konštrukcia špecifickej dvojvláknovej sekvencie DNA2.7 Construction of a specific double stranded DNA sequence
Špecifická dvojvláknová sekvencia DNA použitá v tomto experimente je tvorená dvoma syntéznymi oligonukleotidmi majúcimi nasledujúce sekvencie:The specific double-stranded DNA sequence used in this experiment consists of two synthetic oligonucleotides having the following sequences:
Oligo 5997 (SEQ ID n° 24):Oligo 5997 (SEQ ID NO 24):
GATCCGACTTTCACTTTTCTCTATCACTGATAGTGAGTGGTAAACTCAGATCCGACTTTCACTTTTCTCTATCACTGATAGTGAGTGGTAAACTCA
Oligo 5998 (SEQ ID n° 25):Oligo 5998 (SEQ ID NO 25):
AGCTTGAGTTTACCACTCCCTATCAGTGATAGAGAAAAGTGAAAGTCGAGCTTGAGTTTACCACTCCCTATCAGTGATAGAGAAAAGTGAAAGTCG
Oba tieto syntézne oligonukleotidy boli označené fosforom 33 inkubáciou nasledujúcej zmesi po dobu 30 minút pri teplote 37 °C a za použitia 10 pmólov každého' z oligonukleotidov:Both of these synthesis oligonucleotides were labeled with phosphorus 33 by incubating the following mixture for 30 minutes at 37 ° C and using 10 pmoles of each of the oligonucleotides:
GATCCGACTTTCACTTTTCTCTATCACTGATAGTGAGTGGTAAACTCAGATCCGACTTTCACTTTTCTCTATCACTGATAGTGAGTGGTAAACTCA
CTAGGCTCAAAGTGAAAAGAGATAGTGACTATCACTCACCATTTGAGTCTAGGCTCAAAGTGAAAAGAGATAGTGACTATCACTCACCATTTGAGT
7.3.7.3.
Rozpoznanie dvojvláknovej sekvencie TetO rôznymi hybridnými molekulami podľa vynálezuRecognition of the TetO double stranded sequence by various hybrid molecules of the invention
Väzbová reakcia na DNA sa uskutočňuje v 50 μΐ reakčnej zmesi(Tris-HCl pH 7,4 10 mM, MgCl^ 10 mM, KCL 10 mM, betamerkaptoetanol 6 mM, EDTA 0,1 mM, BSA 0,5 mg/ml) pridaním sekvencie TetO (10~1θΜ) pripravené v príklade 7.2, 10 μΐ translačného produktu pripraveného podľa príkladu 7.1. a 10“eM studeného kompetičného oligonukleotidu AP2 (Promega) použitého na elimináciu nešpecifickej väzby. Špecifickosť interakcie sa overí posunutím rovnováhy pridaním 10 μΜ (Sigma) tetracyklínu k reakčnej zmesi. Reakčné zmesi sa potom inkubujú po dobu 15 minút pri pridá 10 μΐ 50 % glycerolu natívnej elektroforéze na 5 % sa migrácia uskutočňuje pri 200 V a 16 a podrobí autorádiografii.The DNA binding reaction is performed in a 50 μΐ reaction mixture (Tris-HCl pH 7.4 10 mM, MgCl 4 10 mM, KCL 10 mM, betamercaptoethanol 6 mM, EDTA 0.1 mM, BSA 0.5 mg / ml) by adding a TetO sequence (10 -1θ Μ) prepared in Example 7.2, 10 μΐ of the translation product prepared according to Example 7.1. and 10 "to a competition-cold M AP2 oligonucleotide (Promega) used to eliminate nonspecific binding. The specificity of the interaction is verified by shifting the equilibrium by adding 10 μΜ (Sigma) of tetracycline to the reaction mixture. The reaction mixtures are then incubated for 15 minutes while 10 μΐ 50% glycerol of native electrophoresis is added to 5%, migration is performed at 200 V and 16 and subjected to autoradiography.
teplote 20 °C, na čo sa k nej a finálne zmesi sa podrobia polyakrylamidovom géli, pričomat 20 ° C, whereupon it and the final mixtures are subjected to a polyacrylamide gel, wherein
C. Gél sa potom vysušíC. The gel is then dried
Výsledok tohto experimentu uskutočneného s hybridnými molekulami TET19, TET02 a TET07 je zobrazený na obr. 9. Za týchto podmienok možno pozorovať väzbu týchto troch molekúl na špecifickú dvojvláknovú DNA-sekvenciu TetO vzhľadom na migračné oneskorenie takto viazaných molekúl, pričom špecifickosť tejto interakcie je preukázaná· inhibíciou uvedeného migračného oneskorenia pridaním tetracyklínu.The result of this experiment carried out with hybrid molecules TET19, TET02 and TET07 is shown in FIG. 9. Under these conditions, the binding of the three molecules to the specific double-stranded DNA sequence of TetO was observed due to the migration delay of the molecules thus bound, and the specificity of this interaction was demonstrated by the inhibition of said migration delay by the addition of tetracycline.
Tento výsledok takto potvrdzuje skutočnosť, že hybridné molekuly podľa vynálezu sú schopné viazať sa špecifickým spôsobom na nukleotidovú sekvenciu TetO.This result thus confirms that the hybrid molecules of the invention are capable of binding in a specific manner to the nucleotide sequence of TetO.
Príklad 8Example 8
Špecifická väzba hybridných molekúl podľa vynálezu k molekule majúcej transkripčnú transaktivačnú oblasťSpecific Binding of Hybrid Molecules of the Invention to a Molecule Having a Transcriptional Transactivation Region
8.1. Produkcia hybridných molekúl podľa vynálezu a molekúl majúcich alebo nemajúcich transkripčnú transaktivačnú oblasť8.1. Production of Hybrid Molecules of the Invention and Molecules Having or Not having a Transcriptional Transactivation Region
Na účel tohto experimentu boli hybridné molekuly podľa vynálezu ScFv 421, TET19 a TET02 podľa príkladu 6 produkované transláciou in vitro za použitia experimentálneho protokolu podľa príkladu 7.1. za prítomnosti 44 pci 3SS-metionínu (Amersham) (1175 Ci/mmol), pričom sa získajú rádioaktívne značené hybridné molekuly.For the purpose of this experiment, the hybrid molecules of the invention ScFv 421, TET19 and TET02 of Example 6 were produced by in vitro translation using the experimental protocol of Example 7.1. in the presence of 44 pci of 3S S-methionine (Amersham) (1175 Ci / mmol) to give radiolabeled hybrid molecules.
cDNA molekúl majúcich alebo nemajúcich transkripčnú transaktivačnú oblasť bola klonovaná do vektora pBlueBacIII (Invitrogen) v mieste BamHI. Z týchto vektorov boli produkované a purifikované rekombinantné baculovírusy podľa inštrukcií výrobcu. Uvedené molekuly sa produkujú infekciou rekombinantným baculovírusom hmyzích buniek sf9 podľa experimentálneho protokolu výrobcu. Pripravia sa proteínové extrakty s finálnou koncentráciou protokolu opísaného K-Ory-m a kol.The cDNAs of the molecules having or lacking the transcriptional transactivation region were cloned into the pBlueBacIII vector (Invitrogen) at the BamHI site. Recombinant baculoviruses were produced and purified from these vectors according to the manufacturer's instructions. Said molecules are produced by infection with sf9 insect cell recombinant baculovirus according to the manufacturer's experimental protocol. Protein extracts were prepared with a final concentration of the protocol described by K-Ory et al.
3496-3504, 1994). Týmito molekulami sú:3496-3504, 1994). These molecules are:
proteínu 10 mg/ml podľa (K. Ory, EMBO J., 13,protein of 10 mg / ml according to (K. Ory, EMBO J., 13,
- ρ53(1/393): divoký proteín p53,- ρ53 (1/393): wild-type p53 protein,
- p53(1/320): divoký proteín p53 obmedzený na aminokyselinovú sekvenciu 1 až 320, a teda zbavenú oligomeračnej oblasti a oblasti rozpoznateľnej monoklonovacou protilátkou pAb421.- p53 (1/320): wild-type p53 protein restricted to amino acid sequence 1 to 320, and thus deprived of the oligomerization region and the region recognizable by the monoclonal antibody pAb421.
8.2. Väzba hybridných molekúl podľa vynálezu k molekulám majúcim alebo nemajúcim transkripčnú transaktivačnú oblasť μΐ každého z translačných produktov pripravených podľa príkladu 8.1. sa inkubuje s 5 μΐ extraktu baculovírusu pripraveného podľa príkladu 8.1. a 2 μΐ monoklonovacej protilátky D01 (Oncogene Sciences), ktorá rozpoznáva N-terminálnu časť proteínu p53, po dobu 16 hodín pri teplote 4 °C v 100 μΐ modifikovaného pufra RIPA (K. Ory, EMBO J., 13, 3496-3504, 1994). Imunoprecipitácia sa uskutoční postupom opísaným K. Ory-m a kol. (K. Ory, EMBO J.,13,3496-3504, 1994). Komplexy zadržané protilátkou sa eluujú 10 minútovou inkubáciou pri teplote 80 °C za prítomnosti 30 μΐ migračného pufra (Laemmli U.K., Náture, 227, 680-685, 1970) a podrobia sa elektroforéze na 10 % polyakrylamidovom géli v denaturačnom prostredí pri 200 V podľa vyššie opísaného protokolu (Laemmli U.K., Náture, 227, 680-685, 1970). Gél sa potom vysuší a vyvolá pomocou instantného zobrazovača (Packard Instruments), ktorý umožňuje kvantitatívne stanoviť množstvo hybridných molekúl majúcich alebo nemajúcich transkripčnú transaktivačnú oblasť. Výsledky tohto pokusu sú zobrazené na obr. 10.2.8 Binding of the hybrid molecules of the invention to molecules having or not having a transcriptional transactivation region μΐ of each of the translation products prepared according to Example 8.1. Incubate with 5 μΐ of baculovirus extract prepared according to Example 8.1. and 2 μΐ of monoclonal antibody D01 (Oncogene Sciences), which recognizes the N-terminal portion of p53, for 16 hours at 4 ° C in 100 μΐ of modified RIPA buffer (K. Ory, EMBO J., 13, 3496-3504, 1994). Immunoprecipitation is performed as described by K. Ory et al. (K. Ory, EMBO J., 1994, 13, 346-3504). The antibody-retained complexes are eluted by incubating at 80 ° C for 10 minutes in the presence of 30 μΐ migration buffer (Laemmli UK, Nature, 227, 680-685, 1970) and subjected to 10% polyacrylamide gel electrophoresis in a denaturing medium at 200 V above. described protocol (Laemmli UK, Nature, 227, 680-685, 1970). The gel is then dried and developed using an instant imager (Packard Instruments), which makes it possible to quantitatively determine the amount of hybrid molecules having or lacking the transcriptional transactivation region. The results of this experiment are shown in FIG. 10th
Za týchto podmienok sa jasne ukazuje, že hybridná molekula majúca ScFv 421 (TET19) rozpoznáva molekulu p53(1/393) rovnako dobre ako samotný ScFv 421 a že hybridná molekula majúca oblasť 320/393 (TET02) vykazuje rovnaké vlastnosti, avšak má výraznejšiu schopnosť retencie proteínu p53 (1/393). Okrem toho neprítomnosť signálu pozorovaného pri inkubácii s molekulou p53(1/320) ukazuje, že tieto interakcie sú skutočne špecifické a sú médiované C-terminálnou časťou proteínu p53 (aminokyseliny 320 až 393) ako bolo očakávané.Under these conditions, it is clear that a hybrid molecule having a ScFv 421 (TET19) recognizes the p53 (1/393) molecule as well as the ScFv 421 itself and that the hybrid molecule having a 320/393 (TET02) region exhibits the same properties but has a more potent ability retention of the p53 protein (1/393). In addition, the absence of the signal observed upon incubation with the p53 molecule (1/320) shows that these interactions are truly specific and are mediated by the C-terminal portion of the p53 protein (amino acids 320-393) as expected.
Tieto výsledky teda potvrdzujú skutočnosť, že hybridné molekuly podľa vynálezu sú naozaj schopné regrutovať transkripčnú transaktivačnú oblasť nesenou molekulou, ktorej sú špecifickými partnermi.Thus, these results confirm that the hybrid molecules of the invention are indeed capable of recruiting the transcriptional transactivation region carried by the molecule of which they are specific partners.
Príklad 9Example 9
Funkčné regrutovanie transkripčnej transaktivačnej oblasti hybridnými molekulami podľa vynálezuFunctional recombination of the transcriptional transactivation region by the hybrid molecules of the invention
Funkčné regrutovanie oblasti hybridnými molekulami v transaktivačnom systéme in transkripčnej transaktivačnej podľa vynálezu bolo vyhodnotené vivo v bunkách SAOS-2 (ľudský osteosarkóm) s deficitom oboch alel proteínu p53 v nádorovom bunkovom kmeni s deficitom oboch alel proteínu p53 (Maxwell Roth, Oncogene 8, 3421, 1993) a v nádorovom kmeni HT29 s deficitom jednej z oboch alel proteínu p53 a s jednou mutovanou alelou (mutácia H273). Tento systém je založený na použití reportérového génu, ktorý je stanoviteľný enzymaticky a vložený pod kontrolu promótora obsahujúceho nukleotidové motívy špecificky rozpoznateľné represorom Tet (operátor Tet).Functional recruitment of the region by hybrid molecules in the transactivation system of the transcriptional transactivation of the invention was evaluated in vivo in SAOS-2 (human osteosarcoma) cells deficient in both p53 alleles in a tumor cell line deficient in both p53 alleles (Maxwell Roth, Oncogene 8, 3421, 1993) and in the HT29 tumor strain deficient in one of the two alleles of the p53 protein and with one mutated allele (H273 mutation). This system is based on the use of a reporter gene that is detectable enzymatically and placed under the control of a promoter containing nucleotide motifs specifically recognizable by the Tet repressor (Tet operator).
V tomto teste sa reportérový gén LUC (luciferáza) vloží pod kontrolu operátora Tet a je obsiahnutý v plazmide pUHC13-3 (Gossen M. a Bujard H., Proc.Natol.Acad.Sci.USA, 89, 5547-5551, 1992).In this assay, the LUC reporter gene (luciferase) is placed under the control of the Tet operator and is contained in the plasmid pUHC13-3 (Gossen M. and Bujard H., Proc. Natol. Acad. Sci. USA, 89, 5547-5551, 1992) .
9.1. Použité bunkové kmene a kultivačné podmienky9.1. Cell strains used and culture conditions
Bunkové kmene použité v týchto experimentoch, ako i ich genotyp pripojený k proteínu p53 a použité kultivačné podmienky pre ich rast sú uvedené v nasledujúcej tabuľke:The cell strains used in these experiments as well as their genotype attached to the p53 protein and the culture conditions used for their growth are shown in the following table:
Tabuľkatable
transaktivačnú oblasťtransactivation region
Molekulami s transkripčnou transaktivátorovou oblasťou použitými pri tomto experimente sú divoký proteín p53 (Wt) a mutanty G281 a H175 tohto proteínu. cDNA kódujúca tieto tri proteíny bola vložená do miest BamHI vektora pcDNA3 (introgén) .Molecules with transcriptional region used in this experiment are wild-type p53 protein (Wt) and mutants G281 and H175 of this protein. The cDNA encoding these three proteins was inserted into the BamHI sites of the pcDNA3 vector (introgen).
9.3. Intracelulárna expresia hybridných molekúl podľa vynálezu9.3. Intracellular Expression of Hybrid Molecules of the Invention
Hybridné molekuly podľa vynálezu sa exprimujú v bunkách bunkovej kultúry dočasnou transfekciou za použitia nasledujúceho protokolu:The hybrid molecules of the invention are expressed in cell culture cells by transient transfection using the following protocol:
Bunky (3,5.1Os) sa zaočkujú do šesťjamkových titračných platní obsahujúcich v jamke po 2 ml kultivačného prostredia a kultivujú cez noc v inkubátore pri teplote 37 °C s atmosfé40 rou obsahujúcou 5 % oxidu uhličitého. Transfektujú sa potom jednotlivé konštrukcie za použitia lipofektAMINu (Gibco BRL) vo funkcii transfekčného činidla, a to nasledujúcim spôsobom: 1,5 pg totálneho plazmidu sa inkubuje (z toho je 0,25 μg reportérového plazmidu) s 5 μΐ lipofektAMINu po dobu 30 minút s 2 ml kultivačného prostredia (transfekčná zmes). V priebehu tejto doby sa bunky dvakrát premyjú PBS a potom inkubujú po dobu 4 hodín pri teplote 37 °C s transfekčnou zmesou, na čo sa transfekčná zmes odsaje a nahradí 2 ml kultivačného prostredia obohateného 10 % fetálneho teľacieho séra inaktivovaného teplom a bunky sa kultivujú po dobu 48 hodín pri teplote 3 7 °C.Cells (3.5. 10 sec. ) Are seeded into six-well titration plates containing 2 ml of culture medium per well and cultured overnight in an incubator at 37 ° C with a 40% atmosphere of 5% carbon dioxide. The individual constructs are then transfected using lipofectAMIN (Gibco BRL) as transfection agent as follows: 1.5 µg of total plasmid is incubated (of which 0.25 µg reporter plasmid) with 5 µΐ lipofectAMIN for 30 minutes with 2 ml culture medium (transfection mixture). During this time, the cells are washed twice with PBS and then incubated for 4 hours at 37 ° C with the transfection mixture, after which the transfection mixture is aspirated and replaced with 2 ml of culture medium enriched with 10% heat-inactivated fetal calf serum. 48 hours at 37 ° C.
9.4. Detekcia aktivácie transkripcie9.4. Detection of transcriptional activation
Aktivácia transkripcie spojená s funkčným regrutovaním transkripčného transaktivátora sa detekuje a kvantitatívne vyhodnotí zmeraním aktivity luciferázy kódovanej génom LUC za použitia súpravy Luciferase Assay System (Promega) podľa protokolu dodaného výrobcom.Transcriptional activation associated with functional recombinant transactivator recruitment is detected and quantitatively evaluated by measuring luciferase activity encoded by the LUC gene using the Luciferase Assay System (Promega) according to the protocol supplied by the manufacturer.
9.5. Funkčné regrutovanie transkripčnej transaktivačnej oblasti molekulami podľa vynálezu9.5. Functional recruitment of the transcriptional transactivation region by the molecules of the invention
Tento experiment bol uskutočnený za použitia molekúl TET02, TET03 a TET07 podľa príkladu 6. Pri tomto experimente slúži molekula TET07 ako pozitívny kontrolný subjekt vzhľadom na to, že má svoju vlastnú transkripčnú transaktivátorovú oblasť.This experiment was performed using the TETO 2, TETO 3, and TET07 molecules of Example 6. In this experiment, the TET07 molecule serves as a positive control subject due to its own transcriptional transactivator region.
Získané výsledky v bunkách SAOS-2, ktorú sú uvedené na obr. 11, ukazujú, že molekula TET07 je naozaj samostatne schopná aktivovať transkripciu génu LUC vloženého pod kontrolu operátora Tet, a to na rozdiel od konštrukcie TET02. To je v súlade so skutočnosťou, že tento bunkový kmeň neobsahuje endogénny proteín p53, ktorý takto teda nemôže byť regrutovaný molekulou TET02. Naopak, zavedenie divokého proteínu p53 alebo jeho mutantu, ktoré samy o sebe neprodukujú signál, je schopné generovať transkripčnú aktivitu v prítomnosti molekúl TET02. Taký výsledok nemožno pozorovať pri mutante H175, ktorý je v literatúre opísaný ako mutant majúci nefunkčnú transkripčnú transaktivačnú oblasť.The results obtained in SAOS-2 cells shown in FIG. 11, show that the TET07 molecule is indeed self-capable of activating the transcription of the LUC gene placed under the control of the Tet operator, unlike the TET02 construct. This is consistent with the fact that this cell strain does not contain the endogenous p53 protein, which thus cannot be recruited by the TET02 molecule. Conversely, the introduction of the wild-type p53 protein or mutant thereof, which do not themselves produce a signal, is capable of generating transcriptional activity in the presence of TET02 molecules. Such a result cannot be observed with the mutant H175, which is described in the literature as a mutant having a non-functional transcriptional transactivation region.
Tento výsledok získané v bunkovom kmeni SAOS-2 s molekulou TET02 mohol byť reprodukovaný v nádorovom bunkovom kmeni tiež neobsahujúci endogénny p53 (bunky H358) a mohol byť rozšírený aj na molekuly TET03 a TET04 (obr. 12).This result obtained in the cell line SAOS-2 with the TET02 molecule could be reproduced in a tumor cell line also free of endogenous p53 (H358 cells) and could be extended to the TET03 and TET04 molecules (Fig. 12).
S cieľom potvrdenia týchto výsledkov v kontexte rôznych bunkových kmeňov boli molekula TET02, ako i pozitívny kontrolný subjekt TET07 exprimované v bunkách HT29, ktoré majú mutantný endogénny proteín p53 (H273), zatiaľ čo negatívny kontrolný subjekt tohto experimentu spočíva v transfekcii prázdneho vektora pcDNA3. Výsledok tohto experimentu, uvedený v ďalej zaradenej tabuľke, ukazuje, že molekula TET02 je naozaj schopná regrutovať transkripčnú transaktivačnú oblasť endogénneho proteínu p53.To confirm these results in the context of different cell strains, the TET02 molecule as well as the positive control subject TET07 were expressed in HT29 cells having mutant endogenous p53 protein (H273), while the negative control subject in this experiment consisted in transfection of the empty pcDNA3 vector. The result of this experiment, presented in the table below, shows that the TET02 molecule is indeed capable of recruiting the transcriptional transactivation region of the endogenous p53 protein.
Tabuľkatable
Transkripčná aktivácia hybridných molekúl podľa vynálezu v bunkách HT29Transcriptional Activation of Hybrid Molecules of the Invention in HT29 Cells
molekuly podľa vynálezu sú naozaj schopné viazať ako sekvencie dvojvláknovej DNA špecifického charakteru, tak aj proteíny majúce transkripčnú transaktivačnú oblasť a že tieto molekuly sú schopné podmienene indukovať expresiu zainteresovaných génov.indeed, the molecules of the invention are capable of binding both double stranded DNA sequences of a specific nature as well as proteins having a transcriptional transactivation region and that these molecules are capable of conditionally inducing expression of the genes of interest.
Zoznam sekvenciiSequence list
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 1:Sequence Information SEQ ID NO: 1:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 19 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 1 konfigurácia: lineárnalength: 19 base pairs type: nucleotide number of strands: 1 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 1:Sequence description: SEQ ID NO: 1:
TCTCTATCAC TGATAGGGA 19TCTCTATCAC TGATAGGGA
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 2:Sequence Information SEQ ID NO: 2:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 17 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 1 konfigurácia: lineárnalength: 17 base pairs type: nucleotide number of strands: 1 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 2:Sequence description: SEQ ID NO: 2:
TATCACCGCA AGGGATA 17TATCACCGCA AGGGATA 17
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 3:Sequence Information SEQ ID NO: 3:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 74 aminokyselín typ: aminokyselina počet vláken: 1 konfigurácia: lineárnalength: 74 amino acids type: amino acid number of fibers: 1 configuration: linear
Typ molekuly: peptidMolecule type: peptide
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 3:Sequence description: SEQ ID NO: 3:
Η— 7 Ρr.e Lys Thr Glu Glv Pre A.so Ser A.so ó 5 70Ys— 7 Ρr.e Lys Thr Glu Glv For A.so Ser A.so ó 5 70
Informácia o sekvencii SEQ ID n“: 4: Charakteristika sekvencie: dĺžka: 768 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 1 konfigurácia: lineárnaSequence Information SEQ ID n: 4: Sequence Characteristics: Length: 768 base pairs Type: Nucleotide Number of Fibers: 1 Configuration: Linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 4:Sequence description: SEQ ID NO: 4:
Informácia o sekvencií SEQ ID n°: 5:Sequence Information SEQ ID NO: 5:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 15 aminokyselín typ: aminokyselina počet vláken: 1 konfigurácia: lineárnalength: 15 amino acids type: amino acid number of fibers: 1 configuration: linear
Typ molekuly: peptidMolecule type: peptide
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 5:Sequence description: SEQ ID NO: 5:
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 15 10 15Gly Gly Gly Ser Gly Gly Ser Gly Ser Gly Ser Gly Ser Gly Ser Gly Ser 15
Informácia o sekvencií SEQ ID n°: 6:Sequence Information SEQ ID NO: 6:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 30 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 30 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Informácia o sekvencií SEQ ID n°: 7: Charakteristika sekvencie: dĺžka: 18 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnaSequence Information SEQ ID NO: 7: Sequence Characteristics: Length: 18 base pairs Type: Nucleotide Number of Fibers: 2 Configuration: Linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 7:Sequence description: SEQ ID NO: 7:
ATG AAC CGG CTG GGC AAGATG AAC CGG
Met Asn Arg Leu Gly Lys 1 5Met Asn Arg Leu Gly Lys
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 8: Charakteristika sekvencie: dĺžka: 33 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnaSEQ ID NO: 8: Sequence characteristics: length: 33 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 8:Sequence description: SEQ ID NO: 8:
GAA CTIA AAA CTC ATC TCA GAA GAG GAT CTG AAT Glu Gin Lys Leu íle Ser Glu Glu Asp Leu AsnGAA CTIA AAA CTC ATC TCA GAA GAG GAT GAT Glu Gin Lys Leu White Ser Glu Glu Asp Leu Asn
1010
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 9: Charakteristika sekvencie: dĺžka: 7 aminokyselín typ: aminokyselina počet vláken: 1 konfigurácia: lineárnaSEQ ID NO: 9: Sequence characteristics: length: 7 amino acids type: amino acid number of threads: 1 configuration: linear
Typ molekuly: peptidMolecule type: peptide
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 9:Sequence description: SEQ ID NO: 9:
Pro Lys Lys Lys Arg Lys ValFor Lys Lys Lys Arg Lys Val
55
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 10: Charakteristika sekvencie: dĺžka: 66 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnaSequence Information SEQ ID NO: 10: Sequence Characterization: Length: 66 Base Pairs Type: Nucleotide Number of Fibers: 2 Configuration: Linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 10:Sequence description: SEQ ID NO: 10:
GGCTCTAGAC CCAJAGCCCAG TACCCCCCCA GGTTCTTCAA CGCG7GGATC CATGTCCAGA \ag;GGCTCTAGAC CCAJAGCCCAG TACCCCCCCA GGTTCTTCAA CGCG7GGATC CATGTCCAGA \ ag;
G7AAACG7AAAC
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 11:Sequence Information SEQ ID NO: 11:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 51 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 51 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 11:Sequence description: SEQ ID NO: 11:
CGTACGGAAT TCGGGCCCTT ACTCGAGGGA CCCACTTTCA CATTTAAGTT G 51CGTACGGAAT TCGGGCCCTT ACTCGAGGGA CCCACTTTCA CAT 51
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 12:Sequence Information SEQ ID NO: 12:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 66 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 66 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 12:Sequence description: SEQ ID NO: 12:
GGCTCTAGAC CCAAGCCCAG TACCCCCCCA GGTTCTTCAA CGCGTGGATC CATGGAACAAGGCTCTAGAC CCAAGCCCAG TACCCCCCCA GGTTCTTCAA CGCGTGGATC CATGGAACAA
CGCATAACCC TGAAAGCGCATAACCC TGAAAG
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 13:Sequence Information SEQ ID NO: 13:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 51 bázových párovlength: 51 base pairs
4Ί typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárna4Ί type: nucleotide number of fibers: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 13:Sequence description: SEQ ID NO: 13:
CGTACGGAAT TCGGGCCCTT ACTCGAGTGC TGTTGTTTTT TTGTTACTCG G 51CGTACGGAAT TCGGGCCCTT ACTCGAGTGC TGTTGTTTTT TTGTTACTCG G 51
Informácia o sekvencií SEQ ID n°: 14:Sequence Information SEQ ID NO: 14:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 35 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 35 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 14:Sequence description: SEQ ID NO: 14:
CAGGCCATGG CATGAAGAAA CCACTGGATG GAGAA 35CAGGCCATGG CATGAAGAAA CCACTGGATG GAGAA 35
Informácia o sekvencií SEQ ID n°: 15:Sequence Information SEQ ID NO: 15:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 43 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 43 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 15:Sequence description: SEQ ID NO: 15:
CGTCGGATCC TCTAGATGCG GCCGCGTCTG AGTCAGGCCC TTC 43CGTCGGATCC TCTAGATGCG GCCGCGTCTG AGTCAGGCCC TTC 43
Informácia o sekvencií SEQ ID n°: 16:Sequence Information SEQ ID NO: 16:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 31 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 31 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 16:Sequence description: SEQ ID NO: 16:
CAGGCTCGAG AAGAAACCAC TGGATGGAGA ACAGGCTCGAG AAGAAACCAC TGGATGGAGA
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 17:Sequence Information SEQ ID NO: 17:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 61 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 61 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 17:Sequence description: SEQ ID NO: 17:
CAC-GCTCGAC- CCCAAGCCCA GTACCCCCCC AGGTTCTTCA AAGAAACCAC TGGATGGAGACAC-GCTCGAC - CCCAAGCCCA GTACCCCCCC AGGTTCTTCA AAGAAACCAC TGGATGGAGA
AA
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 18:Sequence Information SEQ ID NO: 18:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 37 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 37 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 18:Sequence description: SEQ ID NO: 18:
GGTCGAATTC GGGCCCTCAG TCTGAGTCAG GCCCTTCGGTCGAATTC GGGCCCTCAG TCTGAGTCAG GCCCTTC
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 19:Sequence Information SEQ ID NO: 19:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 29 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 29 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 19:Sequence description: SEQ ID NO: 19:
CAGGCCATGG AGGAGCCGCA GTCAGATCC 29CAGGCCATGG AGGAGCCGCA GTCAGATCC 29
Informácia o sekvenčii SEQ ID n°: 20:Sequence Information SEQ ID NO: 20:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 46 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 46 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 20:Sequence description: SEQ ID NO: 20:
CGTCGGATCC TCTAGATGCG GCCGCCACGG GGGGAGCAGC CTCTGG 46CGTCGGATCC TCTAGATGCG GCCGCCACGG GGGGAGCAGC CTCTGG 46
Informácia o sekvenčii SEQ ID n°: 21:Sequence Information SEQ ID NO: 21:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 66 aminokyselín typ: aminokyselina počet vláken: 1 konfigurácia: lineárnalength: 66 amino acids type: amino acid number of fibers: 1 configuration: linear
Typ molekuly: peptidMolecule type: peptide
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Ser Val Ty 50Ser Val Ty
o Ser Asr. Lys Lys Thr ČOAbout Ser Asr. Lys Lys Thr
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 22:Sequence Information SEQ ID NO: 22:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 23 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 23 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 22:Sequence description: SEQ ID NO: 22:
GATCCTATCA CCGCAAGGGA TAA 23GATCCTATCA CCGCAAGGGA TAA 23
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 23:Sequence Information SEQ ID NO: 23:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 23 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 23 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 23:Sequence description: SEQ ID NO: 23:
GATAGTGGCG TTCCCTATTT CGA 23GATAGTGGCG TTCCCTATTT CGA
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 24:Sequence Information SEQ ID NO: 24:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 48 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 48 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 24:Sequence description: SEQ ID NO: 24:
GATCCGACTT TCACTTTTCT CTATCACTGA TAGTGAGTGG TAAACTCA 48GATCCGACTT TCACTTTTCT CTATCACTGA TAGTGAGTGG TAAACTCA 48
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 25:Sequence Information SEQ ID NO: 25:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 48 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 48 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 25:Sequence description: SEQ ID NO: 25:
AGCTTGAGTT TACCACTCCC TATCAGTGAT AGAGAAAAGT GAAAGTCG 48AGCTTGAGTT TACCACTCCC TATCAGTGAT AGAGAAAAGT GAAAGTCG 48
Informácia o sekvencii SEQ ID n°: 26:Sequence Information SEQ ID NO: 26:
Charakteristika sekvencie:Sequence characteristics:
dĺžka: 96 bázových párov typ: nukleotid počet vláken: 2 konfigurácia: lineárnalength: 96 base pairs type: nucleotide number of strands: 2 configuration: linear
Typ molekuly: cDNAMolecule type: cDNA
Hypotetická: nieHypothetical: no
Antimediátorová: nieAntisense: no
Popis sekvencie: SEQ ID n°: 26:Sequence description: SEQ ID NO: 26:
GATCCGACTT TCACTTTTCT CTATCACTGA TAGTGAGTGG TAAACTCACT AGGCTCAAAG ÓOGATCCGACTT TCACTTTTCT CTATCACTGA TAGTGAGTGG TAAACTCACT AGGCTCAAAG
TGAAAAGAGA TAGTGACTAT CACTCACCAT TTGAGTTGAAAAGAGA TAGTGACTAT CACTCACCAT TTGAGT
Claims (57)
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
FR9503841A FR2732348B1 (en) | 1995-03-31 | 1995-03-31 | CONDITIONAL EXPRESSION SYSTEM |
PCT/FR1996/000477 WO1996030512A1 (en) | 1995-03-31 | 1996-03-29 | Conditional expression system |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SK131197A3 true SK131197A3 (en) | 1998-05-06 |
Family
ID=9477639
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SK1311-97A SK131197A3 (en) | 1995-03-31 | 1996-03-29 | Conditional expression system |
Country Status (15)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0817845A1 (en) |
JP (1) | JPH11503011A (en) |
KR (1) | KR19980703439A (en) |
AU (1) | AU716748B2 (en) |
BR (1) | BR9607928A (en) |
CA (1) | CA2214451A1 (en) |
CZ (1) | CZ308097A3 (en) |
FR (1) | FR2732348B1 (en) |
HU (1) | HUP9801221A3 (en) |
IL (1) | IL117713A0 (en) |
NO (1) | NO974449D0 (en) |
SK (1) | SK131197A3 (en) |
TW (1) | TW496873B (en) |
WO (1) | WO1996030512A1 (en) |
ZA (1) | ZA962506B (en) |
Families Citing this family (15)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0872552A1 (en) * | 1997-04-15 | 1998-10-21 | Leadd B.V. | A gene delivery vehicle expressing the apoptosis-inducing proteins VP2 and/or Apoptin |
EP0878546A1 (en) * | 1997-04-15 | 1998-11-18 | Leadd B.V. | A gene delivery vehicle expressing the apoptosis-inducing proteins VP2 and/or apoptin |
FR2775984B1 (en) * | 1998-03-11 | 2006-09-15 | Bioscreen Therapeutics Sa | QUALITATIVE DIFFERENTIAL SCREENING |
US6881571B1 (en) | 1998-03-11 | 2005-04-19 | Exonhit Therapeutics S.A. | Qualitative differential screening |
FR2755144B1 (en) * | 1996-10-29 | 1998-11-27 | Rhone Poulenc Rorer Sa | SINGLE CHAIN ANTI-P53 ANTIBODY FRAGMENTS AND USE THEREOF |
US7276488B2 (en) | 1997-06-04 | 2007-10-02 | Oxford Biomedica (Uk) Limited | Vector system |
EP1012259B1 (en) | 1997-06-04 | 2009-09-30 | Oxford Biomedica (UK) Limited | Tumor targeted vector |
US6479653B1 (en) * | 1997-08-26 | 2002-11-12 | Ariad Gene Therapeutics, Inc. | Compositions and method for regulation of transcription |
EP1040201A4 (en) * | 1997-11-28 | 2001-11-21 | Invitrogen Corp | Single chain monoclonal antibody fusion reagents that regulate transcription in vivo |
FR2782732A1 (en) * | 1998-08-28 | 2000-03-03 | Transgene Sa | INDUCTIBLE EXPRESSION SYSTEM |
US7691370B2 (en) | 1998-10-15 | 2010-04-06 | Canji, Inc. | Selectivity replicating viral vector |
CA2391925A1 (en) | 1999-11-18 | 2001-05-25 | Oxford Biomedica (Uk) Limited | Antibodies |
GB0015090D0 (en) * | 2000-06-20 | 2000-08-09 | Implyx Ltd | Gene-activating conjugates |
AU2002349204A1 (en) * | 2001-11-26 | 2003-06-10 | University Health Network | Self-assembling p53 peptides as gene delivery vehicles |
ES2421596T3 (en) | 2002-05-10 | 2013-09-04 | Medical Res Council | Activation-induced deaminase (AID) |
Family Cites Families (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0832980B1 (en) * | 1989-01-23 | 2002-06-19 | Chiron Corporation | Recombinant therapies for infection and hyperproliferative disorders |
WO1994004672A1 (en) * | 1992-08-26 | 1994-03-03 | Dnx Corp. | Tetracycline repressor-mediated binary regulation system for control of gene expression in transgenic animals |
GB9224784D0 (en) * | 1992-11-26 | 1993-01-13 | Univ Dundee | Cellular protein |
AU684524B2 (en) * | 1993-06-14 | 1997-12-18 | Tet Systems Holding Gmbh & Co. Kg | Tight control of gene expression in eucaryotic cells by tetracycline-responsive promoters |
US5866755A (en) * | 1993-06-14 | 1999-02-02 | Basf Aktiengellschaft | Animals transgenic for a tetracycline-regulated transcriptional inhibitor |
FR2710074B1 (en) * | 1993-09-15 | 1995-12-08 | Rhone Poulenc Rorer Sa | GRB3-3 gene, its variants and their uses. |
-
1995
- 1995-03-31 FR FR9503841A patent/FR2732348B1/en not_active Expired - Fee Related
-
1996
- 1996-03-28 IL IL11771396A patent/IL117713A0/en unknown
- 1996-03-28 TW TW085103937A patent/TW496873B/en active
- 1996-03-28 ZA ZA962506A patent/ZA962506B/en unknown
- 1996-03-29 AU AU54020/96A patent/AU716748B2/en not_active Ceased
- 1996-03-29 KR KR1019970706843A patent/KR19980703439A/en not_active Ceased
- 1996-03-29 EP EP96911000A patent/EP0817845A1/en not_active Withdrawn
- 1996-03-29 HU HU9801221A patent/HUP9801221A3/en unknown
- 1996-03-29 BR BR9607928A patent/BR9607928A/en not_active Application Discontinuation
- 1996-03-29 WO PCT/FR1996/000477 patent/WO1996030512A1/en not_active Application Discontinuation
- 1996-03-29 SK SK1311-97A patent/SK131197A3/en unknown
- 1996-03-29 CA CA002214451A patent/CA2214451A1/en not_active Abandoned
- 1996-03-29 CZ CZ973080A patent/CZ308097A3/en unknown
- 1996-03-29 JP JP8529022A patent/JPH11503011A/en not_active Ceased
-
1997
- 1997-09-26 NO NO974449A patent/NO974449D0/en not_active Application Discontinuation
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
NO974449L (en) | 1997-09-26 |
ZA962506B (en) | 1996-10-01 |
AU716748B2 (en) | 2000-03-02 |
IL117713A0 (en) | 1996-07-23 |
KR19980703439A (en) | 1998-11-05 |
FR2732348A1 (en) | 1996-10-04 |
CZ308097A3 (en) | 1998-01-14 |
HUP9801221A2 (en) | 1998-08-28 |
CA2214451A1 (en) | 1996-10-03 |
JPH11503011A (en) | 1999-03-23 |
TW496873B (en) | 2002-08-01 |
BR9607928A (en) | 1998-06-09 |
HUP9801221A3 (en) | 1999-09-28 |
WO1996030512A1 (en) | 1996-10-03 |
MX9706928A (en) | 1997-11-29 |
NO974449D0 (en) | 1997-09-26 |
FR2732348B1 (en) | 1997-04-30 |
AU5402096A (en) | 1996-10-16 |
EP0817845A1 (en) | 1998-01-14 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
AU752129B2 (en) | Chimeric transcriptional activators and compositions and uses related thereto | |
AU716748B2 (en) | Conditional expression system | |
CA2224907A1 (en) | Methods and means for targeted gene delivery | |
CZ298806B6 (en) | Use of compound capable of antagonizing at least partially oncogenic activity, viral vector containing nucleic acid sequence coding for such a compound and pharmaceutical composition in which the compound is comprised | |
JPH11196880A (en) | Mutant loxP sequence and its application | |
KR100501881B1 (en) | 53 Protein Variants and Their Therapeutic Uses | |
CN114560915B (en) | Modified high-titer SARS-CoV-2 pseudovirus | |
WO1997046680A1 (en) | Dna encoding dp. 75 and a process for its use | |
US20050233963A1 (en) | Heat shock response and virus replication | |
WO1997011972A1 (en) | Chimeric dna-binding/dna methyltransferase nucleic acid and polypeptide and uses thereof | |
WO1997011972A9 (en) | Chimeric dna-binding/dna methyltransferase nucleic acid and polypeptide and uses thereof | |
CZ145599A3 (en) | METHOD OF RECOVERING TRANSLATION ACTIVITY DEPENDENT ON p53 IN CELLS, SINGLE-CHAIN ANTIBODIES AGAINST p53 AND DNA ENCODING THEREOF, THEIR USE AND PREPARATIONS IN WHICH THEY ARE COMPRISED | |
US20020188103A1 (en) | Chimeric dna-binding/dna methyltransferase nucleic acid and polypeptide and uses thereof | |
KR20020057975A (en) | Gene transfer method | |
JP2005502343A (en) | Humanized baculovirus | |
SK56198A3 (en) | Use of protein gax for treating cancer | |
MXPA97006928A (en) | Condition expression system | |
SK51199A3 (en) | Polypeptides comprising gax protein domains, involved in repressing transcription and/or interacting with other proteins, corresponding nucleic acids and their use | |
CZ291533B6 (en) | P62 protein derivatives, nucleic acids encoding these derivatives and pharmaceutical compositions in which the derivatives are comprised | |
SK146998A3 (en) | Derived tyrosine hydroxylase gene expression system | |
Ghattas | Footprinting in vivo of the Rous sarcoma virus transcription control region |